FuNGI

P49704

Protein Details

Accession

P49704

Localization Confidence

High

Confidence Score

17.2

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
358-386	IPEDQPKKKRAGRKFRKYKEKFRLSHVRQ	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
362-379	QPKKKRAGRKFRKYKEKF

Subcellular Location(s)

nucl 23, cyto 2

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR042239 Nop_C IPR002687 Nop_dom IPR036070 Nop_dom_sf IPR012976 NOSIC IPR027105 Prp31 IPR019175 Prp31_C
Gene Ontology	GO:0005739 C:mitochondrion GO:0005634 C:nucleus GO:0071011 C:precatalytic spliceosome GO:0005681 C:spliceosomal complex GO:0097526 C:spliceosomal tri-snRNP complex GO:0005687 C:U4 snRNP GO:0071001 C:U4/U6 snRNP GO:0046540 C:U4/U6 x U5 tri-snRNP complex GO:0003723 F:RNA binding GO:0000398 P:mRNA splicing, via spliceosome GO:0000387 P:spliceosomal snRNP assembly GO:0000244 P:spliceosomal tri-snRNP complex assembly
KEGG	sce:YGR091W -
Pfam	View protein in Pfam PF01798 Nop PF09785 Prp31_C
PROSITE	View protein in PROSITE PS51358 NOP

Amino Acid Sequences

MSSEEDYFDELEYDLADEVNEEKEDIQTKKLTTVNCQTEKFNPFEILPESIELFRTLALISPDRLSLSETAQILPKIVDLKRILQQQEIDFIKLLPFFNEIIPLIKSNIKLMHNFLISLYSRRFPELSSLIPSPLQYSKVISILENENYSKNESDELFFHLENKAKLTREQILVLTMSMKTSFKNKEPLDIKTRTQILEANSILENLWKLQEDIGQYIASKISIIAPNVCFLVGPEIAAQLIAHAGGVLEFSRIPSCNIASIGKNKHLSHELHTLESGVRQEGYLFASDMIQKFPVSVHKQMLRMLCAKVSLAARVDAGQKNGDRNTVLAHKWKAELSKKARKLSEAPSISETKALPIPEDQPKKKRAGRKFRKYKEKFRLSHVRQLQNRMEFGKQEQTVLDSYGEEVGLGMSNTSLQQAVGATSGSRRSAGNQAKLTKVMKHRISEANQQADEFLISLGHNTEQPNLSPEMVQMHKKQHTNPEEETNWFSGHG

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.08
2	0.07
3	0.07
4	0.06
5	0.08
6	0.1
7	0.1
8	0.09
9	0.1
10	0.13
11	0.2
12	0.21
13	0.25
14	0.27
15	0.28
16	0.33
17	0.37
18	0.35
19	0.37
20	0.46
21	0.51
22	0.53
23	0.54
24	0.52
25	0.56
26	0.58
27	0.53
28	0.46
29	0.39
30	0.32
31	0.34
32	0.33
33	0.28
34	0.25
35	0.23
36	0.22
37	0.2
38	0.2
39	0.17
40	0.14
41	0.11
42	0.11
43	0.1
44	0.1
45	0.13
46	0.14
47	0.15
48	0.16
49	0.17
50	0.17
51	0.17
52	0.17
53	0.15
54	0.15
55	0.18
56	0.18
57	0.19
58	0.21
59	0.21
60	0.19
61	0.18
62	0.17
63	0.18
64	0.18
65	0.24
66	0.23
67	0.28
68	0.33
69	0.4
70	0.39
71	0.37
72	0.41
73	0.35
74	0.41
75	0.38
76	0.33
77	0.27
78	0.25
79	0.24
80	0.22
81	0.21
82	0.14
83	0.14
84	0.14
85	0.14
86	0.16
87	0.14
88	0.14
89	0.15
90	0.15
91	0.15
92	0.17
93	0.18
94	0.19
95	0.24
96	0.24
97	0.25
98	0.28
99	0.31
100	0.29
101	0.28
102	0.25
103	0.24
104	0.23
105	0.24
106	0.23
107	0.2
108	0.21
109	0.23
110	0.23
111	0.19
112	0.24
113	0.23
114	0.23
115	0.25
116	0.25
117	0.24
118	0.24
119	0.24
120	0.2
121	0.19
122	0.19
123	0.15
124	0.16
125	0.17
126	0.19
127	0.19
128	0.16
129	0.18
130	0.19
131	0.2
132	0.2
133	0.19
134	0.18
135	0.19
136	0.21
137	0.18
138	0.15
139	0.16
140	0.15
141	0.15
142	0.15
143	0.18
144	0.18
145	0.17
146	0.18
147	0.18
148	0.2
149	0.19
150	0.22
151	0.21
152	0.2
153	0.22
154	0.25
155	0.27
156	0.26
157	0.27
158	0.24
159	0.22
160	0.21
161	0.19
162	0.16
163	0.11
164	0.09
165	0.09
166	0.09
167	0.08
168	0.14
169	0.18
170	0.2
171	0.3
172	0.29
173	0.37
174	0.4
175	0.45
176	0.46
177	0.46
178	0.44
179	0.4
180	0.42
181	0.33
182	0.31
183	0.29
184	0.24
185	0.26
186	0.24
187	0.21
188	0.18
189	0.18
190	0.17
191	0.14
192	0.12
193	0.07
194	0.08
195	0.06
196	0.06
197	0.07
198	0.09
199	0.1
200	0.1
201	0.11
202	0.1
203	0.1
204	0.1
205	0.1
206	0.07
207	0.06
208	0.05
209	0.07
210	0.09
211	0.09
212	0.12
213	0.12
214	0.12
215	0.12
216	0.12
217	0.09
218	0.07
219	0.1
220	0.07
221	0.07
222	0.07
223	0.07
224	0.07
225	0.07
226	0.06
227	0.03
228	0.03
229	0.03
230	0.02
231	0.02
232	0.02
233	0.02
234	0.03
235	0.03
236	0.03
237	0.03
238	0.04
239	0.05
240	0.06
241	0.07
242	0.08
243	0.08
244	0.08
245	0.1
246	0.11
247	0.12
248	0.18
249	0.2
250	0.24
251	0.28
252	0.27
253	0.29
254	0.32
255	0.32
256	0.3
257	0.35
258	0.31
259	0.27
260	0.27
261	0.25
262	0.2
263	0.2
264	0.16
265	0.08
266	0.07
267	0.07
268	0.07
269	0.07
270	0.08
271	0.07
272	0.07
273	0.06
274	0.07
275	0.09
276	0.1
277	0.1
278	0.09
279	0.09
280	0.09
281	0.09
282	0.16
283	0.19
284	0.22
285	0.26
286	0.29
287	0.31
288	0.35
289	0.36
290	0.31
291	0.3
292	0.27
293	0.22
294	0.19
295	0.17
296	0.17
297	0.16
298	0.14
299	0.12
300	0.12
301	0.12
302	0.13
303	0.18
304	0.16
305	0.17
306	0.18
307	0.19
308	0.22
309	0.23
310	0.23
311	0.18
312	0.17
313	0.19
314	0.2
315	0.21
316	0.24
317	0.25
318	0.25
319	0.26
320	0.28
321	0.32
322	0.33
323	0.41
324	0.44
325	0.52
326	0.58
327	0.63
328	0.63
329	0.6
330	0.59
331	0.56
332	0.57
333	0.49
334	0.44
335	0.41
336	0.42
337	0.38
338	0.35
339	0.29
340	0.21
341	0.21
342	0.19
343	0.16
344	0.15
345	0.21
346	0.28
347	0.37
348	0.41
349	0.46
350	0.51
351	0.59
352	0.63
353	0.67
354	0.69
355	0.71
356	0.76
357	0.8
358	0.86
359	0.88
360	0.93
361	0.92
362	0.92
363	0.92
364	0.91
365	0.83
366	0.81
367	0.82
368	0.76
369	0.77
370	0.76
371	0.74
372	0.68
373	0.73
374	0.71
375	0.64
376	0.61
377	0.54
378	0.47
379	0.39
380	0.38
381	0.39
382	0.32
383	0.28
384	0.26
385	0.25
386	0.24
387	0.23
388	0.2
389	0.12
390	0.12
391	0.12
392	0.11
393	0.08
394	0.07
395	0.06
396	0.06
397	0.06
398	0.05
399	0.04
400	0.05
401	0.06
402	0.06
403	0.06
404	0.05
405	0.06
406	0.07
407	0.07
408	0.07
409	0.07
410	0.07
411	0.09
412	0.12
413	0.12
414	0.13
415	0.13
416	0.16
417	0.26
418	0.34
419	0.4
420	0.44
421	0.48
422	0.5
423	0.55
424	0.54
425	0.51
426	0.52
427	0.53
428	0.52
429	0.52
430	0.56
431	0.59
432	0.62
433	0.65
434	0.64
435	0.63
436	0.57
437	0.53
438	0.47
439	0.39
440	0.33
441	0.24
442	0.15
443	0.08
444	0.07
445	0.08
446	0.09
447	0.1
448	0.12
449	0.13
450	0.17
451	0.18
452	0.19
453	0.22
454	0.23
455	0.23
456	0.21
457	0.21
458	0.23
459	0.26
460	0.31
461	0.33
462	0.4
463	0.46
464	0.5
465	0.56
466	0.59
467	0.63
468	0.64
469	0.64
470	0.64
471	0.6
472	0.59
473	0.57
474	0.49

P49704

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer