Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

P06843

Protein Details
Accession P06843    Localization Confidence High Confidence Score 20.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
208-227QPNRRLKEKLESRKQKSRYQHydrophilic
312-333KREEAWLKKHEEEKRRRKKGIRBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
51-88LKELRRQELLKNGALAKKSGVKRKRGTSSGSEKKKIER
100-124FKRSIGASHAPLKPVVRKKPEPIKK
145-145K
148-173EPVTKERPHFNKPGFKSSKRPQKKAS
312-333KREEAWLKKHEEEKRRRKKGIR
Subcellular Location(s) nucl 24.5, cyto_nucl 13
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR013256  Chromatin_SPT2  
Gene Ontology GO:0005829  C:cytosol  
GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0000217  F:DNA secondary structure binding  
GO:0042393  F:histone binding  
GO:0140713  F:histone chaperone activity  
GO:0006325  P:chromatin organization  
GO:0031507  P:heterochromatin formation  
GO:0000122  P:negative regulation of transcription by RNA polymerase II  
GO:0006355  P:regulation of DNA-templated transcription  
GO:0043631  P:RNA polyadenylation  
GO:0140673  P:transcription elongation-coupled chromatin remodeling  
KEGG sce:YER161C  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF08243  SPT2  
Amino Acid Sequences MSFLSKLSQIRKSTTASKAQVQDPLPKKNDEEYSLLPKNYIRDEDPAVKRLKELRRQELLKNGALAKKSGVKRKRGTSSGSEKKKIERNDDDEGGLGIRFKRSIGASHAPLKPVVRKKPEPIKKMSFEELMKQAENNEKQPPKVKSSEPVTKERPHFNKPGFKSSKRPQKKASPGATLRGVSSGGNSIKSSDSPKPVKLNLPTNGFAQPNRRLKEKLESRKQKSRYQDDYDEEDNDMDDFIEDDEDEGYHSKSKHSNGPGYDRDEIWAMFNRGKKRSEYDYDELEDDDMEANEMEILEEEEMARKMARLEDKREEAWLKKHEEEKRRRKKGIR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.53
2 0.56
3 0.52
4 0.56
5 0.57
6 0.56
7 0.57
8 0.52
9 0.55
10 0.53
11 0.58
12 0.54
13 0.51
14 0.51
15 0.51
16 0.53
17 0.47
18 0.46
19 0.42
20 0.47
21 0.5
22 0.47
23 0.41
24 0.38
25 0.38
26 0.36
27 0.35
28 0.28
29 0.27
30 0.33
31 0.41
32 0.44
33 0.46
34 0.45
35 0.42
36 0.43
37 0.47
38 0.51
39 0.51
40 0.56
41 0.59
42 0.65
43 0.68
44 0.69
45 0.7
46 0.65
47 0.58
48 0.52
49 0.47
50 0.41
51 0.38
52 0.34
53 0.27
54 0.3
55 0.34
56 0.41
57 0.44
58 0.5
59 0.57
60 0.65
61 0.71
62 0.67
63 0.66
64 0.66
65 0.69
66 0.7
67 0.71
68 0.67
69 0.61
70 0.64
71 0.66
72 0.63
73 0.61
74 0.59
75 0.57
76 0.58
77 0.57
78 0.51
79 0.44
80 0.38
81 0.29
82 0.2
83 0.15
84 0.09
85 0.09
86 0.09
87 0.08
88 0.11
89 0.11
90 0.14
91 0.19
92 0.24
93 0.27
94 0.34
95 0.36
96 0.34
97 0.34
98 0.34
99 0.35
100 0.38
101 0.42
102 0.43
103 0.46
104 0.54
105 0.63
106 0.7
107 0.69
108 0.68
109 0.68
110 0.64
111 0.64
112 0.59
113 0.53
114 0.44
115 0.42
116 0.38
117 0.33
118 0.27
119 0.23
120 0.22
121 0.25
122 0.27
123 0.25
124 0.29
125 0.29
126 0.31
127 0.38
128 0.39
129 0.37
130 0.39
131 0.38
132 0.36
133 0.42
134 0.48
135 0.45
136 0.48
137 0.48
138 0.5
139 0.52
140 0.54
141 0.53
142 0.5
143 0.52
144 0.51
145 0.54
146 0.51
147 0.58
148 0.56
149 0.54
150 0.57
151 0.59
152 0.65
153 0.65
154 0.67
155 0.63
156 0.67
157 0.74
158 0.74
159 0.71
160 0.68
161 0.61
162 0.59
163 0.55
164 0.45
165 0.36
166 0.27
167 0.22
168 0.13
169 0.12
170 0.12
171 0.1
172 0.11
173 0.11
174 0.11
175 0.11
176 0.13
177 0.17
178 0.16
179 0.23
180 0.25
181 0.29
182 0.32
183 0.34
184 0.38
185 0.39
186 0.43
187 0.41
188 0.43
189 0.4
190 0.38
191 0.39
192 0.35
193 0.31
194 0.3
195 0.34
196 0.37
197 0.38
198 0.4
199 0.38
200 0.4
201 0.49
202 0.53
203 0.55
204 0.58
205 0.66
206 0.71
207 0.78
208 0.81
209 0.77
210 0.76
211 0.75
212 0.73
213 0.7
214 0.69
215 0.63
216 0.64
217 0.59
218 0.51
219 0.41
220 0.33
221 0.26
222 0.19
223 0.14
224 0.08
225 0.06
226 0.05
227 0.05
228 0.05
229 0.04
230 0.05
231 0.05
232 0.05
233 0.06
234 0.07
235 0.07
236 0.11
237 0.11
238 0.14
239 0.19
240 0.23
241 0.3
242 0.35
243 0.41
244 0.42
245 0.5
246 0.52
247 0.52
248 0.51
249 0.43
250 0.38
251 0.33
252 0.29
253 0.24
254 0.24
255 0.21
256 0.23
257 0.28
258 0.33
259 0.36
260 0.39
261 0.4
262 0.41
263 0.47
264 0.5
265 0.54
266 0.52
267 0.52
268 0.51
269 0.48
270 0.42
271 0.35
272 0.27
273 0.19
274 0.15
275 0.1
276 0.08
277 0.07
278 0.07
279 0.07
280 0.07
281 0.06
282 0.05
283 0.06
284 0.06
285 0.06
286 0.06
287 0.09
288 0.09
289 0.1
290 0.1
291 0.1
292 0.11
293 0.18
294 0.28
295 0.31
296 0.39
297 0.47
298 0.52
299 0.52
300 0.57
301 0.56
302 0.52
303 0.54
304 0.54
305 0.52
306 0.53
307 0.6
308 0.63
309 0.68
310 0.74
311 0.77
312 0.81
313 0.85