Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

P40465

Protein Details
Accession P40465    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
176-202KKNNNTRTSSVRSKRRRIKNGDSLAEYHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 23, cyto_nucl 14
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR031783  Csm2  
IPR027417  P-loop_NTPase  
Gene Ontology GO:0005737  C:cytoplasm  
GO:0005634  C:nucleus  
GO:0097196  C:Shu complex  
GO:0035861  C:site of double-strand break  
GO:0000730  P:DNA recombinase assembly  
GO:0042275  P:error-free postreplication DNA repair  
GO:0043007  P:maintenance of rDNA  
GO:0045132  P:meiotic chromosome segregation  
GO:1903112  P:positive regulation of single-strand break repair via homologous recombination  
GO:0000725  P:recombinational repair  
KEGG sce:YIL132C  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF16834  CSM2  
CDD cd19478  Csm2  
Amino Acid Sequences MEYEDLELITIWPSPTKNKLCQFIKQNLSKEHVVTQLFFIDATSSFPLSQFQKLVPPTLPENVRIYENIRINTCLDLEELSAITVKLLQILSMNKINAQRGTEDAVTEPLKIILYINGLEVMFRNSQFKSSPQRSHELLRDTLLKLRVMGNDENENASIRTLLEFPKEQLLDYYLKKNNNTRTSSVRSKRRRIKNGDSLAEYIWKYYADSLFE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.18
2 0.27
3 0.33
4 0.41
5 0.47
6 0.56
7 0.58
8 0.65
9 0.68
10 0.68
11 0.71
12 0.69
13 0.69
14 0.64
15 0.65
16 0.59
17 0.52
18 0.46
19 0.43
20 0.36
21 0.3
22 0.27
23 0.22
24 0.2
25 0.18
26 0.14
27 0.1
28 0.09
29 0.11
30 0.11
31 0.11
32 0.11
33 0.11
34 0.15
35 0.16
36 0.19
37 0.17
38 0.16
39 0.22
40 0.23
41 0.25
42 0.23
43 0.23
44 0.23
45 0.28
46 0.28
47 0.25
48 0.27
49 0.25
50 0.25
51 0.23
52 0.23
53 0.24
54 0.27
55 0.26
56 0.24
57 0.24
58 0.24
59 0.24
60 0.21
61 0.15
62 0.11
63 0.1
64 0.09
65 0.08
66 0.07
67 0.06
68 0.06
69 0.05
70 0.05
71 0.05
72 0.05
73 0.06
74 0.06
75 0.06
76 0.07
77 0.09
78 0.11
79 0.13
80 0.13
81 0.14
82 0.16
83 0.18
84 0.17
85 0.17
86 0.15
87 0.13
88 0.16
89 0.14
90 0.12
91 0.11
92 0.13
93 0.12
94 0.12
95 0.1
96 0.08
97 0.08
98 0.07
99 0.07
100 0.05
101 0.06
102 0.06
103 0.06
104 0.06
105 0.06
106 0.06
107 0.06
108 0.08
109 0.08
110 0.08
111 0.11
112 0.1
113 0.12
114 0.13
115 0.18
116 0.25
117 0.32
118 0.38
119 0.39
120 0.44
121 0.45
122 0.48
123 0.49
124 0.44
125 0.37
126 0.32
127 0.32
128 0.28
129 0.3
130 0.27
131 0.22
132 0.19
133 0.2
134 0.2
135 0.21
136 0.22
137 0.21
138 0.22
139 0.22
140 0.22
141 0.2
142 0.19
143 0.16
144 0.14
145 0.11
146 0.08
147 0.09
148 0.09
149 0.1
150 0.13
151 0.14
152 0.15
153 0.22
154 0.21
155 0.2
156 0.2
157 0.22
158 0.23
159 0.24
160 0.31
161 0.3
162 0.34
163 0.38
164 0.45
165 0.51
166 0.55
167 0.58
168 0.54
169 0.57
170 0.61
171 0.67
172 0.69
173 0.7
174 0.72
175 0.77
176 0.83
177 0.86
178 0.89
179 0.88
180 0.89
181 0.89
182 0.89
183 0.84
184 0.78
185 0.69
186 0.6
187 0.56
188 0.45
189 0.35
190 0.26
191 0.2
192 0.17
193 0.19