Proteins with Predicted NoLSs

Proteins containing predicted nucleolar localization signals available in the database.

Q04177

Protein Details
Accession Q04177    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
260-284LVSSSTKKRGNKSKKSSKKIQIVSKHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
266-279KKRGNKSKKSSKKI
Subcellular Location(s) nucl 18, cyto_nucl 13.333, cyto 6.5, cyto_mito 4.666
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR007148  SSU_processome_Utp12  
IPR015943  WD40/YVTN_repeat-like_dom_sf  
IPR036322  WD40_repeat_dom_sf  
Gene Ontology GO:0005730  C:nucleolus  
GO:0005654  C:nucleoplasm  
GO:0033553  C:rDNA heterochromatin  
GO:0032040  C:small-subunit processome  
GO:0034455  C:t-UTP complex  
GO:0030490  P:maturation of SSU-rRNA  
GO:0000462  P:maturation of SSU-rRNA from tricistronic rRNA transcript (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA)  
GO:0045943  P:positive regulation of transcription by RNA polymerase I  
KEGG sce:YDR398W  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF04003  Utp12  
Amino Acid Sequences MDSPVLQSAYDPSGQYLCYVTVALDKQRVGVQPTQRATSSGVDTVWNENFLYLEDSKLKVTCLKWVNLASSDTVAIILGMNNGEIWLYSVLANEVTYKFTTGNSYEIKDIDLMGNQLWCIDSSDAFYQFDLLQFKLLQHFRINNCVQLNKLTIVPAGDSVAQLLVASHSISLIDIEEKKVVMTFPGHVSPVSTLQVITNEFFISGAEGDRFLNVYDIHSGMTKCVLVAESDIKELSHSGQADSIAVTTEDGSLEIFVDPLVSSSTKKRGNKSKKSSKKIQIVSKDGRKVPIYNAFINKDLLNVSWLQNATMPYFKNLQWREIPNEYTVEISLNWNNKNKSADRDLHGKDLASATNYVEGNARVTSGDNFKHVDDAIKSWERELTSLEQEQAKPPQANELLTETFGDKLESSTVARISGKKTNLKGSNLKTATTTGTVTVILSQALQSNDHSLLETVLNNRDERVIRDTIFRLKPALAVILLERLAERIARQTHRQGPLNVWVKWCLIIHGGYLVSIPNLMSTLSSLHSTLKRRSDLLPRLLALDARLDCTINKFKTLNYEAGDIHSSEPVVEEDEDDVEYNEELDDAGLIEDGEESYGSEEEEEGDSDNEEEQKHTSSKQDGRLETEQSDGEEEAGYSDVEME
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.18
2 0.19
3 0.17
4 0.14
5 0.13
6 0.13
7 0.11
8 0.15
9 0.18
10 0.22
11 0.25
12 0.24
13 0.25
14 0.3
15 0.33
16 0.32
17 0.36
18 0.4
19 0.44
20 0.48
21 0.5
22 0.46
23 0.44
24 0.42
25 0.4
26 0.35
27 0.28
28 0.25
29 0.23
30 0.25
31 0.28
32 0.25
33 0.22
34 0.19
35 0.17
36 0.16
37 0.15
38 0.18
39 0.14
40 0.16
41 0.18
42 0.19
43 0.21
44 0.22
45 0.22
46 0.23
47 0.23
48 0.29
49 0.31
50 0.32
51 0.36
52 0.38
53 0.4
54 0.37
55 0.38
56 0.31
57 0.26
58 0.24
59 0.18
60 0.15
61 0.12
62 0.09
63 0.08
64 0.07
65 0.06
66 0.06
67 0.06
68 0.06
69 0.06
70 0.06
71 0.05
72 0.07
73 0.06
74 0.07
75 0.07
76 0.08
77 0.08
78 0.09
79 0.09
80 0.1
81 0.1
82 0.12
83 0.12
84 0.13
85 0.13
86 0.14
87 0.18
88 0.16
89 0.21
90 0.22
91 0.23
92 0.24
93 0.24
94 0.24
95 0.2
96 0.19
97 0.15
98 0.13
99 0.12
100 0.11
101 0.12
102 0.1
103 0.1
104 0.1
105 0.09
106 0.1
107 0.1
108 0.09
109 0.12
110 0.15
111 0.17
112 0.17
113 0.16
114 0.15
115 0.15
116 0.18
117 0.17
118 0.14
119 0.14
120 0.14
121 0.15
122 0.21
123 0.23
124 0.22
125 0.25
126 0.32
127 0.32
128 0.4
129 0.4
130 0.38
131 0.4
132 0.38
133 0.34
134 0.31
135 0.31
136 0.24
137 0.23
138 0.19
139 0.16
140 0.15
141 0.15
142 0.12
143 0.1
144 0.1
145 0.09
146 0.08
147 0.07
148 0.07
149 0.06
150 0.05
151 0.05
152 0.05
153 0.05
154 0.04
155 0.04
156 0.04
157 0.05
158 0.05
159 0.05
160 0.08
161 0.09
162 0.1
163 0.11
164 0.11
165 0.11
166 0.11
167 0.11
168 0.09
169 0.1
170 0.11
171 0.13
172 0.15
173 0.15
174 0.14
175 0.15
176 0.15
177 0.16
178 0.15
179 0.12
180 0.11
181 0.11
182 0.13
183 0.14
184 0.12
185 0.11
186 0.1
187 0.09
188 0.09
189 0.08
190 0.07
191 0.06
192 0.06
193 0.06
194 0.06
195 0.06
196 0.07
197 0.07
198 0.06
199 0.08
200 0.07
201 0.08
202 0.09
203 0.09
204 0.09
205 0.11
206 0.11
207 0.1
208 0.11
209 0.09
210 0.08
211 0.08
212 0.08
213 0.06
214 0.08
215 0.11
216 0.11
217 0.11
218 0.12
219 0.11
220 0.11
221 0.11
222 0.11
223 0.11
224 0.1
225 0.1
226 0.11
227 0.11
228 0.11
229 0.11
230 0.09
231 0.06
232 0.06
233 0.06
234 0.05
235 0.05
236 0.05
237 0.05
238 0.04
239 0.04
240 0.05
241 0.05
242 0.04
243 0.04
244 0.04
245 0.04
246 0.04
247 0.05
248 0.05
249 0.07
250 0.1
251 0.18
252 0.25
253 0.29
254 0.36
255 0.46
256 0.57
257 0.66
258 0.74
259 0.78
260 0.81
261 0.85
262 0.88
263 0.86
264 0.85
265 0.81
266 0.78
267 0.75
268 0.72
269 0.72
270 0.68
271 0.65
272 0.56
273 0.52
274 0.46
275 0.4
276 0.35
277 0.36
278 0.33
279 0.31
280 0.33
281 0.32
282 0.31
283 0.31
284 0.27
285 0.19
286 0.16
287 0.12
288 0.1
289 0.09
290 0.09
291 0.1
292 0.1
293 0.1
294 0.12
295 0.12
296 0.12
297 0.13
298 0.13
299 0.12
300 0.15
301 0.16
302 0.23
303 0.23
304 0.25
305 0.27
306 0.3
307 0.33
308 0.33
309 0.33
310 0.26
311 0.26
312 0.22
313 0.18
314 0.16
315 0.11
316 0.09
317 0.09
318 0.11
319 0.14
320 0.16
321 0.21
322 0.21
323 0.23
324 0.27
325 0.27
326 0.28
327 0.31
328 0.32
329 0.31
330 0.39
331 0.38
332 0.37
333 0.35
334 0.31
335 0.25
336 0.22
337 0.2
338 0.12
339 0.11
340 0.08
341 0.11
342 0.11
343 0.11
344 0.11
345 0.11
346 0.11
347 0.1
348 0.1
349 0.07
350 0.08
351 0.09
352 0.12
353 0.12
354 0.13
355 0.14
356 0.14
357 0.15
358 0.14
359 0.15
360 0.12
361 0.13
362 0.17
363 0.19
364 0.19
365 0.18
366 0.2
367 0.18
368 0.18
369 0.19
370 0.17
371 0.17
372 0.18
373 0.19
374 0.19
375 0.2
376 0.22
377 0.23
378 0.23
379 0.21
380 0.2
381 0.25
382 0.24
383 0.23
384 0.22
385 0.23
386 0.19
387 0.19
388 0.19
389 0.13
390 0.13
391 0.12
392 0.11
393 0.07
394 0.07
395 0.08
396 0.08
397 0.09
398 0.09
399 0.1
400 0.11
401 0.12
402 0.14
403 0.17
404 0.22
405 0.27
406 0.31
407 0.34
408 0.41
409 0.45
410 0.48
411 0.52
412 0.5
413 0.55
414 0.5
415 0.48
416 0.4
417 0.36
418 0.32
419 0.26
420 0.22
421 0.12
422 0.12
423 0.12
424 0.11
425 0.1
426 0.08
427 0.07
428 0.06
429 0.06
430 0.08
431 0.09
432 0.1
433 0.1
434 0.12
435 0.13
436 0.13
437 0.13
438 0.1
439 0.1
440 0.11
441 0.12
442 0.11
443 0.15
444 0.17
445 0.17
446 0.17
447 0.2
448 0.2
449 0.21
450 0.24
451 0.23
452 0.22
453 0.26
454 0.28
455 0.33
456 0.34
457 0.32
458 0.28
459 0.26
460 0.26
461 0.23
462 0.21
463 0.13
464 0.11
465 0.11
466 0.11
467 0.11
468 0.1
469 0.09
470 0.08
471 0.08
472 0.08
473 0.08
474 0.13
475 0.19
476 0.23
477 0.28
478 0.36
479 0.44
480 0.5
481 0.55
482 0.51
483 0.48
484 0.54
485 0.56
486 0.5
487 0.43
488 0.38
489 0.34
490 0.34
491 0.3
492 0.22
493 0.17
494 0.15
495 0.14
496 0.14
497 0.13
498 0.11
499 0.11
500 0.1
501 0.07
502 0.07
503 0.07
504 0.05
505 0.05
506 0.05
507 0.05
508 0.05
509 0.07
510 0.08
511 0.09
512 0.1
513 0.14
514 0.2
515 0.25
516 0.32
517 0.37
518 0.39
519 0.41
520 0.45
521 0.51
522 0.54
523 0.56
524 0.54
525 0.47
526 0.46
527 0.44
528 0.39
529 0.29
530 0.27
531 0.2
532 0.18
533 0.18
534 0.17
535 0.16
536 0.23
537 0.3
538 0.26
539 0.3
540 0.28
541 0.29
542 0.38
543 0.41
544 0.4
545 0.33
546 0.35
547 0.31
548 0.34
549 0.34
550 0.25
551 0.23
552 0.18
553 0.16
554 0.12
555 0.13
556 0.11
557 0.12
558 0.11
559 0.11
560 0.11
561 0.12
562 0.12
563 0.11
564 0.11
565 0.1
566 0.09
567 0.09
568 0.08
569 0.07
570 0.06
571 0.06
572 0.05
573 0.05
574 0.05
575 0.05
576 0.05
577 0.05
578 0.05
579 0.05
580 0.05
581 0.05
582 0.05
583 0.07
584 0.07
585 0.07
586 0.07
587 0.07
588 0.09
589 0.1
590 0.1
591 0.1
592 0.1
593 0.11
594 0.11
595 0.13
596 0.13
597 0.13
598 0.14
599 0.15
600 0.19
601 0.21
602 0.22
603 0.27
604 0.33
605 0.4
606 0.48
607 0.54
608 0.52
609 0.58
610 0.61
611 0.59
612 0.51
613 0.47
614 0.38
615 0.31
616 0.31
617 0.23
618 0.19
619 0.15
620 0.13
621 0.11
622 0.11
623 0.1