FuNGI

P38861

Protein Details

Accession

P38861

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

12.6

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
394-425	DVVLVKKLYQRKSKKSRHWKLKRMAKEHKDID	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
403-419	QRKSKKSRHWKLKRMAK

Subcellular Location(s)

nucl 19.5, cyto_nucl 15, cyto 7.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR039768 Nmd3 IPR007064 Nmd3_N
Gene Ontology	GO:0005737 C:cytoplasm GO:0005829 C:cytosol GO:0005654 C:nucleoplasm GO:0005634 C:nucleus GO:0070180 F:large ribosomal subunit rRNA binding GO:0043023 F:ribosomal large subunit binding GO:0015031 P:protein transport GO:0000055 P:ribosomal large subunit export from nucleus
KEGG	sce:YHR170W -
Pfam	View protein in Pfam PF04981 NMD3

Amino Acid Sequences

MEFTPIDPHQHQNAATLLCCNCGTPIDGSTGLVMCYDCIKLTVDITQGIPREANISFCRNCERFLQPPGQWIRAELESRELLAICLRRLKGLTKVRLVDASFIWTEPHSRRIRIKLTVQGEAMTNTIIQQTFEVEYIVIAMQCPDCARSYTTNTWRATVQIRQKVPHKRTFLFLEQLILKHNAHVDTISISEAKDGLDFFYAQKNHAVKMIDFLNAVVPIKHKKSEELISQDTHTGASTYKFSYSVEIVPICKDDLVVLPKKLAKSMGNISQFVLCSKISNTVQFMDPTTLQTADLSPSVYWRAPFNALADVTQLVEFIVLDVDSTGISRGNRVLADITVARTSDLGVNDQVYYVRSHLGGICHAGDSVMGYFIANSNYNSDLFDGLNIDYVPDVVLVKKLYQRKSKKSRHWKLKRMAKEHKDIDASLDYNSRAQKQEMERAEKDYELFLQELEEDAELRQSVNLYKNREANVPPEEHEMDEDEDEDAPQINIDELLDELDEMTLEDGVENTPVESQQ

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.33
2	0.31
3	0.3
4	0.26
5	0.24
6	0.24
7	0.21
8	0.17
9	0.17
10	0.18
11	0.15
12	0.16
13	0.18
14	0.18
15	0.18
16	0.18
17	0.17
18	0.15
19	0.14
20	0.12
21	0.09
22	0.1
23	0.1
24	0.09
25	0.1
26	0.12
27	0.12
28	0.14
29	0.16
30	0.16
31	0.17
32	0.19
33	0.22
34	0.21
35	0.21
36	0.2
37	0.17
38	0.18
39	0.17
40	0.21
41	0.21
42	0.27
43	0.27
44	0.29
45	0.38
46	0.36
47	0.37
48	0.37
49	0.4
50	0.39
51	0.44
52	0.49
53	0.42
54	0.5
55	0.53
56	0.52
57	0.45
58	0.4
59	0.38
60	0.35
61	0.36
62	0.28
63	0.27
64	0.23
65	0.24
66	0.23
67	0.19
68	0.15
69	0.17
70	0.19
71	0.16
72	0.22
73	0.21
74	0.23
75	0.24
76	0.27
77	0.33
78	0.4
79	0.45
80	0.46
81	0.48
82	0.48
83	0.5
84	0.48
85	0.41
86	0.31
87	0.28
88	0.22
89	0.19
90	0.18
91	0.15
92	0.19
93	0.19
94	0.28
95	0.28
96	0.32
97	0.39
98	0.46
99	0.52
100	0.53
101	0.57
102	0.56
103	0.57
104	0.55
105	0.49
106	0.42
107	0.36
108	0.3
109	0.25
110	0.16
111	0.12
112	0.09
113	0.1
114	0.09
115	0.09
116	0.08
117	0.1
118	0.1
119	0.1
120	0.1
121	0.08
122	0.07
123	0.08
124	0.08
125	0.06
126	0.05
127	0.06
128	0.06
129	0.06
130	0.07
131	0.07
132	0.08
133	0.1
134	0.13
135	0.16
136	0.23
137	0.31
138	0.38
139	0.45
140	0.44
141	0.44
142	0.41
143	0.4
144	0.37
145	0.36
146	0.38
147	0.38
148	0.4
149	0.43
150	0.51
151	0.58
152	0.61
153	0.63
154	0.6
155	0.54
156	0.55
157	0.57
158	0.53
159	0.47
160	0.4
161	0.35
162	0.3
163	0.29
164	0.27
165	0.23
166	0.19
167	0.16
168	0.18
169	0.15
170	0.14
171	0.13
172	0.11
173	0.09
174	0.1
175	0.1
176	0.08
177	0.07
178	0.07
179	0.07
180	0.07
181	0.06
182	0.06
183	0.06
184	0.06
185	0.07
186	0.08
187	0.14
188	0.14
189	0.14
190	0.2
191	0.2
192	0.2
193	0.22
194	0.23
195	0.17
196	0.2
197	0.2
198	0.15
199	0.15
200	0.14
201	0.12
202	0.11
203	0.11
204	0.08
205	0.09
206	0.13
207	0.15
208	0.18
209	0.17
210	0.19
211	0.23
212	0.27
213	0.3
214	0.32
215	0.33
216	0.31
217	0.31
218	0.29
219	0.25
220	0.2
221	0.15
222	0.09
223	0.07
224	0.07
225	0.08
226	0.08
227	0.09
228	0.09
229	0.09
230	0.1
231	0.11
232	0.11
233	0.11
234	0.11
235	0.11
236	0.11
237	0.12
238	0.1
239	0.09
240	0.08
241	0.06
242	0.08
243	0.12
244	0.14
245	0.14
246	0.16
247	0.18
248	0.18
249	0.18
250	0.18
251	0.14
252	0.16
253	0.2
254	0.25
255	0.25
256	0.26
257	0.26
258	0.24
259	0.23
260	0.2
261	0.17
262	0.1
263	0.09
264	0.09
265	0.14
266	0.13
267	0.15
268	0.16
269	0.16
270	0.17
271	0.16
272	0.17
273	0.13
274	0.13
275	0.12
276	0.12
277	0.11
278	0.1
279	0.1
280	0.09
281	0.08
282	0.08
283	0.08
284	0.07
285	0.08
286	0.1
287	0.1
288	0.1
289	0.1
290	0.12
291	0.13
292	0.14
293	0.14
294	0.15
295	0.14
296	0.14
297	0.13
298	0.12
299	0.1
300	0.09
301	0.08
302	0.05
303	0.05
304	0.04
305	0.04
306	0.04
307	0.03
308	0.03
309	0.03
310	0.03
311	0.03
312	0.03
313	0.04
314	0.05
315	0.06
316	0.07
317	0.08
318	0.09
319	0.09
320	0.1
321	0.1
322	0.09
323	0.11
324	0.11
325	0.11
326	0.1
327	0.1
328	0.1
329	0.09
330	0.1
331	0.1
332	0.1
333	0.11
334	0.11
335	0.11
336	0.11
337	0.12
338	0.11
339	0.09
340	0.09
341	0.09
342	0.09
343	0.08
344	0.09
345	0.11
346	0.11
347	0.11
348	0.12
349	0.12
350	0.11
351	0.11
352	0.1
353	0.08
354	0.07
355	0.07
356	0.05
357	0.05
358	0.05
359	0.05
360	0.06
361	0.08
362	0.09
363	0.09
364	0.11
365	0.12
366	0.12
367	0.13
368	0.13
369	0.12
370	0.11
371	0.11
372	0.1
373	0.09
374	0.1
375	0.09
376	0.08
377	0.07
378	0.07
379	0.07
380	0.06
381	0.06
382	0.05
383	0.08
384	0.09
385	0.11
386	0.17
387	0.25
388	0.32
389	0.42
390	0.51
391	0.6
392	0.7
393	0.78
394	0.84
395	0.88
396	0.91
397	0.93
398	0.94
399	0.93
400	0.93
401	0.92
402	0.91
403	0.9
404	0.9
405	0.87
406	0.85
407	0.79
408	0.75
409	0.68
410	0.58
411	0.52
412	0.45
413	0.38
414	0.29
415	0.28
416	0.22
417	0.23
418	0.26
419	0.25
420	0.23
421	0.24
422	0.3
423	0.33
424	0.42
425	0.46
426	0.51
427	0.49
428	0.51
429	0.52
430	0.45
431	0.4
432	0.33
433	0.27
434	0.21
435	0.19
436	0.14
437	0.13
438	0.12
439	0.12
440	0.11
441	0.09
442	0.08
443	0.08
444	0.09
445	0.09
446	0.09
447	0.09
448	0.1
449	0.14
450	0.22
451	0.27
452	0.32
453	0.37
454	0.43
455	0.44
456	0.48
457	0.46
458	0.44
459	0.45
460	0.42
461	0.38
462	0.39
463	0.38
464	0.34
465	0.33
466	0.3
467	0.26
468	0.23
469	0.21
470	0.16
471	0.15
472	0.14
473	0.13
474	0.11
475	0.09
476	0.08
477	0.08
478	0.07
479	0.07
480	0.07
481	0.07
482	0.06
483	0.07
484	0.07
485	0.06
486	0.06
487	0.06
488	0.06
489	0.06
490	0.06
491	0.05
492	0.05
493	0.06
494	0.06
495	0.06
496	0.08
497	0.08
498	0.07

P38861

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer