Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

P25555

Protein Details
Accession P25555    Localization Confidence High Confidence Score 18.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
8-32YGNDRSRSRSPVRRRLSDDRDRYDDHydrophilic
36-62SSSNNGNGSRRQRRDRGSRFNDRYDQSHydrophilic
290-312EVREGRFNKRKNNDRYNQRREDLHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
75-99PPRRGGRGRGGSRSFRGGRGGGRGR
Subcellular Location(s) nucl 20.5, cyto_nucl 13, cyto 4.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
Gene Ontology GO:0000781  C:chromosome, telomeric region  
GO:0005737  C:cytoplasm  
GO:0010494  C:cytoplasmic stress granule  
GO:0005829  C:cytosol  
GO:0005634  C:nucleus  
GO:0000932  C:P-body  
GO:0003682  F:chromatin binding  
GO:0003729  F:mRNA binding  
GO:0043047  F:single-stranded telomeric DNA binding  
GO:0071028  P:nuclear mRNA surveillance  
GO:0016973  P:poly(A)+ mRNA export from nucleus  
GO:0000723  P:telomere maintenance  
KEGG sce:YCL011C  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
CDD cd21605  RRM1_HRB1_GBP2  
cd21606  RRM2_HRB1_GBP2  
cd21607  RRM3_HRB1_GBP2  
Amino Acid Sequences MERELGMYGNDRSRSRSPVRRRLSDDRDRYDDYNDSSSNNGNGSRRQRRDRGSRFNDRYDQSYGGSRYHDDRNWPPRRGGRGRGGSRSFRGGRGGGRGRTLGPIVERDLERQFDATKRNFENSIFVRNLTFDCTPEDLKELFGTVGEVVEADIITSKGHHRGMGTVEFTKNESVQDAISKFDGALFMDRKLMVRQDNPPPEAAKEFSKKATREEIDNGFEVFIINLPYSMNWQSLKDMFKECGHVLRADVELDFNGFSRGFGSVIYPTEDEMIRAIDTFNGMEVEGRVLEVREGRFNKRKNNDRYNQRREDLEDTRGTEPGLAQDAAVHIDETAAKFTEGVNPGGDRNCFIYCSNLPFSTARSDLFDLFGPIGKINNAELKPQENGQPTGVAVVEYENLVDADFCIQKLNNYNYGGCSLQISYARRD
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.44
2 0.5
3 0.56
4 0.61
5 0.67
6 0.75
7 0.78
8 0.82
9 0.85
10 0.85
11 0.86
12 0.85
13 0.81
14 0.79
15 0.75
16 0.68
17 0.62
18 0.56
19 0.49
20 0.45
21 0.39
22 0.33
23 0.3
24 0.31
25 0.28
26 0.25
27 0.25
28 0.23
29 0.3
30 0.4
31 0.48
32 0.55
33 0.62
34 0.69
35 0.74
36 0.82
37 0.85
38 0.85
39 0.84
40 0.86
41 0.84
42 0.84
43 0.82
44 0.73
45 0.67
46 0.6
47 0.53
48 0.43
49 0.44
50 0.37
51 0.32
52 0.31
53 0.29
54 0.29
55 0.33
56 0.34
57 0.34
58 0.42
59 0.51
60 0.58
61 0.59
62 0.61
63 0.61
64 0.69
65 0.69
66 0.67
67 0.67
68 0.68
69 0.71
70 0.73
71 0.72
72 0.68
73 0.63
74 0.64
75 0.55
76 0.47
77 0.44
78 0.38
79 0.35
80 0.38
81 0.42
82 0.36
83 0.36
84 0.35
85 0.33
86 0.32
87 0.3
88 0.22
89 0.17
90 0.18
91 0.17
92 0.2
93 0.2
94 0.21
95 0.23
96 0.23
97 0.21
98 0.2
99 0.21
100 0.2
101 0.27
102 0.28
103 0.32
104 0.33
105 0.36
106 0.36
107 0.34
108 0.38
109 0.33
110 0.36
111 0.3
112 0.28
113 0.25
114 0.25
115 0.25
116 0.21
117 0.19
118 0.13
119 0.15
120 0.18
121 0.18
122 0.17
123 0.2
124 0.16
125 0.16
126 0.15
127 0.13
128 0.1
129 0.09
130 0.09
131 0.06
132 0.06
133 0.05
134 0.05
135 0.04
136 0.04
137 0.04
138 0.03
139 0.03
140 0.04
141 0.04
142 0.05
143 0.06
144 0.11
145 0.12
146 0.13
147 0.13
148 0.15
149 0.18
150 0.2
151 0.21
152 0.2
153 0.2
154 0.19
155 0.2
156 0.19
157 0.16
158 0.13
159 0.11
160 0.09
161 0.09
162 0.11
163 0.11
164 0.11
165 0.11
166 0.1
167 0.09
168 0.09
169 0.09
170 0.06
171 0.1
172 0.1
173 0.1
174 0.12
175 0.12
176 0.12
177 0.13
178 0.16
179 0.15
180 0.17
181 0.22
182 0.29
183 0.34
184 0.34
185 0.34
186 0.32
187 0.3
188 0.29
189 0.25
190 0.21
191 0.2
192 0.21
193 0.24
194 0.29
195 0.29
196 0.3
197 0.36
198 0.32
199 0.31
200 0.34
201 0.33
202 0.29
203 0.29
204 0.26
205 0.18
206 0.17
207 0.14
208 0.09
209 0.06
210 0.05
211 0.04
212 0.04
213 0.04
214 0.05
215 0.07
216 0.08
217 0.09
218 0.1
219 0.1
220 0.12
221 0.16
222 0.17
223 0.17
224 0.18
225 0.18
226 0.18
227 0.21
228 0.19
229 0.2
230 0.2
231 0.18
232 0.16
233 0.16
234 0.16
235 0.13
236 0.12
237 0.09
238 0.07
239 0.08
240 0.07
241 0.06
242 0.06
243 0.06
244 0.06
245 0.06
246 0.07
247 0.06
248 0.06
249 0.07
250 0.08
251 0.09
252 0.1
253 0.1
254 0.1
255 0.11
256 0.11
257 0.1
258 0.09
259 0.09
260 0.07
261 0.07
262 0.07
263 0.06
264 0.06
265 0.06
266 0.06
267 0.05
268 0.05
269 0.06
270 0.06
271 0.06
272 0.05
273 0.06
274 0.06
275 0.05
276 0.07
277 0.09
278 0.1
279 0.17
280 0.2
281 0.28
282 0.36
283 0.42
284 0.5
285 0.57
286 0.66
287 0.69
288 0.77
289 0.78
290 0.81
291 0.87
292 0.87
293 0.85
294 0.77
295 0.7
296 0.64
297 0.62
298 0.55
299 0.49
300 0.42
301 0.38
302 0.37
303 0.35
304 0.3
305 0.23
306 0.19
307 0.15
308 0.15
309 0.12
310 0.1
311 0.1
312 0.11
313 0.12
314 0.11
315 0.09
316 0.06
317 0.07
318 0.08
319 0.08
320 0.09
321 0.09
322 0.08
323 0.09
324 0.09
325 0.16
326 0.17
327 0.18
328 0.18
329 0.18
330 0.2
331 0.23
332 0.23
333 0.17
334 0.18
335 0.17
336 0.18
337 0.17
338 0.22
339 0.21
340 0.27
341 0.3
342 0.27
343 0.29
344 0.28
345 0.3
346 0.29
347 0.28
348 0.23
349 0.23
350 0.25
351 0.23
352 0.24
353 0.22
354 0.18
355 0.17
356 0.18
357 0.15
358 0.13
359 0.14
360 0.13
361 0.13
362 0.14
363 0.21
364 0.2
365 0.23
366 0.26
367 0.28
368 0.29
369 0.3
370 0.35
371 0.32
372 0.34
373 0.31
374 0.29
375 0.26
376 0.26
377 0.23
378 0.16
379 0.11
380 0.1
381 0.09
382 0.08
383 0.08
384 0.07
385 0.07
386 0.07
387 0.07
388 0.06
389 0.1
390 0.11
391 0.11
392 0.14
393 0.14
394 0.18
395 0.27
396 0.32
397 0.35
398 0.37
399 0.38
400 0.37
401 0.4
402 0.36
403 0.28
404 0.25
405 0.19
406 0.2
407 0.25