FuNGI

P15938

Protein Details

Accession

P15938

Localization Confidence

High

Confidence Score

18.3

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
76-103	DSTGPKKIAPSINKRKKFKIQLDLDDNE	Hydrophilic
1035-1061	MTDNSNKEDKKQKTKKQNILNGKENSM	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
89-91	KRK
1045-1069	KQKTKKQNILNGKENSMKPFKRRKP

Subcellular Location(s)

nucl 23, cyto_nucl 13.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR011709 DEAD-box_helicase_OB_fold IPR011545 DEAD/DEAH_box_helicase_dom IPR002464 DNA/RNA_helicase_DEAH_CS IPR007502 Helicase-assoc_dom IPR014001 Helicase_ATP-bd IPR001650 Helicase_C IPR027417 P-loop_NTPase
Gene Ontology	GO:0005681 C:spliceosomal complex GO:0071007 C:U2-type catalytic step 2 spliceosome GO:0034458 F:3'-5' RNA helicase activity GO:0005524 F:ATP binding GO:0016887 F:ATP hydrolysis activity GO:0008186 F:ATP-dependent activity, acting on RNA GO:0003723 F:RNA binding GO:0000350 P:generation of catalytic spliceosome for second transesterification step GO:0000398 P:mRNA splicing, via spliceosome GO:0000378 P:RNA exon ligation GO:0016073 P:snRNA metabolic process GO:0040031 P:snRNA modification
KEGG	sce:YKR086W -
Pfam	View protein in Pfam PF00270 DEAD PF04408 HA2 PF00271 Helicase_C PF07717 OB_NTP_bind
PROSITE	View protein in PROSITE PS00690 DEAH_ATP_HELICASE PS51192 HELICASE_ATP_BIND_1 PS51194 HELICASE_CTER
CDD	cd18791 SF2_C_RHA

Amino Acid Sequences

MGHSGREERIKDIFKELTSKELTPGLLLTLQKLAQKPNTNLEQFIASCKALTKLSSNNPIIFNELLELLKNKSEEDSTGPKKIAPSINKRKKFKIQLDLDDNEDELDSPVQKKPAPTRTLFKRIDKLKAKQLRQYSPTVKDPSPNSEQQTQNGHAETKDYEPTRSEVVEEDREWYDNDDDYGNLVPEPLSELPEEAKLLPVIRNIDNDDALRNTVQLYPIPLKQRMEWIPPFLSKFALENKVPTSIIIGSISETSSQVSALSMVNPFRNPDSEFSANAKRGSKLVALRRINMEHIQQSRDNTTVLNTAMGEVLGLENNNKAKDKSNQKICDDTALFTPSKDDIKHTKEQLPVFRCRSQLLSLIRENQVVVIIGETGSGKTTQLAQYLYEEGYANDRGKSIVVTQPRRVAAISVAKRVAMEMQVPLGKEVGYSIRFEDVTDSECTKLKFVTDGILLRETLLDDTLDKYSCVIIDEAHERSLNTDILLGFFKILLARRRDLKLIITSATMNAKKFSAFFGNAPQFTIPGRTFPVQTIYTSNPVQDYVEAAVSQAVKIHLANDCSSGDILIFMTGQEDIETTFDTLQEKFLQVYSKKFGTANFEEINDIEILPIYSALPADLQFKIFQDLHGTKRKIIIATNIAETSLTIKGIRYVIDCGYSKLKVYNPKIGLDSLVITPISKANADQRSGRAGRTAPGTAYRLYTEDTFKEDMYLQTIPEIQRTNLSNTLLLLKSLDVTDELSKFPFIDKPPLQTFLSSLYELWFIGAIDTSGQLTPLGLQMAKFPLQPSLSKILLIAVRNGCSDEMLTIVSMLSVPQVFYRPKERQKEADIARNKFFIAKSDHLTLLNVFEQWRANNFSSHWCNKHFVQYKSLVRARDIRDQLLTILKSQKIPVISSGKDWDIIKKCICSGFAHQAAKITGLRNYVHLKTGVSVQLHPTSALHGLGDLPPYVVYHELLMTSKEYICCVTSVDPFWLMEYGGLLYDIKRIKNDQEATTTGLFGEHYEHTLDKVEDDIDINIRRCKDMRDSVIQELKMTDNSNKEDKKQKTKKQNILNGKENSMKPFKRRKPFF

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.4
2	0.45
3	0.42
4	0.41
5	0.4
6	0.39
7	0.35
8	0.34
9	0.32
10	0.26
11	0.25
12	0.19
13	0.19
14	0.19
15	0.18
16	0.18
17	0.2
18	0.24
19	0.26
20	0.31
21	0.35
22	0.44
23	0.46
24	0.51
25	0.58
26	0.55
27	0.54
28	0.49
29	0.45
30	0.37
31	0.37
32	0.32
33	0.23
34	0.22
35	0.22
36	0.23
37	0.2
38	0.22
39	0.22
40	0.27
41	0.36
42	0.45
43	0.47
44	0.48
45	0.49
46	0.47
47	0.46
48	0.38
49	0.3
50	0.22
51	0.2
52	0.16
53	0.15
54	0.16
55	0.14
56	0.17
57	0.17
58	0.17
59	0.17
60	0.19
61	0.19
62	0.24
63	0.32
64	0.34
65	0.39
66	0.38
67	0.38
68	0.38
69	0.44
70	0.46
71	0.45
72	0.51
73	0.58
74	0.68
75	0.76
76	0.81
77	0.82
78	0.84
79	0.86
80	0.84
81	0.83
82	0.82
83	0.82
84	0.83
85	0.76
86	0.69
87	0.59
88	0.49
89	0.39
90	0.3
91	0.2
92	0.14
93	0.14
94	0.12
95	0.14
96	0.17
97	0.2
98	0.22
99	0.28
100	0.36
101	0.44
102	0.49
103	0.51
104	0.58
105	0.64
106	0.72
107	0.73
108	0.71
109	0.7
110	0.7
111	0.75
112	0.75
113	0.72
114	0.72
115	0.75
116	0.73
117	0.72
118	0.75
119	0.74
120	0.69
121	0.72
122	0.69
123	0.65
124	0.68
125	0.66
126	0.58
127	0.56
128	0.55
129	0.52
130	0.51
131	0.51
132	0.48
133	0.5
134	0.51
135	0.5
136	0.53
137	0.49
138	0.46
139	0.42
140	0.38
141	0.3
142	0.3
143	0.27
144	0.24
145	0.27
146	0.25
147	0.25
148	0.26
149	0.28
150	0.28
151	0.26
152	0.24
153	0.2
154	0.24
155	0.27
156	0.25
157	0.27
158	0.25
159	0.26
160	0.26
161	0.25
162	0.21
163	0.17
164	0.17
165	0.15
166	0.13
167	0.14
168	0.14
169	0.12
170	0.1
171	0.09
172	0.08
173	0.07
174	0.12
175	0.11
176	0.11
177	0.11
178	0.12
179	0.13
180	0.14
181	0.16
182	0.11
183	0.12
184	0.12
185	0.13
186	0.14
187	0.16
188	0.19
189	0.2
190	0.22
191	0.24
192	0.25
193	0.25
194	0.24
195	0.23
196	0.2
197	0.2
198	0.17
199	0.15
200	0.14
201	0.14
202	0.14
203	0.13
204	0.17
205	0.19
206	0.23
207	0.29
208	0.32
209	0.32
210	0.32
211	0.39
212	0.39
213	0.43
214	0.41
215	0.41
216	0.4
217	0.41
218	0.42
219	0.34
220	0.31
221	0.24
222	0.24
223	0.25
224	0.28
225	0.25
226	0.26
227	0.27
228	0.28
229	0.27
230	0.25
231	0.21
232	0.15
233	0.16
234	0.14
235	0.12
236	0.1
237	0.11
238	0.11
239	0.09
240	0.09
241	0.08
242	0.08
243	0.08
244	0.07
245	0.06
246	0.07
247	0.07
248	0.08
249	0.1
250	0.12
251	0.14
252	0.14
253	0.16
254	0.16
255	0.18
256	0.19
257	0.2
258	0.25
259	0.25
260	0.27
261	0.3
262	0.35
263	0.35
264	0.37
265	0.36
266	0.29
267	0.28
268	0.28
269	0.29
270	0.29
271	0.35
272	0.41
273	0.41
274	0.43
275	0.47
276	0.45
277	0.44
278	0.4
279	0.35
280	0.32
281	0.32
282	0.33
283	0.31
284	0.32
285	0.31
286	0.3
287	0.26
288	0.2
289	0.19
290	0.17
291	0.15
292	0.13
293	0.11
294	0.1
295	0.1
296	0.09
297	0.07
298	0.05
299	0.05
300	0.05
301	0.05
302	0.05
303	0.08
304	0.1
305	0.12
306	0.13
307	0.14
308	0.18
309	0.27
310	0.37
311	0.44
312	0.52
313	0.57
314	0.59
315	0.63
316	0.58
317	0.57
318	0.48
319	0.4
320	0.32
321	0.29
322	0.26
323	0.2
324	0.22
325	0.16
326	0.18
327	0.17
328	0.19
329	0.23
330	0.3
331	0.36
332	0.39
333	0.43
334	0.46
335	0.5
336	0.53
337	0.51
338	0.52
339	0.52
340	0.51
341	0.46
342	0.42
343	0.41
344	0.34
345	0.36
346	0.33
347	0.32
348	0.31
349	0.35
350	0.34
351	0.32
352	0.29
353	0.22
354	0.18
355	0.13
356	0.11
357	0.06
358	0.05
359	0.05
360	0.05
361	0.05
362	0.05
363	0.05
364	0.05
365	0.05
366	0.05
367	0.08
368	0.09
369	0.12
370	0.12
371	0.12
372	0.13
373	0.15
374	0.14
375	0.13
376	0.12
377	0.1
378	0.12
379	0.14
380	0.13
381	0.12
382	0.12
383	0.11
384	0.11
385	0.12
386	0.11
387	0.14
388	0.21
389	0.25
390	0.28
391	0.33
392	0.33
393	0.33
394	0.31
395	0.27
396	0.23
397	0.27
398	0.27
399	0.25
400	0.25
401	0.24
402	0.24
403	0.23
404	0.2
405	0.12
406	0.1
407	0.07
408	0.09
409	0.11
410	0.11
411	0.11
412	0.1
413	0.09
414	0.07
415	0.08
416	0.09
417	0.09
418	0.09
419	0.1
420	0.11
421	0.11
422	0.11
423	0.13
424	0.1
425	0.12
426	0.13
427	0.14
428	0.13
429	0.15
430	0.15
431	0.14
432	0.14
433	0.11
434	0.11
435	0.1
436	0.11
437	0.12
438	0.13
439	0.14
440	0.14
441	0.14
442	0.13
443	0.13
444	0.1
445	0.08
446	0.07
447	0.05
448	0.05
449	0.07
450	0.08
451	0.08
452	0.07
453	0.08
454	0.07
455	0.08
456	0.08
457	0.07
458	0.06
459	0.08
460	0.11
461	0.11
462	0.12
463	0.12
464	0.11
465	0.12
466	0.14
467	0.12
468	0.09
469	0.09
470	0.08
471	0.09
472	0.1
473	0.08
474	0.06
475	0.06
476	0.06
477	0.06
478	0.1
479	0.14
480	0.17
481	0.19
482	0.23
483	0.25
484	0.26
485	0.26
486	0.25
487	0.23
488	0.21
489	0.2
490	0.16
491	0.15
492	0.15
493	0.19
494	0.17
495	0.15
496	0.14
497	0.13
498	0.13
499	0.13
500	0.13
501	0.12
502	0.12
503	0.13
504	0.19
505	0.22
506	0.22
507	0.22
508	0.2
509	0.17
510	0.16
511	0.19
512	0.12
513	0.1
514	0.13
515	0.13
516	0.14
517	0.14
518	0.18
519	0.15
520	0.15
521	0.17
522	0.16
523	0.19
524	0.18
525	0.18
526	0.14
527	0.14
528	0.13
529	0.1
530	0.09
531	0.07
532	0.07
533	0.06
534	0.06
535	0.07
536	0.07
537	0.06
538	0.06
539	0.06
540	0.06
541	0.06
542	0.07
543	0.08
544	0.09
545	0.1
546	0.1
547	0.1
548	0.1
549	0.1
550	0.09
551	0.07
552	0.06
553	0.05
554	0.04
555	0.04
556	0.03
557	0.04
558	0.04
559	0.04
560	0.03
561	0.03
562	0.04
563	0.04
564	0.05
565	0.05
566	0.05
567	0.06
568	0.07
569	0.07
570	0.08
571	0.09
572	0.09
573	0.09
574	0.1
575	0.14
576	0.15
577	0.18
578	0.19
579	0.19
580	0.2
581	0.2
582	0.21
583	0.23
584	0.24
585	0.26
586	0.23
587	0.23
588	0.22
589	0.21
590	0.21
591	0.14
592	0.11
593	0.06
594	0.06
595	0.05
596	0.05
597	0.05
598	0.04
599	0.03
600	0.03
601	0.04
602	0.04
603	0.05
604	0.07
605	0.07
606	0.08
607	0.09
608	0.09
609	0.13
610	0.12
611	0.12
612	0.16
613	0.19
614	0.24
615	0.32
616	0.33
617	0.3
618	0.34
619	0.35
620	0.3
621	0.28
622	0.28
623	0.24
624	0.24
625	0.25
626	0.21
627	0.19
628	0.18
629	0.16
630	0.14
631	0.09
632	0.08
633	0.07
634	0.07
635	0.09
636	0.1
637	0.11
638	0.09
639	0.11
640	0.11
641	0.15
642	0.15
643	0.15
644	0.18
645	0.17
646	0.17
647	0.17
648	0.21
649	0.26
650	0.3
651	0.36
652	0.35
653	0.37
654	0.38
655	0.35
656	0.32
657	0.23
658	0.21
659	0.12
660	0.11
661	0.09
662	0.08
663	0.08
664	0.09
665	0.09
666	0.07
667	0.08
668	0.15
669	0.19
670	0.21
671	0.23
672	0.23
673	0.3
674	0.31
675	0.3
676	0.25
677	0.22
678	0.23
679	0.24
680	0.23
681	0.16
682	0.19
683	0.2
684	0.18
685	0.19
686	0.17
687	0.15
688	0.16
689	0.17
690	0.16
691	0.15
692	0.18
693	0.18
694	0.17
695	0.17
696	0.17
697	0.15
698	0.16
699	0.15
700	0.11
701	0.11
702	0.14
703	0.13
704	0.16
705	0.17
706	0.14
707	0.18
708	0.2
709	0.23
710	0.24
711	0.24
712	0.21
713	0.2
714	0.24
715	0.19
716	0.17
717	0.14
718	0.1
719	0.1
720	0.1
721	0.1
722	0.06
723	0.08
724	0.1
725	0.11
726	0.11
727	0.11
728	0.12
729	0.11
730	0.12
731	0.15
732	0.15
733	0.23
734	0.24
735	0.3
736	0.33
737	0.37
738	0.36
739	0.31
740	0.3
741	0.25
742	0.26
743	0.2
744	0.18
745	0.15
746	0.15
747	0.14
748	0.14
749	0.09
750	0.06
751	0.06
752	0.06
753	0.05
754	0.04
755	0.05
756	0.06
757	0.05
758	0.06
759	0.05
760	0.05
761	0.06
762	0.07
763	0.07
764	0.07
765	0.07
766	0.09
767	0.12
768	0.13
769	0.13
770	0.13
771	0.16
772	0.18
773	0.19
774	0.21
775	0.24
776	0.23
777	0.22
778	0.21
779	0.21
780	0.22
781	0.22
782	0.23
783	0.19
784	0.2
785	0.2
786	0.21
787	0.18
788	0.15
789	0.14
790	0.09
791	0.08
792	0.07
793	0.06
794	0.06
795	0.05
796	0.05
797	0.05
798	0.04
799	0.05
800	0.05
801	0.05
802	0.06
803	0.11
804	0.13
805	0.16
806	0.25
807	0.33
808	0.42
809	0.5
810	0.55
811	0.57
812	0.61
813	0.68
814	0.65
815	0.65
816	0.65
817	0.6
818	0.57
819	0.51
820	0.46
821	0.4
822	0.35
823	0.3
824	0.29
825	0.29
826	0.3
827	0.33
828	0.34
829	0.31
830	0.32
831	0.27
832	0.23
833	0.19
834	0.16
835	0.13
836	0.13
837	0.15
838	0.15
839	0.18
840	0.21
841	0.21
842	0.22
843	0.23
844	0.3
845	0.37
846	0.43
847	0.43
848	0.41
849	0.44
850	0.44
851	0.53
852	0.53
853	0.47
854	0.47
855	0.52
856	0.54
857	0.59
858	0.61
859	0.52
860	0.48
861	0.53
862	0.51
863	0.52
864	0.49
865	0.43
866	0.4
867	0.39
868	0.38
869	0.36
870	0.32
871	0.26
872	0.29
873	0.28
874	0.28
875	0.28
876	0.3
877	0.25
878	0.26
879	0.29
880	0.29
881	0.28
882	0.3
883	0.33
884	0.3
885	0.32
886	0.31
887	0.33
888	0.32
889	0.37
890	0.36
891	0.34
892	0.35
893	0.35
894	0.36
895	0.31
896	0.32
897	0.36
898	0.41
899	0.41
900	0.4
901	0.4
902	0.39
903	0.38
904	0.34
905	0.26
906	0.21
907	0.23
908	0.23
909	0.25
910	0.3
911	0.28
912	0.29
913	0.28
914	0.26
915	0.23
916	0.28
917	0.28
918	0.24
919	0.24
920	0.25
921	0.28
922	0.28
923	0.27
924	0.22
925	0.2
926	0.2
927	0.18
928	0.14
929	0.1
930	0.11
931	0.12
932	0.13
933	0.11
934	0.1
935	0.1
936	0.1
937	0.11
938	0.11
939	0.1
940	0.09
941	0.1
942	0.1
943	0.11
944	0.12
945	0.12
946	0.13
947	0.15
948	0.15
949	0.15
950	0.16
951	0.16
952	0.15
953	0.16
954	0.17
955	0.19
956	0.2
957	0.21
958	0.21
959	0.2
960	0.21
961	0.19
962	0.16
963	0.12
964	0.11
965	0.09
966	0.08
967	0.08
968	0.08
969	0.07
970	0.14
971	0.17
972	0.18
973	0.21
974	0.24
975	0.28
976	0.37
977	0.43
978	0.4
979	0.42
980	0.42
981	0.44
982	0.41
983	0.37
984	0.27
985	0.22
986	0.18
987	0.13
988	0.15
989	0.11
990	0.12
991	0.14
992	0.14
993	0.15
994	0.19
995	0.19
996	0.15
997	0.16
998	0.15
999	0.14
1000	0.15
1001	0.15
1002	0.17
1003	0.22
1004	0.25
1005	0.28
1006	0.29
1007	0.32
1008	0.32
1009	0.36
1010	0.39
1011	0.44
1012	0.48
1013	0.53
1014	0.57
1015	0.62
1016	0.68
1017	0.63
1018	0.54
1019	0.47
1020	0.42
1021	0.35
1022	0.33
1023	0.29
1024	0.29
1025	0.34
1026	0.42
1027	0.44
1028	0.48
1029	0.55
1030	0.62
1031	0.68
1032	0.73
1033	0.78
1034	0.8
1035	0.87
1036	0.9
1037	0.91
1038	0.92
1039	0.91
1040	0.89
1041	0.89
1042	0.82
1043	0.77
1044	0.75
1045	0.67
1046	0.64
1047	0.63
1048	0.6
1049	0.61
1050	0.67
1051	0.71

P15938

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer