FuNGI

P39998

Protein Details

Accession

P39998

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

10.3

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
60-86	LTVASQSGKRKQQRQQQQQNDYNQNRG	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Subcellular Location(s)

nucl 20, cyto_nucl 12.5, cyto 3, mito 2

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR025762 DFDF IPR019050 FDF_dom IPR047575 Sm IPR004443 YjeF_N_dom IPR036652 YjeF_N_dom_sf
Gene Ontology	GO:0005737 C:cytoplasm GO:0005634 C:nucleus GO:0000932 C:P-body GO:0003729 F:mRNA binding GO:0031087 P:deadenylation-independent decapping of nuclear-transcribed mRNA GO:0033962 P:P-body assembly GO:1900153 P:positive regulation of nuclear-transcribed mRNA catabolic process, deadenylation-dependent decay
KEGG	sce:YEL015W -
Pfam	View protein in Pfam PF09532 FDF PF03853 YjeF_N
PROSITE	View protein in PROSITE PS51512 DFDF PS52002 SM PS51385 YJEF_N
CDD	cd22576 Edc3_Lsm

Amino Acid Sequences

MSQFVGFGVQVELKDGKLIQGKIAKATSKGLTLNDVQFGDGGKSQAFKVRASRLKDLKVLTVASQSGKRKQQRQQQQQNDYNQNRGEHIDWQDDDVSKIKQQEDFDFQRNLGMFNKKDVFAQLKQNDDILPENRLQGHNRKQTQLQQNNYQNDELVIPDAKKDSWNKISSRNEQSTHQSQPQQDAQDDLVLEDDEHEYDVDDIDDPKYLPITQSLNITHLIHSATNSPSINDKTKGTVINDKDQVLAKLGQMIISQSRSNSTSLPAANKQTTIRSKNTKQNIPMATPVQLLEMESITSEFFSINSAGLLENFAVNASFFLKQKLGGRARLRLQNSNPEPLVVILASDSNRSGAKALALGRHLCQTGHIRVITLFTCSQNELQDSMVKKQTDIYKKCGGKIVNSVSSLESAMETLNSPVEIVIDAMQGYDCTLSDLAGTSEVIESRIKSMISWCNKQRGSTKVWSLDIPNGFDAGSGMPDIFFSDRIEATGIICSGWPLIAINNLIANLPSLEDAVLIDIGIPQGAYSQRTSLRKFQNCDLFVTDGSLLLDL

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.16
2	0.16
3	0.19
4	0.24
5	0.25
6	0.27
7	0.33
8	0.34
9	0.37
10	0.42
11	0.39
12	0.34
13	0.38
14	0.34
15	0.32
16	0.34
17	0.3
18	0.3
19	0.32
20	0.32
21	0.31
22	0.29
23	0.25
24	0.23
25	0.23
26	0.21
27	0.17
28	0.16
29	0.13
30	0.14
31	0.15
32	0.21
33	0.22
34	0.23
35	0.29
36	0.37
37	0.44
38	0.49
39	0.58
40	0.59
41	0.62
42	0.65
43	0.59
44	0.54
45	0.5
46	0.45
47	0.36
48	0.33
49	0.29
50	0.27
51	0.32
52	0.33
53	0.38
54	0.46
55	0.53
56	0.58
57	0.65
58	0.72
59	0.77
60	0.82
61	0.86
62	0.87
63	0.89
64	0.88
65	0.89
66	0.89
67	0.81
68	0.76
69	0.68
70	0.59
71	0.5
72	0.45
73	0.37
74	0.33
75	0.34
76	0.33
77	0.3
78	0.31
79	0.32
80	0.29
81	0.29
82	0.25
83	0.23
84	0.2
85	0.24
86	0.24
87	0.25
88	0.28
89	0.31
90	0.37
91	0.4
92	0.42
93	0.4
94	0.38
95	0.37
96	0.35
97	0.32
98	0.29
99	0.3
100	0.26
101	0.31
102	0.34
103	0.3
104	0.31
105	0.33
106	0.34
107	0.31
108	0.4
109	0.38
110	0.39
111	0.39
112	0.39
113	0.36
114	0.31
115	0.32
116	0.23
117	0.22
118	0.19
119	0.2
120	0.21
121	0.24
122	0.26
123	0.31
124	0.4
125	0.47
126	0.5
127	0.51
128	0.54
129	0.61
130	0.67
131	0.66
132	0.63
133	0.63
134	0.67
135	0.68
136	0.66
137	0.56
138	0.45
139	0.37
140	0.31
141	0.22
142	0.15
143	0.12
144	0.1
145	0.11
146	0.12
147	0.12
148	0.16
149	0.19
150	0.25
151	0.31
152	0.36
153	0.38
154	0.46
155	0.54
156	0.58
157	0.62
158	0.6
159	0.55
160	0.53
161	0.57
162	0.53
163	0.5
164	0.47
165	0.44
166	0.4
167	0.43
168	0.45
169	0.4
170	0.35
171	0.31
172	0.26
173	0.22
174	0.21
175	0.15
176	0.11
177	0.09
178	0.08
179	0.07
180	0.07
181	0.06
182	0.06
183	0.06
184	0.05
185	0.06
186	0.06
187	0.05
188	0.05
189	0.06
190	0.06
191	0.07
192	0.07
193	0.07
194	0.08
195	0.07
196	0.07
197	0.1
198	0.12
199	0.12
200	0.16
201	0.16
202	0.17
203	0.19
204	0.19
205	0.16
206	0.15
207	0.14
208	0.11
209	0.11
210	0.12
211	0.11
212	0.13
213	0.13
214	0.13
215	0.15
216	0.18
217	0.21
218	0.2
219	0.2
220	0.2
221	0.22
222	0.24
223	0.23
224	0.28
225	0.27
226	0.32
227	0.33
228	0.31
229	0.3
230	0.28
231	0.26
232	0.21
233	0.19
234	0.12
235	0.12
236	0.12
237	0.11
238	0.1
239	0.11
240	0.1
241	0.11
242	0.11
243	0.09
244	0.11
245	0.11
246	0.12
247	0.12
248	0.12
249	0.13
250	0.14
251	0.17
252	0.18
253	0.2
254	0.2
255	0.21
256	0.2
257	0.23
258	0.29
259	0.3
260	0.33
261	0.38
262	0.43
263	0.5
264	0.56
265	0.55
266	0.51
267	0.54
268	0.51
269	0.45
270	0.41
271	0.34
272	0.28
273	0.24
274	0.21
275	0.14
276	0.12
277	0.1
278	0.08
279	0.07
280	0.05
281	0.05
282	0.05
283	0.04
284	0.04
285	0.04
286	0.04
287	0.04
288	0.05
289	0.05
290	0.05
291	0.05
292	0.05
293	0.05
294	0.05
295	0.06
296	0.05
297	0.04
298	0.04
299	0.04
300	0.04
301	0.04
302	0.04
303	0.05
304	0.07
305	0.07
306	0.09
307	0.1
308	0.12
309	0.16
310	0.25
311	0.27
312	0.33
313	0.36
314	0.4
315	0.44
316	0.49
317	0.48
318	0.46
319	0.45
320	0.48
321	0.47
322	0.46
323	0.41
324	0.34
325	0.31
326	0.25
327	0.23
328	0.12
329	0.09
330	0.05
331	0.06
332	0.06
333	0.07
334	0.07
335	0.07
336	0.07
337	0.08
338	0.08
339	0.07
340	0.07
341	0.1
342	0.12
343	0.13
344	0.15
345	0.16
346	0.16
347	0.18
348	0.18
349	0.15
350	0.17
351	0.2
352	0.2
353	0.23
354	0.22
355	0.2
356	0.2
357	0.22
358	0.19
359	0.17
360	0.16
361	0.13
362	0.14
363	0.15
364	0.16
365	0.16
366	0.17
367	0.15
368	0.14
369	0.18
370	0.18
371	0.21
372	0.25
373	0.23
374	0.22
375	0.26
376	0.34
377	0.4
378	0.42
379	0.44
380	0.48
381	0.5
382	0.52
383	0.52
384	0.45
385	0.39
386	0.43
387	0.44
388	0.39
389	0.38
390	0.37
391	0.31
392	0.31
393	0.27
394	0.19
395	0.12
396	0.08
397	0.07
398	0.07
399	0.07
400	0.06
401	0.07
402	0.06
403	0.06
404	0.06
405	0.06
406	0.06
407	0.06
408	0.06
409	0.06
410	0.06
411	0.06
412	0.06
413	0.05
414	0.06
415	0.05
416	0.05
417	0.06
418	0.06
419	0.06
420	0.06
421	0.07
422	0.07
423	0.08
424	0.08
425	0.06
426	0.07
427	0.08
428	0.09
429	0.09
430	0.1
431	0.11
432	0.13
433	0.12
434	0.12
435	0.18
436	0.26
437	0.32
438	0.39
439	0.43
440	0.51
441	0.52
442	0.56
443	0.57
444	0.53
445	0.54
446	0.54
447	0.56
448	0.52
449	0.53
450	0.5
451	0.46
452	0.48
453	0.43
454	0.37
455	0.3
456	0.24
457	0.22
458	0.2
459	0.18
460	0.11
461	0.09
462	0.07
463	0.07
464	0.06
465	0.06
466	0.08
467	0.09
468	0.09
469	0.1
470	0.12
471	0.12
472	0.13
473	0.15
474	0.13
475	0.13
476	0.14
477	0.13
478	0.1
479	0.1
480	0.1
481	0.09
482	0.08
483	0.08
484	0.06
485	0.07
486	0.1
487	0.1
488	0.11
489	0.12
490	0.12
491	0.12
492	0.11
493	0.11
494	0.09
495	0.08
496	0.08
497	0.08
498	0.07
499	0.07
500	0.07
501	0.07
502	0.07
503	0.06
504	0.06
505	0.06
506	0.06
507	0.06
508	0.06
509	0.04
510	0.08
511	0.1
512	0.12
513	0.13
514	0.18
515	0.26
516	0.33
517	0.38
518	0.45
519	0.54
520	0.6
521	0.64
522	0.68
523	0.71
524	0.65
525	0.64
526	0.59
527	0.51
528	0.43
529	0.4
530	0.32
531	0.22

P39998

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer