FuNGI

P38883

Protein Details

Accession

P38883

Localization Confidence

Low

Confidence Score

9.4

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
477-501	LFKNRKSIMKQQTKTKQSKRSKSAE	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Subcellular Location(s)

nucl 16, cyto_nucl 11, pero 5, cyto 4

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR012583 RIX1_N
Gene Ontology	GO:0005829 C:cytosol GO:0005654 C:nucleoplasm GO:0005634 C:nucleus GO:0097344 C:Rix1 complex GO:0003682 F:chromatin binding GO:0006267 P:pre-replicative complex assembly involved in nuclear cell cycle DNA replication GO:0030174 P:regulation of DNA-templated DNA replication initiation GO:0000027 P:ribosomal large subunit assembly GO:0006364 P:rRNA processing
KEGG	sce:YHR197W -
Pfam	View protein in Pfam PF08167 RIX1

Amino Acid Sequences

MSEEFIAVSTLARNLEIAKGNEFHTILATLRSPVYINEQLLKSELSFLVTKILKLIRSGNDFDLWKGCHTSVVTCAYNPLVLSTHGGQLLAAIYSRLEQKTGFYSSVISSSHGKQLFNTLISSVAIIIDLMKNKPTLSREALVPKLKAIIPTLITLSQYEPELVLPVLQRILKRNTTTFKPFTNKFRTVLINLIISDYASLGTKTQRLVCENFAYLHLLKIQVSDTSDDETQAHHKIYADSNWRTGLMSILSQFKPIIQLCGEILDFEQDNELYKLIKSLPVIDESNNKEEFLPSLKLDFNAPLTLWEIPQRLSLLADMLVAFISLPTPFPIRVPLGGINSLCEVLLGVSNKYLPLKKELRHDNELNGVINTILPQIQFQGIRLWEIMVSKYGKCGLSFFEGILSSIELFIPLKKKSNNEIDFNVVGSLKFEFATVFRLVNMILSHLGHQLNIISVISQLIEVALFLSHDKTLIDSLFKNRKSIMKQQTKTKQSKRSKSAEGAFSDIYTHPELFVCKNSMNWFNEINDFFITALNNWILPSTPHIQILKYSITQSLRLKERFGYIPESFVNLLRCEVLHPGSERVSILPIAISLLKNINDDMFELLCHPKVPVGMVYQLHKPLDLGEDGEVRDDINKKEVETNESSSNANTGLETLKALENLENVTIPEPKHEVPKVVDDTAIFKKRSVEEVIERESTSSHKKVKFVEETTVDNGEELIVKKAVSQTKEEEKPMEDSEDEEQEEFEIPAIELSDDEEEEEEEE

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.11
2	0.17
3	0.22
4	0.23
5	0.25
6	0.26
7	0.27
8	0.31
9	0.3
10	0.25
11	0.21
12	0.2
13	0.17
14	0.18
15	0.18
16	0.15
17	0.15
18	0.16
19	0.15
20	0.15
21	0.22
22	0.25
23	0.26
24	0.3
25	0.31
26	0.31
27	0.32
28	0.31
29	0.24
30	0.22
31	0.2
32	0.17
33	0.17
34	0.16
35	0.22
36	0.22
37	0.22
38	0.23
39	0.26
40	0.24
41	0.26
42	0.33
43	0.31
44	0.36
45	0.4
46	0.37
47	0.39
48	0.39
49	0.38
50	0.37
51	0.32
52	0.28
53	0.28
54	0.25
55	0.24
56	0.24
57	0.24
58	0.24
59	0.28
60	0.27
61	0.24
62	0.26
63	0.23
64	0.23
65	0.21
66	0.18
67	0.13
68	0.12
69	0.16
70	0.16
71	0.18
72	0.17
73	0.17
74	0.15
75	0.14
76	0.14
77	0.11
78	0.09
79	0.06
80	0.06
81	0.08
82	0.13
83	0.13
84	0.13
85	0.13
86	0.16
87	0.21
88	0.24
89	0.23
90	0.19
91	0.2
92	0.2
93	0.23
94	0.21
95	0.18
96	0.18
97	0.2
98	0.27
99	0.28
100	0.27
101	0.24
102	0.31
103	0.32
104	0.3
105	0.28
106	0.21
107	0.19
108	0.19
109	0.19
110	0.12
111	0.08
112	0.07
113	0.06
114	0.07
115	0.08
116	0.11
117	0.11
118	0.13
119	0.14
120	0.14
121	0.19
122	0.21
123	0.24
124	0.27
125	0.29
126	0.33
127	0.39
128	0.46
129	0.46
130	0.43
131	0.38
132	0.36
133	0.35
134	0.31
135	0.27
136	0.24
137	0.2
138	0.21
139	0.22
140	0.19
141	0.18
142	0.18
143	0.17
144	0.14
145	0.13
146	0.12
147	0.1
148	0.09
149	0.1
150	0.09
151	0.1
152	0.09
153	0.09
154	0.12
155	0.13
156	0.15
157	0.2
158	0.26
159	0.3
160	0.33
161	0.38
162	0.41
163	0.46
164	0.52
165	0.5
166	0.51
167	0.53
168	0.54
169	0.58
170	0.61
171	0.58
172	0.52
173	0.53
174	0.5
175	0.44
176	0.43
177	0.36
178	0.29
179	0.25
180	0.24
181	0.19
182	0.15
183	0.13
184	0.09
185	0.07
186	0.06
187	0.06
188	0.06
189	0.09
190	0.11
191	0.13
192	0.17
193	0.2
194	0.23
195	0.26
196	0.28
197	0.29
198	0.28
199	0.27
200	0.24
201	0.25
202	0.21
203	0.19
204	0.16
205	0.14
206	0.13
207	0.13
208	0.13
209	0.1
210	0.11
211	0.12
212	0.12
213	0.14
214	0.14
215	0.14
216	0.14
217	0.14
218	0.16
219	0.16
220	0.16
221	0.14
222	0.14
223	0.16
224	0.18
225	0.23
226	0.28
227	0.28
228	0.29
229	0.29
230	0.28
231	0.26
232	0.23
233	0.19
234	0.11
235	0.11
236	0.11
237	0.16
238	0.15
239	0.16
240	0.16
241	0.14
242	0.19
243	0.18
244	0.18
245	0.13
246	0.14
247	0.13
248	0.15
249	0.15
250	0.1
251	0.1
252	0.09
253	0.08
254	0.07
255	0.08
256	0.06
257	0.08
258	0.08
259	0.09
260	0.08
261	0.07
262	0.09
263	0.09
264	0.11
265	0.1
266	0.12
267	0.13
268	0.16
269	0.17
270	0.17
271	0.23
272	0.25
273	0.29
274	0.26
275	0.25
276	0.22
277	0.21
278	0.21
279	0.18
280	0.17
281	0.13
282	0.15
283	0.15
284	0.15
285	0.15
286	0.15
287	0.13
288	0.11
289	0.11
290	0.09
291	0.1
292	0.1
293	0.1
294	0.12
295	0.12
296	0.12
297	0.13
298	0.13
299	0.11
300	0.11
301	0.11
302	0.08
303	0.07
304	0.07
305	0.06
306	0.05
307	0.05
308	0.04
309	0.04
310	0.03
311	0.03
312	0.03
313	0.03
314	0.04
315	0.06
316	0.06
317	0.07
318	0.09
319	0.1
320	0.1
321	0.12
322	0.14
323	0.14
324	0.16
325	0.15
326	0.13
327	0.13
328	0.12
329	0.1
330	0.07
331	0.06
332	0.04
333	0.06
334	0.06
335	0.06
336	0.06
337	0.07
338	0.07
339	0.09
340	0.11
341	0.1
342	0.17
343	0.22
344	0.25
345	0.34
346	0.42
347	0.47
348	0.51
349	0.51
350	0.45
351	0.44
352	0.42
353	0.34
354	0.25
355	0.18
356	0.12
357	0.11
358	0.09
359	0.06
360	0.05
361	0.04
362	0.05
363	0.05
364	0.07
365	0.07
366	0.07
367	0.1
368	0.1
369	0.1
370	0.1
371	0.1
372	0.09
373	0.09
374	0.09
375	0.09
376	0.1
377	0.09
378	0.1
379	0.13
380	0.12
381	0.12
382	0.12
383	0.12
384	0.14
385	0.14
386	0.13
387	0.12
388	0.11
389	0.12
390	0.11
391	0.09
392	0.06
393	0.05
394	0.05
395	0.04
396	0.05
397	0.06
398	0.09
399	0.1
400	0.15
401	0.17
402	0.21
403	0.27
404	0.37
405	0.39
406	0.39
407	0.4
408	0.39
409	0.37
410	0.34
411	0.28
412	0.18
413	0.14
414	0.11
415	0.1
416	0.06
417	0.06
418	0.06
419	0.05
420	0.06
421	0.09
422	0.1
423	0.1
424	0.09
425	0.09
426	0.09
427	0.1
428	0.1
429	0.07
430	0.07
431	0.07
432	0.08
433	0.11
434	0.11
435	0.09
436	0.1
437	0.09
438	0.08
439	0.08
440	0.07
441	0.04
442	0.04
443	0.05
444	0.04
445	0.04
446	0.04
447	0.03
448	0.03
449	0.03
450	0.03
451	0.03
452	0.03
453	0.03
454	0.05
455	0.05
456	0.05
457	0.05
458	0.06
459	0.07
460	0.07
461	0.09
462	0.1
463	0.18
464	0.26
465	0.27
466	0.27
467	0.28
468	0.34
469	0.37
470	0.46
471	0.49
472	0.52
473	0.56
474	0.65
475	0.72
476	0.76
477	0.8
478	0.79
479	0.79
480	0.78
481	0.84
482	0.82
483	0.8
484	0.76
485	0.74
486	0.71
487	0.66
488	0.57
489	0.51
490	0.43
491	0.35
492	0.31
493	0.24
494	0.2
495	0.16
496	0.14
497	0.11
498	0.12
499	0.13
500	0.13
501	0.15
502	0.15
503	0.14
504	0.16
505	0.19
506	0.25
507	0.26
508	0.27
509	0.26
510	0.25
511	0.29
512	0.27
513	0.25
514	0.19
515	0.17
516	0.15
517	0.14
518	0.13
519	0.09
520	0.1
521	0.09
522	0.09
523	0.08
524	0.08
525	0.07
526	0.07
527	0.12
528	0.13
529	0.14
530	0.18
531	0.19
532	0.19
533	0.21
534	0.23
535	0.22
536	0.19
537	0.19
538	0.2
539	0.21
540	0.26
541	0.29
542	0.32
543	0.37
544	0.37
545	0.38
546	0.35
547	0.38
548	0.35
549	0.34
550	0.34
551	0.27
552	0.29
553	0.27
554	0.28
555	0.24
556	0.23
557	0.23
558	0.17
559	0.17
560	0.14
561	0.14
562	0.12
563	0.15
564	0.14
565	0.14
566	0.16
567	0.18
568	0.18
569	0.19
570	0.19
571	0.16
572	0.16
573	0.14
574	0.12
575	0.09
576	0.08
577	0.08
578	0.1
579	0.09
580	0.09
581	0.12
582	0.13
583	0.14
584	0.14
585	0.13
586	0.12
587	0.12
588	0.13
589	0.1
590	0.09
591	0.11
592	0.12
593	0.12
594	0.12
595	0.12
596	0.11
597	0.11
598	0.13
599	0.13
600	0.13
601	0.18
602	0.2
603	0.22
604	0.25
605	0.28
606	0.27
607	0.25
608	0.22
609	0.18
610	0.19
611	0.17
612	0.14
613	0.12
614	0.15
615	0.15
616	0.16
617	0.14
618	0.12
619	0.15
620	0.17
621	0.16
622	0.2
623	0.21
624	0.21
625	0.28
626	0.3
627	0.33
628	0.34
629	0.37
630	0.34
631	0.35
632	0.34
633	0.28
634	0.27
635	0.21
636	0.16
637	0.12
638	0.1
639	0.1
640	0.09
641	0.09
642	0.1
643	0.11
644	0.12
645	0.13
646	0.13
647	0.13
648	0.13
649	0.14
650	0.13
651	0.12
652	0.13
653	0.16
654	0.14
655	0.17
656	0.2
657	0.21
658	0.28
659	0.29
660	0.32
661	0.32
662	0.4
663	0.41
664	0.37
665	0.37
666	0.3
667	0.33
668	0.38
669	0.42
670	0.34
671	0.31
672	0.36
673	0.37
674	0.41
675	0.41
676	0.38
677	0.39
678	0.45
679	0.49
680	0.45
681	0.42
682	0.38
683	0.34
684	0.33
685	0.32
686	0.33
687	0.37
688	0.39
689	0.44
690	0.49
691	0.58
692	0.62
693	0.58
694	0.59
695	0.54
696	0.54
697	0.53
698	0.49
699	0.39
700	0.3
701	0.27
702	0.19
703	0.19
704	0.15
705	0.15
706	0.13
707	0.13
708	0.15
709	0.22
710	0.28
711	0.27
712	0.31
713	0.35
714	0.44
715	0.5
716	0.52
717	0.48
718	0.45
719	0.47
720	0.45
721	0.41
722	0.32
723	0.29
724	0.29
725	0.3
726	0.28
727	0.24
728	0.21
729	0.18
730	0.19
731	0.17
732	0.13
733	0.1
734	0.09
735	0.09
736	0.1
737	0.09
738	0.08
739	0.1
740	0.11
741	0.1
742	0.11
743	0.11

P38883

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer