Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

P36009

Protein Details
Accession P36009    Localization Confidence Medium Confidence Score 10.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
4-34NSNSRVASNHTSKKQKVRRNIHPFTNNTRIKHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 16, mito 5, cyto 3, pero 3, cyto_pero 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR011709  DEAD-box_helicase_OB_fold  
IPR011545  DEAD/DEAH_box_helicase_dom  
IPR002464  DNA/RNA_helicase_DEAH_CS  
IPR007502  Helicase-assoc_dom  
IPR014001  Helicase_ATP-bd  
IPR001650  Helicase_C  
IPR027417  P-loop_NTPase  
Gene Ontology GO:0005730  C:nucleolus  
GO:0005654  C:nucleoplasm  
GO:0032040  C:small-subunit processome  
GO:0005524  F:ATP binding  
GO:0016887  F:ATP hydrolysis activity  
GO:0004386  F:helicase activity  
GO:0042802  F:identical protein binding  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0003724  F:RNA helicase activity  
GO:0030490  P:maturation of SSU-rRNA  
GO:0000462  P:maturation of SSU-rRNA from tricistronic rRNA transcript (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA)  
GO:0042254  P:ribosome biogenesis  
KEGG sce:YKL078W  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00270  DEAD  
PF04408  HA2  
PF00271  Helicase_C  
PF07717  OB_NTP_bind  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS00690  DEAH_ATP_HELICASE  
PS51192  HELICASE_ATP_BIND_1  
PS51194  HELICASE_CTER  
CDD cd17917  DEXHc_RHA-like  
cd18791  SF2_C_RHA  
Amino Acid Sequences MAANSNSRVASNHTSKKQKVRRNIHPFTNNTRIKRASKIVKFNDSGEGDHVSDQRSNKENVLTYKSLKSRASDLLKMRETLPVYQHKREIMSYIESNPVTVLIGETGSGKSTQIPQFVLEKLYDTKKHGSIAVTQPRRVAAINLATRVAQEHGCKLGEQVGYSVRFDNTTTTRTRLKYLTDGMLLRELMMNSDLREYSVIVIDEAHERTVLTDLILGFLKSLIQGPRPDLRIIVMSATLQAEKFSEFFNNAPILFVEGRKFDVKQYYLKAPTDDIVDAVIRCCIQINQGEELGDILCFLPGQEEIDKAVTIMEKIAKYVSDEAPVPLIVPYPLYAALPAVQQSLVFAPIKGFKRKVVFSTNIAETSVTISGVKFVVDSGLRKVKVWRHQLGLATLLTVPISQASAMQRSGRAGRESEGKSFRLYCESDYVKLPKQSEPEIARSDVTSPVLMLKRYGVDDLLNWTWFENPGKEAIVMGLQELYELGALDTRGKITKRGQQMALLPLQPHLSSVLIKASEVGCLSQVIDIVSCLSVENLLLNPSPEERDEVNERRLSLCNAGKRYGDLIMLKELFDIYFYELGKSQDASSERNDWCKGLCISIRGFKNVIRVRDQLRVYCKRLFSSISEEDEESKKIGEDGELISKILKCFLTGFIKNTAIGMPDRSYRTVSTGEPISIHPSSMLFMNKSCPGIMYTEYVFTTKGYARNVSRIELSWLQEVVTNAAAVAKQKVSDSK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.61
2 0.67
3 0.77
4 0.8
5 0.81
6 0.82
7 0.83
8 0.86
9 0.87
10 0.89
11 0.88
12 0.87
13 0.84
14 0.82
15 0.83
16 0.79
17 0.72
18 0.72
19 0.68
20 0.63
21 0.64
22 0.65
23 0.65
24 0.67
25 0.73
26 0.73
27 0.75
28 0.73
29 0.67
30 0.65
31 0.57
32 0.49
33 0.41
34 0.36
35 0.28
36 0.29
37 0.29
38 0.23
39 0.26
40 0.27
41 0.31
42 0.32
43 0.34
44 0.33
45 0.37
46 0.4
47 0.41
48 0.47
49 0.44
50 0.43
51 0.49
52 0.5
53 0.51
54 0.48
55 0.45
56 0.43
57 0.48
58 0.51
59 0.5
60 0.52
61 0.55
62 0.55
63 0.53
64 0.49
65 0.46
66 0.41
67 0.38
68 0.39
69 0.4
70 0.44
71 0.48
72 0.51
73 0.48
74 0.49
75 0.46
76 0.41
77 0.34
78 0.34
79 0.31
80 0.29
81 0.32
82 0.29
83 0.28
84 0.26
85 0.22
86 0.16
87 0.13
88 0.11
89 0.06
90 0.06
91 0.06
92 0.08
93 0.08
94 0.08
95 0.09
96 0.08
97 0.1
98 0.18
99 0.21
100 0.23
101 0.23
102 0.25
103 0.28
104 0.29
105 0.28
106 0.21
107 0.2
108 0.22
109 0.28
110 0.29
111 0.3
112 0.34
113 0.35
114 0.37
115 0.36
116 0.34
117 0.35
118 0.41
119 0.47
120 0.47
121 0.46
122 0.45
123 0.43
124 0.43
125 0.36
126 0.28
127 0.23
128 0.26
129 0.28
130 0.28
131 0.27
132 0.26
133 0.25
134 0.25
135 0.21
136 0.16
137 0.15
138 0.16
139 0.18
140 0.19
141 0.19
142 0.18
143 0.22
144 0.2
145 0.19
146 0.18
147 0.2
148 0.21
149 0.22
150 0.22
151 0.17
152 0.17
153 0.17
154 0.2
155 0.18
156 0.21
157 0.22
158 0.25
159 0.31
160 0.32
161 0.35
162 0.32
163 0.33
164 0.35
165 0.37
166 0.36
167 0.33
168 0.33
169 0.3
170 0.3
171 0.26
172 0.2
173 0.18
174 0.14
175 0.12
176 0.12
177 0.11
178 0.09
179 0.12
180 0.11
181 0.1
182 0.11
183 0.1
184 0.1
185 0.11
186 0.11
187 0.09
188 0.09
189 0.1
190 0.12
191 0.12
192 0.11
193 0.09
194 0.09
195 0.09
196 0.11
197 0.1
198 0.07
199 0.08
200 0.08
201 0.09
202 0.1
203 0.09
204 0.07
205 0.07
206 0.07
207 0.06
208 0.09
209 0.1
210 0.13
211 0.15
212 0.18
213 0.23
214 0.26
215 0.25
216 0.22
217 0.22
218 0.2
219 0.19
220 0.16
221 0.11
222 0.09
223 0.1
224 0.1
225 0.1
226 0.08
227 0.07
228 0.07
229 0.08
230 0.08
231 0.08
232 0.09
233 0.1
234 0.1
235 0.12
236 0.13
237 0.12
238 0.12
239 0.11
240 0.13
241 0.13
242 0.13
243 0.12
244 0.12
245 0.14
246 0.15
247 0.16
248 0.15
249 0.21
250 0.22
251 0.25
252 0.28
253 0.32
254 0.35
255 0.36
256 0.34
257 0.29
258 0.27
259 0.25
260 0.21
261 0.14
262 0.11
263 0.11
264 0.1
265 0.09
266 0.09
267 0.06
268 0.06
269 0.07
270 0.06
271 0.08
272 0.12
273 0.14
274 0.15
275 0.16
276 0.16
277 0.15
278 0.16
279 0.13
280 0.09
281 0.06
282 0.05
283 0.04
284 0.04
285 0.04
286 0.04
287 0.04
288 0.06
289 0.06
290 0.07
291 0.08
292 0.09
293 0.08
294 0.08
295 0.08
296 0.07
297 0.06
298 0.07
299 0.09
300 0.08
301 0.09
302 0.09
303 0.09
304 0.1
305 0.14
306 0.13
307 0.12
308 0.12
309 0.12
310 0.13
311 0.12
312 0.11
313 0.08
314 0.07
315 0.05
316 0.05
317 0.05
318 0.05
319 0.06
320 0.05
321 0.05
322 0.05
323 0.06
324 0.06
325 0.06
326 0.06
327 0.05
328 0.05
329 0.06
330 0.06
331 0.07
332 0.07
333 0.06
334 0.07
335 0.13
336 0.17
337 0.2
338 0.21
339 0.23
340 0.27
341 0.29
342 0.31
343 0.31
344 0.31
345 0.3
346 0.33
347 0.3
348 0.26
349 0.25
350 0.21
351 0.15
352 0.14
353 0.11
354 0.07
355 0.06
356 0.05
357 0.06
358 0.06
359 0.06
360 0.04
361 0.04
362 0.05
363 0.06
364 0.07
365 0.1
366 0.15
367 0.15
368 0.16
369 0.2
370 0.25
371 0.33
372 0.4
373 0.4
374 0.38
375 0.4
376 0.41
377 0.38
378 0.34
379 0.25
380 0.18
381 0.14
382 0.11
383 0.08
384 0.07
385 0.06
386 0.04
387 0.04
388 0.03
389 0.05
390 0.06
391 0.08
392 0.09
393 0.1
394 0.1
395 0.12
396 0.15
397 0.15
398 0.15
399 0.15
400 0.15
401 0.23
402 0.24
403 0.28
404 0.28
405 0.27
406 0.27
407 0.27
408 0.26
409 0.23
410 0.22
411 0.17
412 0.21
413 0.21
414 0.22
415 0.24
416 0.27
417 0.26
418 0.29
419 0.3
420 0.27
421 0.28
422 0.29
423 0.33
424 0.32
425 0.33
426 0.32
427 0.31
428 0.28
429 0.25
430 0.24
431 0.19
432 0.16
433 0.11
434 0.09
435 0.12
436 0.14
437 0.14
438 0.12
439 0.12
440 0.13
441 0.13
442 0.14
443 0.1
444 0.09
445 0.09
446 0.14
447 0.14
448 0.13
449 0.12
450 0.12
451 0.12
452 0.14
453 0.14
454 0.11
455 0.1
456 0.11
457 0.12
458 0.12
459 0.11
460 0.09
461 0.09
462 0.08
463 0.07
464 0.06
465 0.05
466 0.05
467 0.05
468 0.05
469 0.03
470 0.04
471 0.03
472 0.04
473 0.05
474 0.06
475 0.06
476 0.07
477 0.11
478 0.11
479 0.16
480 0.21
481 0.28
482 0.35
483 0.4
484 0.4
485 0.41
486 0.44
487 0.43
488 0.41
489 0.35
490 0.27
491 0.23
492 0.23
493 0.19
494 0.16
495 0.13
496 0.1
497 0.09
498 0.1
499 0.12
500 0.11
501 0.11
502 0.12
503 0.11
504 0.11
505 0.11
506 0.1
507 0.08
508 0.08
509 0.09
510 0.07
511 0.08
512 0.06
513 0.06
514 0.06
515 0.06
516 0.06
517 0.06
518 0.05
519 0.05
520 0.05
521 0.05
522 0.05
523 0.05
524 0.07
525 0.07
526 0.07
527 0.08
528 0.1
529 0.11
530 0.11
531 0.14
532 0.13
533 0.18
534 0.25
535 0.29
536 0.34
537 0.34
538 0.34
539 0.34
540 0.35
541 0.33
542 0.32
543 0.33
544 0.34
545 0.35
546 0.37
547 0.35
548 0.35
549 0.34
550 0.28
551 0.26
552 0.21
553 0.19
554 0.22
555 0.22
556 0.2
557 0.18
558 0.17
559 0.14
560 0.13
561 0.12
562 0.09
563 0.12
564 0.12
565 0.13
566 0.15
567 0.16
568 0.17
569 0.17
570 0.14
571 0.17
572 0.18
573 0.2
574 0.22
575 0.28
576 0.29
577 0.34
578 0.34
579 0.3
580 0.29
581 0.32
582 0.29
583 0.26
584 0.27
585 0.25
586 0.27
587 0.34
588 0.35
589 0.33
590 0.33
591 0.3
592 0.38
593 0.4
594 0.41
595 0.39
596 0.42
597 0.43
598 0.49
599 0.5
600 0.46
601 0.51
602 0.55
603 0.54
604 0.55
605 0.53
606 0.48
607 0.48
608 0.45
609 0.38
610 0.39
611 0.39
612 0.37
613 0.37
614 0.36
615 0.36
616 0.35
617 0.33
618 0.25
619 0.2
620 0.16
621 0.14
622 0.14
623 0.11
624 0.12
625 0.13
626 0.18
627 0.18
628 0.18
629 0.2
630 0.21
631 0.21
632 0.22
633 0.19
634 0.14
635 0.15
636 0.21
637 0.28
638 0.29
639 0.31
640 0.33
641 0.35
642 0.34
643 0.33
644 0.27
645 0.21
646 0.2
647 0.2
648 0.17
649 0.21
650 0.25
651 0.26
652 0.28
653 0.27
654 0.29
655 0.29
656 0.27
657 0.27
658 0.26
659 0.25
660 0.24
661 0.24
662 0.27
663 0.24
664 0.23
665 0.18
666 0.16
667 0.16
668 0.18
669 0.21
670 0.16
671 0.17
672 0.22
673 0.24
674 0.25
675 0.24
676 0.22
677 0.19
678 0.21
679 0.22
680 0.21
681 0.19
682 0.2
683 0.21
684 0.21
685 0.2
686 0.17
687 0.19
688 0.19
689 0.23
690 0.24
691 0.31
692 0.34
693 0.42
694 0.44
695 0.43
696 0.42
697 0.38
698 0.41
699 0.39
700 0.38
701 0.33
702 0.31
703 0.28
704 0.28
705 0.28
706 0.23
707 0.19
708 0.15
709 0.12
710 0.13
711 0.14
712 0.13
713 0.16
714 0.15
715 0.15