Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

P40209

Protein Details
Accession P40209    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
407-433LTTSNLNTKKKNNRGRPRAIQRQPTLTHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 23.5, cyto_nucl 13.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR000679  Znf_GATA  
IPR013088  Znf_NHR/GATA  
Gene Ontology GO:0000981  F:DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific  
GO:0043565  F:sequence-specific DNA binding  
GO:0008270  F:zinc ion binding  
GO:0006357  P:regulation of transcription by RNA polymerase II  
KEGG sce:YMR136W  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00320  GATA  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS00344  GATA_ZN_FINGER_1  
PS50114  GATA_ZN_FINGER_2  
CDD cd00202  ZnF_GATA  
Amino Acid Sequences MQAPNIYPFSQTQPQALPGFTYGPPQLVFDHSAPRVDPLHSTVTINSPLPLQHYNGPNAHINSANNNYAYYYHHPNNNDNNNHSNNTIKNNNINSVLPAVNIQISNNSHYRNTHQIPSAPQRLVSIIPDPHMPPNISHFQLNNIHPQMHAPVATDIHFQQVPVYNKTNNGIGTDNINNDKPVNSNQNEVLDNIDERSCHEINRVVSFSKHFENNELTTTANDLNIQSTMDELAKLKSLSNSTHFRQSIATQNFHSLQNHITTIENRLASLLTDRQQEQQQLKQQESEKESSSPFSNKIKLPSLQELTDSISTQHLPTFYDNKRHASDTDLKSSTLHGPLYHRHAFLSTSSSSPSPTAGSAPLQKLQVPRQDDPNDKKMNISSSPFNSITYIPNTTLSPMVQTQLKNLTTSNLNTKKKNNRGRPRAIQRQPTLTTSSHFINNSNPGAAAVSTTTPAANSDEKNPNAKKIIEFCFHCGETETPEWRKGPYGTRTLCNACGLFYRKVTKKFGSKSSNLLLRYRRSIDLANDRRIPDFITIPNRFIHDMDNDQTLDSEYNTILQ
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.38
2 0.38
3 0.36
4 0.31
5 0.25
6 0.27
7 0.24
8 0.26
9 0.21
10 0.21
11 0.21
12 0.21
13 0.21
14 0.21
15 0.25
16 0.22
17 0.29
18 0.27
19 0.29
20 0.28
21 0.3
22 0.28
23 0.25
24 0.26
25 0.22
26 0.26
27 0.25
28 0.26
29 0.25
30 0.27
31 0.29
32 0.27
33 0.24
34 0.2
35 0.19
36 0.22
37 0.23
38 0.22
39 0.25
40 0.29
41 0.34
42 0.35
43 0.38
44 0.39
45 0.39
46 0.38
47 0.35
48 0.31
49 0.32
50 0.35
51 0.35
52 0.29
53 0.27
54 0.25
55 0.23
56 0.27
57 0.26
58 0.29
59 0.31
60 0.36
61 0.4
62 0.46
63 0.55
64 0.6
65 0.6
66 0.57
67 0.59
68 0.58
69 0.57
70 0.51
71 0.46
72 0.4
73 0.42
74 0.41
75 0.38
76 0.41
77 0.42
78 0.44
79 0.41
80 0.38
81 0.32
82 0.31
83 0.27
84 0.2
85 0.18
86 0.15
87 0.15
88 0.14
89 0.13
90 0.15
91 0.16
92 0.2
93 0.22
94 0.24
95 0.24
96 0.26
97 0.3
98 0.35
99 0.37
100 0.39
101 0.39
102 0.4
103 0.46
104 0.52
105 0.55
106 0.45
107 0.42
108 0.37
109 0.35
110 0.33
111 0.27
112 0.24
113 0.18
114 0.19
115 0.21
116 0.22
117 0.23
118 0.25
119 0.24
120 0.19
121 0.24
122 0.28
123 0.27
124 0.27
125 0.25
126 0.28
127 0.34
128 0.35
129 0.37
130 0.33
131 0.32
132 0.3
133 0.31
134 0.27
135 0.22
136 0.2
137 0.13
138 0.13
139 0.14
140 0.15
141 0.15
142 0.13
143 0.15
144 0.15
145 0.13
146 0.14
147 0.21
148 0.24
149 0.26
150 0.3
151 0.28
152 0.29
153 0.31
154 0.31
155 0.24
156 0.22
157 0.19
158 0.16
159 0.19
160 0.19
161 0.2
162 0.2
163 0.2
164 0.18
165 0.17
166 0.18
167 0.16
168 0.19
169 0.25
170 0.23
171 0.26
172 0.27
173 0.3
174 0.29
175 0.27
176 0.24
177 0.16
178 0.16
179 0.14
180 0.13
181 0.09
182 0.1
183 0.16
184 0.15
185 0.14
186 0.16
187 0.19
188 0.21
189 0.25
190 0.25
191 0.19
192 0.2
193 0.22
194 0.23
195 0.22
196 0.23
197 0.19
198 0.21
199 0.24
200 0.24
201 0.24
202 0.22
203 0.19
204 0.16
205 0.17
206 0.15
207 0.11
208 0.1
209 0.08
210 0.09
211 0.09
212 0.08
213 0.06
214 0.06
215 0.07
216 0.06
217 0.06
218 0.06
219 0.07
220 0.08
221 0.09
222 0.09
223 0.1
224 0.13
225 0.14
226 0.19
227 0.23
228 0.23
229 0.31
230 0.3
231 0.29
232 0.28
233 0.28
234 0.33
235 0.32
236 0.32
237 0.25
238 0.27
239 0.29
240 0.29
241 0.27
242 0.18
243 0.16
244 0.16
245 0.15
246 0.13
247 0.12
248 0.12
249 0.14
250 0.16
251 0.14
252 0.12
253 0.12
254 0.11
255 0.1
256 0.12
257 0.11
258 0.11
259 0.13
260 0.14
261 0.16
262 0.18
263 0.23
264 0.24
265 0.26
266 0.31
267 0.31
268 0.31
269 0.33
270 0.34
271 0.34
272 0.36
273 0.33
274 0.27
275 0.26
276 0.26
277 0.24
278 0.23
279 0.19
280 0.19
281 0.2
282 0.23
283 0.23
284 0.26
285 0.29
286 0.29
287 0.31
288 0.33
289 0.32
290 0.28
291 0.27
292 0.24
293 0.22
294 0.2
295 0.17
296 0.12
297 0.11
298 0.11
299 0.1
300 0.11
301 0.08
302 0.09
303 0.12
304 0.19
305 0.2
306 0.28
307 0.3
308 0.33
309 0.35
310 0.35
311 0.33
312 0.31
313 0.38
314 0.34
315 0.38
316 0.35
317 0.33
318 0.32
319 0.34
320 0.3
321 0.23
322 0.2
323 0.14
324 0.16
325 0.19
326 0.27
327 0.27
328 0.25
329 0.23
330 0.23
331 0.23
332 0.21
333 0.22
334 0.15
335 0.13
336 0.14
337 0.14
338 0.14
339 0.14
340 0.14
341 0.1
342 0.1
343 0.1
344 0.1
345 0.12
346 0.16
347 0.18
348 0.19
349 0.19
350 0.21
351 0.24
352 0.28
353 0.32
354 0.33
355 0.33
356 0.39
357 0.45
358 0.5
359 0.53
360 0.57
361 0.55
362 0.49
363 0.49
364 0.43
365 0.41
366 0.36
367 0.33
368 0.29
369 0.27
370 0.33
371 0.31
372 0.3
373 0.27
374 0.25
375 0.25
376 0.23
377 0.22
378 0.17
379 0.18
380 0.18
381 0.17
382 0.17
383 0.14
384 0.13
385 0.12
386 0.13
387 0.16
388 0.16
389 0.17
390 0.23
391 0.24
392 0.22
393 0.22
394 0.23
395 0.22
396 0.24
397 0.32
398 0.35
399 0.39
400 0.43
401 0.52
402 0.6
403 0.67
404 0.75
405 0.76
406 0.78
407 0.83
408 0.88
409 0.9
410 0.9
411 0.9
412 0.88
413 0.87
414 0.8
415 0.78
416 0.71
417 0.63
418 0.57
419 0.47
420 0.4
421 0.33
422 0.31
423 0.27
424 0.25
425 0.23
426 0.23
427 0.28
428 0.28
429 0.25
430 0.23
431 0.19
432 0.19
433 0.17
434 0.13
435 0.09
436 0.08
437 0.08
438 0.08
439 0.08
440 0.07
441 0.09
442 0.12
443 0.15
444 0.16
445 0.23
446 0.31
447 0.33
448 0.42
449 0.43
450 0.45
451 0.45
452 0.46
453 0.43
454 0.42
455 0.46
456 0.45
457 0.45
458 0.45
459 0.46
460 0.44
461 0.4
462 0.35
463 0.3
464 0.28
465 0.31
466 0.34
467 0.31
468 0.34
469 0.35
470 0.33
471 0.37
472 0.35
473 0.38
474 0.38
475 0.45
476 0.45
477 0.48
478 0.53
479 0.53
480 0.51
481 0.46
482 0.39
483 0.31
484 0.33
485 0.35
486 0.32
487 0.34
488 0.41
489 0.44
490 0.51
491 0.56
492 0.57
493 0.62
494 0.65
495 0.7
496 0.7
497 0.66
498 0.67
499 0.68
500 0.67
501 0.6
502 0.59
503 0.57
504 0.54
505 0.58
506 0.55
507 0.49
508 0.46
509 0.47
510 0.49
511 0.53
512 0.55
513 0.56
514 0.57
515 0.56
516 0.54
517 0.5
518 0.44
519 0.36
520 0.32
521 0.32
522 0.36
523 0.37
524 0.38
525 0.39
526 0.4
527 0.38
528 0.35
529 0.32
530 0.27
531 0.3
532 0.31
533 0.33
534 0.3
535 0.28
536 0.28
537 0.26
538 0.21
539 0.17
540 0.16