Proteins with Predicted NoLSs

Proteins containing predicted nucleolar localization signals available in the database.

P07884

Protein Details
Accession P07884    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
282-304IERMKTRTRQYAKRQVKWIKKMLHydrophilic
392-418KYWKIHLGSRRHKSNLKRNTRQADFEKHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 18.5, cyto_nucl 10.5, mito 7
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR039657  Dimethylallyltransferase  
IPR030666  IPP_transferase_euk  
IPR018022  IPT  
IPR027417  P-loop_NTPase  
Gene Ontology GO:0005829  C:cytosol  
GO:0005739  C:mitochondrion  
GO:0005730  C:nucleolus  
GO:0005634  C:nucleus  
GO:0005524  F:ATP binding  
GO:0046872  F:metal ion binding  
GO:0000049  F:tRNA binding  
GO:0052381  F:tRNA dimethylallyltransferase activity  
GO:0006400  P:tRNA modification  
KEGG sce:YOR274W  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF01715  IPPT  
Amino Acid Sequences MLKGPLKGCLNMSKKVIVIAGTTGVGKSQLSIQLAQKFNGEVINSDSMQVYKDIPIITNKHPLQEREGIPHHVMNHVDWSEEYYSHRFETECMNAIEDIHRRGKIPIVVGGTHYYLQTLFNKRVDTKSSERKLTRKQLDILESTDPDVIYNTLVKCDPDIATKYHPNDYRRVQRMLEIYYKTGKKPSETFNEQKITLKFDTLFLWLYSKPEPLFQRLDDRVDDMLERGALQEIKQLYEYYSQNKFTPEQCENGVWQVIGFKEFLPWLTGKTDDNTVKLEDCIERMKTRTRQYAKRQVKWIKKMLIPDIKGDIYLLDATDLSQWDTNASQRAIAISNDFISNRPIKQERAPKALEELLSKGETTMKKLDDWTHYTCNVCRNADGKNVVAIGEKYWKIHLGSRRHKSNLKRNTRQADFEKWKINKKETVE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.39
2 0.38
3 0.36
4 0.27
5 0.23
6 0.19
7 0.17
8 0.15
9 0.15
10 0.13
11 0.11
12 0.11
13 0.1
14 0.09
15 0.12
16 0.15
17 0.17
18 0.21
19 0.27
20 0.35
21 0.37
22 0.37
23 0.35
24 0.31
25 0.29
26 0.28
27 0.23
28 0.15
29 0.18
30 0.21
31 0.2
32 0.2
33 0.2
34 0.17
35 0.18
36 0.17
37 0.14
38 0.12
39 0.14
40 0.14
41 0.16
42 0.22
43 0.26
44 0.29
45 0.37
46 0.36
47 0.4
48 0.44
49 0.44
50 0.45
51 0.48
52 0.46
53 0.44
54 0.47
55 0.45
56 0.43
57 0.43
58 0.38
59 0.33
60 0.31
61 0.24
62 0.27
63 0.22
64 0.21
65 0.18
66 0.21
67 0.19
68 0.19
69 0.22
70 0.18
71 0.2
72 0.2
73 0.21
74 0.18
75 0.17
76 0.23
77 0.23
78 0.23
79 0.22
80 0.23
81 0.22
82 0.22
83 0.26
84 0.22
85 0.23
86 0.24
87 0.24
88 0.24
89 0.25
90 0.29
91 0.27
92 0.26
93 0.26
94 0.25
95 0.24
96 0.25
97 0.25
98 0.22
99 0.2
100 0.17
101 0.13
102 0.11
103 0.13
104 0.18
105 0.21
106 0.24
107 0.26
108 0.3
109 0.31
110 0.35
111 0.36
112 0.37
113 0.4
114 0.46
115 0.49
116 0.55
117 0.57
118 0.61
119 0.67
120 0.71
121 0.69
122 0.64
123 0.63
124 0.6
125 0.6
126 0.54
127 0.47
128 0.39
129 0.32
130 0.28
131 0.24
132 0.18
133 0.14
134 0.12
135 0.1
136 0.08
137 0.11
138 0.1
139 0.1
140 0.11
141 0.11
142 0.1
143 0.12
144 0.12
145 0.13
146 0.15
147 0.16
148 0.21
149 0.26
150 0.28
151 0.33
152 0.37
153 0.36
154 0.41
155 0.46
156 0.5
157 0.5
158 0.51
159 0.45
160 0.44
161 0.44
162 0.42
163 0.4
164 0.32
165 0.28
166 0.32
167 0.33
168 0.3
169 0.31
170 0.28
171 0.26
172 0.29
173 0.33
174 0.35
175 0.41
176 0.44
177 0.45
178 0.47
179 0.45
180 0.45
181 0.4
182 0.36
183 0.29
184 0.27
185 0.2
186 0.19
187 0.19
188 0.15
189 0.15
190 0.1
191 0.12
192 0.11
193 0.13
194 0.12
195 0.13
196 0.12
197 0.16
198 0.17
199 0.19
200 0.21
201 0.2
202 0.26
203 0.26
204 0.28
205 0.23
206 0.24
207 0.2
208 0.18
209 0.17
210 0.1
211 0.09
212 0.07
213 0.07
214 0.05
215 0.06
216 0.06
217 0.06
218 0.09
219 0.09
220 0.1
221 0.1
222 0.1
223 0.1
224 0.15
225 0.17
226 0.18
227 0.22
228 0.23
229 0.23
230 0.25
231 0.26
232 0.24
233 0.29
234 0.26
235 0.24
236 0.24
237 0.24
238 0.23
239 0.22
240 0.2
241 0.13
242 0.11
243 0.1
244 0.09
245 0.09
246 0.08
247 0.07
248 0.07
249 0.08
250 0.08
251 0.09
252 0.09
253 0.1
254 0.1
255 0.12
256 0.12
257 0.13
258 0.19
259 0.18
260 0.19
261 0.2
262 0.19
263 0.19
264 0.18
265 0.18
266 0.13
267 0.13
268 0.16
269 0.17
270 0.17
271 0.19
272 0.27
273 0.33
274 0.39
275 0.47
276 0.52
277 0.59
278 0.68
279 0.76
280 0.78
281 0.78
282 0.81
283 0.81
284 0.83
285 0.82
286 0.8
287 0.76
288 0.68
289 0.66
290 0.65
291 0.64
292 0.55
293 0.49
294 0.44
295 0.38
296 0.35
297 0.29
298 0.2
299 0.13
300 0.12
301 0.09
302 0.06
303 0.06
304 0.06
305 0.08
306 0.08
307 0.08
308 0.09
309 0.09
310 0.1
311 0.11
312 0.13
313 0.16
314 0.16
315 0.15
316 0.14
317 0.16
318 0.16
319 0.16
320 0.15
321 0.12
322 0.13
323 0.14
324 0.14
325 0.13
326 0.16
327 0.19
328 0.18
329 0.25
330 0.27
331 0.3
332 0.38
333 0.47
334 0.5
335 0.54
336 0.55
337 0.48
338 0.5
339 0.5
340 0.43
341 0.35
342 0.3
343 0.25
344 0.24
345 0.23
346 0.19
347 0.22
348 0.21
349 0.23
350 0.27
351 0.25
352 0.26
353 0.3
354 0.35
355 0.36
356 0.41
357 0.43
358 0.42
359 0.43
360 0.45
361 0.44
362 0.45
363 0.44
364 0.4
365 0.37
366 0.33
367 0.35
368 0.39
369 0.39
370 0.33
371 0.3
372 0.29
373 0.26
374 0.27
375 0.23
376 0.18
377 0.23
378 0.23
379 0.21
380 0.23
381 0.26
382 0.25
383 0.32
384 0.37
385 0.41
386 0.5
387 0.59
388 0.66
389 0.7
390 0.76
391 0.79
392 0.82
393 0.81
394 0.82
395 0.83
396 0.84
397 0.87
398 0.85
399 0.83
400 0.79
401 0.79
402 0.76
403 0.73
404 0.73
405 0.69
406 0.74
407 0.73
408 0.74