Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

P21538

Protein Details
Accession P21538    Localization Confidence High Confidence Score 15.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
200-222NGNNHENSQKKRKNNNDDDDRQIHydrophilic
702-724GTRSRIQCRYKWNKLVKREAIAKHydrophilic
768-795LELKLCYERMKKKVKGYKQKSINEISKEHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 23, cyto_nucl 16
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR009057  Homeobox-like_sf  
IPR017930  Myb_dom  
IPR001005  SANT/Myb  
Gene Ontology GO:0000785  C:chromatin  
GO:0005654  C:nucleoplasm  
GO:0005634  C:nucleus  
GO:0001228  F:DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific  
GO:0003700  F:DNA-binding transcription factor activity  
GO:0000978  F:RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding  
GO:0043565  F:sequence-specific DNA binding  
GO:0000976  F:transcription cis-regulatory region binding  
GO:0045944  P:positive regulation of transcription by RNA polymerase II  
GO:0006355  P:regulation of DNA-templated transcription  
GO:0006357  P:regulation of transcription by RNA polymerase II  
GO:0006363  P:termination of RNA polymerase I transcription  
GO:0006369  P:termination of RNA polymerase II transcription  
GO:0001174  P:transcriptional start site selection at RNA polymerase II promoter  
KEGG sce:YBR049C  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF13921  Myb_DNA-bind_6  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51294  HTH_MYB  
PS50090  MYB_LIKE  
CDD cd00167  SANT  
Amino Acid Sequences MPSGHNDKNANQESVEEAVLKYVGVGLDHQNHDPQLHTKDLENKHSKKQNIVESSSDVDVNNNDDSNRNEDNNDDSENISALNANESSSNVDHANSNEQHNAVMDWYLRQTAHNQQDDEDDENNNNTDNGNDSNNHFSQSDIVVDDDDDKNKKDAGVGVDDDHQSMAMAAVAAAYTLSKNNNNNNSIANDSNSRKRQHDNGNNHENSQKKRKNNNDDDDRQIGNVDPELTTLGDADDNDTNNDVIDRDQLVHKAIIDADSITQHPDFQQYLNTAADTDDNEKLKHIKDHLMRTHGLNHQNKNHNDDTDDLSNSTKQYSELQKDSMLDSSLNKSRNYMEVLPKVISQDTQPHQQKSPSHDNEAGSVDNSEISQLLQSAATKASSLVSLSSSSATPSTSRSNNSKAFDKAEDAALERFINEYEAIERLTRQQVCERIWSSDRPKDNFWNNIYKVLPYRSSSSIYKHMRRKYHIFEQRGKWTAEEEQELAKLCAEKEGQWAEIGKTLGRMPEDCRDRWRNYVKCGTNRASNRWSVEEEELLKKVISDMLEEAQQQQSQLHPNLLEEEQHLLQDDQNDHRNNDEDDDDTASAAAAAAAAIQEQQQLLQQKQQDDDDAIAAAAAAASSSLGDNKDEDKPHDSLGIQLDDNSQNSMVPAPSATSTHSKSLSNTIRRHNNKLRKSLMGNGKLDFKDIINWTIVSERMGGTRSRIQCRYKWNKLVKREAIAKIQTVKDDDMLWIFEKLRDLGITEDSQVDWDELAALKPGMKLNGLELKLCYERMKKKVKGYKQKSINEISKELVDYFSSNISMKTEN
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.33
2 0.3
3 0.21
4 0.16
5 0.15
6 0.15
7 0.13
8 0.1
9 0.09
10 0.09
11 0.08
12 0.11
13 0.15
14 0.22
15 0.25
16 0.27
17 0.28
18 0.29
19 0.29
20 0.3
21 0.3
22 0.28
23 0.3
24 0.3
25 0.31
26 0.4
27 0.46
28 0.53
29 0.58
30 0.58
31 0.64
32 0.71
33 0.7
34 0.69
35 0.71
36 0.7
37 0.68
38 0.67
39 0.6
40 0.55
41 0.55
42 0.47
43 0.4
44 0.3
45 0.24
46 0.21
47 0.2
48 0.19
49 0.16
50 0.16
51 0.18
52 0.2
53 0.25
54 0.28
55 0.27
56 0.26
57 0.27
58 0.31
59 0.3
60 0.3
61 0.25
62 0.21
63 0.2
64 0.2
65 0.18
66 0.13
67 0.12
68 0.09
69 0.11
70 0.11
71 0.11
72 0.11
73 0.12
74 0.16
75 0.14
76 0.16
77 0.14
78 0.15
79 0.16
80 0.18
81 0.26
82 0.24
83 0.27
84 0.27
85 0.27
86 0.26
87 0.25
88 0.23
89 0.16
90 0.15
91 0.12
92 0.12
93 0.13
94 0.15
95 0.15
96 0.15
97 0.19
98 0.27
99 0.36
100 0.39
101 0.39
102 0.37
103 0.41
104 0.43
105 0.42
106 0.34
107 0.26
108 0.22
109 0.23
110 0.23
111 0.19
112 0.16
113 0.13
114 0.11
115 0.12
116 0.13
117 0.14
118 0.16
119 0.18
120 0.25
121 0.25
122 0.27
123 0.24
124 0.22
125 0.21
126 0.21
127 0.19
128 0.13
129 0.13
130 0.11
131 0.12
132 0.15
133 0.15
134 0.18
135 0.18
136 0.19
137 0.2
138 0.21
139 0.21
140 0.19
141 0.21
142 0.21
143 0.23
144 0.23
145 0.23
146 0.26
147 0.26
148 0.25
149 0.2
150 0.16
151 0.11
152 0.1
153 0.08
154 0.05
155 0.04
156 0.04
157 0.04
158 0.04
159 0.03
160 0.03
161 0.04
162 0.04
163 0.06
164 0.09
165 0.14
166 0.2
167 0.28
168 0.35
169 0.37
170 0.38
171 0.39
172 0.38
173 0.37
174 0.33
175 0.27
176 0.26
177 0.28
178 0.36
179 0.4
180 0.41
181 0.41
182 0.45
183 0.52
184 0.57
185 0.63
186 0.64
187 0.67
188 0.74
189 0.71
190 0.68
191 0.63
192 0.58
193 0.55
194 0.56
195 0.54
196 0.53
197 0.62
198 0.71
199 0.77
200 0.82
201 0.86
202 0.85
203 0.82
204 0.79
205 0.73
206 0.63
207 0.52
208 0.42
209 0.32
210 0.23
211 0.19
212 0.13
213 0.09
214 0.09
215 0.09
216 0.09
217 0.08
218 0.07
219 0.06
220 0.06
221 0.06
222 0.09
223 0.1
224 0.1
225 0.11
226 0.11
227 0.11
228 0.1
229 0.1
230 0.08
231 0.07
232 0.08
233 0.09
234 0.09
235 0.11
236 0.12
237 0.14
238 0.14
239 0.13
240 0.12
241 0.12
242 0.11
243 0.1
244 0.09
245 0.08
246 0.09
247 0.09
248 0.1
249 0.09
250 0.09
251 0.09
252 0.12
253 0.12
254 0.11
255 0.14
256 0.13
257 0.16
258 0.16
259 0.15
260 0.12
261 0.12
262 0.12
263 0.11
264 0.13
265 0.14
266 0.15
267 0.15
268 0.16
269 0.19
270 0.2
271 0.22
272 0.22
273 0.26
274 0.31
275 0.4
276 0.43
277 0.45
278 0.44
279 0.42
280 0.46
281 0.43
282 0.46
283 0.44
284 0.45
285 0.49
286 0.57
287 0.57
288 0.57
289 0.53
290 0.45
291 0.4
292 0.36
293 0.33
294 0.27
295 0.26
296 0.2
297 0.18
298 0.19
299 0.18
300 0.16
301 0.12
302 0.1
303 0.15
304 0.21
305 0.25
306 0.26
307 0.27
308 0.27
309 0.28
310 0.28
311 0.23
312 0.17
313 0.13
314 0.12
315 0.15
316 0.18
317 0.2
318 0.19
319 0.2
320 0.2
321 0.22
322 0.25
323 0.25
324 0.27
325 0.27
326 0.29
327 0.28
328 0.28
329 0.26
330 0.22
331 0.18
332 0.13
333 0.17
334 0.18
335 0.27
336 0.31
337 0.32
338 0.34
339 0.38
340 0.41
341 0.41
342 0.49
343 0.43
344 0.42
345 0.44
346 0.42
347 0.4
348 0.38
349 0.3
350 0.19
351 0.16
352 0.12
353 0.09
354 0.08
355 0.06
356 0.04
357 0.04
358 0.04
359 0.04
360 0.04
361 0.05
362 0.05
363 0.06
364 0.06
365 0.06
366 0.06
367 0.06
368 0.06
369 0.06
370 0.06
371 0.05
372 0.06
373 0.06
374 0.07
375 0.07
376 0.07
377 0.07
378 0.07
379 0.07
380 0.07
381 0.09
382 0.13
383 0.14
384 0.17
385 0.21
386 0.26
387 0.31
388 0.33
389 0.34
390 0.32
391 0.32
392 0.3
393 0.28
394 0.23
395 0.19
396 0.17
397 0.14
398 0.13
399 0.11
400 0.1
401 0.08
402 0.08
403 0.06
404 0.07
405 0.06
406 0.06
407 0.05
408 0.06
409 0.07
410 0.07
411 0.07
412 0.09
413 0.15
414 0.15
415 0.16
416 0.19
417 0.23
418 0.25
419 0.3
420 0.28
421 0.26
422 0.28
423 0.32
424 0.34
425 0.35
426 0.39
427 0.36
428 0.38
429 0.42
430 0.45
431 0.45
432 0.43
433 0.46
434 0.42
435 0.43
436 0.4
437 0.34
438 0.32
439 0.28
440 0.27
441 0.2
442 0.23
443 0.21
444 0.25
445 0.25
446 0.26
447 0.33
448 0.38
449 0.44
450 0.48
451 0.53
452 0.55
453 0.59
454 0.63
455 0.61
456 0.64
457 0.64
458 0.63
459 0.65
460 0.64
461 0.66
462 0.62
463 0.56
464 0.45
465 0.39
466 0.36
467 0.3
468 0.26
469 0.19
470 0.16
471 0.17
472 0.17
473 0.15
474 0.13
475 0.11
476 0.09
477 0.12
478 0.11
479 0.11
480 0.15
481 0.16
482 0.16
483 0.16
484 0.17
485 0.14
486 0.17
487 0.16
488 0.12
489 0.12
490 0.12
491 0.13
492 0.13
493 0.14
494 0.13
495 0.21
496 0.25
497 0.25
498 0.33
499 0.38
500 0.4
501 0.47
502 0.54
503 0.5
504 0.53
505 0.61
506 0.6
507 0.59
508 0.64
509 0.59
510 0.57
511 0.56
512 0.56
513 0.51
514 0.47
515 0.44
516 0.39
517 0.37
518 0.32
519 0.3
520 0.26
521 0.25
522 0.24
523 0.22
524 0.2
525 0.18
526 0.14
527 0.13
528 0.13
529 0.1
530 0.09
531 0.1
532 0.1
533 0.12
534 0.12
535 0.14
536 0.14
537 0.14
538 0.13
539 0.12
540 0.13
541 0.18
542 0.18
543 0.18
544 0.17
545 0.17
546 0.2
547 0.19
548 0.18
549 0.13
550 0.15
551 0.14
552 0.13
553 0.14
554 0.11
555 0.12
556 0.15
557 0.17
558 0.18
559 0.25
560 0.27
561 0.26
562 0.27
563 0.29
564 0.26
565 0.25
566 0.23
567 0.17
568 0.16
569 0.18
570 0.17
571 0.14
572 0.13
573 0.1
574 0.09
575 0.07
576 0.06
577 0.03
578 0.03
579 0.03
580 0.02
581 0.03
582 0.03
583 0.04
584 0.05
585 0.05
586 0.05
587 0.09
588 0.13
589 0.14
590 0.18
591 0.22
592 0.24
593 0.26
594 0.27
595 0.25
596 0.22
597 0.22
598 0.18
599 0.14
600 0.11
601 0.09
602 0.08
603 0.06
604 0.04
605 0.03
606 0.02
607 0.02
608 0.02
609 0.03
610 0.03
611 0.05
612 0.06
613 0.07
614 0.08
615 0.11
616 0.17
617 0.19
618 0.22
619 0.25
620 0.26
621 0.26
622 0.28
623 0.25
624 0.23
625 0.25
626 0.24
627 0.19
628 0.19
629 0.21
630 0.21
631 0.21
632 0.19
633 0.15
634 0.13
635 0.13
636 0.14
637 0.1
638 0.09
639 0.08
640 0.08
641 0.09
642 0.1
643 0.13
644 0.17
645 0.2
646 0.23
647 0.25
648 0.25
649 0.26
650 0.35
651 0.42
652 0.45
653 0.48
654 0.53
655 0.62
656 0.67
657 0.75
658 0.76
659 0.77
660 0.77
661 0.8
662 0.76
663 0.72
664 0.7
665 0.69
666 0.69
667 0.66
668 0.6
669 0.53
670 0.55
671 0.48
672 0.46
673 0.38
674 0.28
675 0.26
676 0.26
677 0.26
678 0.2
679 0.2
680 0.2
681 0.2
682 0.2
683 0.15
684 0.14
685 0.13
686 0.13
687 0.14
688 0.14
689 0.17
690 0.25
691 0.32
692 0.38
693 0.45
694 0.49
695 0.53
696 0.63
697 0.69
698 0.71
699 0.74
700 0.77
701 0.78
702 0.83
703 0.88
704 0.83
705 0.8
706 0.78
707 0.73
708 0.71
709 0.65
710 0.6
711 0.56
712 0.52
713 0.47
714 0.42
715 0.38
716 0.31
717 0.28
718 0.25
719 0.2
720 0.2
721 0.18
722 0.17
723 0.17
724 0.17
725 0.19
726 0.18
727 0.18
728 0.16
729 0.17
730 0.17
731 0.2
732 0.19
733 0.18
734 0.18
735 0.16
736 0.17
737 0.16
738 0.14
739 0.1
740 0.09
741 0.09
742 0.09
743 0.09
744 0.1
745 0.1
746 0.11
747 0.13
748 0.16
749 0.16
750 0.17
751 0.17
752 0.21
753 0.29
754 0.28
755 0.27
756 0.26
757 0.3
758 0.3
759 0.32
760 0.32
761 0.33
762 0.41
763 0.49
764 0.58
765 0.6
766 0.69
767 0.77
768 0.82
769 0.85
770 0.85
771 0.87
772 0.86
773 0.87
774 0.84
775 0.84
776 0.8
777 0.75
778 0.69
779 0.6
780 0.53
781 0.47
782 0.4
783 0.32
784 0.25
785 0.2
786 0.19
787 0.18
788 0.17
789 0.16
790 0.16