FuNGI

P53742

Protein Details

Accession

P53742

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

13.7

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
1-22	MGTGKKEKSRRIREGDTKDGNL	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
478-479	KK

Subcellular Location(s)

nucl 21.5, cyto_nucl 13, cyto 3.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR030378 G_CP_dom IPR024929 GNL2_CP_dom IPR006073 GTP-bd IPR023179 GTP-bd_ortho_bundle_sf IPR012971 NOG2_N_dom IPR027417 P-loop_NTPase
Gene Ontology	GO:0005730 C:nucleolus GO:0005654 C:nucleoplasm GO:0005634 C:nucleus GO:0030687 C:preribosome, large subunit precursor GO:0005525 F:GTP binding GO:0003924 F:GTPase activity GO:0070180 F:large ribosomal subunit rRNA binding GO:2000200 P:regulation of ribosomal subunit export from nucleus GO:0000055 P:ribosomal large subunit export from nucleus
KEGG	sce:YNR053C -
Pfam	View protein in Pfam PF01926 MMR_HSR1 PF08153 NGP1NT
PROSITE	View protein in PROSITE PS51721 G_CP
CDD	cd01858 NGP_1

Amino Acid Sequences

MGTGKKEKSRRIREGDTKDGNLRVKGENFYRDSKRVKFLNMYTSGKEIRNKKGNLIRAASFQDSTIPDARVQPDRRWFGNTRVISQDALQHFRSALGETQKDTYQVLLRRNKLPMSLLEEKDADESPKARILDTESYADAFGPKAQRKRPRLAASNLEDLVKATNEDITKYEEKQVLDATLGLMGNQEDKENGWTSAAKEAIFSKGQSKRIWNELYKVIDSSDVVIHVLDARDPLGTRCKSVEEYMKKETPHKHLIYVLNKCDLVPTWVAAAWVKHLSKERPTLAFHASITNSFGKGSLIQLLRQFSQLHTDRKQISVGFIGYPNTGKSSIINTLRKKKVCQVAPIPGETKVWQYITLMKRIFLIDCPGIVPPSSKDSEEDILFRGVVRVEHVTHPEQYIPGVLKRCQVKHLERTYEISGWKDATEFIEILARKQGRLLKGGEPDESGVSKQILNDFNRGKIPWFVLPPEKEGEEKPKKKEVEKTA

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.86
2	0.87
3	0.83
4	0.77
5	0.71
6	0.69
7	0.62
8	0.55
9	0.49
10	0.45
11	0.41
12	0.42
13	0.43
14	0.44
15	0.45
16	0.5
17	0.53
18	0.55
19	0.58
20	0.58
21	0.61
22	0.57
23	0.59
24	0.59
25	0.57
26	0.59
27	0.59
28	0.58
29	0.52
30	0.53
31	0.51
32	0.47
33	0.5
34	0.48
35	0.5
36	0.55
37	0.55
38	0.59
39	0.63
40	0.66
41	0.66
42	0.64
43	0.56
44	0.51
45	0.54
46	0.48
47	0.4
48	0.32
49	0.29
50	0.26
51	0.27
52	0.26
53	0.23
54	0.22
55	0.26
56	0.3
57	0.34
58	0.37
59	0.4
60	0.46
61	0.5
62	0.5
63	0.53
64	0.52
65	0.51
66	0.56
67	0.51
68	0.46
69	0.45
70	0.45
71	0.38
72	0.36
73	0.36
74	0.3
75	0.33
76	0.29
77	0.25
78	0.24
79	0.24
80	0.24
81	0.19
82	0.19
83	0.21
84	0.22
85	0.23
86	0.26
87	0.26
88	0.26
89	0.24
90	0.22
91	0.21
92	0.24
93	0.32
94	0.37
95	0.41
96	0.45
97	0.48
98	0.47
99	0.43
100	0.41
101	0.35
102	0.36
103	0.39
104	0.35
105	0.34
106	0.33
107	0.32
108	0.31
109	0.28
110	0.21
111	0.15
112	0.15
113	0.15
114	0.19
115	0.19
116	0.17
117	0.17
118	0.21
119	0.24
120	0.26
121	0.26
122	0.21
123	0.21
124	0.21
125	0.2
126	0.15
127	0.1
128	0.11
129	0.16
130	0.21
131	0.28
132	0.36
133	0.46
134	0.52
135	0.6
136	0.67
137	0.68
138	0.7
139	0.7
140	0.71
141	0.66
142	0.64
143	0.56
144	0.47
145	0.38
146	0.31
147	0.25
148	0.17
149	0.12
150	0.07
151	0.1
152	0.1
153	0.11
154	0.11
155	0.16
156	0.18
157	0.19
158	0.24
159	0.24
160	0.24
161	0.24
162	0.24
163	0.19
164	0.17
165	0.15
166	0.11
167	0.09
168	0.08
169	0.07
170	0.06
171	0.06
172	0.07
173	0.07
174	0.07
175	0.06
176	0.07
177	0.09
178	0.1
179	0.1
180	0.1
181	0.11
182	0.11
183	0.15
184	0.15
185	0.12
186	0.12
187	0.13
188	0.15
189	0.14
190	0.14
191	0.18
192	0.23
193	0.27
194	0.29
195	0.33
196	0.32
197	0.39
198	0.43
199	0.37
200	0.35
201	0.36
202	0.36
203	0.32
204	0.3
205	0.23
206	0.18
207	0.16
208	0.14
209	0.09
210	0.07
211	0.06
212	0.06
213	0.06
214	0.06
215	0.06
216	0.05
217	0.05
218	0.05
219	0.05
220	0.05
221	0.07
222	0.14
223	0.14
224	0.15
225	0.15
226	0.17
227	0.18
228	0.2
229	0.28
230	0.26
231	0.31
232	0.35
233	0.37
234	0.36
235	0.41
236	0.44
237	0.42
238	0.45
239	0.41
240	0.37
241	0.4
242	0.46
243	0.47
244	0.46
245	0.41
246	0.34
247	0.33
248	0.32
249	0.27
250	0.2
251	0.15
252	0.11
253	0.1
254	0.08
255	0.08
256	0.09
257	0.09
258	0.09
259	0.08
260	0.12
261	0.12
262	0.14
263	0.17
264	0.2
265	0.24
266	0.3
267	0.31
268	0.3
269	0.32
270	0.33
271	0.31
272	0.3
273	0.25
274	0.23
275	0.2
276	0.18
277	0.19
278	0.16
279	0.14
280	0.12
281	0.12
282	0.09
283	0.1
284	0.1
285	0.13
286	0.13
287	0.14
288	0.17
289	0.19
290	0.19
291	0.21
292	0.21
293	0.15
294	0.23
295	0.27
296	0.3
297	0.31
298	0.36
299	0.35
300	0.36
301	0.38
302	0.3
303	0.26
304	0.22
305	0.2
306	0.16
307	0.15
308	0.15
309	0.14
310	0.14
311	0.13
312	0.12
313	0.12
314	0.11
315	0.11
316	0.13
317	0.19
318	0.26
319	0.33
320	0.38
321	0.48
322	0.56
323	0.57
324	0.57
325	0.59
326	0.6
327	0.57
328	0.59
329	0.56
330	0.57
331	0.57
332	0.57
333	0.5
334	0.42
335	0.38
336	0.31
337	0.27
338	0.2
339	0.18
340	0.15
341	0.15
342	0.23
343	0.24
344	0.3
345	0.28
346	0.25
347	0.27
348	0.27
349	0.27
350	0.2
351	0.22
352	0.16
353	0.15
354	0.16
355	0.15
356	0.14
357	0.14
358	0.14
359	0.11
360	0.16
361	0.17
362	0.17
363	0.18
364	0.21
365	0.25
366	0.24
367	0.24
368	0.21
369	0.2
370	0.19
371	0.17
372	0.14
373	0.12
374	0.11
375	0.12
376	0.13
377	0.14
378	0.18
379	0.22
380	0.24
381	0.24
382	0.26
383	0.24
384	0.22
385	0.2
386	0.2
387	0.18
388	0.2
389	0.23
390	0.23
391	0.28
392	0.34
393	0.36
394	0.39
395	0.45
396	0.49
397	0.55
398	0.62
399	0.64
400	0.59
401	0.62
402	0.6
403	0.55
404	0.49
405	0.41
406	0.34
407	0.28
408	0.26
409	0.21
410	0.18
411	0.16
412	0.17
413	0.14
414	0.13
415	0.18
416	0.17
417	0.18
418	0.26
419	0.24
420	0.21
421	0.27
422	0.32
423	0.29
424	0.34
425	0.36
426	0.35
427	0.42
428	0.44
429	0.41
430	0.36
431	0.35
432	0.32
433	0.3
434	0.24
435	0.19
436	0.18
437	0.17
438	0.17
439	0.23
440	0.27
441	0.28
442	0.36
443	0.37
444	0.39
445	0.42
446	0.41
447	0.38
448	0.36
449	0.37
450	0.34
451	0.35
452	0.37
453	0.42
454	0.43
455	0.45
456	0.44
457	0.42
458	0.38
459	0.39
460	0.45
461	0.47
462	0.52
463	0.55
464	0.6
465	0.65
466	0.69

P53742

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer