Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

P53851

Protein Details
Accession P53851    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
386-405IEKRRKNNGGGNNHNKRTSKBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
389-422RRKNNGGGNNHNKRTSKNTDRIGKDRPSRFNSKK
Subcellular Location(s) nucl 17.5, cyto_nucl 12.833, cyto 7, cyto_mito 4.833
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR040132  Tex1/THOC3  
IPR015943  WD40/YVTN_repeat-like_dom_sf  
IPR001680  WD40_repeat  
IPR036322  WD40_repeat_dom_sf  
Gene Ontology GO:0000445  C:THO complex part of transcription export complex  
GO:0000346  C:transcription export complex  
GO:0003729  F:mRNA binding  
GO:0006406  P:mRNA export from nucleus  
GO:0006368  P:transcription elongation by RNA polymerase II  
KEGG sce:YNL253W  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00400  WD40  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50082  WD_REPEATS_2  
PS50294  WD_REPEATS_REGION  
Amino Acid Sequences MSTIGAVDILNQKTITSEVAASVTSKYLQSTFSKGNTSHIEDKRFIHVSSRSHSRFTSTPITPNEILSLKFHVSGSSMAYSRMDGSLTVWFIKDASFDKSVEVYIPDCCGSDKLATDLSWNPTSLNQIAVVSNSSEISLLLINEKSLTASKLRTLSLGSKTKVNTCLYDPLGNWLLAATKSEKIYLFDVKKDHSSVCSLNISDISQEDNDVVYSLAWSNGGSHIFIGFKSGYLAILKAKHGILEVCTKIKAHTGPITEIKMDPWGRNFITGSIDGNCYVWNMKSLCCELIINDLNSAVTTLDVCHLGKILGICTEDEMVYFYDLNSGNLLHSKSLANYKTDPVLKFYPDKSWYIMSGKNDTLSNHFVKNEKNLITYWKDMFDNTMIEKRRKNNGGGNNHNKRTSKNTDRIGKDRPSRFNSKK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.2
2 0.18
3 0.13
4 0.12
5 0.12
6 0.13
7 0.13
8 0.13
9 0.13
10 0.13
11 0.13
12 0.12
13 0.13
14 0.13
15 0.17
16 0.19
17 0.24
18 0.28
19 0.3
20 0.35
21 0.34
22 0.39
23 0.41
24 0.45
25 0.49
26 0.5
27 0.52
28 0.5
29 0.52
30 0.53
31 0.5
32 0.43
33 0.4
34 0.4
35 0.4
36 0.43
37 0.5
38 0.46
39 0.46
40 0.46
41 0.44
42 0.4
43 0.42
44 0.44
45 0.36
46 0.41
47 0.41
48 0.48
49 0.43
50 0.41
51 0.39
52 0.32
53 0.3
54 0.25
55 0.25
56 0.2
57 0.2
58 0.2
59 0.17
60 0.16
61 0.16
62 0.17
63 0.17
64 0.16
65 0.15
66 0.16
67 0.16
68 0.15
69 0.15
70 0.12
71 0.09
72 0.1
73 0.12
74 0.13
75 0.13
76 0.12
77 0.12
78 0.12
79 0.12
80 0.13
81 0.11
82 0.15
83 0.16
84 0.16
85 0.17
86 0.18
87 0.18
88 0.16
89 0.16
90 0.12
91 0.11
92 0.12
93 0.11
94 0.11
95 0.11
96 0.11
97 0.11
98 0.12
99 0.12
100 0.12
101 0.14
102 0.14
103 0.16
104 0.18
105 0.22
106 0.21
107 0.21
108 0.19
109 0.19
110 0.22
111 0.2
112 0.17
113 0.13
114 0.12
115 0.12
116 0.12
117 0.12
118 0.09
119 0.09
120 0.08
121 0.07
122 0.07
123 0.06
124 0.06
125 0.06
126 0.06
127 0.07
128 0.07
129 0.07
130 0.07
131 0.07
132 0.08
133 0.08
134 0.09
135 0.1
136 0.11
137 0.14
138 0.16
139 0.17
140 0.16
141 0.18
142 0.21
143 0.27
144 0.32
145 0.3
146 0.31
147 0.32
148 0.35
149 0.39
150 0.35
151 0.29
152 0.25
153 0.3
154 0.28
155 0.29
156 0.25
157 0.24
158 0.24
159 0.22
160 0.19
161 0.13
162 0.13
163 0.1
164 0.12
165 0.1
166 0.1
167 0.11
168 0.12
169 0.13
170 0.13
171 0.16
172 0.22
173 0.21
174 0.22
175 0.23
176 0.24
177 0.25
178 0.25
179 0.23
180 0.17
181 0.18
182 0.16
183 0.17
184 0.17
185 0.15
186 0.14
187 0.14
188 0.13
189 0.1
190 0.1
191 0.08
192 0.07
193 0.07
194 0.06
195 0.06
196 0.06
197 0.06
198 0.05
199 0.04
200 0.04
201 0.04
202 0.04
203 0.04
204 0.04
205 0.04
206 0.06
207 0.06
208 0.06
209 0.06
210 0.06
211 0.07
212 0.07
213 0.08
214 0.07
215 0.06
216 0.07
217 0.07
218 0.07
219 0.07
220 0.08
221 0.08
222 0.1
223 0.1
224 0.11
225 0.11
226 0.11
227 0.11
228 0.11
229 0.11
230 0.15
231 0.16
232 0.15
233 0.16
234 0.16
235 0.16
236 0.18
237 0.18
238 0.16
239 0.19
240 0.19
241 0.22
242 0.25
243 0.26
244 0.24
245 0.23
246 0.2
247 0.22
248 0.22
249 0.19
250 0.18
251 0.21
252 0.21
253 0.22
254 0.22
255 0.17
256 0.18
257 0.17
258 0.16
259 0.14
260 0.14
261 0.13
262 0.13
263 0.11
264 0.1
265 0.1
266 0.09
267 0.11
268 0.11
269 0.12
270 0.15
271 0.16
272 0.16
273 0.16
274 0.16
275 0.12
276 0.19
277 0.2
278 0.18
279 0.17
280 0.16
281 0.15
282 0.15
283 0.15
284 0.07
285 0.05
286 0.04
287 0.05
288 0.06
289 0.08
290 0.08
291 0.07
292 0.08
293 0.08
294 0.09
295 0.09
296 0.09
297 0.09
298 0.1
299 0.1
300 0.1
301 0.11
302 0.1
303 0.09
304 0.1
305 0.08
306 0.09
307 0.09
308 0.08
309 0.12
310 0.12
311 0.13
312 0.12
313 0.12
314 0.11
315 0.15
316 0.16
317 0.11
318 0.12
319 0.13
320 0.14
321 0.22
322 0.24
323 0.24
324 0.26
325 0.28
326 0.33
327 0.37
328 0.36
329 0.34
330 0.35
331 0.35
332 0.38
333 0.37
334 0.39
335 0.37
336 0.38
337 0.36
338 0.34
339 0.34
340 0.33
341 0.36
342 0.32
343 0.34
344 0.33
345 0.32
346 0.32
347 0.3
348 0.31
349 0.32
350 0.31
351 0.29
352 0.3
353 0.31
354 0.33
355 0.39
356 0.41
357 0.37
358 0.36
359 0.34
360 0.38
361 0.4
362 0.41
363 0.36
364 0.32
365 0.31
366 0.29
367 0.31
368 0.27
369 0.25
370 0.24
371 0.3
372 0.32
373 0.37
374 0.44
375 0.47
376 0.55
377 0.57
378 0.6
379 0.61
380 0.66
381 0.7
382 0.75
383 0.79
384 0.79
385 0.8
386 0.8
387 0.73
388 0.68
389 0.66
390 0.66
391 0.65
392 0.64
393 0.68
394 0.71
395 0.77
396 0.79
397 0.78
398 0.78
399 0.77
400 0.77
401 0.77
402 0.75