Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

P04819

Protein Details
Accession P04819    Localization Confidence Low Confidence Score 6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
584-603HYEPSKRSRNWLKLKKDYLEHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) mito 21, mito_nucl 13.666, cyto_mito 11.666, nucl 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR000977  DNA_ligase_ATP-dep  
IPR012309  DNA_ligase_ATP-dep_C  
IPR012310  DNA_ligase_ATP-dep_cent  
IPR016059  DNA_ligase_ATP-dep_CS  
IPR012308  DNA_ligase_ATP-dep_N  
IPR036599  DNA_ligase_N_sf  
IPR012340  NA-bd_OB-fold  
Gene Ontology GO:0005739  C:mitochondrion  
GO:0005634  C:nucleus  
GO:0005524  F:ATP binding  
GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0003910  F:DNA ligase (ATP) activity  
GO:0046872  F:metal ion binding  
GO:0006284  P:base-excision repair  
GO:0051301  P:cell division  
GO:0071897  P:DNA biosynthetic process  
GO:0006266  P:DNA ligation  
GO:0006310  P:DNA recombination  
GO:0006273  P:lagging strand elongation  
GO:0035753  P:maintenance of DNA trinucleotide repeats  
GO:0000278  P:mitotic cell cycle  
GO:0006289  P:nucleotide-excision repair  
GO:1903461  P:Okazaki fragment processing involved in mitotic DNA replication  
KEGG sce:YDL164C  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF04679  DNA_ligase_A_C  
PF01068  DNA_ligase_A_M  
PF04675  DNA_ligase_A_N  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS00697  DNA_LIGASE_A1  
PS00333  DNA_LIGASE_A2  
PS50160  DNA_LIGASE_A3  
CDD cd07900  Adenylation_DNA_ligase_I_Euk  
cd07969  OBF_DNA_ligase_I  
Amino Acid Sequences MRRLLTGCLLSSARPLKSRLPLLMSSSLPSSAGKKPKQATLARFFTSMKNKPTEGTPSPKKSSKHMLEDRMDNVSGEEEYATKKLKQTAVTHTVAAPSSMGSNFSSIPSSAPSSGVADSPQQSQRLVGEVEDALSSNNNDHYSSNIPYSEVCEVFNKIEAISSRLEIIRICSDFFIKIMKQSSKNLIPTTYLFINRLGPDYEAGLELGLGENLLMKTISETCGKSMSQIKLKYKDIGDLGEIAMGARNVQPTMFKPKPLTVGEVFKNLRAIAKTQGKDSQLKKMKLIKRMLTACKGIEAKFLIRSLESKLRIGLAEKTVLISLSKALLLHDENREDSPDKDVPMDVLESAQQKIRDAFCQVPNYEIVINSCLEHGIMNLDKYCTLRPGIPLKPMLAKPTKAINEVLDRFQGETFTSEYKYDGERAQVHLLNDGTMRIYSRNGENMTERYPEINITDFIQDLDTTKNLILDCEAVAWDKDQGKILPFQVLSTRKRKDVELNDVKVKVCLFAFDILCYNDERLINKSLKERREYLTKVTKVVPGEFQYATQITTNNLDELQKFLDESVNHSCEGLMVKMLEGPESHYEPSKRSRNWLKLKKDYLEGVGDSLDLCVLGAYYGRGKRTGTYGGFLLGCYNQDTGEFETCCKIGTGFSDEMLQLLHDRLTPTIIDGPKATFVFDSSAEPDVWFEPTTLFEVLTADLSLSPIYKAGSATFDKGVSLRFPRFLRIREDKGVEDATSSDQIVELYENQSHMQN
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.33
2 0.36
3 0.39
4 0.46
5 0.51
6 0.48
7 0.48
8 0.47
9 0.49
10 0.51
11 0.45
12 0.38
13 0.34
14 0.3
15 0.25
16 0.23
17 0.22
18 0.25
19 0.34
20 0.37
21 0.44
22 0.48
23 0.54
24 0.61
25 0.65
26 0.66
27 0.66
28 0.68
29 0.61
30 0.59
31 0.54
32 0.53
33 0.55
34 0.53
35 0.51
36 0.49
37 0.48
38 0.47
39 0.5
40 0.51
41 0.48
42 0.5
43 0.54
44 0.57
45 0.63
46 0.68
47 0.66
48 0.64
49 0.68
50 0.67
51 0.68
52 0.68
53 0.71
54 0.7
55 0.73
56 0.68
57 0.61
58 0.53
59 0.42
60 0.34
61 0.26
62 0.2
63 0.15
64 0.13
65 0.09
66 0.11
67 0.14
68 0.17
69 0.18
70 0.22
71 0.28
72 0.32
73 0.38
74 0.41
75 0.48
76 0.53
77 0.52
78 0.49
79 0.43
80 0.41
81 0.34
82 0.29
83 0.19
84 0.12
85 0.12
86 0.11
87 0.12
88 0.1
89 0.12
90 0.12
91 0.13
92 0.14
93 0.12
94 0.13
95 0.14
96 0.17
97 0.16
98 0.16
99 0.16
100 0.17
101 0.17
102 0.17
103 0.15
104 0.16
105 0.17
106 0.22
107 0.24
108 0.23
109 0.23
110 0.23
111 0.23
112 0.23
113 0.21
114 0.16
115 0.15
116 0.13
117 0.14
118 0.13
119 0.12
120 0.09
121 0.09
122 0.1
123 0.09
124 0.11
125 0.12
126 0.13
127 0.13
128 0.16
129 0.19
130 0.21
131 0.22
132 0.19
133 0.19
134 0.18
135 0.21
136 0.22
137 0.18
138 0.17
139 0.17
140 0.19
141 0.19
142 0.21
143 0.18
144 0.14
145 0.17
146 0.16
147 0.17
148 0.16
149 0.15
150 0.15
151 0.15
152 0.16
153 0.13
154 0.16
155 0.19
156 0.18
157 0.18
158 0.17
159 0.18
160 0.18
161 0.18
162 0.19
163 0.14
164 0.17
165 0.24
166 0.29
167 0.31
168 0.35
169 0.43
170 0.44
171 0.48
172 0.46
173 0.4
174 0.37
175 0.35
176 0.35
177 0.31
178 0.26
179 0.22
180 0.22
181 0.25
182 0.23
183 0.23
184 0.19
185 0.16
186 0.16
187 0.15
188 0.15
189 0.11
190 0.1
191 0.08
192 0.07
193 0.06
194 0.06
195 0.04
196 0.03
197 0.03
198 0.05
199 0.05
200 0.05
201 0.05
202 0.05
203 0.06
204 0.08
205 0.1
206 0.12
207 0.12
208 0.13
209 0.16
210 0.16
211 0.18
212 0.24
213 0.28
214 0.32
215 0.39
216 0.45
217 0.48
218 0.51
219 0.52
220 0.45
221 0.44
222 0.38
223 0.32
224 0.26
225 0.2
226 0.18
227 0.13
228 0.13
229 0.08
230 0.08
231 0.06
232 0.06
233 0.06
234 0.07
235 0.07
236 0.07
237 0.09
238 0.11
239 0.21
240 0.22
241 0.23
242 0.25
243 0.28
244 0.34
245 0.33
246 0.35
247 0.29
248 0.34
249 0.32
250 0.37
251 0.35
252 0.29
253 0.29
254 0.25
255 0.24
256 0.19
257 0.19
258 0.2
259 0.28
260 0.28
261 0.29
262 0.34
263 0.35
264 0.41
265 0.41
266 0.44
267 0.44
268 0.45
269 0.48
270 0.53
271 0.55
272 0.56
273 0.61
274 0.55
275 0.54
276 0.6
277 0.58
278 0.53
279 0.5
280 0.41
281 0.39
282 0.36
283 0.28
284 0.24
285 0.21
286 0.19
287 0.19
288 0.19
289 0.15
290 0.14
291 0.15
292 0.16
293 0.22
294 0.22
295 0.2
296 0.2
297 0.2
298 0.2
299 0.21
300 0.19
301 0.14
302 0.13
303 0.12
304 0.12
305 0.12
306 0.11
307 0.1
308 0.07
309 0.06
310 0.05
311 0.06
312 0.05
313 0.05
314 0.07
315 0.08
316 0.11
317 0.13
318 0.14
319 0.14
320 0.15
321 0.17
322 0.16
323 0.16
324 0.18
325 0.17
326 0.17
327 0.16
328 0.16
329 0.14
330 0.13
331 0.13
332 0.08
333 0.06
334 0.08
335 0.09
336 0.09
337 0.11
338 0.11
339 0.11
340 0.14
341 0.14
342 0.14
343 0.15
344 0.19
345 0.21
346 0.25
347 0.24
348 0.22
349 0.22
350 0.21
351 0.19
352 0.15
353 0.11
354 0.09
355 0.09
356 0.08
357 0.08
358 0.06
359 0.06
360 0.06
361 0.05
362 0.06
363 0.06
364 0.06
365 0.07
366 0.07
367 0.08
368 0.09
369 0.09
370 0.08
371 0.09
372 0.1
373 0.13
374 0.2
375 0.21
376 0.24
377 0.24
378 0.24
379 0.28
380 0.27
381 0.29
382 0.26
383 0.24
384 0.22
385 0.28
386 0.28
387 0.26
388 0.26
389 0.23
390 0.26
391 0.26
392 0.26
393 0.2
394 0.19
395 0.18
396 0.17
397 0.15
398 0.09
399 0.09
400 0.09
401 0.1
402 0.11
403 0.1
404 0.11
405 0.11
406 0.12
407 0.13
408 0.12
409 0.14
410 0.15
411 0.18
412 0.21
413 0.21
414 0.21
415 0.21
416 0.2
417 0.17
418 0.15
419 0.13
420 0.1
421 0.07
422 0.08
423 0.06
424 0.07
425 0.08
426 0.1
427 0.14
428 0.14
429 0.16
430 0.18
431 0.19
432 0.21
433 0.21
434 0.2
435 0.16
436 0.16
437 0.15
438 0.13
439 0.12
440 0.11
441 0.1
442 0.11
443 0.1
444 0.1
445 0.09
446 0.08
447 0.08
448 0.09
449 0.08
450 0.08
451 0.08
452 0.1
453 0.09
454 0.09
455 0.09
456 0.08
457 0.08
458 0.07
459 0.07
460 0.06
461 0.06
462 0.07
463 0.1
464 0.1
465 0.11
466 0.13
467 0.13
468 0.15
469 0.17
470 0.18
471 0.18
472 0.17
473 0.16
474 0.21
475 0.27
476 0.31
477 0.37
478 0.39
479 0.39
480 0.41
481 0.43
482 0.46
483 0.47
484 0.52
485 0.53
486 0.55
487 0.55
488 0.55
489 0.52
490 0.44
491 0.37
492 0.27
493 0.17
494 0.14
495 0.11
496 0.13
497 0.13
498 0.13
499 0.15
500 0.14
501 0.15
502 0.15
503 0.14
504 0.13
505 0.14
506 0.14
507 0.16
508 0.21
509 0.22
510 0.24
511 0.32
512 0.36
513 0.4
514 0.43
515 0.44
516 0.43
517 0.49
518 0.5
519 0.5
520 0.53
521 0.49
522 0.48
523 0.46
524 0.46
525 0.39
526 0.38
527 0.33
528 0.26
529 0.28
530 0.25
531 0.23
532 0.22
533 0.21
534 0.2
535 0.16
536 0.14
537 0.12
538 0.15
539 0.15
540 0.13
541 0.14
542 0.14
543 0.13
544 0.15
545 0.15
546 0.12
547 0.11
548 0.11
549 0.14
550 0.13
551 0.17
552 0.22
553 0.22
554 0.22
555 0.22
556 0.21
557 0.18
558 0.2
559 0.16
560 0.1
561 0.08
562 0.08
563 0.1
564 0.1
565 0.1
566 0.08
567 0.11
568 0.14
569 0.16
570 0.17
571 0.21
572 0.22
573 0.25
574 0.34
575 0.4
576 0.38
577 0.45
578 0.54
579 0.6
580 0.7
581 0.76
582 0.77
583 0.78
584 0.83
585 0.78
586 0.72
587 0.64
588 0.56
589 0.5
590 0.4
591 0.31
592 0.23
593 0.19
594 0.15
595 0.12
596 0.09
597 0.05
598 0.04
599 0.03
600 0.03
601 0.03
602 0.04
603 0.05
604 0.11
605 0.14
606 0.16
607 0.18
608 0.18
609 0.2
610 0.24
611 0.31
612 0.26
613 0.26
614 0.25
615 0.26
616 0.25
617 0.23
618 0.21
619 0.14
620 0.13
621 0.13
622 0.12
623 0.1
624 0.1
625 0.13
626 0.15
627 0.19
628 0.19
629 0.18
630 0.21
631 0.21
632 0.21
633 0.18
634 0.15
635 0.11
636 0.14
637 0.19
638 0.17
639 0.18
640 0.19
641 0.19
642 0.18
643 0.17
644 0.14
645 0.09
646 0.09
647 0.1
648 0.1
649 0.11
650 0.11
651 0.13
652 0.12
653 0.14
654 0.2
655 0.2
656 0.2
657 0.2
658 0.22
659 0.25
660 0.25
661 0.23
662 0.16
663 0.16
664 0.17
665 0.17
666 0.18
667 0.16
668 0.18
669 0.18
670 0.17
671 0.18
672 0.16
673 0.17
674 0.15
675 0.13
676 0.12
677 0.13
678 0.16
679 0.15
680 0.14
681 0.11
682 0.12
683 0.12
684 0.12
685 0.11
686 0.08
687 0.08
688 0.09
689 0.09
690 0.08
691 0.08
692 0.08
693 0.09
694 0.1
695 0.1
696 0.11
697 0.16
698 0.19
699 0.22
700 0.23
701 0.22
702 0.22
703 0.22
704 0.23
705 0.23
706 0.27
707 0.27
708 0.32
709 0.33
710 0.41
711 0.47
712 0.49
713 0.53
714 0.55
715 0.59
716 0.61
717 0.64
718 0.57
719 0.55
720 0.53
721 0.44
722 0.35
723 0.3
724 0.25
725 0.23
726 0.21
727 0.16
728 0.14
729 0.14
730 0.13
731 0.14
732 0.12
733 0.14
734 0.15
735 0.17