Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

P53861

Protein Details
Accession P53861    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
169-190DHTVYFKKRNTKKTTRLHNEPHHydrophilic
332-355VTANPVTKGHKKKKSGIFVRNAGSHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
343-343K
Subcellular Location(s) nucl 16, cyto_nucl 11, mito 7, cyto 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR001810  F-box_dom  
IPR010684  RNA_pol_II_trans_fac_SIII_A  
Gene Ontology GO:0031463  C:Cul3-RING ubiquitin ligase complex  
GO:0005737  C:cytoplasm  
GO:0070449  C:elongin complex  
GO:0005634  C:nucleus  
GO:0006289  P:nucleotide-excision repair  
GO:0006368  P:transcription elongation by RNA polymerase II  
GO:0006511  P:ubiquitin-dependent protein catabolic process  
KEGG sce:YNL230C  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF06881  Elongin_A  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50181  FBOX  
Amino Acid Sequences MKSLQTLCEISLMRNHSNIQSVSNVPYHLLKRILQKVKIPQLLKLEKSNVLLIFDDDELWLEFLRQDFPTNVHEQFVSKRDIICKYYFDFVKENDIELYHSNQDLLKSCVRQSVVKDIRNNKYRIPYRMLYSKYQQEVEKKQEESAERLRLEMQKLQQEREKKQTIVVDHTVYFKKRNTKKTTRLHNEPHSQLYMKSLKDHESRLKHFKDGGFNIAKRHAQRVAFGGQAGGQSSSPKKGPLSIKPEPVKVNRQMDNVTAEKKDVTQPITPVKKRRSESPSIFLNRKKPALFRPTPKTNAAGSRPHTTAITNDHRTTSHPYPHKDVVTSISSVTANPVTKGHKKKKSGIFVRNAGSDGDSFPHVTATGPTTRPYIYEPRK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.3
2 0.32
3 0.29
4 0.34
5 0.34
6 0.3
7 0.28
8 0.28
9 0.29
10 0.29
11 0.27
12 0.23
13 0.28
14 0.27
15 0.28
16 0.29
17 0.3
18 0.37
19 0.47
20 0.54
21 0.52
22 0.58
23 0.63
24 0.69
25 0.72
26 0.64
27 0.59
28 0.61
29 0.64
30 0.61
31 0.57
32 0.51
33 0.47
34 0.48
35 0.47
36 0.37
37 0.32
38 0.28
39 0.23
40 0.21
41 0.17
42 0.15
43 0.11
44 0.11
45 0.1
46 0.1
47 0.09
48 0.07
49 0.08
50 0.09
51 0.12
52 0.11
53 0.13
54 0.14
55 0.17
56 0.21
57 0.25
58 0.25
59 0.23
60 0.23
61 0.22
62 0.26
63 0.27
64 0.26
65 0.23
66 0.25
67 0.29
68 0.33
69 0.36
70 0.34
71 0.33
72 0.31
73 0.36
74 0.35
75 0.33
76 0.31
77 0.28
78 0.34
79 0.31
80 0.3
81 0.24
82 0.24
83 0.22
84 0.2
85 0.23
86 0.15
87 0.15
88 0.15
89 0.15
90 0.16
91 0.16
92 0.19
93 0.19
94 0.2
95 0.21
96 0.24
97 0.25
98 0.26
99 0.27
100 0.34
101 0.38
102 0.42
103 0.48
104 0.52
105 0.6
106 0.65
107 0.64
108 0.57
109 0.59
110 0.6
111 0.58
112 0.56
113 0.5
114 0.47
115 0.52
116 0.52
117 0.46
118 0.45
119 0.46
120 0.42
121 0.43
122 0.41
123 0.41
124 0.44
125 0.47
126 0.47
127 0.41
128 0.4
129 0.41
130 0.39
131 0.38
132 0.38
133 0.36
134 0.31
135 0.3
136 0.32
137 0.31
138 0.32
139 0.3
140 0.28
141 0.29
142 0.31
143 0.33
144 0.34
145 0.38
146 0.4
147 0.44
148 0.45
149 0.38
150 0.4
151 0.41
152 0.39
153 0.37
154 0.35
155 0.28
156 0.25
157 0.28
158 0.27
159 0.24
160 0.25
161 0.23
162 0.3
163 0.36
164 0.45
165 0.51
166 0.59
167 0.68
168 0.74
169 0.82
170 0.8
171 0.81
172 0.79
173 0.77
174 0.73
175 0.65
176 0.59
177 0.49
178 0.42
179 0.33
180 0.31
181 0.27
182 0.21
183 0.21
184 0.21
185 0.24
186 0.26
187 0.3
188 0.32
189 0.35
190 0.4
191 0.45
192 0.45
193 0.42
194 0.43
195 0.42
196 0.41
197 0.36
198 0.37
199 0.35
200 0.34
201 0.34
202 0.34
203 0.35
204 0.29
205 0.31
206 0.28
207 0.24
208 0.24
209 0.26
210 0.24
211 0.22
212 0.2
213 0.17
214 0.13
215 0.13
216 0.12
217 0.09
218 0.07
219 0.09
220 0.1
221 0.12
222 0.12
223 0.14
224 0.13
225 0.19
226 0.25
227 0.31
228 0.39
229 0.41
230 0.5
231 0.51
232 0.55
233 0.53
234 0.53
235 0.52
236 0.51
237 0.53
238 0.48
239 0.48
240 0.45
241 0.42
242 0.42
243 0.37
244 0.32
245 0.25
246 0.22
247 0.19
248 0.2
249 0.22
250 0.21
251 0.22
252 0.21
253 0.25
254 0.33
255 0.43
256 0.46
257 0.5
258 0.54
259 0.59
260 0.59
261 0.65
262 0.63
263 0.64
264 0.65
265 0.63
266 0.64
267 0.62
268 0.66
269 0.61
270 0.61
271 0.57
272 0.55
273 0.51
274 0.47
275 0.5
276 0.55
277 0.58
278 0.59
279 0.63
280 0.66
281 0.68
282 0.66
283 0.6
284 0.54
285 0.54
286 0.5
287 0.48
288 0.44
289 0.45
290 0.44
291 0.41
292 0.38
293 0.31
294 0.29
295 0.3
296 0.35
297 0.35
298 0.35
299 0.36
300 0.36
301 0.38
302 0.43
303 0.41
304 0.42
305 0.44
306 0.47
307 0.53
308 0.58
309 0.58
310 0.5
311 0.45
312 0.41
313 0.36
314 0.32
315 0.25
316 0.22
317 0.2
318 0.18
319 0.2
320 0.2
321 0.17
322 0.18
323 0.21
324 0.25
325 0.35
326 0.46
327 0.53
328 0.58
329 0.64
330 0.73
331 0.8
332 0.84
333 0.85
334 0.84
335 0.83
336 0.8
337 0.77
338 0.69
339 0.6
340 0.5
341 0.41
342 0.32
343 0.24
344 0.2
345 0.17
346 0.16
347 0.15
348 0.15
349 0.13
350 0.13
351 0.14
352 0.16
353 0.21
354 0.21
355 0.23
356 0.25
357 0.25
358 0.26
359 0.3