Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

P53551

Protein Details
Accession P53551    Localization Confidence High Confidence Score 17
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1-28MAPKKSTTKTTSKGKKPATSKGKEKSTSHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
9-40KTTSKGKKPATSKGKEKSTSKAAIKKTTAKKE
109-165PAGAVKLAKKKSPEVKKEKEVSPKPKQAATSVSATASKAKAASTKLAPKKVVKKKSP
Subcellular Location(s) nucl 19, mito 5, cyto 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR005819  H1/H5  
IPR005818  Histone_H1/H5_H15  
IPR036388  WH-like_DNA-bd_sf  
IPR036390  WH_DNA-bd_sf  
Gene Ontology GO:0000785  C:chromatin  
GO:0000786  C:nucleosome  
GO:0005634  C:nucleus  
GO:0032993  C:protein-DNA complex  
GO:0031490  F:chromatin DNA binding  
GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0003690  F:double-stranded DNA binding  
GO:0060090  F:molecular adaptor activity  
GO:0003676  F:nucleic acid binding  
GO:0031492  F:nucleosomal DNA binding  
GO:0042301  F:phosphate ion binding  
GO:0030527  F:structural constituent of chromatin  
GO:0097100  F:supercoiled DNA binding  
GO:0030261  P:chromosome condensation  
GO:0045910  P:negative regulation of DNA recombination  
GO:0006334  P:nucleosome assembly  
GO:0006355  P:regulation of DNA-templated transcription  
KEGG sce:YPL127C  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00538  Linker_histone  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51504  H15  
CDD cd00073  H15  
Amino Acid Sequences MAPKKSTTKTTSKGKKPATSKGKEKSTSKAAIKKTTAKKEEASSKSYRELIIEGLTALKERKGSSRPALKKFIKENYPIVGSASNFDLYFNNAIKKGVEAGDFEQPKGPAGAVKLAKKKSPEVKKEKEVSPKPKQAATSVSATASKAKAASTKLAPKKVVKKKSPTVTAKKASSPSSLTYKEMILKSMPQLNDGKGSSRIVLKKYVKDTFSSKLKTSSNFDYLFNSAIKKCVENGELVQPKGPSGIIKLNKKKVKLST
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.8
2 0.82
3 0.79
4 0.82
5 0.81
6 0.8
7 0.8
8 0.79
9 0.8
10 0.79
11 0.76
12 0.73
13 0.7
14 0.7
15 0.68
16 0.67
17 0.64
18 0.65
19 0.67
20 0.69
21 0.7
22 0.72
23 0.69
24 0.65
25 0.63
26 0.62
27 0.66
28 0.61
29 0.57
30 0.51
31 0.49
32 0.49
33 0.47
34 0.4
35 0.31
36 0.28
37 0.23
38 0.2
39 0.17
40 0.13
41 0.11
42 0.11
43 0.11
44 0.1
45 0.1
46 0.11
47 0.12
48 0.18
49 0.2
50 0.27
51 0.34
52 0.44
53 0.51
54 0.55
55 0.64
56 0.62
57 0.66
58 0.67
59 0.66
60 0.62
61 0.58
62 0.54
63 0.48
64 0.45
65 0.38
66 0.32
67 0.26
68 0.2
69 0.17
70 0.16
71 0.13
72 0.11
73 0.11
74 0.1
75 0.1
76 0.13
77 0.13
78 0.13
79 0.13
80 0.14
81 0.13
82 0.13
83 0.13
84 0.11
85 0.11
86 0.11
87 0.12
88 0.19
89 0.19
90 0.19
91 0.2
92 0.18
93 0.18
94 0.16
95 0.14
96 0.08
97 0.09
98 0.15
99 0.16
100 0.21
101 0.27
102 0.29
103 0.31
104 0.32
105 0.37
106 0.41
107 0.47
108 0.51
109 0.55
110 0.6
111 0.66
112 0.69
113 0.68
114 0.69
115 0.68
116 0.67
117 0.66
118 0.66
119 0.6
120 0.57
121 0.52
122 0.44
123 0.4
124 0.33
125 0.27
126 0.21
127 0.2
128 0.18
129 0.17
130 0.17
131 0.14
132 0.12
133 0.09
134 0.09
135 0.11
136 0.12
137 0.15
138 0.18
139 0.27
140 0.32
141 0.36
142 0.38
143 0.42
144 0.51
145 0.57
146 0.63
147 0.61
148 0.64
149 0.69
150 0.74
151 0.77
152 0.76
153 0.75
154 0.74
155 0.74
156 0.68
157 0.63
158 0.59
159 0.51
160 0.45
161 0.39
162 0.33
163 0.33
164 0.32
165 0.3
166 0.27
167 0.26
168 0.29
169 0.26
170 0.25
171 0.19
172 0.19
173 0.2
174 0.25
175 0.23
176 0.21
177 0.23
178 0.23
179 0.26
180 0.25
181 0.25
182 0.22
183 0.23
184 0.21
185 0.25
186 0.28
187 0.25
188 0.34
189 0.37
190 0.41
191 0.48
192 0.52
193 0.47
194 0.47
195 0.49
196 0.47
197 0.5
198 0.48
199 0.43
200 0.43
201 0.45
202 0.46
203 0.48
204 0.47
205 0.44
206 0.42
207 0.41
208 0.38
209 0.36
210 0.34
211 0.29
212 0.26
213 0.2
214 0.23
215 0.23
216 0.21
217 0.21
218 0.25
219 0.25
220 0.24
221 0.27
222 0.33
223 0.37
224 0.37
225 0.38
226 0.32
227 0.31
228 0.29
229 0.27
230 0.18
231 0.17
232 0.26
233 0.31
234 0.42
235 0.51
236 0.6
237 0.66
238 0.69