FuNGI

Q12098

Protein Details

Accession

Q12098

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

14.3

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
153-187	VTAKRRPAIRKANSKLKTKPKTKRDPKIIKNITDF	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
156-179	KRRPAIRKANSKLKTKPKTKRDPK

Subcellular Location(s)

nucl 23.5, cyto_nucl 14

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR027784 Slx4_ascomycetes IPR018574 Structure-sp_endonuc_su_Slx4
Gene Ontology	GO:0005737 C:cytoplasm GO:1905348 C:endonuclease complex GO:0000228 C:nuclear chromosome GO:0005634 C:nucleus GO:0033557 C:Slx1-Slx4 complex GO:0017108 F:5'-flap endonuclease activity GO:0006974 P:DNA damage response GO:0006260 P:DNA replication GO:0006261 P:DNA-templated DNA replication GO:0000727 P:double-strand break repair via break-induced replication GO:0000736 P:double-strand break repair via single-strand annealing, removal of nonhomologous ends GO:0036297 P:interstrand cross-link repair GO:2000001 P:regulation of DNA damage checkpoint GO:1903775 P:regulation of DNA double-strand break processing GO:1905261 P:regulation of meiotic DNA double-strand break formation involved in reciprocal meiotic recombination GO:1902681 P:regulation of replication fork arrest at rDNA repeats
KEGG	sce:YLR135W -
Pfam	View protein in Pfam PF09494 Slx4
CDD	cd22869 SLX4_RIM2

Amino Acid Sequences

MELQRAQRNLKFLQNEDYVNVTDQTNLNGESQNAYSLGMETQVPEMQFSLSSDDDSIGTQVKSVTAQKSPMTQETTKNDTERNKDVDKSCNPVSTSHPDLGGSNIEENIFINTQIQSRLDDAEEETNLKLKLEKFKYSFKSSNADDTHSNANVTAKRRPAIRKANSKLKTKPKTKRDPKIIKNITDFNINNYERSRTASLLKQLSGKHKKVLDIIKTQNEGNSDKPPRARNNKGEKATFDTYSEQEWKDIMKLLLQKFPQSEETDLNEVQKFLYGSEKSSNSLDNQESSQQRLWTASQLPPELPDEAIQPEQEERIRDTQSAVNFLSLSQVMDDKSEIMKDEESIIISRGDSTSSQEYGNGLEPQQPVGNVVGEDIELAVGTRINAFSLTDYKACKPMSVEVSRRCENSTDNDYDNISIVSDTTDETSTLFPLDQYRYVFIENDERPPLATDTIGSTQFFTPNTSPLDGIIDLTQESFKAVRSLISPLKVENNKTGVTSQASNQVQVPATRTPTIIPQKNLTTTLKTEEEKNNIGSSIRVKLLQESVVKLNPKLVKHNFYRVEANDSEEEETEFDDQFCIADIQLVDSSKISTKDSTQNPTTSNDIIDTSAASSIASPEKFCEIMMSQSMKELRQSLKTVGLKPMRTKVEIIQSLQTASQILSTANPDNKGEHGGVANFSKIEIFDHLTELIEAFPDFLERIYTFEPIPLNELIEKLFSAEPFVSQIDEMTIREWADVQGICLRNDKK

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.48
2	0.46
3	0.42
4	0.41
5	0.34
6	0.3
7	0.29
8	0.21
9	0.2
10	0.19
11	0.19
12	0.19
13	0.19
14	0.19
15	0.19
16	0.19
17	0.19
18	0.19
19	0.18
20	0.16
21	0.15
22	0.13
23	0.13
24	0.12
25	0.11
26	0.1
27	0.1
28	0.12
29	0.14
30	0.13
31	0.13
32	0.13
33	0.13
34	0.13
35	0.13
36	0.15
37	0.13
38	0.14
39	0.14
40	0.14
41	0.14
42	0.14
43	0.15
44	0.13
45	0.12
46	0.12
47	0.12
48	0.12
49	0.15
50	0.2
51	0.23
52	0.23
53	0.27
54	0.28
55	0.34
56	0.38
57	0.4
58	0.42
59	0.41
60	0.45
61	0.49
62	0.53
63	0.51
64	0.49
65	0.5
66	0.5
67	0.54
68	0.53
69	0.52
70	0.5
71	0.53
72	0.54
73	0.58
74	0.54
75	0.55
76	0.51
77	0.5
78	0.47
79	0.42
80	0.45
81	0.42
82	0.43
83	0.38
84	0.35
85	0.3
86	0.3
87	0.29
88	0.25
89	0.2
90	0.16
91	0.15
92	0.14
93	0.14
94	0.14
95	0.14
96	0.12
97	0.1
98	0.11
99	0.12
100	0.13
101	0.15
102	0.16
103	0.14
104	0.15
105	0.17
106	0.16
107	0.16
108	0.17
109	0.18
110	0.18
111	0.18
112	0.17
113	0.18
114	0.18
115	0.17
116	0.19
117	0.2
118	0.29
119	0.33
120	0.41
121	0.41
122	0.51
123	0.57
124	0.62
125	0.63
126	0.56
127	0.57
128	0.51
129	0.57
130	0.49
131	0.46
132	0.39
133	0.37
134	0.38
135	0.32
136	0.3
137	0.22
138	0.24
139	0.26
140	0.28
141	0.31
142	0.3
143	0.32
144	0.39
145	0.45
146	0.5
147	0.56
148	0.62
149	0.67
150	0.71
151	0.79
152	0.79
153	0.8
154	0.8
155	0.8
156	0.81
157	0.8
158	0.82
159	0.82
160	0.86
161	0.89
162	0.91
163	0.91
164	0.92
165	0.9
166	0.91
167	0.87
168	0.82
169	0.77
170	0.72
171	0.62
172	0.59
173	0.51
174	0.44
175	0.46
176	0.4
177	0.37
178	0.33
179	0.34
180	0.26
181	0.31
182	0.29
183	0.22
184	0.25
185	0.28
186	0.33
187	0.34
188	0.34
189	0.34
190	0.36
191	0.45
192	0.5
193	0.47
194	0.46
195	0.45
196	0.46
197	0.49
198	0.53
199	0.48
200	0.47
201	0.51
202	0.51
203	0.5
204	0.48
205	0.43
206	0.39
207	0.34
208	0.28
209	0.31
210	0.29
211	0.31
212	0.36
213	0.41
214	0.47
215	0.55
216	0.61
217	0.62
218	0.7
219	0.76
220	0.76
221	0.72
222	0.65
223	0.63
224	0.57
225	0.47
226	0.39
227	0.32
228	0.28
229	0.28
230	0.29
231	0.22
232	0.19
233	0.19
234	0.17
235	0.15
236	0.18
237	0.14
238	0.14
239	0.2
240	0.22
241	0.27
242	0.27
243	0.29
244	0.26
245	0.29
246	0.29
247	0.25
248	0.25
249	0.22
250	0.25
251	0.26
252	0.25
253	0.25
254	0.22
255	0.19
256	0.17
257	0.16
258	0.12
259	0.09
260	0.15
261	0.13
262	0.15
263	0.2
264	0.21
265	0.2
266	0.21
267	0.22
268	0.17
269	0.21
270	0.2
271	0.17
272	0.17
273	0.21
274	0.21
275	0.24
276	0.24
277	0.21
278	0.2
279	0.21
280	0.2
281	0.18
282	0.2
283	0.2
284	0.2
285	0.21
286	0.2
287	0.2
288	0.21
289	0.18
290	0.15
291	0.12
292	0.11
293	0.11
294	0.12
295	0.11
296	0.1
297	0.09
298	0.11
299	0.12
300	0.12
301	0.13
302	0.16
303	0.17
304	0.17
305	0.19
306	0.2
307	0.19
308	0.21
309	0.19
310	0.15
311	0.14
312	0.14
313	0.13
314	0.1
315	0.09
316	0.06
317	0.07
318	0.06
319	0.07
320	0.07
321	0.07
322	0.07
323	0.07
324	0.08
325	0.08
326	0.08
327	0.08
328	0.09
329	0.08
330	0.08
331	0.08
332	0.09
333	0.08
334	0.07
335	0.07
336	0.06
337	0.07
338	0.07
339	0.09
340	0.1
341	0.11
342	0.11
343	0.11
344	0.11
345	0.12
346	0.13
347	0.11
348	0.09
349	0.13
350	0.13
351	0.13
352	0.13
353	0.12
354	0.11
355	0.11
356	0.11
357	0.06
358	0.06
359	0.05
360	0.05
361	0.05
362	0.04
363	0.03
364	0.02
365	0.02
366	0.02
367	0.02
368	0.03
369	0.03
370	0.03
371	0.03
372	0.04
373	0.04
374	0.05
375	0.07
376	0.09
377	0.1
378	0.12
379	0.13
380	0.18
381	0.18
382	0.18
383	0.16
384	0.19
385	0.24
386	0.28
387	0.33
388	0.34
389	0.41
390	0.42
391	0.41
392	0.38
393	0.33
394	0.29
395	0.28
396	0.28
397	0.25
398	0.24
399	0.24
400	0.24
401	0.22
402	0.21
403	0.15
404	0.1
405	0.06
406	0.05
407	0.05
408	0.05
409	0.05
410	0.06
411	0.06
412	0.06
413	0.07
414	0.07
415	0.07
416	0.07
417	0.07
418	0.06
419	0.09
420	0.1
421	0.12
422	0.12
423	0.14
424	0.14
425	0.15
426	0.15
427	0.14
428	0.2
429	0.19
430	0.22
431	0.21
432	0.2
433	0.2
434	0.21
435	0.21
436	0.13
437	0.12
438	0.09
439	0.11
440	0.13
441	0.13
442	0.12
443	0.13
444	0.13
445	0.14
446	0.14
447	0.14
448	0.13
449	0.15
450	0.17
451	0.16
452	0.15
453	0.14
454	0.16
455	0.13
456	0.13
457	0.1
458	0.08
459	0.08
460	0.08
461	0.08
462	0.05
463	0.06
464	0.06
465	0.06
466	0.07
467	0.07
468	0.08
469	0.09
470	0.15
471	0.17
472	0.19
473	0.19
474	0.19
475	0.27
476	0.29
477	0.3
478	0.29
479	0.29
480	0.27
481	0.27
482	0.26
483	0.21
484	0.2
485	0.19
486	0.16
487	0.22
488	0.22
489	0.22
490	0.22
491	0.22
492	0.21
493	0.21
494	0.23
495	0.17
496	0.19
497	0.19
498	0.19
499	0.17
500	0.25
501	0.33
502	0.35
503	0.35
504	0.36
505	0.38
506	0.4
507	0.43
508	0.37
509	0.31
510	0.28
511	0.3
512	0.3
513	0.28
514	0.32
515	0.33
516	0.36
517	0.35
518	0.35
519	0.31
520	0.27
521	0.26
522	0.22
523	0.19
524	0.18
525	0.17
526	0.17
527	0.16
528	0.18
529	0.2
530	0.23
531	0.22
532	0.21
533	0.23
534	0.26
535	0.27
536	0.25
537	0.3
538	0.3
539	0.3
540	0.36
541	0.39
542	0.42
543	0.45
544	0.55
545	0.52
546	0.51
547	0.55
548	0.47
549	0.48
550	0.41
551	0.4
552	0.32
553	0.3
554	0.28
555	0.22
556	0.21
557	0.14
558	0.15
559	0.12
560	0.11
561	0.09
562	0.08
563	0.08
564	0.07
565	0.08
566	0.07
567	0.06
568	0.08
569	0.08
570	0.1
571	0.12
572	0.12
573	0.12
574	0.12
575	0.13
576	0.14
577	0.15
578	0.15
579	0.15
580	0.19
581	0.28
582	0.33
583	0.39
584	0.4
585	0.42
586	0.42
587	0.43
588	0.42
589	0.35
590	0.29
591	0.23
592	0.2
593	0.18
594	0.16
595	0.13
596	0.1
597	0.1
598	0.09
599	0.07
600	0.07
601	0.08
602	0.13
603	0.13
604	0.13
605	0.14
606	0.17
607	0.17
608	0.17
609	0.18
610	0.14
611	0.17
612	0.22
613	0.23
614	0.21
615	0.25
616	0.27
617	0.25
618	0.26
619	0.28
620	0.26
621	0.29
622	0.32
623	0.3
624	0.38
625	0.42
626	0.43
627	0.47
628	0.5
629	0.49
630	0.52
631	0.57
632	0.53
633	0.5
634	0.49
635	0.45
636	0.48
637	0.48
638	0.45
639	0.41
640	0.37
641	0.36
642	0.34
643	0.29
644	0.19
645	0.15
646	0.13
647	0.1
648	0.09
649	0.09
650	0.13
651	0.18
652	0.21
653	0.23
654	0.23
655	0.24
656	0.26
657	0.28
658	0.25
659	0.21
660	0.2
661	0.19
662	0.21
663	0.2
664	0.2
665	0.16
666	0.16
667	0.14
668	0.12
669	0.13
670	0.13
671	0.16
672	0.15
673	0.18
674	0.18
675	0.18
676	0.18
677	0.16
678	0.13
679	0.1
680	0.09
681	0.07
682	0.07
683	0.07
684	0.07
685	0.07
686	0.11
687	0.1
688	0.14
689	0.16
690	0.17
691	0.17
692	0.2
693	0.22
694	0.19
695	0.23
696	0.19
697	0.2
698	0.19
699	0.19
700	0.17
701	0.16
702	0.15
703	0.14
704	0.15
705	0.13
706	0.16
707	0.15
708	0.15
709	0.17
710	0.18
711	0.16
712	0.14
713	0.14
714	0.14
715	0.15
716	0.15
717	0.13
718	0.15
719	0.14
720	0.14
721	0.15
722	0.12
723	0.15
724	0.15
725	0.16
726	0.22
727	0.24
728	0.25

Q12098

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer