FuNGI

P53313

Protein Details

Accession

P53313

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

14.8

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
305-327	KLENAIKTVKKKKKNGPGAPQGY	Hydrophilic
701-753	REGRDKFGSRRGKRDNMRSTTNREKERRKNFVMSIHKRSVRGKQKMSLRDKQK	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
296-321	NKKTGRRGKKLENAIKTVKKKKKNGP
701-766	REGRDKFGSRRGKRDNMRSTTNREKERRKNFVMSIHKRSVRGKQKMSLRDKQKVLRAHITKQKKKG

Subcellular Location(s)

mito_nucl 13.666, nucl 13.5, mito 12.5, cyto_mito 7.833

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR016024 ARM-type_fold IPR027312 Sda1 IPR007949 SDA1_C IPR012977 SDA1_N
Gene Ontology	GO:0005730 C:nucleolus GO:0005634 C:nucleus GO:0007049 P:cell cycle GO:0015031 P:protein transport GO:0042273 P:ribosomal large subunit biogenesis GO:0000055 P:ribosomal large subunit export from nucleus GO:0007089 P:traversing start control point of mitotic cell cycle
KEGG	sce:YGR245C -
Pfam	View protein in Pfam PF08158 NUC130_3NT PF05285 SDA1

Amino Acid Sequences

MGRRSRAAMLPTNIILLQNLVKRDPESYQEEFLQQYAHYESLRDIFMLNGLAGGDSAAATNGLDVGNGSSTMAGTNGTTMSTSTSQLIELVGFVSQVCSCFPRETANFPSELKQLLLEHHKSLPFELKEKILSCLTMLRNKDVITAEELIQSLFPLLVAYSSHGNSLGVNSHAKELRKIIYTNLISLLKSCNTNGKNQKLNKSTQAVCFNLLDQPDSQGIWATKLTRELWRRGIWDDSRTVEIMTQAALHQDVKIVMSGVMFFLDADREREENFEENSEDEDGFDLDALRHKMQVNKKTGRRGKKLENAIKTVKKKKKNGPGAPQGYLNFSAIHLLRDPQGFAEKLFKEHLSGKTKNKFDMEQKISLMQLLSRLIGTHKLIVLGIYTFFLKYLTPKQRDVTRIMSACAQACHDLVPPEVINVMVRKIADEFVSDGVANEVAAAGINTIREICSRAPLAIDEILLQDLVEYKGSKAKGVNMAAKSLIALYRDVAPEMLKKKDRGKNAAMEVQEAKKGGKDSKRPQFGADNSVQGIAGIELLAKWKKEHGEESENEDADANWEVDVDSEEDDVDGEWVTMDSDKEYDVDMEDSDDEKDNAKGKESDSDLELSDDDDEKEVKDEQEDADIDPEAAFREIASTRILTPADFAKLQELRNEESVAKIMGIHKQDKREELVDASTLTGPIKYKQSREERLQKVLEGREGRDKFGSRRGKRDNMRSTTNREKERRKNFVMSIHKRSVRGKQKMSLRDKQKVLRAHITKQKKKGY

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.31
2	0.24
3	0.18
4	0.2
5	0.19
6	0.21
7	0.21
8	0.23
9	0.24
10	0.26
11	0.27
12	0.28
13	0.31
14	0.33
15	0.35
16	0.35
17	0.36
18	0.34
19	0.32
20	0.27
21	0.2
22	0.19
23	0.18
24	0.18
25	0.16
26	0.16
27	0.17
28	0.18
29	0.19
30	0.16
31	0.14
32	0.12
33	0.13
34	0.13
35	0.11
36	0.09
37	0.08
38	0.08
39	0.07
40	0.07
41	0.05
42	0.04
43	0.05
44	0.04
45	0.04
46	0.04
47	0.04
48	0.05
49	0.05
50	0.05
51	0.05
52	0.06
53	0.07
54	0.07
55	0.07
56	0.06
57	0.06
58	0.07
59	0.07
60	0.06
61	0.05
62	0.07
63	0.07
64	0.07
65	0.07
66	0.07
67	0.11
68	0.12
69	0.14
70	0.14
71	0.14
72	0.14
73	0.14
74	0.14
75	0.1
76	0.09
77	0.08
78	0.06
79	0.06
80	0.06
81	0.07
82	0.07
83	0.07
84	0.08
85	0.1
86	0.13
87	0.14
88	0.15
89	0.22
90	0.24
91	0.3
92	0.35
93	0.35
94	0.35
95	0.35
96	0.37
97	0.31
98	0.3
99	0.24
100	0.2
101	0.19
102	0.23
103	0.3
104	0.29
105	0.3
106	0.33
107	0.34
108	0.33
109	0.34
110	0.38
111	0.32
112	0.32
113	0.32
114	0.31
115	0.33
116	0.33
117	0.34
118	0.26
119	0.24
120	0.21
121	0.26
122	0.27
123	0.29
124	0.3
125	0.31
126	0.32
127	0.32
128	0.35
129	0.29
130	0.27
131	0.24
132	0.25
133	0.21
134	0.21
135	0.2
136	0.16
137	0.15
138	0.13
139	0.09
140	0.07
141	0.06
142	0.04
143	0.04
144	0.04
145	0.05
146	0.07
147	0.09
148	0.1
149	0.1
150	0.1
151	0.11
152	0.1
153	0.11
154	0.12
155	0.11
156	0.13
157	0.13
158	0.17
159	0.21
160	0.22
161	0.23
162	0.25
163	0.27
164	0.29
165	0.29
166	0.26
167	0.32
168	0.32
169	0.3
170	0.31
171	0.28
172	0.24
173	0.25
174	0.26
175	0.18
176	0.19
177	0.18
178	0.23
179	0.23
180	0.32
181	0.4
182	0.45
183	0.52
184	0.57
185	0.66
186	0.62
187	0.65
188	0.63
189	0.61
190	0.57
191	0.55
192	0.55
193	0.47
194	0.44
195	0.4
196	0.33
197	0.29
198	0.26
199	0.2
200	0.14
201	0.15
202	0.13
203	0.13
204	0.12
205	0.12
206	0.12
207	0.12
208	0.14
209	0.13
210	0.14
211	0.17
212	0.19
213	0.24
214	0.29
215	0.32
216	0.37
217	0.39
218	0.4
219	0.39
220	0.44
221	0.39
222	0.37
223	0.35
224	0.31
225	0.29
226	0.27
227	0.25
228	0.18
229	0.16
230	0.13
231	0.1
232	0.08
233	0.07
234	0.07
235	0.08
236	0.07
237	0.07
238	0.07
239	0.08
240	0.07
241	0.07
242	0.07
243	0.07
244	0.06
245	0.06
246	0.05
247	0.05
248	0.05
249	0.04
250	0.04
251	0.06
252	0.06
253	0.08
254	0.1
255	0.11
256	0.11
257	0.13
258	0.15
259	0.16
260	0.16
261	0.16
262	0.14
263	0.14
264	0.15
265	0.15
266	0.13
267	0.1
268	0.09
269	0.08
270	0.07
271	0.07
272	0.05
273	0.05
274	0.09
275	0.11
276	0.11
277	0.13
278	0.15
279	0.22
280	0.3
281	0.38
282	0.43
283	0.49
284	0.54
285	0.62
286	0.69
287	0.72
288	0.72
289	0.71
290	0.72
291	0.72
292	0.77
293	0.74
294	0.71
295	0.67
296	0.66
297	0.66
298	0.64
299	0.66
300	0.65
301	0.66
302	0.7
303	0.74
304	0.77
305	0.81
306	0.82
307	0.81
308	0.83
309	0.78
310	0.71
311	0.64
312	0.54
313	0.45
314	0.37
315	0.28
316	0.18
317	0.13
318	0.14
319	0.11
320	0.11
321	0.09
322	0.09
323	0.11
324	0.11
325	0.11
326	0.09
327	0.12
328	0.11
329	0.11
330	0.17
331	0.15
332	0.17
333	0.19
334	0.18
335	0.18
336	0.22
337	0.29
338	0.3
339	0.35
340	0.41
341	0.47
342	0.48
343	0.49
344	0.46
345	0.42
346	0.41
347	0.46
348	0.42
349	0.37
350	0.36
351	0.34
352	0.32
353	0.29
354	0.23
355	0.13
356	0.1
357	0.08
358	0.07
359	0.06
360	0.07
361	0.07
362	0.09
363	0.09
364	0.09
365	0.08
366	0.08
367	0.08
368	0.08
369	0.08
370	0.06
371	0.05
372	0.05
373	0.05
374	0.04
375	0.05
376	0.05
377	0.05
378	0.07
379	0.16
380	0.24
381	0.28
382	0.3
383	0.33
384	0.38
385	0.41
386	0.43
387	0.39
388	0.35
389	0.32
390	0.31
391	0.3
392	0.25
393	0.23
394	0.19
395	0.15
396	0.11
397	0.1
398	0.1
399	0.09
400	0.09
401	0.08
402	0.09
403	0.08
404	0.08
405	0.08
406	0.07
407	0.07
408	0.06
409	0.07
410	0.06
411	0.06
412	0.07
413	0.08
414	0.08
415	0.08
416	0.08
417	0.08
418	0.08
419	0.09
420	0.08
421	0.07
422	0.07
423	0.06
424	0.05
425	0.04
426	0.03
427	0.03
428	0.03
429	0.03
430	0.02
431	0.03
432	0.03
433	0.03
434	0.03
435	0.04
436	0.05
437	0.07
438	0.07
439	0.1
440	0.11
441	0.11
442	0.11
443	0.11
444	0.13
445	0.11
446	0.11
447	0.08
448	0.08
449	0.08
450	0.07
451	0.06
452	0.04
453	0.05
454	0.05
455	0.06
456	0.06
457	0.06
458	0.11
459	0.11
460	0.13
461	0.13
462	0.17
463	0.22
464	0.26
465	0.31
466	0.28
467	0.29
468	0.27
469	0.26
470	0.22
471	0.16
472	0.13
473	0.08
474	0.08
475	0.07
476	0.1
477	0.11
478	0.11
479	0.11
480	0.1
481	0.15
482	0.18
483	0.23
484	0.24
485	0.28
486	0.37
487	0.43
488	0.49
489	0.51
490	0.53
491	0.54
492	0.55
493	0.56
494	0.47
495	0.44
496	0.39
497	0.34
498	0.3
499	0.23
500	0.19
501	0.16
502	0.18
503	0.22
504	0.27
505	0.35
506	0.44
507	0.53
508	0.61
509	0.59
510	0.6
511	0.61
512	0.56
513	0.53
514	0.45
515	0.37
516	0.3
517	0.29
518	0.26
519	0.18
520	0.15
521	0.08
522	0.06
523	0.04
524	0.04
525	0.03
526	0.07
527	0.09
528	0.09
529	0.1
530	0.13
531	0.16
532	0.19
533	0.24
534	0.28
535	0.34
536	0.35
537	0.42
538	0.44
539	0.41
540	0.38
541	0.33
542	0.26
543	0.2
544	0.2
545	0.12
546	0.07
547	0.07
548	0.07
549	0.07
550	0.08
551	0.07
552	0.07
553	0.06
554	0.07
555	0.06
556	0.07
557	0.06
558	0.06
559	0.05
560	0.04
561	0.04
562	0.04
563	0.05
564	0.05
565	0.06
566	0.06
567	0.06
568	0.07
569	0.07
570	0.08
571	0.08
572	0.08
573	0.09
574	0.08
575	0.09
576	0.1
577	0.1
578	0.11
579	0.12
580	0.11
581	0.12
582	0.14
583	0.18
584	0.18
585	0.21
586	0.22
587	0.21
588	0.27
589	0.28
590	0.27
591	0.24
592	0.25
593	0.22
594	0.21
595	0.2
596	0.14
597	0.13
598	0.12
599	0.11
600	0.11
601	0.11
602	0.1
603	0.12
604	0.13
605	0.12
606	0.12
607	0.13
608	0.13
609	0.17
610	0.17
611	0.16
612	0.15
613	0.15
614	0.14
615	0.13
616	0.12
617	0.09
618	0.09
619	0.08
620	0.06
621	0.09
622	0.09
623	0.11
624	0.12
625	0.12
626	0.12
627	0.16
628	0.17
629	0.13
630	0.15
631	0.16
632	0.18
633	0.18
634	0.17
635	0.21
636	0.24
637	0.26
638	0.28
639	0.29
640	0.29
641	0.31
642	0.33
643	0.25
644	0.23
645	0.24
646	0.2
647	0.16
648	0.15
649	0.15
650	0.18
651	0.24
652	0.3
653	0.33
654	0.4
655	0.44
656	0.46
657	0.49
658	0.45
659	0.41
660	0.37
661	0.34
662	0.28
663	0.24
664	0.22
665	0.18
666	0.17
667	0.15
668	0.14
669	0.14
670	0.16
671	0.25
672	0.28
673	0.32
674	0.41
675	0.51
676	0.57
677	0.66
678	0.73
679	0.7
680	0.73
681	0.71
682	0.66
683	0.63
684	0.58
685	0.56
686	0.49
687	0.46
688	0.48
689	0.47
690	0.46
691	0.45
692	0.46
693	0.42
694	0.48
695	0.56
696	0.52
697	0.61
698	0.67
699	0.71
700	0.76
701	0.83
702	0.83
703	0.79
704	0.83
705	0.79
706	0.79
707	0.79
708	0.79
709	0.78
710	0.77
711	0.81
712	0.82
713	0.86
714	0.87
715	0.83
716	0.82
717	0.78
718	0.78
719	0.79
720	0.77
721	0.76
722	0.75
723	0.73
724	0.69
725	0.7
726	0.7
727	0.7
728	0.71
729	0.69
730	0.68
731	0.73
732	0.79
733	0.82
734	0.81
735	0.8
736	0.79
737	0.8
738	0.79
739	0.78
740	0.76
741	0.74
742	0.75
743	0.71
744	0.71
745	0.73
746	0.77
747	0.78

P53313

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer