Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

P07273

Protein Details
Accession P07273    Localization Confidence Low Confidence Score 9.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
266-288TDRFTCGKCKEKKVSYYQLQTRSHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 25, cyto_nucl 13.833, mito_nucl 13.333
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR035100  TF_IIS-typ  
IPR003617  TFIIS/CRSP70_N_sub  
IPR035441  TFIIS/LEDGF_dom_sf  
IPR003618  TFIIS_cen_dom  
IPR036575  TFIIS_cen_dom_sf  
IPR017923  TFIIS_N  
IPR006289  TFSII  
IPR001222  Znf_TFIIS  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0000993  F:RNA polymerase II complex binding  
GO:0001139  F:RNA polymerase II complex recruiting activity  
GO:0000977  F:RNA polymerase II transcription regulatory region sequence-specific DNA binding  
GO:0008270  F:zinc ion binding  
GO:0006351  P:DNA-templated transcription  
GO:0001193  P:maintenance of transcriptional fidelity during transcription elongation by RNA polymerase II  
GO:0045899  P:positive regulation of RNA polymerase II transcription preinitiation complex assembly  
GO:0032968  P:positive regulation of transcription elongation by RNA polymerase II  
GO:0031440  P:regulation of mRNA 3'-end processing  
GO:0031564  P:transcription antitermination  
GO:0006383  P:transcription by RNA polymerase III  
GO:0006362  P:transcription elongation by RNA polymerase I  
GO:0006368  P:transcription elongation by RNA polymerase II  
GO:0006367  P:transcription initiation at RNA polymerase II promoter  
GO:0042797  P:tRNA transcription by RNA polymerase III  
KEGG sce:YGL043W  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF08711  Med26  
PF01096  TFIIS_C  
PF07500  TFIIS_M  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51321  TFIIS_CENTRAL  
PS51319  TFIIS_N  
PS00466  ZF_TFIIS_1  
PS51133  ZF_TFIIS_2  
CDD cd00183  TFIIS_I  
cd13749  Zn-ribbon_TFIIS  
Amino Acid Sequences MDSKEVLVHVKNLEKNKSNDAAVLEILHVLDKEFVPTEKLLRETKVGVEVNKFKKSTNVEISKLVKKMISSWKDAINKNKRSRQAQQHHQDHAPGNAEDKTTVGESVNGVQQPASSQSDAMKQDKYVSTKPRNSKNDGVDTAIYHHKLRDQVLKALYDVLAKESEHPPQSILHTAKAIESEMNKVNNCDTNEAAYKARYRIIYSNVISKNNPDLKHKIANGDITPEFLATCDAKDLAPAPLKQKIEEIAKQNLYNAQGATIERSVTDRFTCGKCKEKKVSYYQLQTRSADEPLTTFCTCEACGNRWKFS
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.5
2 0.53
3 0.56
4 0.57
5 0.5
6 0.48
7 0.42
8 0.36
9 0.29
10 0.26
11 0.19
12 0.15
13 0.14
14 0.11
15 0.09
16 0.08
17 0.09
18 0.08
19 0.1
20 0.11
21 0.12
22 0.14
23 0.16
24 0.19
25 0.2
26 0.25
27 0.25
28 0.26
29 0.28
30 0.27
31 0.28
32 0.32
33 0.31
34 0.29
35 0.34
36 0.4
37 0.44
38 0.49
39 0.47
40 0.4
41 0.45
42 0.48
43 0.5
44 0.51
45 0.51
46 0.47
47 0.54
48 0.59
49 0.57
50 0.52
51 0.45
52 0.35
53 0.29
54 0.34
55 0.37
56 0.36
57 0.36
58 0.37
59 0.44
60 0.5
61 0.54
62 0.58
63 0.58
64 0.64
65 0.67
66 0.72
67 0.72
68 0.72
69 0.77
70 0.78
71 0.78
72 0.79
73 0.8
74 0.8
75 0.77
76 0.71
77 0.66
78 0.56
79 0.49
80 0.42
81 0.31
82 0.26
83 0.22
84 0.21
85 0.16
86 0.15
87 0.13
88 0.1
89 0.11
90 0.08
91 0.08
92 0.08
93 0.1
94 0.12
95 0.11
96 0.1
97 0.1
98 0.09
99 0.1
100 0.12
101 0.13
102 0.1
103 0.11
104 0.12
105 0.18
106 0.21
107 0.23
108 0.2
109 0.18
110 0.22
111 0.24
112 0.28
113 0.28
114 0.34
115 0.41
116 0.48
117 0.55
118 0.61
119 0.63
120 0.65
121 0.66
122 0.62
123 0.6
124 0.53
125 0.48
126 0.39
127 0.33
128 0.3
129 0.26
130 0.22
131 0.15
132 0.14
133 0.15
134 0.16
135 0.18
136 0.23
137 0.22
138 0.26
139 0.27
140 0.27
141 0.25
142 0.23
143 0.21
144 0.14
145 0.12
146 0.09
147 0.08
148 0.07
149 0.1
150 0.11
151 0.14
152 0.15
153 0.15
154 0.14
155 0.15
156 0.16
157 0.2
158 0.2
159 0.17
160 0.17
161 0.17
162 0.16
163 0.16
164 0.14
165 0.1
166 0.09
167 0.12
168 0.15
169 0.17
170 0.17
171 0.17
172 0.18
173 0.21
174 0.22
175 0.2
176 0.17
177 0.18
178 0.2
179 0.21
180 0.2
181 0.18
182 0.19
183 0.18
184 0.21
185 0.19
186 0.2
187 0.22
188 0.25
189 0.3
190 0.29
191 0.36
192 0.36
193 0.38
194 0.35
195 0.33
196 0.37
197 0.36
198 0.37
199 0.34
200 0.36
201 0.39
202 0.45
203 0.44
204 0.39
205 0.36
206 0.38
207 0.33
208 0.33
209 0.28
210 0.23
211 0.22
212 0.18
213 0.15
214 0.11
215 0.13
216 0.08
217 0.09
218 0.08
219 0.09
220 0.08
221 0.1
222 0.11
223 0.13
224 0.18
225 0.2
226 0.22
227 0.28
228 0.29
229 0.29
230 0.3
231 0.31
232 0.33
233 0.36
234 0.38
235 0.39
236 0.42
237 0.42
238 0.41
239 0.39
240 0.34
241 0.31
242 0.25
243 0.18
244 0.17
245 0.17
246 0.19
247 0.16
248 0.14
249 0.13
250 0.15
251 0.16
252 0.16
253 0.17
254 0.16
255 0.2
256 0.24
257 0.31
258 0.34
259 0.43
260 0.49
261 0.58
262 0.65
263 0.69
264 0.74
265 0.76
266 0.81
267 0.8
268 0.82
269 0.8
270 0.78
271 0.75
272 0.68
273 0.62
274 0.54
275 0.47
276 0.38
277 0.3
278 0.23
279 0.22
280 0.26
281 0.23
282 0.2
283 0.19
284 0.2
285 0.21
286 0.26
287 0.27
288 0.26
289 0.36