Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

Q12173

Protein Details
Accession Q12173    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
232-261VHTVRTRRSYNKPMSNHRNRRNNNPSREECHydrophilic
265-284RLCFYCKKEGHRLNECRARKHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 17.5, cyto_nucl 11, cyto 3.5, mito 2, golg 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR045358  Ty3_capsid  
IPR001878  Znf_CCHC  
IPR036875  Znf_CCHC_sf  
Gene Ontology GO:0005737  C:cytoplasm  
GO:0000943  C:retrotransposon nucleocapsid  
GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0008270  F:zinc ion binding  
GO:0032197  P:retrotransposition  
KEGG sce:YGR109W-A  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF19259  Ty3_capsid  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50158  ZF_CCHC  
Amino Acid Sequences MSFMDQIPGGGNYPKLPVECLPNFPIQPSLTFRGRNDSHKLKNFISEIMLNMSMISWPNDASRIVYCRRHLLNPAAQWANDFVQEQGILEITFDTFIQGLYQHFYKPPDINKIFNAITQLSEAKLGIERLNQRFRKIWDRMPPDFMTEKAAIMTYTRLLTKETYNIVRMHKPETLKDAMEEAYQTTALTERFFPGFELDADGDTIIGATTHLQEEYDSDYDSEDNLTQNGYVHTVRTRRSYNKPMSNHRNRRNNNPSREECIKNRLCFYCKKEGHRLNECRARKASSNRS
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.19
2 0.18
3 0.2
4 0.2
5 0.27
6 0.29
7 0.33
8 0.34
9 0.37
10 0.37
11 0.35
12 0.37
13 0.29
14 0.3
15 0.31
16 0.33
17 0.33
18 0.37
19 0.36
20 0.41
21 0.44
22 0.47
23 0.5
24 0.53
25 0.58
26 0.62
27 0.67
28 0.59
29 0.61
30 0.57
31 0.49
32 0.43
33 0.34
34 0.27
35 0.25
36 0.24
37 0.17
38 0.15
39 0.14
40 0.11
41 0.11
42 0.11
43 0.08
44 0.09
45 0.1
46 0.11
47 0.12
48 0.13
49 0.15
50 0.18
51 0.23
52 0.28
53 0.29
54 0.35
55 0.38
56 0.39
57 0.4
58 0.43
59 0.44
60 0.42
61 0.46
62 0.4
63 0.37
64 0.34
65 0.32
66 0.25
67 0.2
68 0.17
69 0.11
70 0.11
71 0.11
72 0.1
73 0.08
74 0.08
75 0.06
76 0.06
77 0.06
78 0.05
79 0.05
80 0.05
81 0.05
82 0.04
83 0.04
84 0.05
85 0.05
86 0.06
87 0.08
88 0.09
89 0.09
90 0.11
91 0.13
92 0.16
93 0.19
94 0.23
95 0.31
96 0.32
97 0.33
98 0.32
99 0.35
100 0.32
101 0.29
102 0.28
103 0.18
104 0.16
105 0.15
106 0.15
107 0.1
108 0.1
109 0.09
110 0.07
111 0.08
112 0.08
113 0.08
114 0.12
115 0.17
116 0.22
117 0.32
118 0.32
119 0.34
120 0.36
121 0.4
122 0.44
123 0.43
124 0.44
125 0.44
126 0.5
127 0.5
128 0.51
129 0.48
130 0.42
131 0.39
132 0.33
133 0.27
134 0.2
135 0.18
136 0.13
137 0.13
138 0.09
139 0.09
140 0.09
141 0.06
142 0.07
143 0.07
144 0.07
145 0.09
146 0.1
147 0.11
148 0.13
149 0.16
150 0.16
151 0.19
152 0.21
153 0.23
154 0.26
155 0.27
156 0.27
157 0.27
158 0.27
159 0.26
160 0.29
161 0.28
162 0.24
163 0.23
164 0.21
165 0.18
166 0.17
167 0.15
168 0.1
169 0.08
170 0.08
171 0.07
172 0.06
173 0.07
174 0.07
175 0.08
176 0.08
177 0.09
178 0.1
179 0.1
180 0.1
181 0.1
182 0.11
183 0.1
184 0.12
185 0.11
186 0.11
187 0.11
188 0.1
189 0.08
190 0.07
191 0.06
192 0.04
193 0.03
194 0.03
195 0.04
196 0.05
197 0.06
198 0.06
199 0.06
200 0.06
201 0.07
202 0.12
203 0.12
204 0.12
205 0.11
206 0.12
207 0.12
208 0.12
209 0.13
210 0.09
211 0.09
212 0.08
213 0.09
214 0.08
215 0.09
216 0.1
217 0.11
218 0.11
219 0.12
220 0.17
221 0.21
222 0.24
223 0.3
224 0.36
225 0.41
226 0.5
227 0.58
228 0.63
229 0.68
230 0.73
231 0.78
232 0.82
233 0.86
234 0.87
235 0.87
236 0.88
237 0.84
238 0.87
239 0.87
240 0.86
241 0.85
242 0.83
243 0.79
244 0.76
245 0.78
246 0.74
247 0.68
248 0.68
249 0.66
250 0.61
251 0.62
252 0.6
253 0.58
254 0.6
255 0.62
256 0.62
257 0.61
258 0.65
259 0.69
260 0.71
261 0.76
262 0.78
263 0.79
264 0.78
265 0.82
266 0.78
267 0.75
268 0.7
269 0.67
270 0.64