Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

Q12080

Protein Details
Accession Q12080    Localization Confidence High Confidence Score 23.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1-34MAPTNLTKKPSQYKQSSRKGKKAWRKNIDLSDVEHydrophilic
68-91DEILKNKLIKRKQIKKVLKSKEILHydrophilic
306-340IKLSINKPVKNKKKTKYQRNKAKRHEEKVKLQQELHydrophilic
365-391IESDSNKVKKSKKNKKHKLGTKYSVIDHydrophilic
426-455SGKVETRVPVRKGRKYKQKITEKWTHKDFKBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
17-25SRKGKKAWR
76-84IKRKQIKKV
312-333KPVKNKKKTKYQRNKAKRHEEK
371-382KVKKSKKNKKHK
436-444RKGRKYKQK
Subcellular Location(s) nucl 23.5, cyto_nucl 14.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR011687  Nop53/GLTSCR2  
Gene Ontology GO:0000176  C:nuclear exosome (RNase complex)  
GO:0005730  C:nucleolus  
GO:0005654  C:nucleoplasm  
GO:0005634  C:nucleus  
GO:0008097  F:5S rRNA binding  
GO:0019843  F:rRNA binding  
GO:0000460  P:maturation of 5.8S rRNA  
GO:0000463  P:maturation of LSU-rRNA from tricistronic rRNA transcript (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA)  
GO:0000027  P:ribosomal large subunit assembly  
GO:0000055  P:ribosomal large subunit export from nucleus  
GO:0006364  P:rRNA processing  
KEGG sce:YPL146C  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF07767  Nop53  
Amino Acid Sequences MAPTNLTKKPSQYKQSSRKGKKAWRKNIDLSDVEQYMEKKIDHEITHGTSDITSLQNDALFHVDVEGDEILKNKLIKRKQIKKVLKSKEILDAVKTNSKIAALNHHKNSSGNPNKIQGVSKHELKKLMALAGRVHGESKIKNRVAKDGLVKTTAGDLWGEESNSKKQKVKLPSGIKLDVEKKDQIPEELLKKSTTSWSTASVRPSTLDIEPIAVKEFTEIPHAGKSYNPNNKAWSELINKEYKEEKAREDERIALEKYKERIRHLMETLDDNEEEESSSNEEEEEEEEENENENESTQCSGSDKEIKLSINKPVKNKKKTKYQRNKAKRHEEKVKLQQELKELRQRVKDLEEVINSEETEILSAIESDSNKVKKSKKNKKHKLGTKYSVIDERLEIKFSDELSDSLRKLKPEGNLLYDTVRKLQSSGKVETRVPVRKGRKYKQKITEKWTHKDFK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.8
2 0.88
3 0.9
4 0.9
5 0.9
6 0.9
7 0.9
8 0.91
9 0.91
10 0.91
11 0.9
12 0.89
13 0.89
14 0.87
15 0.83
16 0.75
17 0.67
18 0.62
19 0.53
20 0.44
21 0.37
22 0.3
23 0.26
24 0.26
25 0.22
26 0.17
27 0.22
28 0.27
29 0.26
30 0.28
31 0.3
32 0.3
33 0.32
34 0.31
35 0.26
36 0.2
37 0.2
38 0.19
39 0.15
40 0.12
41 0.11
42 0.12
43 0.13
44 0.13
45 0.13
46 0.14
47 0.12
48 0.12
49 0.11
50 0.11
51 0.09
52 0.11
53 0.1
54 0.08
55 0.08
56 0.09
57 0.1
58 0.13
59 0.15
60 0.18
61 0.27
62 0.33
63 0.43
64 0.52
65 0.62
66 0.69
67 0.78
68 0.83
69 0.85
70 0.89
71 0.89
72 0.87
73 0.79
74 0.72
75 0.7
76 0.65
77 0.56
78 0.49
79 0.43
80 0.39
81 0.41
82 0.39
83 0.31
84 0.26
85 0.25
86 0.24
87 0.21
88 0.28
89 0.31
90 0.39
91 0.44
92 0.45
93 0.45
94 0.43
95 0.46
96 0.46
97 0.46
98 0.43
99 0.41
100 0.44
101 0.45
102 0.47
103 0.46
104 0.38
105 0.38
106 0.38
107 0.43
108 0.44
109 0.45
110 0.46
111 0.43
112 0.43
113 0.36
114 0.35
115 0.29
116 0.25
117 0.23
118 0.23
119 0.24
120 0.2
121 0.19
122 0.16
123 0.17
124 0.19
125 0.25
126 0.31
127 0.33
128 0.37
129 0.38
130 0.43
131 0.43
132 0.44
133 0.45
134 0.41
135 0.39
136 0.37
137 0.36
138 0.29
139 0.27
140 0.22
141 0.15
142 0.1
143 0.08
144 0.09
145 0.1
146 0.1
147 0.09
148 0.11
149 0.18
150 0.24
151 0.27
152 0.29
153 0.33
154 0.41
155 0.48
156 0.55
157 0.57
158 0.59
159 0.63
160 0.64
161 0.61
162 0.54
163 0.5
164 0.47
165 0.4
166 0.36
167 0.32
168 0.27
169 0.29
170 0.29
171 0.25
172 0.22
173 0.23
174 0.25
175 0.24
176 0.25
177 0.21
178 0.21
179 0.21
180 0.22
181 0.2
182 0.18
183 0.17
184 0.21
185 0.24
186 0.27
187 0.29
188 0.26
189 0.24
190 0.22
191 0.22
192 0.19
193 0.16
194 0.14
195 0.11
196 0.11
197 0.11
198 0.11
199 0.11
200 0.08
201 0.08
202 0.08
203 0.08
204 0.07
205 0.11
206 0.11
207 0.11
208 0.13
209 0.13
210 0.12
211 0.13
212 0.18
213 0.23
214 0.31
215 0.32
216 0.32
217 0.34
218 0.34
219 0.35
220 0.31
221 0.27
222 0.23
223 0.24
224 0.26
225 0.27
226 0.27
227 0.26
228 0.28
229 0.26
230 0.27
231 0.26
232 0.25
233 0.3
234 0.32
235 0.33
236 0.32
237 0.33
238 0.29
239 0.32
240 0.3
241 0.24
242 0.24
243 0.25
244 0.27
245 0.3
246 0.3
247 0.29
248 0.35
249 0.37
250 0.4
251 0.38
252 0.37
253 0.32
254 0.32
255 0.31
256 0.25
257 0.21
258 0.16
259 0.14
260 0.12
261 0.11
262 0.08
263 0.07
264 0.07
265 0.07
266 0.06
267 0.06
268 0.06
269 0.06
270 0.07
271 0.09
272 0.08
273 0.09
274 0.1
275 0.1
276 0.11
277 0.1
278 0.1
279 0.08
280 0.08
281 0.07
282 0.07
283 0.08
284 0.07
285 0.08
286 0.08
287 0.1
288 0.13
289 0.2
290 0.2
291 0.21
292 0.24
293 0.25
294 0.28
295 0.29
296 0.35
297 0.36
298 0.39
299 0.46
300 0.53
301 0.63
302 0.68
303 0.76
304 0.75
305 0.78
306 0.85
307 0.88
308 0.89
309 0.89
310 0.9
311 0.92
312 0.94
313 0.93
314 0.94
315 0.93
316 0.91
317 0.91
318 0.88
319 0.87
320 0.86
321 0.83
322 0.78
323 0.71
324 0.65
325 0.62
326 0.61
327 0.57
328 0.55
329 0.51
330 0.52
331 0.54
332 0.53
333 0.48
334 0.45
335 0.42
336 0.38
337 0.39
338 0.35
339 0.31
340 0.31
341 0.28
342 0.24
343 0.2
344 0.16
345 0.11
346 0.1
347 0.08
348 0.07
349 0.05
350 0.06
351 0.06
352 0.08
353 0.09
354 0.1
355 0.17
356 0.19
357 0.22
358 0.29
359 0.37
360 0.43
361 0.55
362 0.64
363 0.68
364 0.78
365 0.86
366 0.9
367 0.93
368 0.93
369 0.93
370 0.92
371 0.89
372 0.87
373 0.79
374 0.72
375 0.67
376 0.59
377 0.5
378 0.41
379 0.39
380 0.31
381 0.29
382 0.25
383 0.21
384 0.22
385 0.2
386 0.21
387 0.17
388 0.17
389 0.2
390 0.25
391 0.23
392 0.28
393 0.31
394 0.29
395 0.31
396 0.35
397 0.35
398 0.39
399 0.43
400 0.42
401 0.41
402 0.42
403 0.43
404 0.41
405 0.38
406 0.34
407 0.31
408 0.26
409 0.25
410 0.3
411 0.34
412 0.37
413 0.42
414 0.44
415 0.47
416 0.48
417 0.52
418 0.55
419 0.55
420 0.54
421 0.57
422 0.6
423 0.66
424 0.75
425 0.8
426 0.82
427 0.83
428 0.89
429 0.89
430 0.91
431 0.9
432 0.89
433 0.89
434 0.86
435 0.85