FuNGI

P38439

Protein Details

Accession

P38439

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

14.2

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
333-360	ELERKQSQILRDRRRRQLKEKEKQESPD	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
345-351	RRRRQLK

Subcellular Location(s)

nucl 24, cyto_nucl 14.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR007149 Leo1
Gene Ontology	GO:0016593 C:Cdc73/Paf1 complex GO:0005634 C:nucleus GO:0003723 F:RNA binding GO:1990269 F:RNA polymerase II C-terminal domain phosphoserine binding GO:0061629 F:RNA polymerase II-specific DNA-binding transcription factor binding GO:0003712 F:transcription coregulator activity GO:0006325 P:chromatin organization GO:0006353 P:DNA-templated transcription termination GO:0016571 P:histone methylation GO:2001209 P:positive regulation of transcription elongation by RNA polymerase I GO:0032968 P:positive regulation of transcription elongation by RNA polymerase II GO:0090262 P:regulation of transcription-coupled nucleotide-excision repair GO:0006368 P:transcription elongation by RNA polymerase II
KEGG	sce:YOR123C -
Pfam	View protein in Pfam PF04004 Leo1

Amino Acid Sequences

MSSESPQDQPQKEQISNNVGVTTNSTSNEETSRSQDDNVKEVNGNDDTKEEEQEEDAELDDLFGDDNDDDDDDDVKKSETEKSDSDSDEDDEGENINHRSRHRESLGLDDDEAEEQAMYTRKFYGEDANNFSDQDETTHTFKEENVELVRHIIPSKANVNETASHNEIFYARIPNFLTIDPIPFDPPSFEAKVNERASNSASREDQLDDRLIDENTVRWRYSRDKDQHVFKESNTQIVQWSDGTYSLKVGEECTDILVNDTSNTFLTVSHDQQELIQCYEGGEIKKTLMFIPTSTNSKIHQKLSKAVIRRNQRQSKGPGTYIVSMDPEVEKKELERKQSQILRDRRRRQLKEKEKQESPDAAFETGFRKQNSPTTYGASRRNEYEEDDFLVDDDEEEEAAFDDEEDDNEEEEEEEDADEENASRLRNLKREGAAMYREEEEEEKDRSETKRRRVAVIEDDEDED

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.54
2	0.53
3	0.53
4	0.49
5	0.42
6	0.35
7	0.32
8	0.31
9	0.28
10	0.23
11	0.21
12	0.23
13	0.22
14	0.24
15	0.26
16	0.25
17	0.24
18	0.26
19	0.3
20	0.29
21	0.31
22	0.35
23	0.36
24	0.38
25	0.37
26	0.35
27	0.31
28	0.3
29	0.32
30	0.29
31	0.28
32	0.23
33	0.22
34	0.24
35	0.24
36	0.25
37	0.21
38	0.18
39	0.18
40	0.18
41	0.19
42	0.15
43	0.14
44	0.12
45	0.11
46	0.09
47	0.08
48	0.07
49	0.06
50	0.05
51	0.06
52	0.05
53	0.06
54	0.07
55	0.07
56	0.07
57	0.08
58	0.09
59	0.09
60	0.1
61	0.11
62	0.1
63	0.11
64	0.13
65	0.19
66	0.22
67	0.25
68	0.27
69	0.31
70	0.35
71	0.35
72	0.35
73	0.31
74	0.28
75	0.24
76	0.23
77	0.18
78	0.14
79	0.13
80	0.12
81	0.12
82	0.12
83	0.15
84	0.18
85	0.18
86	0.26
87	0.3
88	0.37
89	0.38
90	0.42
91	0.4
92	0.46
93	0.49
94	0.43
95	0.39
96	0.31
97	0.29
98	0.24
99	0.22
100	0.12
101	0.07
102	0.06
103	0.08
104	0.11
105	0.11
106	0.11
107	0.12
108	0.13
109	0.14
110	0.16
111	0.22
112	0.26
113	0.31
114	0.36
115	0.38
116	0.38
117	0.37
118	0.36
119	0.28
120	0.2
121	0.17
122	0.15
123	0.16
124	0.17
125	0.18
126	0.18
127	0.18
128	0.18
129	0.21
130	0.17
131	0.17
132	0.17
133	0.16
134	0.16
135	0.19
136	0.19
137	0.15
138	0.15
139	0.13
140	0.12
141	0.15
142	0.19
143	0.19
144	0.19
145	0.19
146	0.22
147	0.24
148	0.26
149	0.27
150	0.24
151	0.22
152	0.21
153	0.2
154	0.18
155	0.16
156	0.15
157	0.15
158	0.13
159	0.16
160	0.16
161	0.17
162	0.18
163	0.17
164	0.18
165	0.14
166	0.15
167	0.13
168	0.13
169	0.14
170	0.12
171	0.12
172	0.1
173	0.12
174	0.15
175	0.16
176	0.16
177	0.17
178	0.2
179	0.29
180	0.3
181	0.3
182	0.26
183	0.25
184	0.27
185	0.29
186	0.27
187	0.22
188	0.2
189	0.19
190	0.2
191	0.2
192	0.19
193	0.15
194	0.15
195	0.12
196	0.13
197	0.14
198	0.12
199	0.11
200	0.1
201	0.11
202	0.14
203	0.16
204	0.15
205	0.14
206	0.18
207	0.24
208	0.29
209	0.37
210	0.38
211	0.45
212	0.5
213	0.58
214	0.59
215	0.58
216	0.53
217	0.44
218	0.48
219	0.39
220	0.39
221	0.31
222	0.26
223	0.22
224	0.21
225	0.22
226	0.12
227	0.13
228	0.08
229	0.09
230	0.1
231	0.08
232	0.08
233	0.08
234	0.08
235	0.08
236	0.08
237	0.08
238	0.08
239	0.08
240	0.09
241	0.08
242	0.07
243	0.08
244	0.08
245	0.07
246	0.06
247	0.06
248	0.06
249	0.06
250	0.07
251	0.06
252	0.06
253	0.09
254	0.12
255	0.14
256	0.15
257	0.16
258	0.15
259	0.16
260	0.2
261	0.18
262	0.16
263	0.15
264	0.12
265	0.12
266	0.13
267	0.14
268	0.11
269	0.11
270	0.1
271	0.11
272	0.11
273	0.12
274	0.11
275	0.11
276	0.11
277	0.1
278	0.15
279	0.17
280	0.2
281	0.21
282	0.22
283	0.22
284	0.3
285	0.33
286	0.34
287	0.37
288	0.35
289	0.4
290	0.46
291	0.49
292	0.47
293	0.49
294	0.51
295	0.55
296	0.62
297	0.67
298	0.68
299	0.68
300	0.69
301	0.7
302	0.72
303	0.67
304	0.58
305	0.51
306	0.46
307	0.43
308	0.36
309	0.3
310	0.22
311	0.18
312	0.17
313	0.15
314	0.13
315	0.12
316	0.12
317	0.11
318	0.12
319	0.21
320	0.25
321	0.31
322	0.35
323	0.36
324	0.45
325	0.5
326	0.55
327	0.56
328	0.62
329	0.65
330	0.71
331	0.77
332	0.78
333	0.84
334	0.86
335	0.86
336	0.87
337	0.88
338	0.88
339	0.89
340	0.87
341	0.82
342	0.78
343	0.73
344	0.69
345	0.6
346	0.55
347	0.46
348	0.38
349	0.33
350	0.29
351	0.27
352	0.26
353	0.28
354	0.24
355	0.25
356	0.27
357	0.34
358	0.37
359	0.37
360	0.33
361	0.34
362	0.38
363	0.42
364	0.48
365	0.47
366	0.46
367	0.44
368	0.47
369	0.43
370	0.42
371	0.4
372	0.34
373	0.31
374	0.28
375	0.25
376	0.21
377	0.2
378	0.16
379	0.11
380	0.1
381	0.07
382	0.06
383	0.06
384	0.06
385	0.06
386	0.06
387	0.06
388	0.05
389	0.07
390	0.07
391	0.08
392	0.11
393	0.11
394	0.11
395	0.12
396	0.12
397	0.1
398	0.11
399	0.11
400	0.08
401	0.07
402	0.07
403	0.08
404	0.08
405	0.07
406	0.07
407	0.08
408	0.1
409	0.1
410	0.12
411	0.18
412	0.24
413	0.32
414	0.36
415	0.41
416	0.43
417	0.46
418	0.48
419	0.48
420	0.46
421	0.41
422	0.39
423	0.33
424	0.31
425	0.29
426	0.27
427	0.25
428	0.25
429	0.26
430	0.24
431	0.24
432	0.28
433	0.32
434	0.41
435	0.45
436	0.51
437	0.58
438	0.6
439	0.65
440	0.66
441	0.68
442	0.68
443	0.67
444	0.6

P38439

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer