Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

P38336

Protein Details
Accession P38336    Localization Confidence Low Confidence Score 9.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
41-61GLTSRLQRQQRKSKLNLDNLQHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 15, cyto_nucl 11, mito 5, cyto 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR016848  RNase_P/MRP_Rpp29-subunit  
IPR036980  RNase_P/MRP_Rpp29_sf  
IPR023534  Rof/RNase_P-like  
IPR002730  Rpp29/RNP1  
Gene Ontology GO:0005655  C:nucleolar ribonuclease P complex  
GO:0000172  C:ribonuclease MRP complex  
GO:0030677  C:ribonuclease P complex  
GO:0033204  F:ribonuclease P RNA binding  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0042134  F:rRNA primary transcript binding  
GO:0034965  P:intronic box C/D RNA processing  
GO:0000460  P:maturation of 5.8S rRNA  
GO:0000294  P:nuclear-transcribed mRNA catabolic process, RNase MRP-dependent  
GO:0090502  P:RNA phosphodiester bond hydrolysis, endonucleolytic  
GO:0006364  P:rRNA processing  
GO:0001682  P:tRNA 5'-leader removal  
GO:0008033  P:tRNA processing  
KEGG sce:YBR257W  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF01868  RNase_P-MRP_p29  
Amino Acid Sequences MDRTQTFIKDCLFTKCLEDPEKPFNENRFQDTLLLLPTDGGLTSRLQRQQRKSKLNLDNLQKVSQLESADKQLEKRDYQRINKNSKIALREYINNCKKNTKKCLKLAYENKITDKEDLLHYIEEKHPTIYESLPQYVDFVPMYKELWINYIKELLNITKNLKTFNGSLALLKLSMADYNGALLRVTKSKNKTLIGLQGIVIWDSQKFFIMIVKGNIIDEIKCIPKKGTVFQFEIPISDDDDSALRYSILGDRFKYRSVDRAGRKFKSRRCDDMLYYIQN
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.33
2 0.34
3 0.38
4 0.39
5 0.42
6 0.4
7 0.48
8 0.51
9 0.49
10 0.5
11 0.48
12 0.53
13 0.52
14 0.52
15 0.47
16 0.43
17 0.42
18 0.37
19 0.33
20 0.25
21 0.22
22 0.16
23 0.12
24 0.11
25 0.09
26 0.08
27 0.07
28 0.07
29 0.08
30 0.12
31 0.18
32 0.24
33 0.32
34 0.41
35 0.51
36 0.6
37 0.69
38 0.75
39 0.76
40 0.8
41 0.81
42 0.82
43 0.8
44 0.77
45 0.76
46 0.69
47 0.64
48 0.55
49 0.46
50 0.38
51 0.33
52 0.26
53 0.2
54 0.19
55 0.21
56 0.23
57 0.23
58 0.23
59 0.26
60 0.3
61 0.31
62 0.34
63 0.4
64 0.45
65 0.53
66 0.61
67 0.64
68 0.68
69 0.69
70 0.68
71 0.63
72 0.59
73 0.54
74 0.47
75 0.43
76 0.37
77 0.4
78 0.41
79 0.47
80 0.51
81 0.51
82 0.5
83 0.54
84 0.58
85 0.59
86 0.65
87 0.64
88 0.64
89 0.68
90 0.76
91 0.73
92 0.77
93 0.76
94 0.74
95 0.72
96 0.65
97 0.59
98 0.53
99 0.48
100 0.38
101 0.31
102 0.24
103 0.17
104 0.18
105 0.17
106 0.14
107 0.13
108 0.14
109 0.15
110 0.16
111 0.16
112 0.14
113 0.13
114 0.13
115 0.14
116 0.12
117 0.14
118 0.13
119 0.14
120 0.14
121 0.13
122 0.14
123 0.13
124 0.13
125 0.1
126 0.08
127 0.08
128 0.08
129 0.09
130 0.08
131 0.08
132 0.07
133 0.1
134 0.12
135 0.11
136 0.11
137 0.15
138 0.14
139 0.14
140 0.15
141 0.14
142 0.15
143 0.16
144 0.18
145 0.17
146 0.18
147 0.19
148 0.18
149 0.19
150 0.17
151 0.17
152 0.17
153 0.14
154 0.14
155 0.14
156 0.14
157 0.11
158 0.1
159 0.09
160 0.06
161 0.06
162 0.06
163 0.05
164 0.05
165 0.06
166 0.07
167 0.06
168 0.06
169 0.07
170 0.08
171 0.12
172 0.15
173 0.2
174 0.25
175 0.31
176 0.37
177 0.37
178 0.38
179 0.37
180 0.42
181 0.38
182 0.34
183 0.28
184 0.24
185 0.23
186 0.2
187 0.17
188 0.1
189 0.08
190 0.08
191 0.08
192 0.07
193 0.07
194 0.07
195 0.1
196 0.11
197 0.13
198 0.14
199 0.15
200 0.15
201 0.15
202 0.16
203 0.14
204 0.12
205 0.1
206 0.12
207 0.17
208 0.18
209 0.19
210 0.19
211 0.24
212 0.27
213 0.34
214 0.39
215 0.39
216 0.42
217 0.43
218 0.47
219 0.42
220 0.4
221 0.35
222 0.27
223 0.23
224 0.19
225 0.17
226 0.12
227 0.13
228 0.13
229 0.11
230 0.11
231 0.08
232 0.08
233 0.1
234 0.14
235 0.18
236 0.21
237 0.22
238 0.28
239 0.31
240 0.34
241 0.37
242 0.34
243 0.37
244 0.42
245 0.5
246 0.53
247 0.62
248 0.68
249 0.7
250 0.78
251 0.8
252 0.78
253 0.8
254 0.78
255 0.76
256 0.75
257 0.76
258 0.7
259 0.7