FuNGI

P40965

Protein Details

Accession

P40965

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

10.2

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
24-47	SNSISKPSTKKSIRNQKSPTNISS	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Subcellular Location(s)

nucl 19, cyto_nucl 11.5, mito 4, cyto 2

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR011184 DNA_mismatch_repair_Msh2 IPR000432 DNA_mismatch_repair_MutS_C IPR007861 DNA_mismatch_repair_MutS_clamp IPR007696 DNA_mismatch_repair_MutS_core IPR036187 DNA_mismatch_repair_MutS_sf IPR007860 DNA_mmatch_repair_MutS_con_dom IPR036678 MutS_con_dom_sf IPR045076 MutS_family IPR027417 P-loop_NTPase
Gene Ontology	GO:0062128 C:MutSgamma complex GO:0000228 C:nuclear chromosome GO:0005634 C:nucleus GO:0005524 F:ATP binding GO:0140664 F:ATP-dependent DNA damage sensor activity GO:0030983 F:mismatched DNA binding GO:0007131 P:reciprocal meiotic recombination
KEGG	sce:YFL003C -
Pfam	View protein in Pfam PF05188 MutS_II PF05192 MutS_III PF05190 MutS_IV PF00488 MutS_V
PROSITE	View protein in PROSITE PS00486 DNA_MISMATCH_REPAIR_2
CDD	cd03282 ABC_MSH4_euk

Amino Acid Sequences

MSESNLSSFISTNYFNLRSAANSSNSISKPSTKKSIRNQKSPTNISSWALKKKTLQIAETTWENNEKDSTHSHYLMTGSMASRTATSLSRYSTNASLLGPSIDCVLCCIYEVPRDISTRIGLCIINCNTGQMYLSDFMDSQIYIRVVHKLQIYQPTEILIPSSSLAPTVSKLATMIKFNVAETVKIEEGSRKCFNSQDGLAAITKYLMDDTKKDLKIEEIIDKTFALCAASAAISYMEEIISKSSRNLNAFRKLRIQFEGTENTMLIDSKTVRGLELVENKLDKNGISLWKFLDTTSTKMGQRSLRNSILQPLTDRGSIEMRLEALEELKANDDLLQKLRLEMKSLPDLDKLFSRLLCINHSAIKPDQRINYVLLLKETLQSVKSLKDALNDQLIQSRLISETKKIFNNDAIMEIEKLINSCINEDCVWASSAIQLLNQRSYAVKSDSNGLLDVSRQIYKEVKEEFFREVEDLTAKNKINLDHNYDSARGFYLRIKRQEFTDDVATLPDVFISRTIKKNYIECTTLNIIKKNARLKEVMEEILLLSEETVDELLDKIATHISELFMIAEAVAILDLVCSFTYNLKENNYTIPIFTNNLLIRDSRHPLLEKVLKNFVPNTISSTKHSSSLQIITGCNMSGKSVYLKQVALICIMAQMGSGIPALYGSFPVFKRLHARVCNDSMELTSSNFGFEMKEMAYFLDDINTETLLILDELGRGSSIADGFCVSLAVTEHLLRTEATVFLSTHFQDIPKIMSKKPAVSHLHMDAVLLNDNSVKMNYQLTQKSVAIENSGIRVVKKIFNPDIIAEAYNIHSLLKIAKARTENEDSNGVVDQKTINQMKRIHNLVAILKECAGNEKEPLTLGKLKEINSDFIENFEE

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.23
2	0.23
3	0.24
4	0.23
5	0.22
6	0.26
7	0.29
8	0.26
9	0.27
10	0.29
11	0.35
12	0.35
13	0.37
14	0.34
15	0.38
16	0.42
17	0.46
18	0.54
19	0.54
20	0.63
21	0.7
22	0.79
23	0.8
24	0.83
25	0.84
26	0.83
27	0.86
28	0.83
29	0.76
30	0.7
31	0.64
32	0.55
33	0.56
34	0.54
35	0.53
36	0.49
37	0.49
38	0.49
39	0.54
40	0.61
41	0.58
42	0.53
43	0.49
44	0.5
45	0.51
46	0.49
47	0.41
48	0.35
49	0.35
50	0.33
51	0.29
52	0.27
53	0.23
54	0.23
55	0.26
56	0.31
57	0.32
58	0.33
59	0.31
60	0.31
61	0.31
62	0.28
63	0.25
64	0.2
65	0.15
66	0.15
67	0.15
68	0.13
69	0.13
70	0.13
71	0.14
72	0.14
73	0.16
74	0.18
75	0.21
76	0.23
77	0.24
78	0.27
79	0.27
80	0.27
81	0.25
82	0.22
83	0.2
84	0.18
85	0.18
86	0.14
87	0.12
88	0.13
89	0.12
90	0.11
91	0.12
92	0.12
93	0.11
94	0.12
95	0.13
96	0.12
97	0.16
98	0.2
99	0.22
100	0.24
101	0.27
102	0.26
103	0.27
104	0.28
105	0.25
106	0.23
107	0.22
108	0.19
109	0.17
110	0.25
111	0.24
112	0.24
113	0.23
114	0.23
115	0.21
116	0.21
117	0.21
118	0.13
119	0.14
120	0.13
121	0.13
122	0.13
123	0.12
124	0.12
125	0.13
126	0.12
127	0.1
128	0.12
129	0.12
130	0.12
131	0.14
132	0.18
133	0.18
134	0.22
135	0.24
136	0.23
137	0.28
138	0.36
139	0.38
140	0.34
141	0.34
142	0.31
143	0.29
144	0.26
145	0.22
146	0.13
147	0.11
148	0.09
149	0.1
150	0.09
151	0.09
152	0.09
153	0.09
154	0.1
155	0.12
156	0.11
157	0.1
158	0.11
159	0.16
160	0.18
161	0.2
162	0.21
163	0.21
164	0.22
165	0.22
166	0.27
167	0.22
168	0.21
169	0.19
170	0.22
171	0.18
172	0.18
173	0.19
174	0.2
175	0.22
176	0.28
177	0.31
178	0.28
179	0.29
180	0.32
181	0.33
182	0.32
183	0.31
184	0.27
185	0.24
186	0.24
187	0.23
188	0.2
189	0.18
190	0.12
191	0.11
192	0.08
193	0.08
194	0.09
195	0.1
196	0.12
197	0.18
198	0.27
199	0.29
200	0.29
201	0.28
202	0.28
203	0.31
204	0.32
205	0.33
206	0.26
207	0.25
208	0.26
209	0.25
210	0.23
211	0.19
212	0.16
213	0.09
214	0.07
215	0.06
216	0.06
217	0.06
218	0.06
219	0.06
220	0.06
221	0.05
222	0.05
223	0.05
224	0.04
225	0.05
226	0.05
227	0.07
228	0.08
229	0.09
230	0.11
231	0.16
232	0.2
233	0.24
234	0.31
235	0.35
236	0.45
237	0.47
238	0.49
239	0.52
240	0.5
241	0.5
242	0.46
243	0.42
244	0.35
245	0.37
246	0.38
247	0.3
248	0.29
249	0.25
250	0.22
251	0.19
252	0.17
253	0.12
254	0.09
255	0.09
256	0.09
257	0.11
258	0.11
259	0.11
260	0.11
261	0.13
262	0.16
263	0.22
264	0.23
265	0.23
266	0.23
267	0.23
268	0.24
269	0.22
270	0.16
271	0.11
272	0.13
273	0.18
274	0.18
275	0.19
276	0.2
277	0.21
278	0.22
279	0.2
280	0.23
281	0.18
282	0.2
283	0.23
284	0.26
285	0.25
286	0.26
287	0.31
288	0.3
289	0.35
290	0.37
291	0.4
292	0.4
293	0.41
294	0.4
295	0.42
296	0.38
297	0.32
298	0.28
299	0.24
300	0.22
301	0.21
302	0.2
303	0.15
304	0.15
305	0.15
306	0.14
307	0.12
308	0.1
309	0.1
310	0.1
311	0.09
312	0.07
313	0.07
314	0.07
315	0.07
316	0.07
317	0.07
318	0.07
319	0.1
320	0.11
321	0.12
322	0.13
323	0.15
324	0.14
325	0.16
326	0.21
327	0.18
328	0.2
329	0.2
330	0.22
331	0.25
332	0.27
333	0.26
334	0.24
335	0.24
336	0.22
337	0.22
338	0.21
339	0.16
340	0.15
341	0.16
342	0.16
343	0.17
344	0.18
345	0.18
346	0.17
347	0.21
348	0.21
349	0.22
350	0.21
351	0.26
352	0.27
353	0.28
354	0.29
355	0.27
356	0.28
357	0.27
358	0.29
359	0.25
360	0.22
361	0.19
362	0.17
363	0.15
364	0.15
365	0.14
366	0.1
367	0.09
368	0.1
369	0.1
370	0.1
371	0.11
372	0.12
373	0.12
374	0.13
375	0.15
376	0.15
377	0.18
378	0.17
379	0.17
380	0.18
381	0.18
382	0.16
383	0.14
384	0.13
385	0.1
386	0.12
387	0.13
388	0.12
389	0.16
390	0.2
391	0.23
392	0.24
393	0.24
394	0.23
395	0.25
396	0.22
397	0.19
398	0.16
399	0.14
400	0.13
401	0.12
402	0.1
403	0.08
404	0.08
405	0.06
406	0.07
407	0.06
408	0.07
409	0.07
410	0.08
411	0.08
412	0.09
413	0.09
414	0.08
415	0.09
416	0.07
417	0.07
418	0.06
419	0.07
420	0.07
421	0.08
422	0.1
423	0.1
424	0.11
425	0.11
426	0.11
427	0.1
428	0.11
429	0.12
430	0.12
431	0.12
432	0.12
433	0.15
434	0.15
435	0.15
436	0.14
437	0.12
438	0.1
439	0.09
440	0.1
441	0.09
442	0.09
443	0.09
444	0.1
445	0.12
446	0.13
447	0.18
448	0.2
449	0.2
450	0.21
451	0.22
452	0.23
453	0.21
454	0.2
455	0.16
456	0.13
457	0.12
458	0.11
459	0.1
460	0.09
461	0.14
462	0.13
463	0.14
464	0.16
465	0.17
466	0.21
467	0.24
468	0.3
469	0.27
470	0.28
471	0.28
472	0.27
473	0.26
474	0.2
475	0.18
476	0.11
477	0.1
478	0.13
479	0.21
480	0.26
481	0.33
482	0.35
483	0.35
484	0.36
485	0.4
486	0.37
487	0.31
488	0.29
489	0.22
490	0.19
491	0.19
492	0.17
493	0.13
494	0.11
495	0.08
496	0.05
497	0.05
498	0.06
499	0.1
500	0.13
501	0.18
502	0.21
503	0.25
504	0.27
505	0.31
506	0.34
507	0.34
508	0.33
509	0.28
510	0.3
511	0.29
512	0.32
513	0.3
514	0.28
515	0.27
516	0.28
517	0.33
518	0.36
519	0.35
520	0.33
521	0.32
522	0.31
523	0.34
524	0.33
525	0.29
526	0.22
527	0.19
528	0.16
529	0.14
530	0.13
531	0.07
532	0.04
533	0.03
534	0.03
535	0.03
536	0.03
537	0.03
538	0.03
539	0.04
540	0.04
541	0.04
542	0.04
543	0.05
544	0.06
545	0.06
546	0.06
547	0.06
548	0.07
549	0.07
550	0.07
551	0.07
552	0.06
553	0.06
554	0.05
555	0.04
556	0.04
557	0.03
558	0.03
559	0.02
560	0.02
561	0.02
562	0.02
563	0.03
564	0.03
565	0.04
566	0.04
567	0.07
568	0.1
569	0.12
570	0.15
571	0.17
572	0.19
573	0.2
574	0.22
575	0.23
576	0.21
577	0.19
578	0.18
579	0.17
580	0.17
581	0.16
582	0.19
583	0.16
584	0.17
585	0.18
586	0.16
587	0.18
588	0.22
589	0.25
590	0.2
591	0.22
592	0.23
593	0.23
594	0.31
595	0.35
596	0.34
597	0.34
598	0.39
599	0.37
600	0.37
601	0.37
602	0.32
603	0.27
604	0.23
605	0.26
606	0.23
607	0.25
608	0.26
609	0.32
610	0.29
611	0.3
612	0.3
613	0.26
614	0.26
615	0.26
616	0.26
617	0.22
618	0.21
619	0.2
620	0.2
621	0.17
622	0.14
623	0.12
624	0.1
625	0.08
626	0.09
627	0.11
628	0.14
629	0.18
630	0.19
631	0.19
632	0.21
633	0.24
634	0.23
635	0.2
636	0.17
637	0.13
638	0.11
639	0.11
640	0.09
641	0.05
642	0.05
643	0.04
644	0.04
645	0.05
646	0.04
647	0.04
648	0.04
649	0.04
650	0.04
651	0.05
652	0.06
653	0.1
654	0.1
655	0.17
656	0.18
657	0.2
658	0.27
659	0.31
660	0.39
661	0.41
662	0.46
663	0.46
664	0.5
665	0.49
666	0.43
667	0.38
668	0.3
669	0.27
670	0.22
671	0.17
672	0.14
673	0.12
674	0.12
675	0.11
676	0.11
677	0.08
678	0.08
679	0.09
680	0.08
681	0.09
682	0.09
683	0.09
684	0.1
685	0.1
686	0.09
687	0.09
688	0.09
689	0.1
690	0.1
691	0.1
692	0.09
693	0.09
694	0.09
695	0.07
696	0.07
697	0.06
698	0.05
699	0.06
700	0.06
701	0.06
702	0.06
703	0.05
704	0.06
705	0.07
706	0.07
707	0.07
708	0.07
709	0.07
710	0.08
711	0.08
712	0.07
713	0.06
714	0.06
715	0.07
716	0.08
717	0.09
718	0.1
719	0.1
720	0.1
721	0.11
722	0.1
723	0.11
724	0.11
725	0.1
726	0.11
727	0.12
728	0.12
729	0.13
730	0.17
731	0.15
732	0.16
733	0.16
734	0.16
735	0.16
736	0.17
737	0.2
738	0.25
739	0.28
740	0.27
741	0.35
742	0.38
743	0.42
744	0.44
745	0.49
746	0.46
747	0.48
748	0.52
749	0.47
750	0.47
751	0.4
752	0.37
753	0.29
754	0.25
755	0.23
756	0.17
757	0.14
758	0.11
759	0.12
760	0.13
761	0.12
762	0.11
763	0.1
764	0.13
765	0.16
766	0.23
767	0.26
768	0.27
769	0.32
770	0.32
771	0.33
772	0.33
773	0.31
774	0.26
775	0.25
776	0.24
777	0.21
778	0.23
779	0.21
780	0.18
781	0.21
782	0.22
783	0.26
784	0.28
785	0.35
786	0.36
787	0.39
788	0.41
789	0.38
790	0.38
791	0.34
792	0.31
793	0.22
794	0.2
795	0.18
796	0.16
797	0.15
798	0.12
799	0.1
800	0.1
801	0.12
802	0.17
803	0.2
804	0.21
805	0.27
806	0.31
807	0.34
808	0.41
809	0.46
810	0.42
811	0.41
812	0.43
813	0.37
814	0.35
815	0.34
816	0.28
817	0.2
818	0.18
819	0.16
820	0.16
821	0.25
822	0.3
823	0.31
824	0.36
825	0.44
826	0.51
827	0.58
828	0.59
829	0.53
830	0.48
831	0.49
832	0.47
833	0.47
834	0.4
835	0.34
836	0.3
837	0.29
838	0.27
839	0.28
840	0.26
841	0.21
842	0.23
843	0.22
844	0.22
845	0.22
846	0.24
847	0.24
848	0.27
849	0.27
850	0.32
851	0.35
852	0.35
853	0.42
854	0.43
855	0.42
856	0.4
857	0.44
858	0.35

P40965

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer