Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

Q6CNF1

Protein Details
Accession Q6CNF1    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1-29MSVKKQSSKSSVPKLTKKDDKKVKSSSSGHydrophilic
330-356DKLSRVRGKDFTKNKNKMKRGSYRGGSHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 19.5, cyto_nucl 12.5, mito 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR007718  Srp40_C  
Gene Ontology GO:0005730  C:nucleolus  
KEGG kla:KLLA0_E13047g  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF05022  SRP40_C  
Amino Acid Sequences MSVKKQSSKSSVPKLTKKDDKKVKSSSSGSESSSNSSDSSSSGSGSGSGSGSDSDSDSGSDSSSSSSSDSESNSDSSSSSSSSSSSSSSSDSDSSSDSDSSSSSDSSSSSDSDSDSDSSSSASSESDDEDEKDIKIKIKDEKSEPVAVEVKVSKSSNSDSESSSDSSSDSDSSSDSSSDSDSDSNSSSSSSSDSDSDSSSSSSSDSSSDSSSDSDSDSDSDSDSDSDSSSDSSSSSSDSDSSDSETAVETETNSKRPLETESDSTENSKESSQEPSTKKQMISAGVDEVLPGQRKHFSRVEREKIAFEHEVLTDNTYKGAAGTWGEMANDKLSRVRGKDFTKNKNKMKRGSYRGGSITMASGSYKFTD
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.8
2 0.83
3 0.83
4 0.83
5 0.83
6 0.84
7 0.83
8 0.83
9 0.84
10 0.81
11 0.79
12 0.75
13 0.71
14 0.66
15 0.61
16 0.55
17 0.51
18 0.45
19 0.4
20 0.37
21 0.32
22 0.25
23 0.23
24 0.2
25 0.16
26 0.18
27 0.14
28 0.14
29 0.13
30 0.13
31 0.12
32 0.12
33 0.13
34 0.09
35 0.09
36 0.09
37 0.09
38 0.09
39 0.09
40 0.1
41 0.09
42 0.09
43 0.09
44 0.1
45 0.1
46 0.1
47 0.09
48 0.09
49 0.09
50 0.1
51 0.1
52 0.09
53 0.1
54 0.11
55 0.12
56 0.13
57 0.14
58 0.16
59 0.16
60 0.16
61 0.16
62 0.14
63 0.14
64 0.14
65 0.13
66 0.12
67 0.11
68 0.11
69 0.12
70 0.13
71 0.13
72 0.13
73 0.13
74 0.14
75 0.14
76 0.16
77 0.15
78 0.15
79 0.15
80 0.15
81 0.15
82 0.15
83 0.14
84 0.12
85 0.12
86 0.11
87 0.12
88 0.12
89 0.1
90 0.09
91 0.09
92 0.09
93 0.11
94 0.12
95 0.11
96 0.11
97 0.11
98 0.11
99 0.12
100 0.13
101 0.12
102 0.11
103 0.11
104 0.1
105 0.1
106 0.1
107 0.09
108 0.07
109 0.07
110 0.06
111 0.07
112 0.08
113 0.09
114 0.09
115 0.1
116 0.12
117 0.13
118 0.12
119 0.14
120 0.15
121 0.18
122 0.19
123 0.22
124 0.28
125 0.33
126 0.38
127 0.39
128 0.43
129 0.43
130 0.44
131 0.4
132 0.36
133 0.33
134 0.27
135 0.26
136 0.21
137 0.19
138 0.18
139 0.18
140 0.15
141 0.14
142 0.16
143 0.18
144 0.19
145 0.19
146 0.17
147 0.19
148 0.2
149 0.2
150 0.18
151 0.15
152 0.12
153 0.11
154 0.11
155 0.1
156 0.08
157 0.07
158 0.07
159 0.08
160 0.08
161 0.08
162 0.07
163 0.07
164 0.07
165 0.07
166 0.08
167 0.07
168 0.07
169 0.08
170 0.08
171 0.08
172 0.08
173 0.08
174 0.07
175 0.07
176 0.08
177 0.08
178 0.08
179 0.09
180 0.09
181 0.1
182 0.1
183 0.11
184 0.1
185 0.09
186 0.09
187 0.08
188 0.08
189 0.07
190 0.07
191 0.07
192 0.07
193 0.08
194 0.09
195 0.09
196 0.09
197 0.09
198 0.09
199 0.09
200 0.09
201 0.08
202 0.08
203 0.08
204 0.08
205 0.08
206 0.08
207 0.08
208 0.08
209 0.08
210 0.08
211 0.07
212 0.06
213 0.06
214 0.06
215 0.07
216 0.07
217 0.06
218 0.06
219 0.07
220 0.07
221 0.08
222 0.08
223 0.08
224 0.08
225 0.09
226 0.1
227 0.1
228 0.12
229 0.12
230 0.11
231 0.11
232 0.1
233 0.1
234 0.09
235 0.09
236 0.07
237 0.13
238 0.15
239 0.17
240 0.18
241 0.19
242 0.18
243 0.19
244 0.23
245 0.22
246 0.24
247 0.26
248 0.29
249 0.31
250 0.31
251 0.32
252 0.28
253 0.23
254 0.2
255 0.17
256 0.14
257 0.13
258 0.19
259 0.21
260 0.29
261 0.33
262 0.38
263 0.44
264 0.47
265 0.46
266 0.43
267 0.44
268 0.39
269 0.39
270 0.34
271 0.28
272 0.24
273 0.24
274 0.2
275 0.17
276 0.16
277 0.15
278 0.14
279 0.14
280 0.21
281 0.23
282 0.29
283 0.34
284 0.37
285 0.45
286 0.55
287 0.62
288 0.63
289 0.64
290 0.6
291 0.55
292 0.55
293 0.45
294 0.36
295 0.29
296 0.22
297 0.23
298 0.21
299 0.22
300 0.19
301 0.17
302 0.17
303 0.14
304 0.14
305 0.11
306 0.11
307 0.1
308 0.09
309 0.1
310 0.11
311 0.12
312 0.12
313 0.13
314 0.14
315 0.15
316 0.15
317 0.15
318 0.17
319 0.21
320 0.27
321 0.29
322 0.35
323 0.39
324 0.46
325 0.55
326 0.62
327 0.68
328 0.73
329 0.8
330 0.83
331 0.86
332 0.88
333 0.86
334 0.87
335 0.87
336 0.85
337 0.85
338 0.8
339 0.77
340 0.71
341 0.65
342 0.55
343 0.46
344 0.38
345 0.28
346 0.24
347 0.17
348 0.15