Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

Q05775

Protein Details
Accession Q05775    Localization Confidence Medium Confidence Score 14
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
39-69AEEEEKKPAPKPKKEQPKKVKKGKESSADRABasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
44-62KKPAPKPKKEQPKKVKKGK
215-236RLARVRGGTATGGAGKKKVKGK
Subcellular Location(s) nucl 14.5, cyto_nucl 12.5, cyto 9.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR023194  eIF3-like_dom_sf  
IPR013906  eIF3j  
Gene Ontology GO:0010494  C:cytoplasmic stress granule  
GO:0016282  C:eukaryotic 43S preinitiation complex  
GO:0033290  C:eukaryotic 48S preinitiation complex  
GO:0005852  C:eukaryotic translation initiation factor 3 complex  
GO:0003743  F:translation initiation factor activity  
GO:0002181  P:cytoplasmic translation  
GO:0001732  P:formation of cytoplasmic translation initiation complex  
GO:0000462  P:maturation of SSU-rRNA from tricistronic rRNA transcript (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA)  
KEGG sce:YLR192C  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF08597  eIF3_subunit  
Amino Acid Sequences MSWDDEAINGSMGNDDAVLMDSWDAEIGDDEPVMQSWDAEEEEKKPAPKPKKEQPKKVKKGKESSADRALLDIDTLDEKTRKELIKKAEMESDLNNAADLFAGLGVAEEHPRARALQKEQEEQALKRPAFTKDTPIETHPLFNAETKREYQDLRKALTAAITPMNKKSPLNYSSSLAIDLIRDVAKPMSIESIRQTVATLNVLIKDKEREERQARLARVRGGTATGGAGKKKVKGKTNLGGAFKKDQDFDLDGPDDFEFGDDDFM
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.06
2 0.05
3 0.05
4 0.07
5 0.07
6 0.06
7 0.06
8 0.06
9 0.06
10 0.07
11 0.06
12 0.05
13 0.06
14 0.06
15 0.07
16 0.06
17 0.07
18 0.07
19 0.07
20 0.08
21 0.07
22 0.07
23 0.07
24 0.09
25 0.1
26 0.11
27 0.12
28 0.13
29 0.19
30 0.22
31 0.24
32 0.27
33 0.36
34 0.44
35 0.53
36 0.6
37 0.65
38 0.73
39 0.82
40 0.88
41 0.9
42 0.91
43 0.92
44 0.93
45 0.92
46 0.9
47 0.89
48 0.87
49 0.86
50 0.82
51 0.79
52 0.76
53 0.68
54 0.58
55 0.49
56 0.41
57 0.3
58 0.22
59 0.15
60 0.08
61 0.07
62 0.08
63 0.09
64 0.1
65 0.1
66 0.13
67 0.19
68 0.21
69 0.24
70 0.29
71 0.35
72 0.42
73 0.45
74 0.44
75 0.43
76 0.42
77 0.4
78 0.35
79 0.3
80 0.22
81 0.19
82 0.17
83 0.12
84 0.1
85 0.08
86 0.07
87 0.04
88 0.03
89 0.03
90 0.02
91 0.03
92 0.03
93 0.03
94 0.04
95 0.04
96 0.05
97 0.05
98 0.06
99 0.07
100 0.08
101 0.13
102 0.17
103 0.25
104 0.28
105 0.31
106 0.31
107 0.36
108 0.36
109 0.31
110 0.34
111 0.33
112 0.29
113 0.28
114 0.3
115 0.27
116 0.3
117 0.3
118 0.3
119 0.26
120 0.29
121 0.29
122 0.28
123 0.29
124 0.24
125 0.24
126 0.17
127 0.16
128 0.13
129 0.15
130 0.16
131 0.15
132 0.17
133 0.17
134 0.19
135 0.2
136 0.21
137 0.23
138 0.28
139 0.29
140 0.29
141 0.28
142 0.27
143 0.25
144 0.25
145 0.2
146 0.14
147 0.15
148 0.15
149 0.15
150 0.17
151 0.2
152 0.2
153 0.2
154 0.21
155 0.24
156 0.24
157 0.29
158 0.29
159 0.28
160 0.28
161 0.29
162 0.26
163 0.19
164 0.17
165 0.12
166 0.1
167 0.09
168 0.07
169 0.07
170 0.07
171 0.07
172 0.08
173 0.08
174 0.08
175 0.13
176 0.13
177 0.14
178 0.16
179 0.19
180 0.18
181 0.18
182 0.18
183 0.13
184 0.15
185 0.15
186 0.13
187 0.11
188 0.13
189 0.15
190 0.15
191 0.16
192 0.19
193 0.2
194 0.27
195 0.3
196 0.36
197 0.4
198 0.45
199 0.52
200 0.56
201 0.57
202 0.57
203 0.57
204 0.53
205 0.49
206 0.45
207 0.37
208 0.31
209 0.28
210 0.21
211 0.18
212 0.17
213 0.18
214 0.17
215 0.21
216 0.21
217 0.27
218 0.34
219 0.4
220 0.44
221 0.51
222 0.59
223 0.63
224 0.71
225 0.71
226 0.71
227 0.68
228 0.63
229 0.61
230 0.56
231 0.5
232 0.41
233 0.35
234 0.34
235 0.34
236 0.31
237 0.3
238 0.28
239 0.25
240 0.26
241 0.25
242 0.2
243 0.15
244 0.15
245 0.1