Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

Q05580

Protein Details
Accession Q05580    Localization Confidence High Confidence Score 16.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
9-50VTPTRNFRRTQGPQNNTKPHNDRKNFRRKQKKNNLSAEPNLTHydrophilic
617-639LNTTSGGNKKKGKQKQLLFHIGVHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
32-39KNFRRKQK
Subcellular Location(s) nucl 24.5, cyto_nucl 14.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR041888  RING-HC_ZNF598/Hel2  
IPR044288  ZNF598/Hel2  
IPR013087  Znf_C2H2_type  
IPR001841  Znf_RING  
IPR013083  Znf_RING/FYVE/PHD  
Gene Ontology GO:0005737  C:cytoplasm  
GO:0046872  F:metal ion binding  
GO:0043022  F:ribosome binding  
GO:0070181  F:small ribosomal subunit rRNA binding  
GO:0061630  F:ubiquitin protein ligase activity  
GO:0036205  P:histone catabolic process  
GO:0061157  P:mRNA destabilization  
GO:0010629  P:negative regulation of gene expression  
GO:0070651  P:nonfunctional rRNA decay  
GO:0070534  P:protein K63-linked ubiquitination  
GO:0016567  P:protein ubiquitination  
GO:0072344  P:rescue of stalled ribosome  
GO:1990116  P:ribosome-associated ubiquitin-dependent protein catabolic process  
KEGG sce:YDR266C  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF13920  zf-C3HC4_3  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50089  ZF_RING_2  
PS00028  ZINC_FINGER_C2H2_1  
CDD cd16615  RING-HC_ZNF598  
Amino Acid Sequences MSESVKENVTPTRNFRRTQGPQNNTKPHNDRKNFRRKQKKNNLSAEPNLTTSSADDTDEENELCVICARKLTYVSLTPCHHKTCHICGFRQRALYNKKSCLICRTENEEVMFTDRIDGDISDKYNFCEKNEKYGINFTSEEVATETLNLLKFFCPLSKDEQVCDFGSFKKYNEHLKSEHNRMICLICATHKHAFPCELEIFTQNQLRNHQTKGNSEGFKGHPMCAFCSGKRFYSDDELYIHMRNQHEKCHICDKMNPASPQYFKDYNQLFDHFKHSHYVCTVQTCLDNKFVVFKDELELQAHILQEHGNILKGKPKFFQSELSTFISAPSRVIRERDDYDLPSISSLPGSSSGSRTDVRSASSPEESRLRLAERAKYYLENSKEDFNKFSSYNEDYSKGRLSAEKLLESYKLLFTKPNADVYLLIHNLAETFPKNSSKYNNLNAIYEQREQTLARQTSLPSLSSDSSLSMSIGRGHWGGTNDGGSAGAALGVRNIKNLPTLKSPSASYDPFATTVKKNTLRPVQNIKRTTPQSVSYRTSTNTVAFSPTYLESKKGSSSTSLNNSKDKLKSLNLPQLPPPKPKVQIPGLNRPQIADPKQWGKKSSTQDTNVHDNLRELNTTSGGNKKKGKQKQLLFHIGV
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.55
2 0.57
3 0.6
4 0.63
5 0.69
6 0.72
7 0.69
8 0.73
9 0.82
10 0.87
11 0.8
12 0.81
13 0.79
14 0.78
15 0.81
16 0.79
17 0.79
18 0.8
19 0.87
20 0.88
21 0.9
22 0.91
23 0.9
24 0.93
25 0.94
26 0.94
27 0.93
28 0.93
29 0.91
30 0.88
31 0.84
32 0.8
33 0.71
34 0.62
35 0.52
36 0.43
37 0.33
38 0.26
39 0.24
40 0.17
41 0.16
42 0.15
43 0.16
44 0.17
45 0.19
46 0.18
47 0.14
48 0.13
49 0.13
50 0.12
51 0.13
52 0.13
53 0.11
54 0.14
55 0.15
56 0.18
57 0.2
58 0.22
59 0.24
60 0.29
61 0.32
62 0.36
63 0.39
64 0.42
65 0.44
66 0.46
67 0.42
68 0.43
69 0.46
70 0.48
71 0.55
72 0.54
73 0.55
74 0.59
75 0.67
76 0.65
77 0.65
78 0.57
79 0.57
80 0.61
81 0.65
82 0.64
83 0.6
84 0.62
85 0.59
86 0.61
87 0.59
88 0.56
89 0.54
90 0.52
91 0.55
92 0.53
93 0.52
94 0.51
95 0.44
96 0.38
97 0.35
98 0.3
99 0.21
100 0.18
101 0.15
102 0.14
103 0.14
104 0.13
105 0.11
106 0.14
107 0.16
108 0.16
109 0.16
110 0.18
111 0.24
112 0.25
113 0.25
114 0.32
115 0.32
116 0.39
117 0.45
118 0.44
119 0.4
120 0.47
121 0.45
122 0.4
123 0.39
124 0.3
125 0.28
126 0.26
127 0.24
128 0.17
129 0.17
130 0.12
131 0.12
132 0.11
133 0.1
134 0.11
135 0.11
136 0.1
137 0.1
138 0.11
139 0.12
140 0.13
141 0.13
142 0.14
143 0.22
144 0.28
145 0.29
146 0.3
147 0.32
148 0.34
149 0.32
150 0.32
151 0.26
152 0.21
153 0.26
154 0.25
155 0.23
156 0.27
157 0.3
158 0.38
159 0.42
160 0.45
161 0.42
162 0.5
163 0.57
164 0.57
165 0.57
166 0.48
167 0.43
168 0.4
169 0.38
170 0.29
171 0.22
172 0.15
173 0.13
174 0.16
175 0.21
176 0.24
177 0.25
178 0.26
179 0.27
180 0.28
181 0.27
182 0.29
183 0.25
184 0.21
185 0.2
186 0.2
187 0.2
188 0.2
189 0.24
190 0.21
191 0.22
192 0.25
193 0.31
194 0.32
195 0.33
196 0.35
197 0.34
198 0.36
199 0.4
200 0.43
201 0.38
202 0.36
203 0.38
204 0.34
205 0.38
206 0.36
207 0.3
208 0.25
209 0.25
210 0.26
211 0.28
212 0.29
213 0.22
214 0.28
215 0.28
216 0.27
217 0.29
218 0.29
219 0.24
220 0.3
221 0.3
222 0.25
223 0.24
224 0.25
225 0.24
226 0.23
227 0.22
228 0.18
229 0.19
230 0.25
231 0.25
232 0.28
233 0.34
234 0.35
235 0.38
236 0.43
237 0.44
238 0.39
239 0.41
240 0.42
241 0.42
242 0.46
243 0.43
244 0.37
245 0.38
246 0.38
247 0.36
248 0.37
249 0.31
250 0.26
251 0.33
252 0.32
253 0.31
254 0.32
255 0.33
256 0.28
257 0.27
258 0.33
259 0.26
260 0.25
261 0.26
262 0.24
263 0.23
264 0.22
265 0.24
266 0.19
267 0.2
268 0.2
269 0.16
270 0.19
271 0.18
272 0.19
273 0.18
274 0.17
275 0.14
276 0.18
277 0.17
278 0.16
279 0.15
280 0.13
281 0.13
282 0.14
283 0.15
284 0.12
285 0.12
286 0.1
287 0.12
288 0.12
289 0.1
290 0.08
291 0.08
292 0.07
293 0.08
294 0.07
295 0.07
296 0.08
297 0.08
298 0.14
299 0.15
300 0.17
301 0.17
302 0.2
303 0.22
304 0.23
305 0.29
306 0.27
307 0.28
308 0.31
309 0.31
310 0.28
311 0.25
312 0.24
313 0.19
314 0.15
315 0.13
316 0.11
317 0.11
318 0.12
319 0.14
320 0.15
321 0.18
322 0.2
323 0.24
324 0.24
325 0.23
326 0.23
327 0.22
328 0.2
329 0.16
330 0.14
331 0.1
332 0.08
333 0.07
334 0.05
335 0.06
336 0.08
337 0.08
338 0.09
339 0.1
340 0.13
341 0.14
342 0.14
343 0.16
344 0.15
345 0.16
346 0.17
347 0.19
348 0.19
349 0.21
350 0.21
351 0.2
352 0.23
353 0.21
354 0.2
355 0.19
356 0.18
357 0.2
358 0.22
359 0.26
360 0.25
361 0.27
362 0.27
363 0.27
364 0.28
365 0.3
366 0.31
367 0.27
368 0.26
369 0.29
370 0.31
371 0.31
372 0.3
373 0.25
374 0.26
375 0.23
376 0.23
377 0.22
378 0.22
379 0.24
380 0.24
381 0.25
382 0.22
383 0.24
384 0.25
385 0.2
386 0.18
387 0.17
388 0.19
389 0.23
390 0.25
391 0.23
392 0.22
393 0.23
394 0.22
395 0.21
396 0.2
397 0.16
398 0.15
399 0.14
400 0.15
401 0.15
402 0.22
403 0.23
404 0.25
405 0.22
406 0.22
407 0.22
408 0.22
409 0.26
410 0.19
411 0.17
412 0.13
413 0.13
414 0.12
415 0.12
416 0.12
417 0.07
418 0.09
419 0.11
420 0.15
421 0.17
422 0.2
423 0.25
424 0.31
425 0.37
426 0.41
427 0.46
428 0.43
429 0.44
430 0.42
431 0.42
432 0.38
433 0.34
434 0.29
435 0.22
436 0.23
437 0.21
438 0.23
439 0.28
440 0.25
441 0.23
442 0.24
443 0.24
444 0.27
445 0.28
446 0.26
447 0.17
448 0.19
449 0.19
450 0.18
451 0.18
452 0.14
453 0.13
454 0.13
455 0.12
456 0.1
457 0.1
458 0.11
459 0.11
460 0.11
461 0.11
462 0.11
463 0.13
464 0.14
465 0.15
466 0.14
467 0.14
468 0.12
469 0.12
470 0.11
471 0.08
472 0.07
473 0.05
474 0.05
475 0.05
476 0.04
477 0.06
478 0.1
479 0.1
480 0.11
481 0.12
482 0.12
483 0.18
484 0.21
485 0.23
486 0.27
487 0.33
488 0.34
489 0.36
490 0.36
491 0.35
492 0.38
493 0.35
494 0.29
495 0.27
496 0.26
497 0.26
498 0.26
499 0.24
500 0.22
501 0.26
502 0.34
503 0.36
504 0.38
505 0.45
506 0.53
507 0.56
508 0.61
509 0.66
510 0.67
511 0.71
512 0.72
513 0.68
514 0.68
515 0.65
516 0.63
517 0.55
518 0.53
519 0.51
520 0.53
521 0.54
522 0.47
523 0.47
524 0.43
525 0.42
526 0.37
527 0.32
528 0.27
529 0.23
530 0.23
531 0.2
532 0.19
533 0.19
534 0.18
535 0.21
536 0.2
537 0.21
538 0.2
539 0.22
540 0.25
541 0.24
542 0.24
543 0.23
544 0.27
545 0.32
546 0.4
547 0.46
548 0.46
549 0.49
550 0.51
551 0.53
552 0.52
553 0.49
554 0.45
555 0.42
556 0.47
557 0.51
558 0.58
559 0.56
560 0.56
561 0.59
562 0.64
563 0.64
564 0.63
565 0.6
566 0.58
567 0.58
568 0.6
569 0.61
570 0.6
571 0.63
572 0.64
573 0.69
574 0.7
575 0.71
576 0.66
577 0.59
578 0.55
579 0.56
580 0.53
581 0.49
582 0.48
583 0.52
584 0.59
585 0.62
586 0.6
587 0.57
588 0.61
589 0.64
590 0.66
591 0.65
592 0.64
593 0.67
594 0.69
595 0.71
596 0.67
597 0.6
598 0.51
599 0.43
600 0.41
601 0.37
602 0.33
603 0.26
604 0.24
605 0.23
606 0.24
607 0.26
608 0.3
609 0.33
610 0.39
611 0.46
612 0.52
613 0.6
614 0.69
615 0.76
616 0.78
617 0.81
618 0.84
619 0.86