FuNGI

P38922

Protein Details

Accession

P38922

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

11.5

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
7-32	GSENNNRSRSRSRSPVRRRMSDDHGY	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Subcellular Location(s)

nucl 26.5, cyto_nucl 14

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR012677 Nucleotide-bd_a/b_plait_sf IPR035979 RBD_domain_sf IPR000504 RRM_dom
Gene Ontology	GO:0005737 C:cytoplasm GO:0010494 C:cytoplasmic stress granule GO:0005634 C:nucleus GO:0000932 C:P-body GO:0003682 F:chromatin binding GO:0003729 F:mRNA binding GO:0003723 F:RNA binding GO:0071028 P:nuclear mRNA surveillance
KEGG	sce:YNL004W -
Pfam	View protein in Pfam PF00076 RRM_1
PROSITE	View protein in PROSITE PS50102 RRM
CDD	cd21605 RRM1_HRB1_GBP2 cd21606 RRM2_HRB1_GBP2 cd21607 RRM3_HRB1_GBP2

Amino Acid Sequences

MSDQERGSENNNRSRSRSRSPVRRRMSDDHGYERDNHLSRRSGNYNGRRKFADTYRGSRDRGEYRGGRERSDYRERERFNNRDNPRSRDRYDDRRRGRDVTGRYGNRRDDYPRSFRSRHNTRDDSRRGGFGSSGARGDYGPLLARELDSTYEEKVNRNYSNSIFVGNLTYDSTPEDLTEFFSQIGKVVRADIITSRGHHRGMGTVEFTNSDDVDRAIRQYDGAFFMDRKIFVRQDNPPPSNNIKERKALDRGELRHNRKTHEVIVKNLPASVNWQALKDIFKECGNVAHADVELDGDGVSTGSGTVSFYDIKDLHRAIEKYNGYSIEGNVLDVKSKESVHNHSDGDDVDIPMDDSPVNEEARKFTENVVGGGERNRLIYCSNLPFSTAKSDLYDLFETIGKVNNAELRYDSKGAPTGIAVVEYDNVDDADVCIERLNNYNYGGCDLDISYAKRL

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.63
2	0.66
3	0.66
4	0.69
5	0.7
6	0.74
7	0.81
8	0.86
9	0.86
10	0.87
11	0.86
12	0.83
13	0.81
14	0.79
15	0.74
16	0.72
17	0.67
18	0.6
19	0.55
20	0.52
21	0.52
22	0.47
23	0.44
24	0.4
25	0.42
26	0.44
27	0.49
28	0.49
29	0.5
30	0.55
31	0.63
32	0.68
33	0.67
34	0.68
35	0.62
36	0.62
37	0.6
38	0.57
39	0.57
40	0.53
41	0.55
42	0.61
43	0.64
44	0.62
45	0.58
46	0.58
47	0.53
48	0.5
49	0.51
50	0.45
51	0.47
52	0.56
53	0.54
54	0.49
55	0.5
56	0.51
57	0.51
58	0.57
59	0.55
60	0.53
61	0.61
62	0.62
63	0.65
64	0.7
65	0.69
66	0.68
67	0.72
68	0.7
69	0.71
70	0.74
71	0.72
72	0.72
73	0.72
74	0.66
75	0.66
76	0.67
77	0.68
78	0.73
79	0.76
80	0.76
81	0.77
82	0.79
83	0.73
84	0.71
85	0.68
86	0.62
87	0.61
88	0.62
89	0.6
90	0.61
91	0.64
92	0.63
93	0.57
94	0.55
95	0.51
96	0.5
97	0.52
98	0.54
99	0.55
100	0.58
101	0.6
102	0.62
103	0.67
104	0.67
105	0.68
106	0.7
107	0.7
108	0.68
109	0.75
110	0.74
111	0.71
112	0.63
113	0.57
114	0.48
115	0.41
116	0.35
117	0.28
118	0.25
119	0.19
120	0.18
121	0.15
122	0.15
123	0.14
124	0.14
125	0.12
126	0.09
127	0.09
128	0.08
129	0.09
130	0.09
131	0.09
132	0.09
133	0.09
134	0.09
135	0.1
136	0.11
137	0.12
138	0.16
139	0.17
140	0.19
141	0.22
142	0.27
143	0.27
144	0.28
145	0.3
146	0.27
147	0.31
148	0.29
149	0.26
150	0.2
151	0.18
152	0.17
153	0.14
154	0.13
155	0.09
156	0.09
157	0.08
158	0.09
159	0.09
160	0.08
161	0.08
162	0.08
163	0.07
164	0.1
165	0.11
166	0.1
167	0.1
168	0.1
169	0.1
170	0.11
171	0.13
172	0.1
173	0.09
174	0.1
175	0.1
176	0.09
177	0.1
178	0.09
179	0.11
180	0.12
181	0.13
182	0.16
183	0.17
184	0.18
185	0.18
186	0.17
187	0.17
188	0.18
189	0.18
190	0.16
191	0.14
192	0.14
193	0.14
194	0.14
195	0.12
196	0.1
197	0.08
198	0.07
199	0.07
200	0.08
201	0.07
202	0.07
203	0.07
204	0.07
205	0.07
206	0.08
207	0.08
208	0.09
209	0.1
210	0.1
211	0.09
212	0.11
213	0.12
214	0.12
215	0.12
216	0.13
217	0.14
218	0.15
219	0.2
220	0.24
221	0.33
222	0.41
223	0.41
224	0.39
225	0.42
226	0.44
227	0.46
228	0.47
229	0.43
230	0.38
231	0.41
232	0.43
233	0.43
234	0.46
235	0.4
236	0.4
237	0.4
238	0.4
239	0.46
240	0.52
241	0.53
242	0.54
243	0.54
244	0.51
245	0.49
246	0.49
247	0.46
248	0.46
249	0.43
250	0.4
251	0.44
252	0.44
253	0.39
254	0.37
255	0.3
256	0.2
257	0.21
258	0.2
259	0.19
260	0.17
261	0.17
262	0.17
263	0.18
264	0.2
265	0.18
266	0.16
267	0.14
268	0.13
269	0.14
270	0.14
271	0.16
272	0.16
273	0.15
274	0.14
275	0.13
276	0.12
277	0.11
278	0.11
279	0.08
280	0.06
281	0.05
282	0.05
283	0.03
284	0.03
285	0.03
286	0.03
287	0.03
288	0.03
289	0.03
290	0.03
291	0.03
292	0.04
293	0.05
294	0.06
295	0.07
296	0.11
297	0.11
298	0.13
299	0.17
300	0.17
301	0.17
302	0.23
303	0.24
304	0.21
305	0.29
306	0.29
307	0.26
308	0.29
309	0.28
310	0.24
311	0.24
312	0.23
313	0.18
314	0.17
315	0.16
316	0.14
317	0.14
318	0.13
319	0.13
320	0.14
321	0.12
322	0.13
323	0.17
324	0.2
325	0.26
326	0.29
327	0.33
328	0.31
329	0.3
330	0.3
331	0.26
332	0.26
333	0.22
334	0.18
335	0.14
336	0.14
337	0.13
338	0.12
339	0.12
340	0.07
341	0.06
342	0.08
343	0.1
344	0.12
345	0.13
346	0.13
347	0.16
348	0.2
349	0.22
350	0.2
351	0.19
352	0.24
353	0.24
354	0.23
355	0.23
356	0.2
357	0.2
358	0.21
359	0.22
360	0.17
361	0.17
362	0.17
363	0.15
364	0.15
365	0.18
366	0.2
367	0.24
368	0.26
369	0.25
370	0.27
371	0.27
372	0.28
373	0.31
374	0.27
375	0.22
376	0.22
377	0.23
378	0.22
379	0.27
380	0.26
381	0.2
382	0.2
383	0.2
384	0.19
385	0.18
386	0.21
387	0.16
388	0.15
389	0.17
390	0.21
391	0.2
392	0.2
393	0.22
394	0.21
395	0.26
396	0.28
397	0.27
398	0.25
399	0.28
400	0.27
401	0.26
402	0.21
403	0.19
404	0.17
405	0.17
406	0.14
407	0.11
408	0.12
409	0.11
410	0.11
411	0.09
412	0.09
413	0.08
414	0.08
415	0.07
416	0.09
417	0.09
418	0.09
419	0.09
420	0.1
421	0.12
422	0.18
423	0.21
424	0.21
425	0.23
426	0.26
427	0.26
428	0.28
429	0.27
430	0.21
431	0.2
432	0.17
433	0.19
434	0.2

P38922

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer