FuNGI

P13099

Protein Details

Accession

P13099

Localization Confidence

Low

Confidence Score

6.2

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
625-646	KDIVEKYRKYWHKTNACKNTLL	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Subcellular Location(s)

mito 13, cyto_mito 10.333, cyto_nucl 5.666, cyto 5.5, nucl 4.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR000380 Topo_IA IPR003601 Topo_IA_2 IPR023406 Topo_IA_AS IPR013497 Topo_IA_cen IPR013824 Topo_IA_cen_sub1 IPR013825 Topo_IA_cen_sub2 IPR013826 Topo_IA_cen_sub3 IPR023405 Topo_IA_core_domain IPR003602 Topo_IA_DNA-bd_dom IPR006171 TOPRIM_domain IPR034144 TOPRIM_TopoIII
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0031422 C:RecQ family helicase-topoisomerase III complex GO:0003677 F:DNA binding GO:0003916 F:DNA topoisomerase activity GO:0003917 F:DNA topoisomerase type I (single strand cut, ATP-independent) activity GO:0006265 P:DNA topological change GO:0000724 P:double-strand break repair via homologous recombination GO:0007064 P:mitotic sister chromatid cohesion GO:0007131 P:reciprocal meiotic recombination GO:0000018 P:regulation of DNA recombination GO:0007004 P:telomere maintenance via telomerase
KEGG	sce:YLR234W -
Pfam	View protein in Pfam PF01131 Topoisom_bac PF01751 Toprim
PROSITE	View protein in PROSITE PS00396 TOPOISOMERASE_I_PROK PS50880 TOPRIM
CDD	cd00186 TOP1Ac cd03362 TOPRIM_TopoIA_TopoIII

Amino Acid Sequences

MKVLCVAEKNSIAKAVSQILGGGRSTSRDSGYMYVKNYDFMFSGFPFARNGANCEVTMTSVAGHLTGIDFSHDSHGWGKCAIQELFDAPLNEIMNNNQKKIASNIKREARNADYLMIWTDCDREGEYIGWEIWQEAKRGNRLIQNDQVYRAVFSHLERQHILNAARNPSRLDMKSVHAVGTRIEIDLRAGVTFTRLLTETLRNKLRNQATMTKDGAKHRGGNKNDSQVVSYGTCQFPTLGFVVDRFERIRNFVPEEFWYIQLVVENKDNGGTTTFQWDRGHLFDRLSVLTFYETCIETAGNVAQVVDLKSKPTTKYRPLPLTTVELQKNCARYLRLNAKQSLDAAEKLYQKGFISYPRTETDTFPHAMDLKSLVEKQAQLDQLAAGGRTAWASYAASLLQPENTSNNNKFKFPRSGSHDDKAHPPIHPIVSLGPEANVSPVERRVYEYVARHFLACCSEDAKGQSMTLVLDWAVERFSASGLVVLERNFLDVYPWARWETTKQLPRLEMNALVDIAKAEMKAGTTAPPKPMTESELILLMDTNGIGTDATIAEHIDKIQVRNYVRSEKVGKETYLQPTTLGVSLVHGFEAIGLEDSFAKPFQRREMEQDLKKICEGHASKTDVVKDIVEKYRKYWHKTNACKNTLLQVYDRVKASM

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.28
2	0.27
3	0.23
4	0.21
5	0.21
6	0.19
7	0.2
8	0.18
9	0.17
10	0.13
11	0.15
12	0.19
13	0.19
14	0.2
15	0.19
16	0.22
17	0.25
18	0.31
19	0.33
20	0.32
21	0.36
22	0.34
23	0.35
24	0.33
25	0.3
26	0.24
27	0.2
28	0.21
29	0.16
30	0.21
31	0.2
32	0.2
33	0.2
34	0.2
35	0.24
36	0.22
37	0.26
38	0.26
39	0.27
40	0.26
41	0.26
42	0.25
43	0.21
44	0.21
45	0.17
46	0.12
47	0.11
48	0.11
49	0.09
50	0.08
51	0.07
52	0.07
53	0.07
54	0.07
55	0.08
56	0.08
57	0.09
58	0.14
59	0.14
60	0.15
61	0.2
62	0.22
63	0.21
64	0.22
65	0.22
66	0.19
67	0.26
68	0.24
69	0.19
70	0.19
71	0.19
72	0.22
73	0.23
74	0.22
75	0.16
76	0.19
77	0.19
78	0.18
79	0.17
80	0.18
81	0.26
82	0.27
83	0.28
84	0.27
85	0.28
86	0.29
87	0.35
88	0.41
89	0.4
90	0.47
91	0.55
92	0.61
93	0.65
94	0.65
95	0.66
96	0.6
97	0.57
98	0.49
99	0.41
100	0.33
101	0.29
102	0.29
103	0.23
104	0.19
105	0.13
106	0.13
107	0.12
108	0.12
109	0.13
110	0.11
111	0.12
112	0.13
113	0.13
114	0.13
115	0.13
116	0.12
117	0.1
118	0.1
119	0.15
120	0.16
121	0.16
122	0.18
123	0.23
124	0.28
125	0.32
126	0.35
127	0.35
128	0.39
129	0.44
130	0.48
131	0.5
132	0.47
133	0.46
134	0.44
135	0.39
136	0.34
137	0.29
138	0.23
139	0.17
140	0.17
141	0.24
142	0.23
143	0.27
144	0.27
145	0.28
146	0.28
147	0.32
148	0.32
149	0.29
150	0.31
151	0.35
152	0.36
153	0.35
154	0.34
155	0.32
156	0.37
157	0.32
158	0.32
159	0.28
160	0.29
161	0.34
162	0.33
163	0.31
164	0.26
165	0.26
166	0.21
167	0.22
168	0.19
169	0.13
170	0.13
171	0.11
172	0.1
173	0.11
174	0.11
175	0.07
176	0.07
177	0.06
178	0.08
179	0.08
180	0.08
181	0.08
182	0.08
183	0.1
184	0.12
185	0.2
186	0.23
187	0.3
188	0.37
189	0.37
190	0.38
191	0.46
192	0.48
193	0.46
194	0.46
195	0.48
196	0.45
197	0.48
198	0.49
199	0.46
200	0.45
201	0.44
202	0.44
203	0.38
204	0.4
205	0.42
206	0.49
207	0.47
208	0.5
209	0.51
210	0.53
211	0.53
212	0.47
213	0.41
214	0.32
215	0.31
216	0.25
217	0.22
218	0.18
219	0.15
220	0.15
221	0.14
222	0.14
223	0.11
224	0.12
225	0.12
226	0.09
227	0.09
228	0.09
229	0.11
230	0.11
231	0.13
232	0.12
233	0.14
234	0.14
235	0.17
236	0.21
237	0.22
238	0.26
239	0.25
240	0.26
241	0.25
242	0.3
243	0.27
244	0.24
245	0.21
246	0.17
247	0.16
248	0.16
249	0.16
250	0.11
251	0.12
252	0.11
253	0.11
254	0.11
255	0.11
256	0.09
257	0.1
258	0.09
259	0.08
260	0.15
261	0.15
262	0.18
263	0.18
264	0.19
265	0.19
266	0.2
267	0.23
268	0.17
269	0.17
270	0.15
271	0.17
272	0.16
273	0.15
274	0.13
275	0.1
276	0.1
277	0.09
278	0.09
279	0.09
280	0.09
281	0.08
282	0.08
283	0.07
284	0.06
285	0.07
286	0.07
287	0.05
288	0.05
289	0.05
290	0.04
291	0.05
292	0.06
293	0.08
294	0.08
295	0.09
296	0.1
297	0.13
298	0.15
299	0.22
300	0.28
301	0.34
302	0.41
303	0.48
304	0.53
305	0.52
306	0.52
307	0.46
308	0.45
309	0.39
310	0.38
311	0.33
312	0.27
313	0.28
314	0.28
315	0.27
316	0.23
317	0.23
318	0.18
319	0.17
320	0.25
321	0.32
322	0.36
323	0.39
324	0.4
325	0.4
326	0.39
327	0.38
328	0.33
329	0.25
330	0.19
331	0.16
332	0.18
333	0.18
334	0.18
335	0.18
336	0.16
337	0.14
338	0.15
339	0.15
340	0.16
341	0.2
342	0.2
343	0.23
344	0.23
345	0.27
346	0.26
347	0.26
348	0.24
349	0.22
350	0.23
351	0.2
352	0.19
353	0.17
354	0.16
355	0.15
356	0.13
357	0.1
358	0.11
359	0.11
360	0.11
361	0.11
362	0.11
363	0.12
364	0.16
365	0.16
366	0.14
367	0.14
368	0.13
369	0.13
370	0.13
371	0.11
372	0.06
373	0.05
374	0.05
375	0.05
376	0.05
377	0.04
378	0.04
379	0.04
380	0.05
381	0.05
382	0.06
383	0.06
384	0.06
385	0.07
386	0.07
387	0.07
388	0.08
389	0.09
390	0.12
391	0.17
392	0.22
393	0.29
394	0.3
395	0.33
396	0.35
397	0.38
398	0.44
399	0.43
400	0.46
401	0.47
402	0.54
403	0.56
404	0.6
405	0.58
406	0.51
407	0.53
408	0.5
409	0.43
410	0.35
411	0.32
412	0.29
413	0.27
414	0.25
415	0.2
416	0.16
417	0.16
418	0.16
419	0.14
420	0.11
421	0.1
422	0.09
423	0.09
424	0.09
425	0.07
426	0.08
427	0.11
428	0.12
429	0.13
430	0.16
431	0.17
432	0.2
433	0.24
434	0.27
435	0.28
436	0.31
437	0.31
438	0.28
439	0.27
440	0.25
441	0.23
442	0.19
443	0.16
444	0.13
445	0.13
446	0.15
447	0.16
448	0.18
449	0.15
450	0.14
451	0.13
452	0.12
453	0.12
454	0.1
455	0.09
456	0.06
457	0.06
458	0.06
459	0.06
460	0.06
461	0.05
462	0.06
463	0.05
464	0.06
465	0.06
466	0.05
467	0.07
468	0.07
469	0.08
470	0.09
471	0.09
472	0.1
473	0.1
474	0.11
475	0.09
476	0.09
477	0.09
478	0.11
479	0.14
480	0.14
481	0.16
482	0.16
483	0.16
484	0.18
485	0.21
486	0.26
487	0.32
488	0.38
489	0.4
490	0.43
491	0.45
492	0.47
493	0.46
494	0.4
495	0.34
496	0.29
497	0.26
498	0.22
499	0.19
500	0.16
501	0.13
502	0.11
503	0.09
504	0.07
505	0.06
506	0.06
507	0.07
508	0.08
509	0.09
510	0.14
511	0.17
512	0.2
513	0.25
514	0.27
515	0.28
516	0.3
517	0.32
518	0.31
519	0.29
520	0.27
521	0.23
522	0.23
523	0.22
524	0.18
525	0.16
526	0.12
527	0.09
528	0.07
529	0.07
530	0.04
531	0.04
532	0.04
533	0.04
534	0.05
535	0.05
536	0.05
537	0.06
538	0.06
539	0.07
540	0.08
541	0.08
542	0.12
543	0.14
544	0.15
545	0.2
546	0.26
547	0.27
548	0.33
549	0.38
550	0.41
551	0.41
552	0.46
553	0.46
554	0.45
555	0.5
556	0.49
557	0.45
558	0.41
559	0.46
560	0.48
561	0.46
562	0.41
563	0.34
564	0.3
565	0.31
566	0.27
567	0.21
568	0.13
569	0.12
570	0.14
571	0.13
572	0.12
573	0.1
574	0.09
575	0.08
576	0.09
577	0.07
578	0.07
579	0.07
580	0.08
581	0.09
582	0.1
583	0.11
584	0.11
585	0.14
586	0.17
587	0.2
588	0.29
589	0.36
590	0.38
591	0.45
592	0.55
593	0.61
594	0.63
595	0.68
596	0.64
597	0.58
598	0.57
599	0.5
600	0.4
601	0.4
602	0.37
603	0.35
604	0.38
605	0.41
606	0.43
607	0.46
608	0.48
609	0.41
610	0.4
611	0.35
612	0.31
613	0.33
614	0.39
615	0.41
616	0.39
617	0.4
618	0.49
619	0.55
620	0.6
621	0.62
622	0.64
623	0.68
624	0.78
625	0.85
626	0.86
627	0.82
628	0.78
629	0.7
630	0.68
631	0.63
632	0.55
633	0.46
634	0.45
635	0.45
636	0.46

P13099

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer