FuNGI

Q06106

Protein Details

Accession

Q06106

Localization Confidence

High

Confidence Score

20.3

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
15-37	DDNLREHFTKRLRQKHSHQAVNG	Hydrophilic
100-143	VPQPMKEKRREALKRFREKEEKLLQEENRKKKKVDENKHSNIDD	Basic
750-769	QSGNTKTKSNKKSGKIIVKN	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
104-132	MKEKRREALKRFREKEEKLLQEENRKKKK
443-447	KELKR

Subcellular Location(s)

nucl 19.5, cyto_nucl 12.5, cyto 4.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR034482 Mrd1_RRM3 IPR012677 Nucleotide-bd_a/b_plait_sf IPR035979 RBD_domain_sf IPR000504 RRM_dom
Gene Ontology	GO:0030686 C:90S preribosome GO:0005737 C:cytoplasm GO:0005730 C:nucleolus GO:0005634 C:nucleus GO:1990904 C:ribonucleoprotein complex GO:0032040 C:small-subunit processome GO:0003729 F:mRNA binding GO:0042134 F:rRNA primary transcript binding GO:0000480 P:endonucleolytic cleavage in 5'-ETS of tricistronic rRNA transcript (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA) GO:0000447 P:endonucleolytic cleavage in ITS1 to separate SSU-rRNA from 5.8S rRNA and LSU-rRNA from tricistronic rRNA transcript (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA) GO:0000472 P:endonucleolytic cleavage to generate mature 5'-end of SSU-rRNA from (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA) GO:0030490 P:maturation of SSU-rRNA GO:0034462 P:small-subunit processome assembly
KEGG	sce:YPR112C -
Pfam	View protein in Pfam PF00076 RRM_1
PROSITE	View protein in PROSITE PS50102 RRM
CDD	cd12315 RRM1_RBM19_MRD1 cd12566 RRM2_MRD1 cd12568 RRM3_MRD1 cd12319 RRM4_MRD1 cd12570 RRM5_MRD1

Amino Acid Sequences

MSRIIVKGLPVYLTDDNLREHFTKRLRQKHSHQAVNGSGPDLITDVKILRDRNGESRRFGFIGYRNEEDAFDAVEYFNGSFINTSKIEVSMAKSFADPRVPQPMKEKRREALKRFREKEEKLLQEENRKKKKVDENKHSNIDDEIRKNKQLQEFMETMKPSSQVTSWEKVGIDKSIEDEKLKREEEDSSVQGNSLLAHALALKEENNKDEAPNLVIENESDDEYSALNRNRDEDQEDAGEEEKMISISNLKDTDIGLVNDDANSDEKENEKRRNLAQDEKVSDLDWFKQRRVRIKESEAETREKSSSYATEQNESLDTKKEEQPERAVPQKTDEELAIEKINQTGRLFLRNILYTSKEEDFRKLFSPFGELEEVHVALDTRTGQSKGFAYVLFKDSKNAVNAYVELDKQIFQGRLLHILPGEEKKSHRLDEFDLKNMPLKKQKELKRKAAASRQTFSWNSLYMNQDAVLGSVAAKLGLEKSQLIDAENSSSAVKQALAEAHVIGDVRKYFESKGVDLTKFSQLKSTNQRDDKVILVKNFPFGTTREELGEMFLPYGKLERLLMPPAGTIAIVQFRDTTSARAAFTKLSYKRFKDGIIYLERGPKDCFTKPAEADDLINNTSAKEEENPVEVKPSSNDLMEANKDVTEGSSNAHDEDVIDGPTVSIFIKNLNFSTTNQNLTDRFKVFTGFVVAQVKTKPDPKHQGKTLSMGFGFVEFRTKEQANAVIAAMDGTVIDGHKIQLKLSHRQASQSGNTKTKSNKKSGKIIVKNLPFEATRKDVFELFNSFGQLKSVRVPKKFDKSARGFAFVEFLLPKEAENAMDQLHGVHLLGRRLVMQYAEEDAVDAEEEIARMTKKVRKQVATNEMAALRNGGGRKKLDVDDEENEGF

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.23
2	0.23
3	0.24
4	0.25
5	0.29
6	0.25
7	0.26
8	0.32
9	0.37
10	0.45
11	0.52
12	0.61
13	0.66
14	0.73
15	0.8
16	0.83
17	0.86
18	0.84
19	0.78
20	0.75
21	0.7
22	0.66
23	0.58
24	0.48
25	0.38
26	0.29
27	0.26
28	0.19
29	0.15
30	0.09
31	0.1
32	0.1
33	0.14
34	0.19
35	0.2
36	0.23
37	0.29
38	0.32
39	0.41
40	0.49
41	0.5
42	0.51
43	0.53
44	0.53
45	0.48
46	0.45
47	0.42
48	0.4
49	0.45
50	0.44
51	0.44
52	0.41
53	0.41
54	0.41
55	0.36
56	0.29
57	0.21
58	0.15
59	0.13
60	0.11
61	0.1
62	0.11
63	0.09
64	0.09
65	0.07
66	0.07
67	0.08
68	0.09
69	0.13
70	0.13
71	0.14
72	0.15
73	0.15
74	0.17
75	0.18
76	0.21
77	0.21
78	0.21
79	0.21
80	0.21
81	0.23
82	0.24
83	0.3
84	0.27
85	0.26
86	0.37
87	0.38
88	0.39
89	0.47
90	0.55
91	0.58
92	0.66
93	0.68
94	0.63
95	0.72
96	0.79
97	0.79
98	0.79
99	0.8
100	0.82
101	0.8
102	0.84
103	0.83
104	0.77
105	0.77
106	0.76
107	0.72
108	0.66
109	0.69
110	0.65
111	0.66
112	0.71
113	0.72
114	0.72
115	0.7
116	0.66
117	0.67
118	0.73
119	0.73
120	0.75
121	0.75
122	0.76
123	0.81
124	0.87
125	0.78
126	0.68
127	0.6
128	0.55
129	0.52
130	0.48
131	0.47
132	0.44
133	0.47
134	0.49
135	0.52
136	0.52
137	0.5
138	0.46
139	0.45
140	0.43
141	0.43
142	0.45
143	0.39
144	0.34
145	0.29
146	0.28
147	0.22
148	0.21
149	0.18
150	0.21
151	0.26
152	0.29
153	0.28
154	0.29
155	0.29
156	0.29
157	0.3
158	0.25
159	0.2
160	0.16
161	0.19
162	0.21
163	0.22
164	0.23
165	0.24
166	0.26
167	0.32
168	0.32
169	0.3
170	0.27
171	0.28
172	0.3
173	0.33
174	0.31
175	0.26
176	0.25
177	0.24
178	0.23
179	0.2
180	0.15
181	0.1
182	0.08
183	0.05
184	0.06
185	0.06
186	0.06
187	0.06
188	0.07
189	0.08
190	0.14
191	0.15
192	0.17
193	0.19
194	0.19
195	0.19
196	0.2
197	0.2
198	0.16
199	0.16
200	0.14
201	0.12
202	0.12
203	0.11
204	0.12
205	0.12
206	0.11
207	0.09
208	0.09
209	0.09
210	0.09
211	0.1
212	0.14
213	0.16
214	0.18
215	0.18
216	0.21
217	0.22
218	0.25
219	0.26
220	0.22
221	0.21
222	0.2
223	0.2
224	0.18
225	0.17
226	0.15
227	0.12
228	0.1
229	0.07
230	0.06
231	0.06
232	0.05
233	0.08
234	0.08
235	0.13
236	0.13
237	0.13
238	0.14
239	0.14
240	0.16
241	0.16
242	0.15
243	0.13
244	0.13
245	0.13
246	0.12
247	0.12
248	0.1
249	0.09
250	0.09
251	0.09
252	0.09
253	0.12
254	0.21
255	0.28
256	0.34
257	0.37
258	0.4
259	0.43
260	0.51
261	0.53
262	0.54
263	0.54
264	0.54
265	0.53
266	0.51
267	0.48
268	0.39
269	0.35
270	0.28
271	0.25
272	0.25
273	0.25
274	0.25
275	0.29
276	0.34
277	0.42
278	0.49
279	0.52
280	0.53
281	0.57
282	0.61
283	0.61
284	0.66
285	0.59
286	0.55
287	0.49
288	0.44
289	0.38
290	0.31
291	0.27
292	0.2
293	0.19
294	0.19
295	0.25
296	0.23
297	0.25
298	0.25
299	0.25
300	0.25
301	0.24
302	0.2
303	0.17
304	0.18
305	0.19
306	0.23
307	0.29
308	0.31
309	0.33
310	0.37
311	0.39
312	0.42
313	0.45
314	0.43
315	0.37
316	0.38
317	0.38
318	0.33
319	0.28
320	0.23
321	0.18
322	0.17
323	0.18
324	0.14
325	0.11
326	0.11
327	0.12
328	0.13
329	0.13
330	0.12
331	0.15
332	0.15
333	0.19
334	0.2
335	0.2
336	0.22
337	0.21
338	0.22
339	0.19
340	0.2
341	0.17
342	0.2
343	0.2
344	0.22
345	0.22
346	0.25
347	0.25
348	0.24
349	0.26
350	0.23
351	0.22
352	0.18
353	0.21
354	0.17
355	0.18
356	0.17
357	0.14
358	0.15
359	0.15
360	0.15
361	0.11
362	0.1
363	0.08
364	0.06
365	0.07
366	0.06
367	0.06
368	0.08
369	0.09
370	0.09
371	0.1
372	0.11
373	0.12
374	0.12
375	0.11
376	0.11
377	0.13
378	0.16
379	0.17
380	0.16
381	0.16
382	0.17
383	0.19
384	0.19
385	0.17
386	0.15
387	0.13
388	0.14
389	0.15
390	0.14
391	0.12
392	0.11
393	0.1
394	0.1
395	0.1
396	0.12
397	0.1
398	0.09
399	0.13
400	0.13
401	0.16
402	0.16
403	0.16
404	0.13
405	0.13
406	0.14
407	0.13
408	0.14
409	0.13
410	0.13
411	0.18
412	0.21
413	0.22
414	0.21
415	0.21
416	0.23
417	0.3
418	0.31
419	0.29
420	0.27
421	0.26
422	0.29
423	0.28
424	0.28
425	0.27
426	0.27
427	0.31
428	0.39
429	0.48
430	0.54
431	0.61
432	0.66
433	0.67
434	0.7
435	0.7
436	0.7
437	0.7
438	0.64
439	0.58
440	0.5
441	0.47
442	0.42
443	0.38
444	0.31
445	0.23
446	0.19
447	0.21
448	0.21
449	0.16
450	0.16
451	0.14
452	0.12
453	0.11
454	0.1
455	0.07
456	0.05
457	0.05
458	0.04
459	0.04
460	0.04
461	0.03
462	0.03
463	0.04
464	0.05
465	0.05
466	0.05
467	0.06
468	0.07
469	0.08
470	0.09
471	0.09
472	0.08
473	0.09
474	0.09
475	0.09
476	0.08
477	0.08
478	0.07
479	0.07
480	0.07
481	0.05
482	0.06
483	0.06
484	0.07
485	0.07
486	0.07
487	0.07
488	0.07
489	0.07
490	0.06
491	0.07
492	0.06
493	0.08
494	0.08
495	0.09
496	0.09
497	0.14
498	0.17
499	0.16
500	0.22
501	0.25
502	0.25
503	0.25
504	0.27
505	0.3
506	0.29
507	0.28
508	0.27
509	0.25
510	0.31
511	0.4
512	0.46
513	0.46
514	0.48
515	0.5
516	0.47
517	0.46
518	0.42
519	0.39
520	0.34
521	0.27
522	0.27
523	0.26
524	0.28
525	0.26
526	0.23
527	0.18
528	0.16
529	0.2
530	0.19
531	0.19
532	0.17
533	0.17
534	0.17
535	0.17
536	0.17
537	0.11
538	0.1
539	0.09
540	0.08
541	0.08
542	0.09
543	0.08
544	0.07
545	0.08
546	0.1
547	0.12
548	0.14
549	0.14
550	0.13
551	0.13
552	0.13
553	0.12
554	0.09
555	0.07
556	0.06
557	0.09
558	0.09
559	0.09
560	0.09
561	0.09
562	0.12
563	0.13
564	0.14
565	0.13
566	0.15
567	0.16
568	0.16
569	0.17
570	0.15
571	0.17
572	0.24
573	0.25
574	0.31
575	0.38
576	0.39
577	0.43
578	0.43
579	0.42
580	0.39
581	0.37
582	0.36
583	0.34
584	0.34
585	0.31
586	0.35
587	0.34
588	0.31
589	0.3
590	0.26
591	0.26
592	0.25
593	0.28
594	0.27
595	0.33
596	0.32
597	0.34
598	0.34
599	0.3
600	0.3
601	0.27
602	0.25
603	0.19
604	0.19
605	0.15
606	0.13
607	0.12
608	0.11
609	0.1
610	0.1
611	0.12
612	0.12
613	0.16
614	0.17
615	0.16
616	0.19
617	0.19
618	0.18
619	0.16
620	0.18
621	0.17
622	0.16
623	0.16
624	0.14
625	0.17
626	0.18
627	0.18
628	0.15
629	0.14
630	0.13
631	0.13
632	0.12
633	0.1
634	0.09
635	0.09
636	0.11
637	0.11
638	0.12
639	0.12
640	0.11
641	0.09
642	0.11
643	0.11
644	0.09
645	0.09
646	0.08
647	0.08
648	0.08
649	0.08
650	0.06
651	0.06
652	0.05
653	0.08
654	0.11
655	0.12
656	0.13
657	0.16
658	0.17
659	0.18
660	0.27
661	0.27
662	0.28
663	0.28
664	0.3
665	0.29
666	0.33
667	0.37
668	0.3
669	0.28
670	0.25
671	0.26
672	0.23
673	0.22
674	0.22
675	0.17
676	0.19
677	0.22
678	0.22
679	0.23
680	0.23
681	0.25
682	0.23
683	0.3
684	0.31
685	0.36
686	0.47
687	0.54
688	0.62
689	0.66
690	0.7
691	0.65
692	0.67
693	0.6
694	0.54
695	0.44
696	0.36
697	0.29
698	0.22
699	0.21
700	0.14
701	0.18
702	0.14
703	0.15
704	0.2
705	0.2
706	0.2
707	0.22
708	0.26
709	0.22
710	0.23
711	0.21
712	0.16
713	0.15
714	0.14
715	0.11
716	0.06
717	0.05
718	0.04
719	0.04
720	0.04
721	0.05
722	0.05
723	0.06
724	0.12
725	0.13
726	0.13
727	0.19
728	0.24
729	0.32
730	0.4
731	0.48
732	0.43
733	0.47
734	0.5
735	0.51
736	0.53
737	0.54
738	0.52
739	0.5
740	0.51
741	0.52
742	0.57
743	0.61
744	0.61
745	0.62
746	0.65
747	0.65
748	0.74
749	0.78
750	0.8
751	0.78
752	0.79
753	0.79
754	0.76
755	0.73
756	0.64
757	0.57
758	0.47
759	0.41
760	0.38
761	0.34
762	0.29
763	0.28
764	0.29
765	0.28
766	0.29
767	0.3
768	0.29
769	0.27
770	0.26
771	0.26
772	0.24
773	0.22
774	0.23
775	0.2
776	0.17
777	0.22
778	0.29
779	0.34
780	0.39
781	0.46
782	0.53
783	0.62
784	0.7
785	0.7
786	0.72
787	0.72
788	0.78
789	0.74
790	0.7
791	0.61
792	0.52
793	0.48
794	0.37
795	0.32
796	0.22
797	0.19
798	0.16
799	0.16
800	0.15
801	0.15
802	0.15
803	0.14
804	0.15
805	0.15
806	0.13
807	0.14
808	0.14
809	0.11
810	0.11
811	0.1
812	0.09
813	0.11
814	0.14
815	0.16
816	0.17
817	0.17
818	0.17
819	0.19
820	0.2
821	0.17
822	0.15
823	0.14
824	0.17
825	0.17
826	0.15
827	0.14
828	0.13
829	0.12
830	0.11
831	0.1
832	0.07
833	0.07
834	0.07
835	0.07
836	0.09
837	0.1
838	0.11
839	0.16
840	0.23
841	0.3
842	0.4
843	0.49
844	0.54
845	0.61
846	0.7
847	0.75
848	0.73
849	0.68
850	0.62
851	0.55
852	0.49
853	0.42
854	0.32
855	0.23
856	0.22
857	0.23
858	0.23
859	0.26
860	0.27
861	0.31
862	0.36
863	0.38
864	0.4
865	0.43
866	0.45
867	0.43

Q06106

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer