Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

P28007

Protein Details
Accession P28007    Localization Confidence Low Confidence Score 9.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
121-149RFLPKPKVVGPPKPKNKKKRSGAPGGRGGBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
124-205PKPKVVGPPKPKNKKKRSGAPGGRGGASMGRGGSRGGFRGGRGGSSFRGGRGGSSFRGGSRGGSFRGGSRGGSRGGFRGGRR
Subcellular Location(s) mito 15.5, cyto_mito 10.666, nucl 7, cyto_nucl 6.833, cyto 4.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR038664  Gar1/Naf1_Cbf5-bd_sf  
IPR007504  H/ACA_rnp_Gar1/Naf1  
IPR009000  Transl_B-barrel_sf  
Gene Ontology GO:0031429  C:box H/ACA snoRNP complex  
GO:0005730  C:nucleolus  
GO:0034513  F:box H/ACA snoRNA binding  
GO:0000454  P:snoRNA guided rRNA pseudouridine synthesis  
GO:0031120  P:snRNA pseudouridine synthesis  
KEGG sce:YHR089C  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF04410  Gar1  
Amino Acid Sequences MSFRGGNRGGRGGFRGGFRGGRTGSARSFQQGPPDTVLEMGAFLHPCEGDIVCRSINTKIPYFNAPIYLENKTQVGKVDEILGPLNEVFFTIKCGDGVQATSFKEGDKFYIAADKLLPIERFLPKPKVVGPPKPKNKKKRSGAPGGRGGASMGRGGSRGGFRGGRGGSSFRGGRGGSSFRGGSRGGSFRGGSRGGSRGGFRGGRR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.3
2 0.3
3 0.27
4 0.29
5 0.27
6 0.3
7 0.26
8 0.28
9 0.3
10 0.3
11 0.3
12 0.31
13 0.31
14 0.29
15 0.33
16 0.29
17 0.35
18 0.35
19 0.35
20 0.35
21 0.35
22 0.31
23 0.27
24 0.26
25 0.16
26 0.13
27 0.1
28 0.09
29 0.08
30 0.07
31 0.08
32 0.07
33 0.08
34 0.09
35 0.08
36 0.08
37 0.1
38 0.12
39 0.12
40 0.12
41 0.13
42 0.15
43 0.2
44 0.22
45 0.22
46 0.23
47 0.25
48 0.28
49 0.29
50 0.27
51 0.25
52 0.23
53 0.23
54 0.24
55 0.25
56 0.23
57 0.21
58 0.21
59 0.18
60 0.17
61 0.17
62 0.16
63 0.13
64 0.13
65 0.15
66 0.14
67 0.15
68 0.14
69 0.12
70 0.1
71 0.09
72 0.09
73 0.05
74 0.05
75 0.05
76 0.04
77 0.07
78 0.07
79 0.07
80 0.07
81 0.08
82 0.08
83 0.08
84 0.09
85 0.07
86 0.09
87 0.09
88 0.1
89 0.1
90 0.1
91 0.11
92 0.11
93 0.11
94 0.1
95 0.09
96 0.09
97 0.14
98 0.13
99 0.12
100 0.12
101 0.11
102 0.11
103 0.14
104 0.14
105 0.1
106 0.13
107 0.15
108 0.18
109 0.22
110 0.26
111 0.24
112 0.26
113 0.29
114 0.35
115 0.38
116 0.45
117 0.51
118 0.57
119 0.67
120 0.76
121 0.82
122 0.83
123 0.88
124 0.88
125 0.88
126 0.88
127 0.86
128 0.86
129 0.86
130 0.82
131 0.8
132 0.71
133 0.62
134 0.51
135 0.43
136 0.33
137 0.24
138 0.17
139 0.1
140 0.08
141 0.08
142 0.08
143 0.1
144 0.1
145 0.11
146 0.14
147 0.14
148 0.14
149 0.2
150 0.2
151 0.19
152 0.2
153 0.21
154 0.2
155 0.24
156 0.24
157 0.19
158 0.22
159 0.2
160 0.2
161 0.22
162 0.24
163 0.2
164 0.24
165 0.24
166 0.21
167 0.24
168 0.22
169 0.21
170 0.22
171 0.25
172 0.23
173 0.26
174 0.26
175 0.25
176 0.3
177 0.28
178 0.25
179 0.25
180 0.26
181 0.25
182 0.27
183 0.26
184 0.25
185 0.3