Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

P25441

Protein Details
Accession P25441    Localization Confidence High Confidence Score 23.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
25-46KPSLKFKPKAVARKSKEEREAAHydrophilic
53-75EEESKRGNDKKHFNNKNKRVTGAHydrophilic
328-355METQASDPSKKKKNIKKKDTKDALSTREHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
24-71AKPSLKFKPKAVARKSKEEREAAASKVKLEEESKRGNDKKHFNNKNKR
337-346KKKKNIKKKD
Subcellular Location(s) nucl 23, cyto 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR007811  RPC4  
Gene Ontology GO:0005654  C:nucleoplasm  
GO:0005634  C:nucleus  
GO:0005666  C:RNA polymerase III complex  
GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0006386  P:termination of RNA polymerase III transcription  
GO:0006383  P:transcription by RNA polymerase III  
GO:0006384  P:transcription initiation at RNA polymerase III promoter  
GO:0042797  P:tRNA transcription by RNA polymerase III  
KEGG sce:YDL150W  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF05132  RNA_pol_Rpc4  
Amino Acid Sequences MSSNKGNGRLPSLKDSSSNGGGSAKPSLKFKPKAVARKSKEEREAAASKVKLEEESKRGNDKKHFNNKNKRVTGAGGQQRRMAKYLNNTHVISSGPLAAGNFVSEKGDLRRGFIKSEGSGSSLVQKGLETIDNGAESSENEAEDDDNEGVASKSKKKFNMGKEFEARNLIEDEDDGESEKSSDVDMDDEEWRSKRIEQLFPVRPVRVRHEDVETVKREIQEALSEKPTREPTPSVKTEPVGTGLQSYLEERERQVNEKLADLGLEKEFQSVDGKEAAAELELLNADHQHILRKLKKMNNKPERFMVFQLPTRLPAFERPAVKEEKEDMETQASDPSKKKKNIKKKDTKDALSTRELAGKVGSIRVHKSGKLSVKIGNVVMDIGKGAETTFLQDVIALSIADDASSAELLGRVDGKIVVTPQI
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.44
2 0.46
3 0.44
4 0.41
5 0.37
6 0.3
7 0.28
8 0.27
9 0.27
10 0.3
11 0.28
12 0.26
13 0.3
14 0.37
15 0.44
16 0.49
17 0.52
18 0.55
19 0.6
20 0.68
21 0.74
22 0.77
23 0.74
24 0.79
25 0.83
26 0.82
27 0.81
28 0.75
29 0.68
30 0.65
31 0.62
32 0.54
33 0.53
34 0.44
35 0.38
36 0.36
37 0.33
38 0.29
39 0.29
40 0.33
41 0.32
42 0.4
43 0.43
44 0.5
45 0.54
46 0.58
47 0.63
48 0.66
49 0.7
50 0.73
51 0.79
52 0.8
53 0.86
54 0.89
55 0.91
56 0.85
57 0.76
58 0.69
59 0.62
60 0.58
61 0.56
62 0.55
63 0.51
64 0.49
65 0.52
66 0.53
67 0.51
68 0.45
69 0.38
70 0.34
71 0.37
72 0.45
73 0.47
74 0.48
75 0.47
76 0.45
77 0.44
78 0.39
79 0.3
80 0.21
81 0.16
82 0.1
83 0.1
84 0.09
85 0.09
86 0.08
87 0.08
88 0.07
89 0.07
90 0.08
91 0.07
92 0.1
93 0.12
94 0.19
95 0.19
96 0.21
97 0.27
98 0.27
99 0.29
100 0.29
101 0.3
102 0.23
103 0.26
104 0.24
105 0.2
106 0.19
107 0.18
108 0.2
109 0.19
110 0.18
111 0.15
112 0.14
113 0.13
114 0.13
115 0.14
116 0.1
117 0.09
118 0.1
119 0.1
120 0.1
121 0.09
122 0.08
123 0.07
124 0.09
125 0.09
126 0.08
127 0.08
128 0.08
129 0.08
130 0.08
131 0.1
132 0.07
133 0.06
134 0.06
135 0.07
136 0.06
137 0.1
138 0.12
139 0.18
140 0.24
141 0.29
142 0.32
143 0.4
144 0.48
145 0.54
146 0.63
147 0.61
148 0.62
149 0.64
150 0.63
151 0.56
152 0.52
153 0.42
154 0.32
155 0.27
156 0.2
157 0.13
158 0.11
159 0.12
160 0.08
161 0.08
162 0.08
163 0.07
164 0.07
165 0.07
166 0.07
167 0.06
168 0.05
169 0.06
170 0.05
171 0.05
172 0.05
173 0.07
174 0.08
175 0.09
176 0.1
177 0.11
178 0.12
179 0.12
180 0.13
181 0.16
182 0.21
183 0.24
184 0.27
185 0.36
186 0.41
187 0.45
188 0.47
189 0.43
190 0.4
191 0.39
192 0.41
193 0.38
194 0.35
195 0.31
196 0.32
197 0.35
198 0.35
199 0.39
200 0.34
201 0.3
202 0.29
203 0.27
204 0.24
205 0.2
206 0.18
207 0.16
208 0.16
209 0.16
210 0.2
211 0.2
212 0.2
213 0.23
214 0.26
215 0.23
216 0.24
217 0.25
218 0.26
219 0.33
220 0.36
221 0.35
222 0.33
223 0.33
224 0.31
225 0.28
226 0.26
227 0.19
228 0.15
229 0.13
230 0.11
231 0.11
232 0.1
233 0.1
234 0.09
235 0.1
236 0.11
237 0.11
238 0.18
239 0.19
240 0.22
241 0.23
242 0.26
243 0.25
244 0.26
245 0.25
246 0.19
247 0.17
248 0.15
249 0.15
250 0.1
251 0.1
252 0.09
253 0.09
254 0.09
255 0.09
256 0.11
257 0.1
258 0.1
259 0.11
260 0.1
261 0.1
262 0.1
263 0.09
264 0.07
265 0.07
266 0.05
267 0.04
268 0.05
269 0.05
270 0.05
271 0.05
272 0.05
273 0.07
274 0.07
275 0.11
276 0.15
277 0.23
278 0.28
279 0.34
280 0.42
281 0.48
282 0.58
283 0.64
284 0.71
285 0.74
286 0.75
287 0.73
288 0.73
289 0.7
290 0.64
291 0.56
292 0.53
293 0.46
294 0.43
295 0.45
296 0.38
297 0.36
298 0.33
299 0.31
300 0.25
301 0.27
302 0.29
303 0.29
304 0.32
305 0.33
306 0.37
307 0.4
308 0.39
309 0.37
310 0.34
311 0.33
312 0.32
313 0.3
314 0.27
315 0.26
316 0.25
317 0.23
318 0.25
319 0.22
320 0.24
321 0.28
322 0.35
323 0.41
324 0.49
325 0.58
326 0.63
327 0.73
328 0.8
329 0.87
330 0.89
331 0.9
332 0.93
333 0.92
334 0.87
335 0.85
336 0.81
337 0.76
338 0.69
339 0.61
340 0.51
341 0.47
342 0.42
343 0.33
344 0.25
345 0.22
346 0.19
347 0.2
348 0.22
349 0.2
350 0.23
351 0.29
352 0.32
353 0.31
354 0.34
355 0.39
356 0.44
357 0.46
358 0.46
359 0.44
360 0.45
361 0.46
362 0.43
363 0.36
364 0.28
365 0.23
366 0.21
367 0.16
368 0.11
369 0.09
370 0.08
371 0.06
372 0.06
373 0.07
374 0.07
375 0.1
376 0.11
377 0.11
378 0.11
379 0.11
380 0.12
381 0.11
382 0.12
383 0.08
384 0.07
385 0.08
386 0.08
387 0.07
388 0.07
389 0.06
390 0.06
391 0.06
392 0.06
393 0.05
394 0.07
395 0.07
396 0.09
397 0.1
398 0.09
399 0.1
400 0.11
401 0.11
402 0.13