Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

Q12216

Protein Details
Accession Q12216    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
663-683GDDGKIRKRRHSNVSIYIPKNHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 22, cyto 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR023321  PINIT  
IPR038654  PINIT_sf  
IPR003034  SAP_dom  
IPR036361  SAP_dom_sf  
IPR031141  SIZ1/2_SP-RING  
IPR004181  Znf_MIZ  
IPR013083  Znf_RING/FYVE/PHD  
Gene Ontology GO:0000785  C:chromatin  
GO:0005737  C:cytoplasm  
GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003690  F:double-stranded DNA binding  
GO:0061665  F:SUMO ligase activity  
GO:0019789  F:SUMO transferase activity  
GO:0008270  F:zinc ion binding  
GO:0007059  P:chromosome segregation  
GO:1990683  P:DNA double-strand break attachment to nuclear envelope  
GO:0016925  P:protein sumoylation  
KEGG sce:YOR156C  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF14324  PINIT  
PF02037  SAP  
PF02891  zf-MIZ  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51466  PINIT  
PS50800  SAP  
PS51044  ZF_SP_RING  
CDD cd16793  SP-RING_ScSiz-like  
Amino Acid Sequences MASVMSNNNNNNNNNNASYMFTNPLSNTGGGLINEIKDAINEMEQLKVLELKQICKSLDLSITGKKAVLQDRIKQFLRKSCDIGHIDPWRPKAIKILIAKVRINSSLPKYSTLWETLKTGAFKHPVASGQLPVTALQSTALPPYSQQQALAYSFTSPFYKPIVQIPDANKKLKQSAGRGCTKMKFKVSKSNHDLLKSNKSYKLYLFSGFSIPFIYETVGHEAIDFPYPCELVFNGTKLEDNVKGLKKQNGTGNPANLTPYLKVPTEMNHLDLHYLNIDKEYSISCFIVEVFSPEALLGKILKRPKIIKQATTAYIKRTLNEQDDDDIITTSTVLSLQCPISCTRMKYPAKTDQCKHIQCFDALWFLHSQSQVPTWQCPICQHPIKFDQLKISEFVDNIIQNCNEDVEQVEISVDGSWKPIHNSSAVITDTVNQNHSVKNENQGTVKQEQDYDSRNAFDTNLRNGSNHNEPEIISLDSSDDEAFIPASKSFPTHVNPRNDQLRADIFPSESEGSSDYNPNHTSTPKGSPTMDQDNYQDAFQMRSFLNQGATTNINDTPTNNSSINSFVTATNGDSRIFYNRGPSTPLLPAVLQNLTNQTEAQRNPYGPNYNTTAQDRNLLGIEGDLPPIPPVDPNSEAETELPTRTTSAAHLPPYIHVSTSGHGDDGKIRKRRHSNVSIYIPKNPYATLMKRRPQANHAIMNKTLAQTNDFNTSAQDNSEVVDLTSD
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.42
2 0.4
3 0.33
4 0.3
5 0.29
6 0.28
7 0.26
8 0.23
9 0.24
10 0.22
11 0.25
12 0.25
13 0.22
14 0.2
15 0.18
16 0.19
17 0.17
18 0.19
19 0.18
20 0.15
21 0.15
22 0.16
23 0.13
24 0.11
25 0.13
26 0.12
27 0.12
28 0.14
29 0.14
30 0.15
31 0.16
32 0.16
33 0.15
34 0.16
35 0.15
36 0.19
37 0.21
38 0.24
39 0.29
40 0.34
41 0.33
42 0.32
43 0.33
44 0.3
45 0.32
46 0.31
47 0.29
48 0.3
49 0.32
50 0.3
51 0.29
52 0.28
53 0.3
54 0.32
55 0.39
56 0.39
57 0.46
58 0.53
59 0.6
60 0.61
61 0.61
62 0.61
63 0.59
64 0.62
65 0.58
66 0.54
67 0.51
68 0.56
69 0.55
70 0.52
71 0.53
72 0.52
73 0.54
74 0.55
75 0.54
76 0.52
77 0.48
78 0.46
79 0.46
80 0.43
81 0.44
82 0.45
83 0.51
84 0.5
85 0.55
86 0.56
87 0.5
88 0.48
89 0.42
90 0.39
91 0.36
92 0.36
93 0.38
94 0.37
95 0.38
96 0.37
97 0.37
98 0.38
99 0.38
100 0.34
101 0.28
102 0.28
103 0.28
104 0.3
105 0.28
106 0.27
107 0.28
108 0.29
109 0.28
110 0.27
111 0.27
112 0.25
113 0.29
114 0.28
115 0.24
116 0.21
117 0.22
118 0.21
119 0.19
120 0.18
121 0.13
122 0.11
123 0.09
124 0.09
125 0.09
126 0.1
127 0.11
128 0.09
129 0.1
130 0.14
131 0.18
132 0.18
133 0.17
134 0.17
135 0.2
136 0.21
137 0.21
138 0.18
139 0.15
140 0.15
141 0.16
142 0.17
143 0.14
144 0.14
145 0.18
146 0.19
147 0.19
148 0.25
149 0.29
150 0.29
151 0.35
152 0.39
153 0.46
154 0.48
155 0.5
156 0.46
157 0.43
158 0.45
159 0.44
160 0.44
161 0.42
162 0.47
163 0.52
164 0.57
165 0.57
166 0.58
167 0.59
168 0.59
169 0.56
170 0.55
171 0.55
172 0.52
173 0.6
174 0.62
175 0.67
176 0.68
177 0.69
178 0.64
179 0.6
180 0.6
181 0.55
182 0.58
183 0.53
184 0.51
185 0.48
186 0.46
187 0.45
188 0.43
189 0.43
190 0.35
191 0.32
192 0.29
193 0.26
194 0.27
195 0.24
196 0.22
197 0.17
198 0.14
199 0.12
200 0.11
201 0.1
202 0.08
203 0.09
204 0.14
205 0.14
206 0.14
207 0.13
208 0.14
209 0.14
210 0.17
211 0.16
212 0.11
213 0.12
214 0.12
215 0.12
216 0.12
217 0.11
218 0.11
219 0.12
220 0.12
221 0.12
222 0.13
223 0.13
224 0.13
225 0.16
226 0.13
227 0.14
228 0.2
229 0.22
230 0.27
231 0.31
232 0.36
233 0.35
234 0.38
235 0.43
236 0.42
237 0.46
238 0.45
239 0.44
240 0.4
241 0.38
242 0.35
243 0.28
244 0.24
245 0.17
246 0.16
247 0.15
248 0.14
249 0.15
250 0.14
251 0.15
252 0.21
253 0.2
254 0.2
255 0.18
256 0.18
257 0.19
258 0.18
259 0.17
260 0.11
261 0.11
262 0.09
263 0.09
264 0.09
265 0.07
266 0.08
267 0.08
268 0.08
269 0.1
270 0.09
271 0.09
272 0.09
273 0.09
274 0.09
275 0.08
276 0.08
277 0.07
278 0.07
279 0.07
280 0.07
281 0.07
282 0.06
283 0.07
284 0.06
285 0.07
286 0.12
287 0.15
288 0.18
289 0.22
290 0.25
291 0.32
292 0.42
293 0.44
294 0.43
295 0.45
296 0.48
297 0.48
298 0.51
299 0.45
300 0.36
301 0.4
302 0.37
303 0.31
304 0.3
305 0.3
306 0.28
307 0.28
308 0.26
309 0.2
310 0.21
311 0.2
312 0.17
313 0.13
314 0.09
315 0.07
316 0.06
317 0.05
318 0.04
319 0.04
320 0.04
321 0.04
322 0.06
323 0.07
324 0.07
325 0.09
326 0.09
327 0.13
328 0.15
329 0.17
330 0.19
331 0.29
332 0.31
333 0.33
334 0.38
335 0.44
336 0.51
337 0.54
338 0.53
339 0.52
340 0.58
341 0.58
342 0.54
343 0.49
344 0.41
345 0.35
346 0.34
347 0.27
348 0.22
349 0.18
350 0.17
351 0.13
352 0.12
353 0.14
354 0.13
355 0.13
356 0.09
357 0.11
358 0.13
359 0.14
360 0.15
361 0.15
362 0.15
363 0.16
364 0.17
365 0.19
366 0.23
367 0.29
368 0.28
369 0.3
370 0.33
371 0.39
372 0.39
373 0.36
374 0.34
375 0.3
376 0.3
377 0.27
378 0.25
379 0.2
380 0.18
381 0.17
382 0.14
383 0.12
384 0.12
385 0.13
386 0.11
387 0.1
388 0.1
389 0.1
390 0.08
391 0.07
392 0.07
393 0.07
394 0.07
395 0.06
396 0.06
397 0.05
398 0.06
399 0.06
400 0.06
401 0.04
402 0.05
403 0.06
404 0.07
405 0.09
406 0.1
407 0.11
408 0.11
409 0.12
410 0.12
411 0.15
412 0.15
413 0.13
414 0.12
415 0.13
416 0.15
417 0.15
418 0.15
419 0.13
420 0.13
421 0.15
422 0.16
423 0.19
424 0.17
425 0.24
426 0.26
427 0.26
428 0.27
429 0.27
430 0.3
431 0.29
432 0.29
433 0.22
434 0.2
435 0.2
436 0.22
437 0.24
438 0.23
439 0.22
440 0.21
441 0.21
442 0.2
443 0.19
444 0.2
445 0.2
446 0.21
447 0.24
448 0.23
449 0.23
450 0.24
451 0.28
452 0.3
453 0.27
454 0.24
455 0.2
456 0.2
457 0.22
458 0.23
459 0.18
460 0.11
461 0.11
462 0.1
463 0.09
464 0.1
465 0.07
466 0.06
467 0.06
468 0.06
469 0.06
470 0.06
471 0.07
472 0.06
473 0.07
474 0.07
475 0.08
476 0.09
477 0.13
478 0.17
479 0.25
480 0.33
481 0.4
482 0.43
483 0.48
484 0.53
485 0.5
486 0.47
487 0.41
488 0.37
489 0.31
490 0.29
491 0.24
492 0.18
493 0.17
494 0.2
495 0.17
496 0.13
497 0.12
498 0.12
499 0.13
500 0.14
501 0.17
502 0.15
503 0.18
504 0.19
505 0.2
506 0.21
507 0.2
508 0.22
509 0.23
510 0.29
511 0.27
512 0.29
513 0.29
514 0.3
515 0.35
516 0.4
517 0.38
518 0.33
519 0.32
520 0.34
521 0.33
522 0.3
523 0.26
524 0.18
525 0.19
526 0.17
527 0.18
528 0.14
529 0.15
530 0.17
531 0.16
532 0.17
533 0.16
534 0.16
535 0.16
536 0.18
537 0.16
538 0.17
539 0.16
540 0.16
541 0.15
542 0.16
543 0.2
544 0.2
545 0.23
546 0.21
547 0.21
548 0.2
549 0.22
550 0.22
551 0.16
552 0.16
553 0.12
554 0.13
555 0.14
556 0.15
557 0.16
558 0.16
559 0.15
560 0.15
561 0.16
562 0.2
563 0.21
564 0.2
565 0.24
566 0.26
567 0.27
568 0.3
569 0.3
570 0.29
571 0.29
572 0.3
573 0.24
574 0.21
575 0.21
576 0.2
577 0.2
578 0.17
579 0.16
580 0.19
581 0.19
582 0.19
583 0.18
584 0.18
585 0.22
586 0.23
587 0.28
588 0.28
589 0.28
590 0.31
591 0.37
592 0.41
593 0.36
594 0.39
595 0.39
596 0.37
597 0.4
598 0.41
599 0.39
600 0.33
601 0.37
602 0.33
603 0.29
604 0.27
605 0.23
606 0.18
607 0.14
608 0.15
609 0.1
610 0.11
611 0.09
612 0.09
613 0.09
614 0.1
615 0.1
616 0.1
617 0.12
618 0.17
619 0.2
620 0.22
621 0.26
622 0.27
623 0.27
624 0.26
625 0.27
626 0.23
627 0.21
628 0.19
629 0.15
630 0.15
631 0.15
632 0.15
633 0.14
634 0.2
635 0.24
636 0.25
637 0.28
638 0.27
639 0.29
640 0.33
641 0.31
642 0.24
643 0.21
644 0.2
645 0.19
646 0.23
647 0.21
648 0.17
649 0.16
650 0.17
651 0.23
652 0.3
653 0.37
654 0.41
655 0.44
656 0.53
657 0.64
658 0.71
659 0.74
660 0.75
661 0.76
662 0.77
663 0.84
664 0.84
665 0.76
666 0.76
667 0.68
668 0.61
669 0.53
670 0.43
671 0.38
672 0.37
673 0.42
674 0.45
675 0.52
676 0.57
677 0.62
678 0.68
679 0.69
680 0.67
681 0.69
682 0.67
683 0.67
684 0.66
685 0.64
686 0.59
687 0.57
688 0.53
689 0.44
690 0.38
691 0.3
692 0.28
693 0.26
694 0.28
695 0.31
696 0.29
697 0.28
698 0.27
699 0.28
700 0.24
701 0.22
702 0.21
703 0.15
704 0.15
705 0.16
706 0.14