Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

P40562

Protein Details
Accession P40562    Localization Confidence High Confidence Score 25.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
269-291SMDIVKYMKKRKKEKIEVPLLLEHydrophilic
495-515KYTRKHAPKGRKKVERLHRQEBasic
692-723TQCMMGKKVKPKKAITKKKRVQENKKPKKFFMHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
278-281KRKK
498-513RKHAPKGRKKVERLHR
698-720KKVKPKKAITKKKRVQENKKPKK
Subcellular Location(s) nucl 24, cyto 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR039686  FANCM/Mph1-like_ID  
IPR044749  FANCM_DEXDc  
IPR006935  Helicase/UvrB_N  
IPR014001  Helicase_ATP-bd  
IPR001650  Helicase_C  
IPR027417  P-loop_NTPase  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0043138  F:3'-5' DNA helicase activity  
GO:0005524  F:ATP binding  
GO:0016887  F:ATP hydrolysis activity  
GO:0033677  F:DNA/RNA helicase activity  
GO:0070336  F:flap-structured DNA binding  
GO:0000400  F:four-way junction DNA binding  
GO:0009378  F:four-way junction helicase activity  
GO:0033567  P:DNA replication, Okazaki fragment processing  
GO:0007535  P:donor selection  
GO:0045003  P:double-strand break repair via synthesis-dependent strand annealing  
GO:0036297  P:interstrand cross-link repair  
GO:0060543  P:negative regulation of strand invasion  
GO:0000725  P:recombinational repair  
KEGG sce:YIR002C  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00271  Helicase_C  
PF04851  ResIII  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51192  HELICASE_ATP_BIND_1  
PS51194  HELICASE_CTER  
CDD cd18033  DEXDc_FANCM  
cd12091  FANCM_ID  
cd18801  SF2_C_FANCM_Hef  
Amino Acid Sequences MASADDYFSDFEDDELDKLYEKAINKSVKETITRRAVPVQKDLHDNVLPGQKTVYEEIQRDVSFGPTHHELDYDALSFYVYPTNYEVRDYQYTIVHKSLFQNTLCAIPTGMGKTFIASTVMLNYFRWTKKAKIIFTAPTRPLVAQQIKACLGITGIPSDQTAILLDKSRKNREEIWANKRVFFATPQVVENDLKRGVLDPKDIVCLVIDEAHRATGSSAYTNVVKFIDRFNSSYRLLALTATPASDLEGVQEVVNNLDISKIEIRTEESMDIVKYMKKRKKEKIEVPLLLEIEDIIEQLGMAVKPVLQQAIELGIYEECDPSQINAFKAMQQSQKIIANPTIPEGIKWRNFFILQLLNNVGQMLKRLKIYGIRTFFNYFQNKCTEFTTKYNLKKSTNKIAAEFYYHPILKNIKNQCENYLSDPKFVGHGKLQCVRDELMDFFQKRGSDSRVIIFTELRESALEIVKFIDSVADDQIRPHIFIGQARAKEGFDEVKYTRKHAPKGRKKVERLHRQEQEKFLEAERTKRAANDKLERSARRTGSSEEAQISGMNQKMQKEVIHNFKKGEYNVLVCTSIGEEGLDIGEVDLIICYDTTSSPIKNIQRMGRTGRKRDGKIVLLFSSNESYKFERAMEDYSTLQALISKQCIDYKKSDRIIPEDIIPECHETLITINDENEIINEMEDVDEVIRYATQCMMGKKVKPKKAITKKKRVQENKKPKKFFMPDNVETSIVSASTLINKFLVNESGGKQLVTSNENPSKKRKIFKALDNLENDSTEEASSSLETEDEEVSDDNNVFIAEGQNGCQKDLETAIIRTGESLTTLKPLHNFERPNMALFVNDCGLPTKIEKNVKDIRGNQHNLEKEKSCTVDKNNMVLSLDDWNFFRNRYIPEGVSFDVEPNFVQYTKGVKVPHCHKVSKIITLFNDESNDNKKRTIDMNYTKCLARGMLRDEKKFVKVNDKSQVDNNSVNHDSSQSFTLSNAELDDILGSDSDF
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.13
2 0.15
3 0.15
4 0.13
5 0.13
6 0.15
7 0.17
8 0.18
9 0.24
10 0.29
11 0.36
12 0.36
13 0.41
14 0.45
15 0.46
16 0.52
17 0.49
18 0.5
19 0.53
20 0.54
21 0.53
22 0.56
23 0.58
24 0.55
25 0.6
26 0.58
27 0.52
28 0.56
29 0.54
30 0.52
31 0.46
32 0.43
33 0.39
34 0.4
35 0.36
36 0.3
37 0.29
38 0.24
39 0.25
40 0.28
41 0.3
42 0.28
43 0.29
44 0.32
45 0.37
46 0.35
47 0.34
48 0.31
49 0.27
50 0.23
51 0.22
52 0.25
53 0.23
54 0.25
55 0.23
56 0.23
57 0.21
58 0.22
59 0.24
60 0.18
61 0.14
62 0.12
63 0.12
64 0.12
65 0.12
66 0.14
67 0.12
68 0.12
69 0.16
70 0.2
71 0.21
72 0.24
73 0.24
74 0.25
75 0.3
76 0.3
77 0.29
78 0.3
79 0.33
80 0.34
81 0.35
82 0.3
83 0.28
84 0.32
85 0.37
86 0.37
87 0.34
88 0.33
89 0.31
90 0.33
91 0.31
92 0.26
93 0.19
94 0.15
95 0.17
96 0.17
97 0.17
98 0.16
99 0.15
100 0.16
101 0.16
102 0.15
103 0.14
104 0.12
105 0.11
106 0.14
107 0.17
108 0.16
109 0.16
110 0.19
111 0.24
112 0.25
113 0.29
114 0.29
115 0.31
116 0.4
117 0.48
118 0.49
119 0.49
120 0.54
121 0.57
122 0.61
123 0.65
124 0.57
125 0.52
126 0.5
127 0.43
128 0.4
129 0.41
130 0.39
131 0.36
132 0.36
133 0.38
134 0.37
135 0.37
136 0.34
137 0.24
138 0.2
139 0.16
140 0.15
141 0.12
142 0.11
143 0.12
144 0.11
145 0.12
146 0.12
147 0.1
148 0.1
149 0.09
150 0.1
151 0.16
152 0.21
153 0.27
154 0.35
155 0.44
156 0.45
157 0.48
158 0.52
159 0.55
160 0.61
161 0.63
162 0.64
163 0.64
164 0.63
165 0.61
166 0.57
167 0.49
168 0.4
169 0.33
170 0.31
171 0.28
172 0.28
173 0.27
174 0.27
175 0.29
176 0.29
177 0.27
178 0.25
179 0.2
180 0.18
181 0.17
182 0.18
183 0.2
184 0.22
185 0.24
186 0.22
187 0.23
188 0.26
189 0.25
190 0.23
191 0.18
192 0.15
193 0.13
194 0.15
195 0.13
196 0.13
197 0.13
198 0.14
199 0.13
200 0.13
201 0.13
202 0.1
203 0.11
204 0.1
205 0.11
206 0.12
207 0.14
208 0.14
209 0.15
210 0.13
211 0.13
212 0.13
213 0.16
214 0.21
215 0.21
216 0.23
217 0.26
218 0.3
219 0.3
220 0.3
221 0.27
222 0.22
223 0.2
224 0.19
225 0.15
226 0.13
227 0.12
228 0.11
229 0.1
230 0.09
231 0.09
232 0.09
233 0.09
234 0.07
235 0.08
236 0.09
237 0.09
238 0.1
239 0.09
240 0.08
241 0.1
242 0.08
243 0.07
244 0.07
245 0.07
246 0.09
247 0.12
248 0.12
249 0.12
250 0.13
251 0.16
252 0.17
253 0.19
254 0.16
255 0.14
256 0.15
257 0.14
258 0.14
259 0.13
260 0.14
261 0.18
262 0.28
263 0.33
264 0.41
265 0.51
266 0.6
267 0.7
268 0.78
269 0.81
270 0.82
271 0.87
272 0.81
273 0.74
274 0.67
275 0.56
276 0.45
277 0.35
278 0.24
279 0.15
280 0.11
281 0.08
282 0.04
283 0.04
284 0.03
285 0.03
286 0.05
287 0.05
288 0.05
289 0.05
290 0.05
291 0.07
292 0.08
293 0.08
294 0.06
295 0.06
296 0.07
297 0.08
298 0.08
299 0.07
300 0.07
301 0.06
302 0.07
303 0.08
304 0.08
305 0.06
306 0.06
307 0.07
308 0.07
309 0.12
310 0.14
311 0.14
312 0.17
313 0.18
314 0.2
315 0.24
316 0.27
317 0.26
318 0.25
319 0.27
320 0.26
321 0.29
322 0.27
323 0.26
324 0.24
325 0.22
326 0.21
327 0.21
328 0.21
329 0.17
330 0.16
331 0.19
332 0.23
333 0.26
334 0.27
335 0.26
336 0.25
337 0.26
338 0.25
339 0.25
340 0.24
341 0.2
342 0.21
343 0.21
344 0.19
345 0.19
346 0.18
347 0.15
348 0.09
349 0.12
350 0.12
351 0.12
352 0.12
353 0.13
354 0.14
355 0.2
356 0.24
357 0.29
358 0.3
359 0.3
360 0.32
361 0.34
362 0.35
363 0.37
364 0.39
365 0.32
366 0.31
367 0.36
368 0.34
369 0.33
370 0.34
371 0.3
372 0.28
373 0.3
374 0.36
375 0.38
376 0.43
377 0.49
378 0.5
379 0.51
380 0.56
381 0.58
382 0.61
383 0.6
384 0.55
385 0.5
386 0.48
387 0.43
388 0.4
389 0.35
390 0.27
391 0.24
392 0.23
393 0.22
394 0.21
395 0.25
396 0.23
397 0.3
398 0.34
399 0.37
400 0.42
401 0.43
402 0.43
403 0.43
404 0.41
405 0.39
406 0.42
407 0.36
408 0.31
409 0.31
410 0.27
411 0.26
412 0.25
413 0.22
414 0.16
415 0.19
416 0.22
417 0.28
418 0.29
419 0.27
420 0.29
421 0.27
422 0.24
423 0.21
424 0.18
425 0.15
426 0.19
427 0.18
428 0.17
429 0.18
430 0.17
431 0.17
432 0.19
433 0.2
434 0.19
435 0.19
436 0.21
437 0.21
438 0.21
439 0.2
440 0.18
441 0.14
442 0.13
443 0.12
444 0.1
445 0.08
446 0.08
447 0.09
448 0.11
449 0.11
450 0.08
451 0.09
452 0.08
453 0.08
454 0.08
455 0.07
456 0.04
457 0.06
458 0.07
459 0.08
460 0.08
461 0.08
462 0.12
463 0.12
464 0.12
465 0.11
466 0.11
467 0.11
468 0.12
469 0.18
470 0.19
471 0.19
472 0.19
473 0.2
474 0.18
475 0.17
476 0.17
477 0.14
478 0.09
479 0.13
480 0.13
481 0.19
482 0.2
483 0.22
484 0.29
485 0.31
486 0.38
487 0.42
488 0.53
489 0.56
490 0.67
491 0.74
492 0.75
493 0.76
494 0.79
495 0.82
496 0.81
497 0.79
498 0.77
499 0.75
500 0.72
501 0.71
502 0.66
503 0.59
504 0.5
505 0.43
506 0.34
507 0.35
508 0.29
509 0.3
510 0.28
511 0.26
512 0.24
513 0.26
514 0.3
515 0.28
516 0.34
517 0.38
518 0.38
519 0.42
520 0.48
521 0.47
522 0.47
523 0.47
524 0.42
525 0.37
526 0.36
527 0.32
528 0.31
529 0.31
530 0.29
531 0.22
532 0.21
533 0.19
534 0.17
535 0.15
536 0.12
537 0.11
538 0.12
539 0.12
540 0.12
541 0.13
542 0.15
543 0.16
544 0.18
545 0.22
546 0.3
547 0.34
548 0.35
549 0.35
550 0.37
551 0.39
552 0.35
553 0.34
554 0.25
555 0.21
556 0.21
557 0.21
558 0.19
559 0.15
560 0.15
561 0.11
562 0.09
563 0.07
564 0.05
565 0.04
566 0.04
567 0.04
568 0.03
569 0.03
570 0.03
571 0.03
572 0.03
573 0.03
574 0.02
575 0.02
576 0.03
577 0.03
578 0.03
579 0.03
580 0.03
581 0.06
582 0.08
583 0.08
584 0.1
585 0.16
586 0.19
587 0.23
588 0.27
589 0.3
590 0.32
591 0.36
592 0.41
593 0.45
594 0.49
595 0.52
596 0.55
597 0.59
598 0.57
599 0.6
600 0.58
601 0.54
602 0.51
603 0.48
604 0.41
605 0.34
606 0.32
607 0.27
608 0.24
609 0.19
610 0.16
611 0.15
612 0.16
613 0.15
614 0.16
615 0.15
616 0.14
617 0.15
618 0.17
619 0.16
620 0.16
621 0.15
622 0.15
623 0.14
624 0.13
625 0.11
626 0.1
627 0.1
628 0.1
629 0.11
630 0.11
631 0.11
632 0.16
633 0.19
634 0.21
635 0.27
636 0.32
637 0.39
638 0.42
639 0.44
640 0.42
641 0.44
642 0.45
643 0.38
644 0.34
645 0.29
646 0.26
647 0.25
648 0.24
649 0.21
650 0.17
651 0.15
652 0.13
653 0.09
654 0.1
655 0.11
656 0.11
657 0.09
658 0.09
659 0.1
660 0.1
661 0.09
662 0.09
663 0.08
664 0.07
665 0.06
666 0.06
667 0.06
668 0.06
669 0.06
670 0.06
671 0.04
672 0.04
673 0.04
674 0.04
675 0.05
676 0.05
677 0.06
678 0.06
679 0.09
680 0.12
681 0.14
682 0.2
683 0.24
684 0.29
685 0.38
686 0.47
687 0.51
688 0.56
689 0.63
690 0.68
691 0.75
692 0.81
693 0.82
694 0.84
695 0.84
696 0.85
697 0.87
698 0.87
699 0.87
700 0.87
701 0.88
702 0.88
703 0.91
704 0.88
705 0.8
706 0.79
707 0.74
708 0.71
709 0.7
710 0.68
711 0.62
712 0.62
713 0.61
714 0.5
715 0.44
716 0.37
717 0.26
718 0.16
719 0.12
720 0.08
721 0.06
722 0.11
723 0.12
724 0.12
725 0.12
726 0.12
727 0.13
728 0.15
729 0.16
730 0.11
731 0.13
732 0.14
733 0.18
734 0.18
735 0.17
736 0.16
737 0.17
738 0.18
739 0.2
740 0.21
741 0.25
742 0.32
743 0.37
744 0.4
745 0.45
746 0.53
747 0.55
748 0.61
749 0.6
750 0.63
751 0.66
752 0.72
753 0.76
754 0.72
755 0.73
756 0.68
757 0.64
758 0.54
759 0.47
760 0.38
761 0.28
762 0.22
763 0.15
764 0.12
765 0.08
766 0.08
767 0.07
768 0.07
769 0.07
770 0.06
771 0.06
772 0.08
773 0.08
774 0.07
775 0.08
776 0.08
777 0.08
778 0.09
779 0.09
780 0.07
781 0.07
782 0.07
783 0.06
784 0.06
785 0.07
786 0.08
787 0.08
788 0.1
789 0.15
790 0.15
791 0.16
792 0.16
793 0.15
794 0.14
795 0.16
796 0.18
797 0.16
798 0.16
799 0.18
800 0.18
801 0.17
802 0.16
803 0.16
804 0.12
805 0.12
806 0.12
807 0.11
808 0.14
809 0.16
810 0.17
811 0.2
812 0.25
813 0.28
814 0.34
815 0.36
816 0.34
817 0.43
818 0.42
819 0.41
820 0.38
821 0.32
822 0.27
823 0.25
824 0.25
825 0.16
826 0.15
827 0.13
828 0.13
829 0.14
830 0.14
831 0.16
832 0.18
833 0.25
834 0.33
835 0.34
836 0.4
837 0.48
838 0.52
839 0.57
840 0.59
841 0.61
842 0.64
843 0.67
844 0.63
845 0.62
846 0.63
847 0.59
848 0.58
849 0.52
850 0.45
851 0.46
852 0.45
853 0.41
854 0.41
855 0.43
856 0.47
857 0.47
858 0.49
859 0.46
860 0.44
861 0.4
862 0.34
863 0.29
864 0.27
865 0.24
866 0.2
867 0.19
868 0.2
869 0.2
870 0.2
871 0.22
872 0.2
873 0.22
874 0.27
875 0.32
876 0.3
877 0.33
878 0.36
879 0.34
880 0.32
881 0.29
882 0.24
883 0.21
884 0.2
885 0.16
886 0.15
887 0.16
888 0.13
889 0.14
890 0.14
891 0.18
892 0.2
893 0.24
894 0.25
895 0.28
896 0.37
897 0.44
898 0.52
899 0.53
900 0.54
901 0.51
902 0.58
903 0.58
904 0.58
905 0.54
906 0.51
907 0.47
908 0.52
909 0.51
910 0.43
911 0.41
912 0.33
913 0.33
914 0.35
915 0.39
916 0.33
917 0.34
918 0.33
919 0.35
920 0.39
921 0.43
922 0.46
923 0.5
924 0.56
925 0.58
926 0.59
927 0.55
928 0.51
929 0.44
930 0.36
931 0.31
932 0.3
933 0.33
934 0.41
935 0.47
936 0.5
937 0.54
938 0.57
939 0.57
940 0.57
941 0.54
942 0.55
943 0.55
944 0.61
945 0.65
946 0.64
947 0.61
948 0.61
949 0.63
950 0.57
951 0.56
952 0.48
953 0.46
954 0.44
955 0.42
956 0.36
957 0.32
958 0.28
959 0.24
960 0.25
961 0.19
962 0.17
963 0.16
964 0.19
965 0.17
966 0.17
967 0.15
968 0.14
969 0.12
970 0.12
971 0.12
972 0.09
973 0.08