Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

P39956

Protein Details
Accession P39956    Localization Confidence High Confidence Score 16.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
108-128YVPPEDPKARRNSRKGSVSKSHydrophilic
712-763KECQRKFSSGHHLTRHKKSVHSGEKPHSCPKCGKRFKRRDHVLQHLNKKIPCBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
117-122RRNSRK
Subcellular Location(s) nucl 24.5, cyto_nucl 15
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR003347  JmjC_dom  
IPR003349  JmjN  
IPR036236  Znf_C2H2_sf  
IPR013087  Znf_C2H2_type  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0001227  F:DNA-binding transcription repressor activity, RNA polymerase II-specific  
GO:0051864  F:histone H3K36 demethylase activity  
GO:0032454  F:histone H3K9 demethylase activity  
GO:0046872  F:metal ion binding  
GO:0043565  F:sequence-specific DNA binding  
GO:0006338  P:chromatin remodeling  
GO:0010507  P:negative regulation of autophagy  
GO:0000122  P:negative regulation of transcription by RNA polymerase II  
GO:0032968  P:positive regulation of transcription elongation by RNA polymerase II  
KEGG sce:YER169W  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF02373  JmjC  
PF02375  JmjN  
PF00096  zf-C2H2  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51184  JMJC  
PS51183  JMJN  
PS00028  ZINC_FINGER_C2H2_1  
PS50157  ZINC_FINGER_C2H2_2  
Amino Acid Sequences MTKLIAPSEIVGGVPVFKPTYEQFEDFYAYCKAINKYGMKSGVVKVIPPKEWKDKLDLPYSAETLQKIKIKSPIQQHISGNKGLFMVQNVEKNKTYNIIQWKDLSKDYVPPEDPKARRNSRKGSVSKSTKLKLKNFESSFNIDDFEQFRTEYTIDLSDFQNTERLKFLEEYYWKTLNFTTPMYGADTPGSIFPEGLNVWNVAKLPNILDHMETKVPGVNDSYLYAGLWKASFSWHLEDQDLYSINYIHFGAPKQWYSIPQEDRFKFYKFMQEQFPEEAKNCPEFLRHKMFLASPKLLQENGIRCNEIVHHEGEFMITYPYGYHAGFNYGYNLAESVNFALEEWLPIGKKAGKCHCISDSVEIDVKKLAKSWRDNNKESKGTPPLNQLPNPAMPLLHRPTLKEMESSSLRSTSPDVGHFSNFKSKSSGVSSPLLSRMKDYSNIVEPTLEDPTLKLKRISSFQEQPLNKLLKRETSQTAMLTDHEDNIVAMSLTSMANSAASSPRLPLSRLNSSNELSNAQPLLDMTNNTLAFPRPNGPSGLNPLLYISNKNISGISHSAPHSPVNPNISLIKRVKSPNIVTLNISRESSRSPIALNYEARQQHSQQHSFSTPSTVSNLSTSVLGPLSDTNDIKTPHPERPNHKTANRILKKESPVETSKSNLILSKVASTRQEDSFTSRNDDLDKEQGSSPLNSKFAPEEIVLSGKNKIYICKECQRKFSSGHHLTRHKKSVHSGEKPHSCPKCGKRFKRRDHVLQHLNKKIPCISNETTVDAPIMNPTVQPQDGKAAINQQSTPLN
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.11
2 0.12
3 0.11
4 0.11
5 0.15
6 0.16
7 0.24
8 0.28
9 0.29
10 0.29
11 0.31
12 0.35
13 0.31
14 0.32
15 0.26
16 0.2
17 0.21
18 0.25
19 0.24
20 0.26
21 0.34
22 0.36
23 0.38
24 0.45
25 0.46
26 0.43
27 0.44
28 0.42
29 0.42
30 0.37
31 0.36
32 0.37
33 0.4
34 0.43
35 0.45
36 0.5
37 0.52
38 0.58
39 0.58
40 0.59
41 0.6
42 0.61
43 0.63
44 0.58
45 0.53
46 0.5
47 0.49
48 0.42
49 0.37
50 0.32
51 0.27
52 0.31
53 0.31
54 0.29
55 0.31
56 0.38
57 0.4
58 0.45
59 0.52
60 0.56
61 0.57
62 0.62
63 0.63
64 0.62
65 0.62
66 0.59
67 0.49
68 0.41
69 0.35
70 0.3
71 0.25
72 0.19
73 0.21
74 0.2
75 0.27
76 0.28
77 0.33
78 0.33
79 0.34
80 0.33
81 0.32
82 0.3
83 0.31
84 0.38
85 0.38
86 0.39
87 0.43
88 0.45
89 0.45
90 0.44
91 0.41
92 0.33
93 0.35
94 0.36
95 0.39
96 0.38
97 0.38
98 0.43
99 0.49
100 0.5
101 0.5
102 0.57
103 0.6
104 0.67
105 0.73
106 0.74
107 0.74
108 0.81
109 0.81
110 0.78
111 0.78
112 0.77
113 0.76
114 0.75
115 0.72
116 0.68
117 0.7
118 0.7
119 0.69
120 0.68
121 0.7
122 0.64
123 0.64
124 0.62
125 0.59
126 0.53
127 0.44
128 0.38
129 0.28
130 0.27
131 0.23
132 0.21
133 0.16
134 0.14
135 0.14
136 0.16
137 0.16
138 0.13
139 0.14
140 0.14
141 0.13
142 0.15
143 0.16
144 0.16
145 0.16
146 0.16
147 0.2
148 0.18
149 0.18
150 0.2
151 0.2
152 0.2
153 0.21
154 0.22
155 0.25
156 0.28
157 0.33
158 0.35
159 0.38
160 0.35
161 0.35
162 0.34
163 0.3
164 0.3
165 0.24
166 0.2
167 0.18
168 0.19
169 0.21
170 0.2
171 0.17
172 0.15
173 0.14
174 0.13
175 0.13
176 0.14
177 0.1
178 0.09
179 0.08
180 0.11
181 0.11
182 0.11
183 0.11
184 0.11
185 0.11
186 0.12
187 0.12
188 0.1
189 0.11
190 0.1
191 0.1
192 0.12
193 0.14
194 0.14
195 0.15
196 0.16
197 0.18
198 0.18
199 0.17
200 0.15
201 0.15
202 0.14
203 0.14
204 0.14
205 0.12
206 0.12
207 0.13
208 0.13
209 0.11
210 0.1
211 0.1
212 0.08
213 0.08
214 0.07
215 0.07
216 0.06
217 0.07
218 0.09
219 0.11
220 0.15
221 0.17
222 0.18
223 0.19
224 0.19
225 0.19
226 0.19
227 0.18
228 0.14
229 0.12
230 0.11
231 0.1
232 0.11
233 0.11
234 0.09
235 0.1
236 0.1
237 0.14
238 0.17
239 0.18
240 0.19
241 0.2
242 0.23
243 0.27
244 0.35
245 0.37
246 0.4
247 0.48
248 0.47
249 0.51
250 0.5
251 0.46
252 0.41
253 0.36
254 0.4
255 0.34
256 0.37
257 0.38
258 0.38
259 0.39
260 0.4
261 0.4
262 0.31
263 0.29
264 0.28
265 0.24
266 0.23
267 0.21
268 0.16
269 0.2
270 0.22
271 0.27
272 0.33
273 0.31
274 0.3
275 0.32
276 0.34
277 0.36
278 0.37
279 0.33
280 0.25
281 0.27
282 0.27
283 0.25
284 0.25
285 0.23
286 0.23
287 0.26
288 0.26
289 0.24
290 0.23
291 0.23
292 0.22
293 0.21
294 0.18
295 0.14
296 0.13
297 0.13
298 0.13
299 0.12
300 0.11
301 0.08
302 0.06
303 0.05
304 0.05
305 0.05
306 0.06
307 0.08
308 0.08
309 0.08
310 0.07
311 0.1
312 0.11
313 0.11
314 0.12
315 0.1
316 0.1
317 0.1
318 0.1
319 0.07
320 0.07
321 0.07
322 0.05
323 0.05
324 0.05
325 0.05
326 0.06
327 0.05
328 0.05
329 0.05
330 0.06
331 0.06
332 0.06
333 0.08
334 0.12
335 0.14
336 0.2
337 0.27
338 0.31
339 0.32
340 0.35
341 0.35
342 0.34
343 0.33
344 0.31
345 0.25
346 0.22
347 0.24
348 0.21
349 0.19
350 0.17
351 0.17
352 0.12
353 0.14
354 0.16
355 0.2
356 0.26
357 0.35
358 0.43
359 0.5
360 0.54
361 0.59
362 0.63
363 0.6
364 0.54
365 0.51
366 0.48
367 0.43
368 0.41
369 0.4
370 0.4
371 0.41
372 0.41
373 0.37
374 0.32
375 0.3
376 0.28
377 0.21
378 0.15
379 0.11
380 0.16
381 0.17
382 0.18
383 0.18
384 0.18
385 0.22
386 0.25
387 0.25
388 0.21
389 0.19
390 0.19
391 0.2
392 0.21
393 0.18
394 0.16
395 0.15
396 0.15
397 0.16
398 0.15
399 0.15
400 0.14
401 0.16
402 0.16
403 0.17
404 0.18
405 0.18
406 0.23
407 0.22
408 0.21
409 0.21
410 0.2
411 0.21
412 0.25
413 0.26
414 0.21
415 0.23
416 0.23
417 0.21
418 0.27
419 0.26
420 0.21
421 0.2
422 0.19
423 0.18
424 0.2
425 0.2
426 0.17
427 0.2
428 0.21
429 0.2
430 0.18
431 0.17
432 0.16
433 0.16
434 0.14
435 0.08
436 0.08
437 0.15
438 0.18
439 0.18
440 0.18
441 0.19
442 0.22
443 0.26
444 0.31
445 0.31
446 0.35
447 0.38
448 0.46
449 0.44
450 0.43
451 0.46
452 0.45
453 0.38
454 0.36
455 0.32
456 0.3
457 0.32
458 0.34
459 0.3
460 0.3
461 0.31
462 0.27
463 0.27
464 0.21
465 0.2
466 0.19
467 0.16
468 0.13
469 0.11
470 0.1
471 0.09
472 0.08
473 0.08
474 0.04
475 0.04
476 0.03
477 0.04
478 0.04
479 0.04
480 0.04
481 0.04
482 0.04
483 0.04
484 0.06
485 0.06
486 0.08
487 0.08
488 0.09
489 0.11
490 0.12
491 0.14
492 0.17
493 0.22
494 0.29
495 0.32
496 0.35
497 0.36
498 0.35
499 0.36
500 0.33
501 0.29
502 0.2
503 0.19
504 0.15
505 0.12
506 0.11
507 0.09
508 0.1
509 0.09
510 0.1
511 0.09
512 0.14
513 0.15
514 0.15
515 0.15
516 0.14
517 0.14
518 0.16
519 0.18
520 0.15
521 0.16
522 0.18
523 0.19
524 0.21
525 0.26
526 0.27
527 0.24
528 0.21
529 0.21
530 0.22
531 0.21
532 0.2
533 0.16
534 0.16
535 0.16
536 0.17
537 0.16
538 0.14
539 0.17
540 0.18
541 0.17
542 0.17
543 0.18
544 0.2
545 0.2
546 0.22
547 0.21
548 0.22
549 0.24
550 0.24
551 0.24
552 0.23
553 0.27
554 0.27
555 0.31
556 0.3
557 0.29
558 0.31
559 0.34
560 0.36
561 0.39
562 0.4
563 0.41
564 0.44
565 0.42
566 0.39
567 0.4
568 0.4
569 0.34
570 0.33
571 0.24
572 0.2
573 0.22
574 0.22
575 0.19
576 0.16
577 0.15
578 0.17
579 0.21
580 0.25
581 0.24
582 0.23
583 0.29
584 0.31
585 0.33
586 0.34
587 0.32
588 0.36
589 0.42
590 0.44
591 0.38
592 0.41
593 0.39
594 0.38
595 0.37
596 0.32
597 0.24
598 0.22
599 0.23
600 0.2
601 0.18
602 0.17
603 0.17
604 0.13
605 0.13
606 0.12
607 0.11
608 0.1
609 0.09
610 0.09
611 0.09
612 0.11
613 0.14
614 0.14
615 0.14
616 0.19
617 0.2
618 0.21
619 0.29
620 0.3
621 0.35
622 0.43
623 0.49
624 0.53
625 0.61
626 0.69
627 0.69
628 0.68
629 0.68
630 0.68
631 0.72
632 0.72
633 0.67
634 0.63
635 0.62
636 0.64
637 0.63
638 0.58
639 0.53
640 0.5
641 0.49
642 0.45
643 0.41
644 0.38
645 0.34
646 0.31
647 0.27
648 0.24
649 0.23
650 0.21
651 0.24
652 0.23
653 0.24
654 0.26
655 0.28
656 0.3
657 0.3
658 0.32
659 0.28
660 0.33
661 0.35
662 0.34
663 0.37
664 0.34
665 0.33
666 0.32
667 0.33
668 0.3
669 0.31
670 0.3
671 0.26
672 0.26
673 0.28
674 0.28
675 0.28
676 0.28
677 0.27
678 0.27
679 0.25
680 0.26
681 0.25
682 0.23
683 0.24
684 0.2
685 0.18
686 0.17
687 0.2
688 0.19
689 0.18
690 0.21
691 0.19
692 0.23
693 0.22
694 0.25
695 0.3
696 0.36
697 0.42
698 0.49
699 0.58
700 0.59
701 0.68
702 0.68
703 0.66
704 0.64
705 0.66
706 0.67
707 0.66
708 0.69
709 0.69
710 0.74
711 0.77
712 0.81
713 0.81
714 0.73
715 0.69
716 0.69
717 0.71
718 0.72
719 0.72
720 0.72
721 0.73
722 0.78
723 0.79
724 0.8
725 0.73
726 0.67
727 0.68
728 0.69
729 0.7
730 0.72
731 0.78
732 0.79
733 0.86
734 0.92
735 0.94
736 0.94
737 0.93
738 0.92
739 0.92
740 0.91
741 0.9
742 0.89
743 0.86
744 0.83
745 0.74
746 0.68
747 0.64
748 0.59
749 0.52
750 0.51
751 0.46
752 0.48
753 0.49
754 0.49
755 0.42
756 0.37
757 0.35
758 0.26
759 0.23
760 0.17
761 0.17
762 0.13
763 0.13
764 0.15
765 0.2
766 0.21
767 0.22
768 0.21
769 0.25
770 0.27
771 0.29
772 0.28
773 0.32
774 0.36
775 0.38
776 0.37