Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

P40050

Protein Details
Accession P40050    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
83-114NKTSKQLERINSKKRRQLKKLQKTAYPKDQAFHydrophilic
624-643LKGTERKKFLARRHLLRLKQBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
95-102KKRRQLKK
Subcellular Location(s) nucl 20, mito_nucl 12.833, cyto_nucl 11.833, mito 4.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR002885  Pentatricopeptide_repeat  
IPR011990  TPR-like_helical_dom_sf  
Gene Ontology GO:0005739  C:mitochondrion  
KEGG sce:YER077C  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF13041  PPR_2  
Amino Acid Sequences MGLKITKGQLRTKDLNQSSSKSSQSSRIGVDTCIFTRMLPRINTAINLTEHLLRRSFHSLTNLQKTQVKERLHELERHGFILNKTSKQLERINSKKRRQLKKLQKTAYPKDQAFHILRKFHKINNEALADTKLGPTSQSDLKFLSLTKDKRLFYTILGVNGEQLRDSKLIANDVQKFLKRGQLEKAVFLARLAKKKGVVGMNLIMKYYIEVVQSQQSAVDIFNWRKKWGVPIDQHSITILFNGLSKQENLVSKKYGELVLKTIDSLCDKNELTEIEYNTALAALINCTDETLVFKLLNKKCPGLKKDSITYTLMIRSCTRIADEKRFMVVLNDLMNKIPDYCVDSKLLFEYCEVICSQKSPKIEKQGMGLWALCEYFQFDKTIFKKYLTQSDFPTLVPLSHWNINKPFPLNKHVVGLFMNYCLKNKEYDLAMEIFKTLEAQNNQMLDQSIYHKYMETVITTRPITCGDECLDIYERVASSAQISITRRTLILVYNAFQRQSLKAVINKDASNAEATLHKIRGFIDSVEATYSSKLNGKVYRFNSWKFLFPIVKNLNMNDKVSTVELKSILDEYLKSLLNGEFGKEFKASIEDKRFVTLEGIRLVKVLTERIKLPSLDSEEIASLKGTERKKFLARRHLLRLKQILLEDLADIEGNSRRKGDSENTSTSEERIMEDLAELILETSYDKF
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.63
2 0.66
3 0.64
4 0.6
5 0.58
6 0.56
7 0.53
8 0.46
9 0.45
10 0.45
11 0.46
12 0.46
13 0.42
14 0.42
15 0.41
16 0.38
17 0.39
18 0.34
19 0.29
20 0.26
21 0.24
22 0.18
23 0.23
24 0.26
25 0.3
26 0.28
27 0.31
28 0.33
29 0.35
30 0.36
31 0.33
32 0.32
33 0.26
34 0.27
35 0.25
36 0.27
37 0.28
38 0.29
39 0.29
40 0.25
41 0.29
42 0.33
43 0.33
44 0.31
45 0.35
46 0.39
47 0.46
48 0.55
49 0.52
50 0.49
51 0.52
52 0.52
53 0.54
54 0.56
55 0.5
56 0.43
57 0.49
58 0.54
59 0.54
60 0.56
61 0.53
62 0.54
63 0.52
64 0.51
65 0.44
66 0.38
67 0.35
68 0.39
69 0.38
70 0.32
71 0.33
72 0.36
73 0.37
74 0.4
75 0.47
76 0.45
77 0.5
78 0.57
79 0.65
80 0.7
81 0.77
82 0.79
83 0.83
84 0.85
85 0.84
86 0.86
87 0.87
88 0.87
89 0.9
90 0.88
91 0.86
92 0.85
93 0.85
94 0.84
95 0.81
96 0.71
97 0.62
98 0.57
99 0.57
100 0.51
101 0.5
102 0.45
103 0.45
104 0.46
105 0.53
106 0.54
107 0.5
108 0.55
109 0.5
110 0.5
111 0.49
112 0.49
113 0.4
114 0.39
115 0.36
116 0.28
117 0.25
118 0.21
119 0.14
120 0.12
121 0.12
122 0.12
123 0.15
124 0.19
125 0.2
126 0.21
127 0.22
128 0.23
129 0.23
130 0.22
131 0.24
132 0.27
133 0.28
134 0.35
135 0.41
136 0.4
137 0.41
138 0.45
139 0.39
140 0.32
141 0.39
142 0.32
143 0.28
144 0.29
145 0.26
146 0.25
147 0.25
148 0.24
149 0.15
150 0.14
151 0.13
152 0.12
153 0.14
154 0.15
155 0.15
156 0.18
157 0.21
158 0.27
159 0.29
160 0.32
161 0.34
162 0.32
163 0.33
164 0.31
165 0.34
166 0.3
167 0.29
168 0.31
169 0.38
170 0.37
171 0.36
172 0.38
173 0.34
174 0.31
175 0.28
176 0.31
177 0.26
178 0.31
179 0.32
180 0.31
181 0.31
182 0.33
183 0.38
184 0.33
185 0.3
186 0.26
187 0.29
188 0.31
189 0.3
190 0.28
191 0.22
192 0.18
193 0.17
194 0.15
195 0.12
196 0.08
197 0.09
198 0.1
199 0.14
200 0.14
201 0.14
202 0.12
203 0.11
204 0.11
205 0.1
206 0.12
207 0.13
208 0.17
209 0.23
210 0.25
211 0.25
212 0.26
213 0.27
214 0.32
215 0.34
216 0.39
217 0.39
218 0.44
219 0.51
220 0.5
221 0.49
222 0.41
223 0.35
224 0.25
225 0.19
226 0.13
227 0.06
228 0.07
229 0.07
230 0.08
231 0.08
232 0.09
233 0.09
234 0.13
235 0.18
236 0.2
237 0.23
238 0.23
239 0.22
240 0.23
241 0.24
242 0.24
243 0.2
244 0.18
245 0.17
246 0.17
247 0.17
248 0.16
249 0.15
250 0.13
251 0.13
252 0.13
253 0.11
254 0.13
255 0.13
256 0.13
257 0.15
258 0.14
259 0.14
260 0.17
261 0.17
262 0.15
263 0.15
264 0.14
265 0.13
266 0.12
267 0.09
268 0.05
269 0.05
270 0.04
271 0.04
272 0.05
273 0.05
274 0.05
275 0.05
276 0.05
277 0.06
278 0.07
279 0.08
280 0.07
281 0.1
282 0.19
283 0.23
284 0.3
285 0.3
286 0.31
287 0.35
288 0.43
289 0.44
290 0.44
291 0.46
292 0.43
293 0.47
294 0.46
295 0.45
296 0.38
297 0.35
298 0.28
299 0.26
300 0.23
301 0.19
302 0.17
303 0.16
304 0.15
305 0.15
306 0.15
307 0.18
308 0.22
309 0.28
310 0.3
311 0.29
312 0.29
313 0.29
314 0.27
315 0.21
316 0.18
317 0.11
318 0.11
319 0.11
320 0.11
321 0.11
322 0.11
323 0.1
324 0.1
325 0.08
326 0.06
327 0.1
328 0.11
329 0.13
330 0.14
331 0.14
332 0.14
333 0.15
334 0.15
335 0.11
336 0.09
337 0.1
338 0.08
339 0.09
340 0.09
341 0.09
342 0.08
343 0.1
344 0.12
345 0.12
346 0.16
347 0.21
348 0.25
349 0.34
350 0.37
351 0.36
352 0.37
353 0.37
354 0.35
355 0.31
356 0.26
357 0.17
358 0.14
359 0.13
360 0.1
361 0.07
362 0.07
363 0.07
364 0.08
365 0.09
366 0.08
367 0.16
368 0.17
369 0.23
370 0.22
371 0.22
372 0.28
373 0.3
374 0.39
375 0.36
376 0.37
377 0.33
378 0.36
379 0.36
380 0.29
381 0.29
382 0.19
383 0.16
384 0.14
385 0.14
386 0.14
387 0.18
388 0.19
389 0.2
390 0.23
391 0.25
392 0.27
393 0.27
394 0.28
395 0.26
396 0.31
397 0.31
398 0.29
399 0.3
400 0.28
401 0.26
402 0.22
403 0.21
404 0.16
405 0.14
406 0.17
407 0.14
408 0.15
409 0.15
410 0.16
411 0.15
412 0.16
413 0.16
414 0.14
415 0.14
416 0.16
417 0.16
418 0.15
419 0.14
420 0.13
421 0.1
422 0.09
423 0.1
424 0.08
425 0.11
426 0.12
427 0.14
428 0.17
429 0.17
430 0.18
431 0.17
432 0.17
433 0.12
434 0.12
435 0.14
436 0.14
437 0.15
438 0.15
439 0.14
440 0.14
441 0.16
442 0.16
443 0.14
444 0.13
445 0.13
446 0.17
447 0.17
448 0.17
449 0.15
450 0.16
451 0.17
452 0.15
453 0.17
454 0.15
455 0.17
456 0.16
457 0.18
458 0.19
459 0.16
460 0.16
461 0.15
462 0.13
463 0.12
464 0.12
465 0.09
466 0.08
467 0.1
468 0.1
469 0.13
470 0.15
471 0.17
472 0.18
473 0.18
474 0.17
475 0.17
476 0.17
477 0.15
478 0.18
479 0.17
480 0.17
481 0.22
482 0.24
483 0.23
484 0.23
485 0.23
486 0.19
487 0.2
488 0.23
489 0.2
490 0.23
491 0.27
492 0.31
493 0.33
494 0.32
495 0.3
496 0.27
497 0.24
498 0.22
499 0.18
500 0.14
501 0.12
502 0.15
503 0.18
504 0.18
505 0.18
506 0.18
507 0.18
508 0.2
509 0.2
510 0.17
511 0.17
512 0.16
513 0.16
514 0.16
515 0.16
516 0.13
517 0.13
518 0.13
519 0.1
520 0.14
521 0.15
522 0.2
523 0.25
524 0.28
525 0.36
526 0.4
527 0.48
528 0.48
529 0.49
530 0.51
531 0.48
532 0.49
533 0.43
534 0.46
535 0.43
536 0.39
537 0.47
538 0.42
539 0.46
540 0.43
541 0.42
542 0.44
543 0.4
544 0.41
545 0.31
546 0.29
547 0.24
548 0.24
549 0.25
550 0.16
551 0.17
552 0.16
553 0.15
554 0.16
555 0.15
556 0.14
557 0.13
558 0.13
559 0.12
560 0.15
561 0.15
562 0.14
563 0.16
564 0.15
565 0.18
566 0.18
567 0.17
568 0.16
569 0.16
570 0.18
571 0.16
572 0.16
573 0.13
574 0.18
575 0.19
576 0.25
577 0.33
578 0.34
579 0.35
580 0.38
581 0.37
582 0.33
583 0.35
584 0.29
585 0.25
586 0.27
587 0.27
588 0.24
589 0.24
590 0.23
591 0.21
592 0.19
593 0.21
594 0.21
595 0.23
596 0.25
597 0.29
598 0.33
599 0.31
600 0.32
601 0.33
602 0.34
603 0.33
604 0.32
605 0.29
606 0.26
607 0.26
608 0.24
609 0.18
610 0.12
611 0.14
612 0.2
613 0.23
614 0.28
615 0.32
616 0.37
617 0.46
618 0.54
619 0.6
620 0.65
621 0.69
622 0.72
623 0.79
624 0.82
625 0.78
626 0.78
627 0.76
628 0.69
629 0.63
630 0.56
631 0.48
632 0.4
633 0.35
634 0.26
635 0.19
636 0.16
637 0.12
638 0.1
639 0.1
640 0.15
641 0.17
642 0.18
643 0.19
644 0.19
645 0.21
646 0.27
647 0.33
648 0.37
649 0.42
650 0.47
651 0.49
652 0.53
653 0.52
654 0.48
655 0.43
656 0.34
657 0.28
658 0.23
659 0.2
660 0.16
661 0.15
662 0.15
663 0.11
664 0.1
665 0.08
666 0.06
667 0.06
668 0.05