FuNGI

Q08965

Protein Details

Accession

Q08965

Localization Confidence

High

Confidence Score

23.4

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
1-32	MEQSNKQHRKAKEKNTAKKKLHTQGHNAKAFA	Hydrophilic
178-201	KSQSTLRASKKRLKHRFWTEVYQG	Hydrophilic
821-846	KFGIVKARLRRHRWHKKILKTNDPLV	Hydrophilic
1075-1101	KELPFKSQIHQMKPQKKKTYMAKRAVV	Hydrophilic
1116-1170	VLTISKAKDSKRKEQKASQRKERLKKLAKMEEEKSQRDKEKKKEYFAQNGKRTTM	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
8-20	HRKAKEKNTAKKK
827-837	ARLRRHRWHKK
1119-1159	ISKAKDSKRKEQKASQRKERLKKLAKMEEEKSQRDKEKKKE
1177-1183	RPRKMRR

Subcellular Location(s)

nucl 24.5, cyto_nucl 14

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR012948 AARP2CN IPR003959 ATPase_AAA_core IPR039761 Bms1/Tsr1 IPR037875 Bms1_N IPR007034 BMS1_TSR1_C IPR030387 G_Bms1/Tsr1_dom IPR027417 P-loop_NTPase
Gene Ontology	GO:0030686 C:90S preribosome GO:0005737 C:cytoplasm GO:0005739 C:mitochondrion GO:0005730 C:nucleolus GO:0005654 C:nucleoplasm GO:0005634 C:nucleus GO:0032040 C:small-subunit processome GO:0005524 F:ATP binding GO:0016887 F:ATP hydrolysis activity GO:0005525 F:GTP binding GO:0003924 F:GTPase activity GO:0003729 F:mRNA binding GO:0034511 F:U3 snoRNA binding GO:0000480 P:endonucleolytic cleavage in 5'-ETS of tricistronic rRNA transcript (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA) GO:0000479 P:endonucleolytic cleavage of tricistronic rRNA transcript (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA) GO:0000472 P:endonucleolytic cleavage to generate mature 5'-end of SSU-rRNA from (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA) GO:0030490 P:maturation of SSU-rRNA GO:0000462 P:maturation of SSU-rRNA from tricistronic rRNA transcript (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA) GO:2000232 P:regulation of rRNA processing GO:0042274 P:ribosomal small subunit biogenesis
KEGG	sce:YPL217C -
Pfam	View protein in Pfam PF00004 AAA PF08142 AARP2CN PF04950 RIBIOP_C
PROSITE	View protein in PROSITE PS51714 G_BMS1
CDD	cd01882 BMS1

Amino Acid Sequences

MEQSNKQHRKAKEKNTAKKKLHTQGHNAKAFAVAAPGKMARTMQRSSDVNERKLHVPMVDRTPEDDPPPFIVAVVGPPGTGKTTLIRSLVRRMTKSTLNDIQGPITVVSGKHRRLTFLECPADDLNAMIDIAKIADLVLLLIDGNFGFEMETMEFLNIAQHHGMPRVLGVATHLDLFKSQSTLRASKKRLKHRFWTEVYQGAKLFYLSGVINGRYPDREILNLSRFISVMKFRPLKWRNEHPYMLADRFTDLTHPELIETQGLQIDRKVAIYGYLHGTPLPSAPGTRVHIAGVGDFSVAQIEKLPDPCPTPFYQQKLDDFEREKMKEEAKANGEITTASTTRRRKRLDDKDKLIYAPMSDVGGVLMDKDAVYIDIGKKNEEPSFVPGQERGEGEKLMTGLQSVEQSIAEKFDGVGLQLFSNGTELHEVADHEGMDVESGEESIEDDEGKSKGRTSLRKPRIYGKPVQEEDADIDNLPSDEEPYTNDDDVQDSEPRMVEIDFNNTGEQGAEKLALETDSEFEESEDEFSWERTAANKLKKTESKKRTWNIGKLIYMDNISPEECIRRWRGEDDDSKDESDIEEDVDDDFFRKKDGTVTKEGNKDHAVDLEKFVPYFDTFEKLAKKWKSVDAIKERFLGAGILGNDNKTKSDSNEGGEELYGDFEDLEDGNPSEQAEDNSDKESEDEDENEDTNGDDDNSFTNFDAEEKKDLTMEQEREMNAAKKEKLRAQFEIEEGENFKEDDENNEYDTWYELQKAKISKQLEINNIEYQEMTPEQRQRIEGFKAGSYVRIVFEKVPMEFVKNFNPKFPIVMGGLLPTEIKFGIVKARLRRHRWHKKILKTNDPLVLSLGWRRFQTLPIYTTTDSRTRTRMLKYTPEHTYCNAAFYGPLCSPNTPFCGVQIVANSDTGNGFRIAATGIVEEIDVNIEIVKKLKLVGFPYKIFKNTAFIKDMFSSAMEVARFEGAQIKTVSGIRGEIKRALSKPEGHYRAAFEDKILMSDIVILRSWYPVRVKKFYNPVTSLLLKEKTEWKGLRLTGQIRAAMNLETPSNPDSAYHKIERVERHFNGLKVPKAVQKELPFKSQIHQMKPQKKKTYMAKRAVVLGGDEKKARSFIQKVLTISKAKDSKRKEQKASQRKERLKKLAKMEEEKSQRDKEKKKEYFAQNGKRTTMGGDDESRPRKMRR

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.88
2	0.9
3	0.93
4	0.9
5	0.89
6	0.88
7	0.87
8	0.86
9	0.84
10	0.83
11	0.83
12	0.86
13	0.81
14	0.71
15	0.61
16	0.53
17	0.45
18	0.35
19	0.3
20	0.21
21	0.16
22	0.19
23	0.19
24	0.18
25	0.19
26	0.21
27	0.22
28	0.27
29	0.29
30	0.3
31	0.36
32	0.38
33	0.41
34	0.49
35	0.51
36	0.51
37	0.53
38	0.53
39	0.49
40	0.5
41	0.48
42	0.41
43	0.39
44	0.39
45	0.42
46	0.44
47	0.41
48	0.42
49	0.43
50	0.43
51	0.4
52	0.37
53	0.32
54	0.3
55	0.31
56	0.27
57	0.24
58	0.21
59	0.18
60	0.17
61	0.17
62	0.13
63	0.1
64	0.1
65	0.11
66	0.13
67	0.13
68	0.12
69	0.14
70	0.18
71	0.22
72	0.26
73	0.3
74	0.31
75	0.4
76	0.47
77	0.49
78	0.48
79	0.49
80	0.51
81	0.53
82	0.55
83	0.54
84	0.54
85	0.5
86	0.52
87	0.48
88	0.43
89	0.37
90	0.34
91	0.26
92	0.19
93	0.17
94	0.13
95	0.2
96	0.27
97	0.3
98	0.35
99	0.35
100	0.38
101	0.41
102	0.48
103	0.48
104	0.49
105	0.52
106	0.45
107	0.49
108	0.46
109	0.43
110	0.34
111	0.27
112	0.18
113	0.12
114	0.12
115	0.07
116	0.06
117	0.06
118	0.06
119	0.06
120	0.05
121	0.04
122	0.05
123	0.04
124	0.04
125	0.04
126	0.04
127	0.04
128	0.04
129	0.04
130	0.04
131	0.04
132	0.04
133	0.04
134	0.05
135	0.05
136	0.07
137	0.07
138	0.08
139	0.08
140	0.08
141	0.08
142	0.08
143	0.11
144	0.1
145	0.11
146	0.11
147	0.13
148	0.14
149	0.17
150	0.17
151	0.13
152	0.13
153	0.13
154	0.12
155	0.11
156	0.11
157	0.12
158	0.12
159	0.14
160	0.13
161	0.12
162	0.12
163	0.15
164	0.14
165	0.14
166	0.14
167	0.18
168	0.24
169	0.31
170	0.39
171	0.47
172	0.53
173	0.59
174	0.68
175	0.73
176	0.78
177	0.79
178	0.81
179	0.81
180	0.84
181	0.81
182	0.8
183	0.74
184	0.7
185	0.64
186	0.56
187	0.46
188	0.37
189	0.31
190	0.23
191	0.19
192	0.12
193	0.12
194	0.09
195	0.12
196	0.14
197	0.14
198	0.16
199	0.17
200	0.18
201	0.17
202	0.2
203	0.19
204	0.18
205	0.19
206	0.22
207	0.28
208	0.3
209	0.32
210	0.31
211	0.29
212	0.27
213	0.26
214	0.25
215	0.23
216	0.23
217	0.28
218	0.31
219	0.31
220	0.43
221	0.48
222	0.54
223	0.58
224	0.65
225	0.65
226	0.69
227	0.69
228	0.61
229	0.62
230	0.57
231	0.5
232	0.41
233	0.33
234	0.26
235	0.25
236	0.23
237	0.18
238	0.14
239	0.14
240	0.14
241	0.14
242	0.13
243	0.13
244	0.14
245	0.13
246	0.12
247	0.1
248	0.11
249	0.12
250	0.11
251	0.11
252	0.13
253	0.12
254	0.12
255	0.12
256	0.09
257	0.11
258	0.12
259	0.14
260	0.15
261	0.15
262	0.15
263	0.15
264	0.15
265	0.13
266	0.13
267	0.12
268	0.09
269	0.08
270	0.1
271	0.15
272	0.18
273	0.19
274	0.19
275	0.17
276	0.19
277	0.19
278	0.18
279	0.14
280	0.1
281	0.09
282	0.08
283	0.08
284	0.07
285	0.06
286	0.06
287	0.07
288	0.09
289	0.11
290	0.13
291	0.14
292	0.15
293	0.18
294	0.19
295	0.21
296	0.22
297	0.28
298	0.32
299	0.36
300	0.41
301	0.42
302	0.46
303	0.49
304	0.49
305	0.48
306	0.45
307	0.46
308	0.47
309	0.44
310	0.42
311	0.38
312	0.38
313	0.38
314	0.36
315	0.37
316	0.33
317	0.36
318	0.33
319	0.3
320	0.28
321	0.21
322	0.21
323	0.17
324	0.14
325	0.13
326	0.2
327	0.28
328	0.36
329	0.44
330	0.47
331	0.52
332	0.63
333	0.72
334	0.76
335	0.78
336	0.77
337	0.76
338	0.74
339	0.66
340	0.57
341	0.46
342	0.35
343	0.25
344	0.19
345	0.11
346	0.09
347	0.09
348	0.07
349	0.07
350	0.06
351	0.05
352	0.04
353	0.04
354	0.04
355	0.04
356	0.04
357	0.04
358	0.04
359	0.07
360	0.1
361	0.14
362	0.15
363	0.16
364	0.17
365	0.2
366	0.22
367	0.21
368	0.2
369	0.21
370	0.26
371	0.25
372	0.25
373	0.24
374	0.24
375	0.24
376	0.23
377	0.21
378	0.17
379	0.16
380	0.15
381	0.15
382	0.13
383	0.11
384	0.1
385	0.08
386	0.06
387	0.07
388	0.08
389	0.07
390	0.07
391	0.06
392	0.08
393	0.08
394	0.08
395	0.07
396	0.07
397	0.07
398	0.07
399	0.07
400	0.06
401	0.07
402	0.07
403	0.07
404	0.07
405	0.07
406	0.06
407	0.07
408	0.07
409	0.06
410	0.06
411	0.06
412	0.06
413	0.07
414	0.07
415	0.08
416	0.09
417	0.08
418	0.07
419	0.07
420	0.07
421	0.06
422	0.06
423	0.05
424	0.04
425	0.04
426	0.04
427	0.03
428	0.04
429	0.04
430	0.04
431	0.04
432	0.04
433	0.06
434	0.07
435	0.09
436	0.09
437	0.09
438	0.15
439	0.21
440	0.29
441	0.36
442	0.47
443	0.55
444	0.61
445	0.63
446	0.66
447	0.69
448	0.67
449	0.66
450	0.63
451	0.63
452	0.57
453	0.57
454	0.48
455	0.39
456	0.36
457	0.3
458	0.23
459	0.13
460	0.12
461	0.1
462	0.1
463	0.09
464	0.06
465	0.05
466	0.05
467	0.05
468	0.07
469	0.1
470	0.12
471	0.12
472	0.13
473	0.12
474	0.12
475	0.14
476	0.15
477	0.12
478	0.1
479	0.11
480	0.11
481	0.1
482	0.1
483	0.08
484	0.08
485	0.08
486	0.12
487	0.12
488	0.13
489	0.13
490	0.12
491	0.12
492	0.1
493	0.1
494	0.06
495	0.05
496	0.05
497	0.05
498	0.05
499	0.05
500	0.05
501	0.05
502	0.05
503	0.06
504	0.06
505	0.06
506	0.06
507	0.06
508	0.07
509	0.07
510	0.07
511	0.07
512	0.07
513	0.07
514	0.07
515	0.08
516	0.07
517	0.07
518	0.08
519	0.13
520	0.18
521	0.25
522	0.29
523	0.32
524	0.38
525	0.44
526	0.51
527	0.57
528	0.59
529	0.61
530	0.66
531	0.68
532	0.72
533	0.72
534	0.7
535	0.66
536	0.62
537	0.54
538	0.47
539	0.44
540	0.34
541	0.28
542	0.21
543	0.15
544	0.12
545	0.1
546	0.08
547	0.07
548	0.09
549	0.08
550	0.12
551	0.14
552	0.15
553	0.17
554	0.19
555	0.22
556	0.26
557	0.32
558	0.34
559	0.37
560	0.36
561	0.35
562	0.33
563	0.29
564	0.23
565	0.17
566	0.12
567	0.06
568	0.05
569	0.05
570	0.05
571	0.05
572	0.05
573	0.05
574	0.06
575	0.06
576	0.06
577	0.06
578	0.06
579	0.13
580	0.18
581	0.22
582	0.27
583	0.32
584	0.37
585	0.42
586	0.42
587	0.38
588	0.34
589	0.3
590	0.25
591	0.24
592	0.21
593	0.17
594	0.18
595	0.17
596	0.16
597	0.15
598	0.14
599	0.11
600	0.09
601	0.11
602	0.09
603	0.1
604	0.11
605	0.14
606	0.17
607	0.17
608	0.25
609	0.24
610	0.27
611	0.26
612	0.3
613	0.34
614	0.35
615	0.43
616	0.45
617	0.47
618	0.46
619	0.45
620	0.41
621	0.33
622	0.3
623	0.21
624	0.11
625	0.1
626	0.08
627	0.09
628	0.09
629	0.1
630	0.1
631	0.1
632	0.11
633	0.1
634	0.1
635	0.1
636	0.16
637	0.17
638	0.18
639	0.19
640	0.19
641	0.17
642	0.16
643	0.15
644	0.09
645	0.08
646	0.06
647	0.04
648	0.04
649	0.03
650	0.04
651	0.04
652	0.04
653	0.04
654	0.05
655	0.05
656	0.05
657	0.05
658	0.06
659	0.06
660	0.06
661	0.09
662	0.11
663	0.12
664	0.13
665	0.14
666	0.13
667	0.13
668	0.13
669	0.11
670	0.1
671	0.1
672	0.11
673	0.12
674	0.12
675	0.11
676	0.1
677	0.08
678	0.08
679	0.07
680	0.06
681	0.05
682	0.05
683	0.06
684	0.07
685	0.07
686	0.07
687	0.07
688	0.07
689	0.08
690	0.12
691	0.12
692	0.13
693	0.14
694	0.14
695	0.14
696	0.14
697	0.17
698	0.2
699	0.2
700	0.19
701	0.21
702	0.21
703	0.22
704	0.24
705	0.23
706	0.19
707	0.23
708	0.24
709	0.25
710	0.29
711	0.34
712	0.39
713	0.41
714	0.41
715	0.42
716	0.41
717	0.38
718	0.37
719	0.31
720	0.25
721	0.21
722	0.19
723	0.14
724	0.11
725	0.1
726	0.09
727	0.09
728	0.12
729	0.15
730	0.16
731	0.17
732	0.17
733	0.17
734	0.15
735	0.17
736	0.14
737	0.1
738	0.12
739	0.13
740	0.14
741	0.18
742	0.2
743	0.21
744	0.27
745	0.28
746	0.28
747	0.33
748	0.38
749	0.4
750	0.41
751	0.42
752	0.38
753	0.37
754	0.33
755	0.26
756	0.2
757	0.16
758	0.14
759	0.13
760	0.15
761	0.19
762	0.21
763	0.23
764	0.24
765	0.24
766	0.28
767	0.29
768	0.28
769	0.25
770	0.23
771	0.24
772	0.22
773	0.22
774	0.18
775	0.16
776	0.13
777	0.13
778	0.14
779	0.11
780	0.15
781	0.15
782	0.14
783	0.17
784	0.16
785	0.19
786	0.2
787	0.21
788	0.27
789	0.33
790	0.33
791	0.33
792	0.35
793	0.32
794	0.32
795	0.3
796	0.23
797	0.17
798	0.17
799	0.15
800	0.12
801	0.12
802	0.11
803	0.1
804	0.07
805	0.07
806	0.06
807	0.06
808	0.05
809	0.06
810	0.12
811	0.17
812	0.22
813	0.29
814	0.39
815	0.47
816	0.54
817	0.64
818	0.69
819	0.76
820	0.8
821	0.83
822	0.82
823	0.84
824	0.88
825	0.87
826	0.86
827	0.8
828	0.76
829	0.71
830	0.62
831	0.52
832	0.43
833	0.35
834	0.26
835	0.25
836	0.23
837	0.19
838	0.18
839	0.22
840	0.21
841	0.23
842	0.28
843	0.28
844	0.27
845	0.28
846	0.32
847	0.29
848	0.31
849	0.31
850	0.3
851	0.29
852	0.3
853	0.3
854	0.3
855	0.35
856	0.38
857	0.41
858	0.41
859	0.48
860	0.49
861	0.53
862	0.56
863	0.54
864	0.52
865	0.46
866	0.47
867	0.37
868	0.35
869	0.29
870	0.21
871	0.18
872	0.16
873	0.19
874	0.13
875	0.16
876	0.15
877	0.16
878	0.18
879	0.21
880	0.24
881	0.22
882	0.21
883	0.19
884	0.22
885	0.21
886	0.2
887	0.2
888	0.2
889	0.18
890	0.19
891	0.18
892	0.14
893	0.14
894	0.13
895	0.12
896	0.08
897	0.08
898	0.07
899	0.08
900	0.08
901	0.08
902	0.08
903	0.06
904	0.06
905	0.06
906	0.06
907	0.05
908	0.05
909	0.05
910	0.05
911	0.05
912	0.05
913	0.06
914	0.06
915	0.08
916	0.09
917	0.08
918	0.1
919	0.13
920	0.16
921	0.2
922	0.29
923	0.33
924	0.36
925	0.41
926	0.43
927	0.43
928	0.42
929	0.37
930	0.35
931	0.36
932	0.37
933	0.36
934	0.33
935	0.35
936	0.33
937	0.33
938	0.27
939	0.21
940	0.18
941	0.14
942	0.16
943	0.12
944	0.11
945	0.11
946	0.12
947	0.11
948	0.1
949	0.16
950	0.14
951	0.18
952	0.18
953	0.18
954	0.19
955	0.2
956	0.21
957	0.14
958	0.16
959	0.17
960	0.2
961	0.23
962	0.25
963	0.27
964	0.33
965	0.34
966	0.37
967	0.38
968	0.41
969	0.45
970	0.52
971	0.52
972	0.48
973	0.49
974	0.45
975	0.46
976	0.44
977	0.37
978	0.27
979	0.28
980	0.26
981	0.25
982	0.23
983	0.17
984	0.13
985	0.17
986	0.18
987	0.14
988	0.14
989	0.13
990	0.12
991	0.16
992	0.17
993	0.17
994	0.24
995	0.29
996	0.37
997	0.42
998	0.47
999	0.51
1000	0.61
1001	0.64
1002	0.65
1003	0.61
1004	0.57
1005	0.57
1006	0.55
1007	0.49
1008	0.45
1009	0.41
1010	0.33
1011	0.34
1012	0.38
1013	0.35
1014	0.42
1015	0.4
1016	0.37
1017	0.4
1018	0.41
1019	0.44
1020	0.43
1021	0.42
1022	0.4
1023	0.42
1024	0.43
1025	0.36
1026	0.36
1027	0.31
1028	0.25
1029	0.24
1030	0.18
1031	0.16
1032	0.13
1033	0.15
1034	0.15
1035	0.15
1036	0.14
1037	0.14
1038	0.17
1039	0.22
1040	0.28
1041	0.28
1042	0.3
1043	0.34
1044	0.4
1045	0.47
1046	0.5
1047	0.54
1048	0.48
1049	0.54
1050	0.55
1051	0.52
1052	0.56
1053	0.54
1054	0.5
1055	0.45
1056	0.47
1057	0.44
1058	0.46
1059	0.49
1060	0.47
1061	0.49
1062	0.55
1063	0.55
1064	0.57
1065	0.55
1066	0.5
1067	0.5
1068	0.53
1069	0.51
1070	0.49
1071	0.55
1072	0.59
1073	0.66
1074	0.75
1075	0.82
1076	0.82
1077	0.8
1078	0.82
1079	0.83
1080	0.84
1081	0.84
1082	0.83
1083	0.79
1084	0.72
1085	0.71
1086	0.63
1087	0.53
1088	0.44
1089	0.41
1090	0.36
1091	0.33
1092	0.32
1093	0.29
1094	0.29
1095	0.3
1096	0.3
1097	0.31
1098	0.3
1099	0.34
1100	0.41
1101	0.45
1102	0.46
1103	0.5
1104	0.53
1105	0.49
1106	0.46
1107	0.49
1108	0.48
1109	0.49
1110	0.55
1111	0.57
1112	0.62
1113	0.69
1114	0.78
1115	0.78
1116	0.8
1117	0.86
1118	0.87
1119	0.91
1120	0.91
1121	0.9
1122	0.91
1123	0.92
1124	0.92
1125	0.92
1126	0.91
1127	0.89
1128	0.88
1129	0.87
1130	0.86
1131	0.83
1132	0.77
1133	0.75
1134	0.73
1135	0.72
1136	0.69
1137	0.67
1138	0.67
1139	0.7
1140	0.75
1141	0.76
1142	0.79
1143	0.81
1144	0.82
1145	0.84
1146	0.84
1147	0.85
1148	0.86
1149	0.86
1150	0.83
1151	0.8
1152	0.74
1153	0.65
1154	0.56
1155	0.47
1156	0.41
1157	0.35
1158	0.31
1159	0.31
1160	0.34
1161	0.42
1162	0.47
1163	0.5

Q08965

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer