FuNGI

P18480

Protein Details

Accession

P18480

Localization Confidence

High

Confidence Score

15.1

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
660-687	LERLDKDKDRDTRRKRRQGRSNRRGMLA	Basic
754-776	LRNTTTYKSRPDRPKPVSPPCYI	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
669-683	RDTRRKRRQGRSNRR

Subcellular Location(s)

nucl 20, cyto_nucl 12, mito 3, cyto 2, plas 2

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR006939 SNF5
Gene Ontology	GO:0000785 C:chromatin GO:0005829 C:cytosol GO:0000228 C:nuclear chromosome GO:0005634 C:nucleus GO:0016514 C:SWI/SNF complex GO:0061629 F:RNA polymerase II-specific DNA-binding transcription factor binding GO:0000436 P:carbon catabolite activation of transcription from RNA polymerase II promoter GO:0006338 P:chromatin remodeling GO:0000724 P:double-strand break repair via homologous recombination GO:1905168 P:positive regulation of double-strand break repair via homologous recombination GO:2000219 P:positive regulation of invasive growth in response to glucose limitation GO:0045944 P:positive regulation of transcription by RNA polymerase II GO:0006357 P:regulation of transcription by RNA polymerase II
KEGG	sce:YBR289W -
Pfam	View protein in Pfam PF04855 SNF5

Amino Acid Sequences

MNNQPQGTNSVPNSIGNIFSNIGTPSFNMAQIPQQLYQSLTPQQLQMIQQRHQQLLRSRLQQQQQQQQQTSPPPQTHQSPPPPPQQSQPIANQSATSTPPPPPAPHNLHPQIGQVPLAPAPINLPPQIAQLPLATQQQVLNKLRQQAIAKNNPQVVNAITVAQQQVQRQIEQQKGQQTAQTQLEQQRQLLVQQQQQQQLRNQIQRQQQQQFRHHVQIQQQQQKQQQQQQQHQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQGQIPQSQQVPQVRSMSGQPPTNVQPTIGQLPQLPKLNLPKYQTIQYDPPETKLPYPTYWSDKKADTDTLLYEQIIQRDKINKYSLIRETNGYDPFSIYGFSNKEYISRLWHTLKYYQDLKNTRMKSITSTSQKIPSASIWGNGYSGYGNGITNTTTRVIPQVEVGNRKHYLEDKLKVYKQAMNETSEQLVPIRLEFDQDRDRFFLRDTLLWNKNDKLIKIEDFVDDMLRDYRFEDATREQHIDTICQSIQEQIQEFQGNPYIELNQDRLGGDDLRIRIKLDIVVGQNQLIDQFEWDISNSDNCPEEFAESMCQELELPGEFVTAIAHSIREQVHMYHKSLALLGYNFDGSAIEDDDIRSRMLPTITLDDVYRPAAESKIFTPNLLQISAAELERLDKDKDRDTRRKRRQGRSNRRGMLALSGTSASNTSMNGVHNTVAAGNASSLPPGEILLPDIADIPRTFRTPVPSTLMPGGVDVGPSVESYELRNTTTYKSRPDRPKPVSPPCYIIDHIPGHSLLLSIKLPGKVNTKEEFAAAPNDTSSGTNAMLPSPESLKTKLNSNIRAGVTIPSIPNPIANHTVTNSPNPTLQPVIPGGAASKSVPTPSLPIAPPVAPHDSEATLLTNSNNGSSNNNTQNT

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.28
2	0.27
3	0.21
4	0.23
5	0.19
6	0.18
7	0.19
8	0.17
9	0.16
10	0.15
11	0.14
12	0.17
13	0.17
14	0.18
15	0.17
16	0.17
17	0.22
18	0.27
19	0.31
20	0.27
21	0.27
22	0.27
23	0.29
24	0.3
25	0.29
26	0.28
27	0.28
28	0.27
29	0.27
30	0.28
31	0.3
32	0.33
33	0.36
34	0.37
35	0.37
36	0.42
37	0.47
38	0.5
39	0.48
40	0.5
41	0.5
42	0.53
43	0.57
44	0.58
45	0.59
46	0.62
47	0.67
48	0.67
49	0.68
50	0.69
51	0.71
52	0.73
53	0.69
54	0.65
55	0.65
56	0.66
57	0.64
58	0.61
59	0.54
60	0.49
61	0.52
62	0.55
63	0.56
64	0.57
65	0.59
66	0.61
67	0.65
68	0.7
69	0.71
70	0.67
71	0.66
72	0.65
73	0.61
74	0.58
75	0.6
76	0.58
77	0.55
78	0.53
79	0.47
80	0.39
81	0.36
82	0.33
83	0.28
84	0.23
85	0.22
86	0.28
87	0.31
88	0.32
89	0.34
90	0.4
91	0.46
92	0.49
93	0.57
94	0.55
95	0.55
96	0.53
97	0.51
98	0.45
99	0.38
100	0.33
101	0.23
102	0.2
103	0.18
104	0.18
105	0.15
106	0.12
107	0.13
108	0.16
109	0.18
110	0.17
111	0.18
112	0.17
113	0.2
114	0.21
115	0.19
116	0.16
117	0.14
118	0.15
119	0.17
120	0.19
121	0.17
122	0.17
123	0.19
124	0.23
125	0.31
126	0.32
127	0.35
128	0.36
129	0.42
130	0.43
131	0.45
132	0.45
133	0.44
134	0.51
135	0.55
136	0.56
137	0.56
138	0.59
139	0.54
140	0.51
141	0.45
142	0.36
143	0.29
144	0.24
145	0.19
146	0.15
147	0.16
148	0.16
149	0.17
150	0.19
151	0.17
152	0.25
153	0.26
154	0.26
155	0.3
156	0.36
157	0.4
158	0.42
159	0.45
160	0.44
161	0.46
162	0.46
163	0.43
164	0.38
165	0.38
166	0.38
167	0.35
168	0.32
169	0.35
170	0.42
171	0.4
172	0.38
173	0.35
174	0.32
175	0.31
176	0.34
177	0.32
178	0.31
179	0.38
180	0.44
181	0.48
182	0.51
183	0.53
184	0.51
185	0.55
186	0.57
187	0.57
188	0.55
189	0.55
190	0.6
191	0.64
192	0.68
193	0.67
194	0.66
195	0.67
196	0.7
197	0.72
198	0.68
199	0.69
200	0.63
201	0.59
202	0.6
203	0.6
204	0.62
205	0.63
206	0.61
207	0.61
208	0.65
209	0.68
210	0.68
211	0.68
212	0.65
213	0.65
214	0.7
215	0.74
216	0.76
217	0.76
218	0.75
219	0.73
220	0.74
221	0.74
222	0.74
223	0.72
224	0.68
225	0.67
226	0.68
227	0.68
228	0.69
229	0.67
230	0.67
231	0.66
232	0.68
233	0.68
234	0.68
235	0.68
236	0.68
237	0.68
238	0.68
239	0.68
240	0.68
241	0.68
242	0.68
243	0.68
244	0.68
245	0.68
246	0.68
247	0.68
248	0.68
249	0.68
250	0.66
251	0.65
252	0.61
253	0.58
254	0.54
255	0.5
256	0.45
257	0.42
258	0.36
259	0.32
260	0.31
261	0.28
262	0.3
263	0.31
264	0.3
265	0.3
266	0.31
267	0.28
268	0.27
269	0.28
270	0.28
271	0.27
272	0.27
273	0.24
274	0.25
275	0.28
276	0.3
277	0.27
278	0.23
279	0.2
280	0.2
281	0.24
282	0.2
283	0.18
284	0.17
285	0.2
286	0.24
287	0.26
288	0.24
289	0.23
290	0.31
291	0.34
292	0.37
293	0.37
294	0.39
295	0.37
296	0.42
297	0.41
298	0.37
299	0.38
300	0.36
301	0.4
302	0.34
303	0.34
304	0.33
305	0.32
306	0.3
307	0.3
308	0.3
309	0.24
310	0.28
311	0.29
312	0.32
313	0.35
314	0.37
315	0.35
316	0.34
317	0.36
318	0.34
319	0.32
320	0.27
321	0.24
322	0.22
323	0.21
324	0.19
325	0.16
326	0.15
327	0.15
328	0.17
329	0.18
330	0.17
331	0.18
332	0.24
333	0.26
334	0.29
335	0.3
336	0.3
337	0.3
338	0.36
339	0.39
340	0.36
341	0.36
342	0.33
343	0.33
344	0.33
345	0.33
346	0.27
347	0.21
348	0.17
349	0.17
350	0.15
351	0.13
352	0.09
353	0.11
354	0.11
355	0.12
356	0.13
357	0.13
358	0.14
359	0.15
360	0.16
361	0.17
362	0.19
363	0.23
364	0.24
365	0.27
366	0.28
367	0.3
368	0.32
369	0.31
370	0.35
371	0.34
372	0.38
373	0.39
374	0.41
375	0.44
376	0.44
377	0.4
378	0.36
379	0.33
380	0.29
381	0.3
382	0.34
383	0.31
384	0.33
385	0.33
386	0.37
387	0.37
388	0.34
389	0.3
390	0.23
391	0.22
392	0.19
393	0.19
394	0.15
395	0.14
396	0.14
397	0.12
398	0.12
399	0.07
400	0.07
401	0.06
402	0.06
403	0.05
404	0.05
405	0.06
406	0.06
407	0.06
408	0.07
409	0.08
410	0.07
411	0.08
412	0.1
413	0.1
414	0.1
415	0.11
416	0.15
417	0.16
418	0.22
419	0.23
420	0.25
421	0.25
422	0.25
423	0.25
424	0.23
425	0.26
426	0.27
427	0.3
428	0.31
429	0.36
430	0.37
431	0.38
432	0.38
433	0.34
434	0.3
435	0.33
436	0.3
437	0.27
438	0.27
439	0.26
440	0.25
441	0.22
442	0.19
443	0.12
444	0.11
445	0.08
446	0.07
447	0.07
448	0.06
449	0.08
450	0.08
451	0.12
452	0.18
453	0.19
454	0.2
455	0.21
456	0.22
457	0.21
458	0.21
459	0.21
460	0.15
461	0.16
462	0.18
463	0.24
464	0.28
465	0.29
466	0.3
467	0.27
468	0.31
469	0.31
470	0.28
471	0.24
472	0.22
473	0.22
474	0.21
475	0.22
476	0.17
477	0.16
478	0.16
479	0.13
480	0.1
481	0.09
482	0.09
483	0.08
484	0.08
485	0.08
486	0.09
487	0.09
488	0.1
489	0.12
490	0.15
491	0.18
492	0.2
493	0.21
494	0.2
495	0.21
496	0.21
497	0.19
498	0.16
499	0.16
500	0.13
501	0.12
502	0.12
503	0.12
504	0.12
505	0.13
506	0.13
507	0.11
508	0.13
509	0.13
510	0.13
511	0.12
512	0.16
513	0.14
514	0.13
515	0.13
516	0.12
517	0.12
518	0.13
519	0.14
520	0.1
521	0.11
522	0.11
523	0.11
524	0.12
525	0.11
526	0.11
527	0.13
528	0.13
529	0.14
530	0.15
531	0.14
532	0.13
533	0.13
534	0.13
535	0.11
536	0.14
537	0.14
538	0.16
539	0.16
540	0.16
541	0.15
542	0.14
543	0.13
544	0.1
545	0.08
546	0.05
547	0.06
548	0.06
549	0.06
550	0.07
551	0.07
552	0.07
553	0.09
554	0.09
555	0.09
556	0.1
557	0.1
558	0.11
559	0.11
560	0.11
561	0.1
562	0.11
563	0.12
564	0.11
565	0.11
566	0.09
567	0.09
568	0.08
569	0.07
570	0.07
571	0.05
572	0.06
573	0.05
574	0.06
575	0.05
576	0.05
577	0.05
578	0.05
579	0.05
580	0.04
581	0.05
582	0.05
583	0.08
584	0.09
585	0.11
586	0.11
587	0.13
588	0.21
589	0.24
590	0.26
591	0.26
592	0.26
593	0.25
594	0.24
595	0.23
596	0.16
597	0.13
598	0.12
599	0.1
600	0.09
601	0.08
602	0.08
603	0.07
604	0.06
605	0.07
606	0.07
607	0.06
608	0.07
609	0.07
610	0.09
611	0.1
612	0.1
613	0.09
614	0.09
615	0.11
616	0.11
617	0.12
618	0.12
619	0.15
620	0.16
621	0.16
622	0.15
623	0.14
624	0.15
625	0.15
626	0.13
627	0.09
628	0.1
629	0.11
630	0.11
631	0.12
632	0.13
633	0.21
634	0.21
635	0.2
636	0.21
637	0.23
638	0.24
639	0.22
640	0.2
641	0.12
642	0.14
643	0.15
644	0.14
645	0.1
646	0.08
647	0.09
648	0.11
649	0.14
650	0.13
651	0.16
652	0.2
653	0.27
654	0.36
655	0.45
656	0.54
657	0.62
658	0.71
659	0.79
660	0.86
661	0.89
662	0.91
663	0.92
664	0.93
665	0.94
666	0.93
667	0.93
668	0.87
669	0.78
670	0.69
671	0.59
672	0.53
673	0.43
674	0.33
675	0.23
676	0.19
677	0.16
678	0.15
679	0.15
680	0.1
681	0.08
682	0.08
683	0.09
684	0.1
685	0.11
686	0.13
687	0.14
688	0.13
689	0.13
690	0.13
691	0.11
692	0.1
693	0.08
694	0.07
695	0.06
696	0.07
697	0.07
698	0.07
699	0.07
700	0.06
701	0.06
702	0.07
703	0.07
704	0.06
705	0.08
706	0.08
707	0.08
708	0.08
709	0.09
710	0.09
711	0.1
712	0.1
713	0.12
714	0.14
715	0.15
716	0.17
717	0.18
718	0.25
719	0.28
720	0.32
721	0.35
722	0.34
723	0.35
724	0.35
725	0.34
726	0.27
727	0.23
728	0.21
729	0.14
730	0.13
731	0.09
732	0.08
733	0.07
734	0.07
735	0.07
736	0.07
737	0.07
738	0.09
739	0.15
740	0.16
741	0.16
742	0.18
743	0.2
744	0.24
745	0.32
746	0.34
747	0.38
748	0.44
749	0.53
750	0.62
751	0.7
752	0.77
753	0.76
754	0.82
755	0.82
756	0.86
757	0.84
758	0.76
759	0.71
760	0.63
761	0.6
762	0.5
763	0.42
764	0.39
765	0.34
766	0.31
767	0.28
768	0.26
769	0.21
770	0.2
771	0.18
772	0.11
773	0.12
774	0.11
775	0.12
776	0.16
777	0.19
778	0.2
779	0.25
780	0.32
781	0.34
782	0.39
783	0.4
784	0.4
785	0.37
786	0.36
787	0.33
788	0.28
789	0.28
790	0.23
791	0.2
792	0.17
793	0.17
794	0.17
795	0.16
796	0.15
797	0.13
798	0.12
799	0.13
800	0.14
801	0.14
802	0.14
803	0.14
804	0.15
805	0.15
806	0.18
807	0.19
808	0.22
809	0.27
810	0.28
811	0.35
812	0.41
813	0.47
814	0.49
815	0.51
816	0.55
817	0.5
818	0.5
819	0.43
820	0.38
821	0.31
822	0.29
823	0.25
824	0.2
825	0.21
826	0.2
827	0.22
828	0.21
829	0.24
830	0.25
831	0.25
832	0.26
833	0.25
834	0.32
835	0.3
836	0.35
837	0.34
838	0.31
839	0.33
840	0.32
841	0.34
842	0.31
843	0.29
844	0.27
845	0.25
846	0.25
847	0.22
848	0.21
849	0.18
850	0.15
851	0.16
852	0.13
853	0.14
854	0.13
855	0.15
856	0.16
857	0.16
858	0.18
859	0.2
860	0.27
861	0.25
862	0.27
863	0.29
864	0.28
865	0.29
866	0.3
867	0.32
868	0.26
869	0.27
870	0.27
871	0.24
872	0.24
873	0.24
874	0.21
875	0.17
876	0.17
877	0.16
878	0.16
879	0.15
880	0.17
881	0.18
882	0.17
883	0.21
884	0.26
885	0.34

P18480

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer