FuNGI

P53972

Protein Details

Accession

P53972

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

12.3

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
28-51	QTLVLKSCKRYKLKSNPKHIYAVL	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Subcellular Location(s)

nucl 19, cyto 7

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR001678 MeTrfase_RsmB/NOP2 IPR023267 RCMT IPR029063 SAM-dependent_MTases_sf
Gene Ontology	GO:0005730 C:nucleolus GO:0005634 C:nucleus GO:0003723 F:RNA binding GO:0009383 F:rRNA (cytosine-C5-)-methyltransferase activity GO:0070475 P:rRNA base methylation
KEGG	sce:YNL022C -
Pfam	View protein in Pfam PF01189 Methyltr_RsmB-F
PROSITE	View protein in PROSITE PS51686 SAM_MT_RSMB_NOP

Amino Acid Sequences

MNFYRDATWVLEDIEKEAAKERISGSMQTLVLKSCKRYKLKSNPKHIYAVLDSCWKYKPYLEKVMKKAHILEDIPKKKGKPLFSRLTLLLLCHDLLLSKQKRIQMGKHPIKDYVLKFKSPLHSEMVKLKLKLKVRELSELVLSEDISNDLPPVRWIRINPLKCHPNGETEPVLAELRKKFTLKVDKWSELVPGSIYYDEFIPNLFGIHPSDKITAHELYKHGKIIIQDRASCFPAHILNPGPSDIVIDSCSAPGNKTTHTASYIYPEPPKDNNTRIYAFEKDPERAKVLQKMIKIAGCSPNISVNVGDFTKLATPEKYKDVTCFIVDPSCSGSGIFGRKFFDSFNRRKIDDKDDDGGIVPDEQEEFIAKEELQTRLAKLSSFQFQMVKHAMSFPAAKKIVYSTCSIHAEENERVVIDLLLDKSVREWGWKVAPKREVIPSWPRRGKVEEFEEVFRDGVTYDPQQLAEGCIRALPKSDGGIGFFAVCFERD

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.22
2	0.2
3	0.19
4	0.22
5	0.23
6	0.21
7	0.24
8	0.23
9	0.25
10	0.28
11	0.29
12	0.27
13	0.3
14	0.3
15	0.3
16	0.3
17	0.26
18	0.29
19	0.31
20	0.34
21	0.37
22	0.46
23	0.51
24	0.58
25	0.66
26	0.71
27	0.79
28	0.83
29	0.86
30	0.86
31	0.83
32	0.81
33	0.71
34	0.65
35	0.59
36	0.52
37	0.44
38	0.42
39	0.39
40	0.35
41	0.37
42	0.32
43	0.29
44	0.31
45	0.38
46	0.38
47	0.48
48	0.56
49	0.62
50	0.68
51	0.77
52	0.75
53	0.68
54	0.64
55	0.58
56	0.54
57	0.47
58	0.48
59	0.49
60	0.51
61	0.53
62	0.52
63	0.49
64	0.5
65	0.54
66	0.55
67	0.54
68	0.57
69	0.62
70	0.63
71	0.67
72	0.6
73	0.59
74	0.49
75	0.4
76	0.32
77	0.24
78	0.19
79	0.15
80	0.14
81	0.09
82	0.1
83	0.2
84	0.21
85	0.24
86	0.27
87	0.31
88	0.38
89	0.43
90	0.49
91	0.49
92	0.58
93	0.63
94	0.67
95	0.65
96	0.6
97	0.58
98	0.59
99	0.52
100	0.51
101	0.45
102	0.39
103	0.39
104	0.42
105	0.46
106	0.43
107	0.41
108	0.36
109	0.35
110	0.37
111	0.42
112	0.44
113	0.41
114	0.38
115	0.4
116	0.41
117	0.45
118	0.48
119	0.49
120	0.48
121	0.46
122	0.51
123	0.48
124	0.44
125	0.38
126	0.33
127	0.27
128	0.2
129	0.18
130	0.11
131	0.1
132	0.09
133	0.08
134	0.07
135	0.07
136	0.07
137	0.07
138	0.09
139	0.12
140	0.13
141	0.15
142	0.16
143	0.26
144	0.35
145	0.4
146	0.42
147	0.47
148	0.51
149	0.49
150	0.54
151	0.45
152	0.43
153	0.4
154	0.4
155	0.33
156	0.27
157	0.27
158	0.23
159	0.22
160	0.15
161	0.17
162	0.15
163	0.17
164	0.2
165	0.2
166	0.2
167	0.28
168	0.39
169	0.37
170	0.44
171	0.47
172	0.47
173	0.47
174	0.46
175	0.39
176	0.29
177	0.27
178	0.17
179	0.11
180	0.1
181	0.09
182	0.09
183	0.07
184	0.07
185	0.07
186	0.07
187	0.06
188	0.06
189	0.05
190	0.06
191	0.06
192	0.06
193	0.08
194	0.09
195	0.1
196	0.11
197	0.13
198	0.13
199	0.14
200	0.17
201	0.17
202	0.16
203	0.18
204	0.18
205	0.2
206	0.21
207	0.21
208	0.17
209	0.17
210	0.19
211	0.21
212	0.26
213	0.25
214	0.26
215	0.27
216	0.29
217	0.28
218	0.26
219	0.21
220	0.16
221	0.15
222	0.14
223	0.14
224	0.13
225	0.13
226	0.14
227	0.14
228	0.13
229	0.1
230	0.1
231	0.08
232	0.07
233	0.06
234	0.06
235	0.06
236	0.06
237	0.07
238	0.07
239	0.07
240	0.1
241	0.1
242	0.1
243	0.13
244	0.14
245	0.14
246	0.16
247	0.17
248	0.15
249	0.17
250	0.19
251	0.19
252	0.2
253	0.2
254	0.21
255	0.21
256	0.26
257	0.27
258	0.28
259	0.3
260	0.32
261	0.33
262	0.32
263	0.34
264	0.33
265	0.29
266	0.3
267	0.28
268	0.26
269	0.27
270	0.26
271	0.26
272	0.26
273	0.28
274	0.3
275	0.34
276	0.35
277	0.34
278	0.35
279	0.34
280	0.32
281	0.3
282	0.26
283	0.25
284	0.23
285	0.23
286	0.2
287	0.21
288	0.2
289	0.2
290	0.17
291	0.11
292	0.13
293	0.12
294	0.12
295	0.08
296	0.08
297	0.1
298	0.11
299	0.12
300	0.12
301	0.15
302	0.17
303	0.22
304	0.24
305	0.22
306	0.23
307	0.26
308	0.25
309	0.23
310	0.22
311	0.18
312	0.18
313	0.18
314	0.16
315	0.15
316	0.14
317	0.13
318	0.12
319	0.11
320	0.12
321	0.17
322	0.18
323	0.17
324	0.18
325	0.19
326	0.2
327	0.2
328	0.26
329	0.31
330	0.36
331	0.43
332	0.46
333	0.47
334	0.51
335	0.55
336	0.55
337	0.53
338	0.51
339	0.45
340	0.41
341	0.4
342	0.36
343	0.31
344	0.22
345	0.15
346	0.1
347	0.07
348	0.07
349	0.07
350	0.06
351	0.07
352	0.07
353	0.08
354	0.09
355	0.08
356	0.11
357	0.14
358	0.16
359	0.18
360	0.19
361	0.18
362	0.2
363	0.21
364	0.18
365	0.17
366	0.2
367	0.22
368	0.22
369	0.23
370	0.24
371	0.23
372	0.29
373	0.3
374	0.27
375	0.22
376	0.23
377	0.21
378	0.2
379	0.24
380	0.2
381	0.26
382	0.26
383	0.25
384	0.24
385	0.28
386	0.29
387	0.27
388	0.28
389	0.22
390	0.27
391	0.3
392	0.31
393	0.28
394	0.28
395	0.31
396	0.3
397	0.29
398	0.24
399	0.21
400	0.2
401	0.19
402	0.15
403	0.1
404	0.12
405	0.1
406	0.12
407	0.12
408	0.11
409	0.11
410	0.16
411	0.15
412	0.16
413	0.17
414	0.21
415	0.3
416	0.38
417	0.43
418	0.47
419	0.52
420	0.51
421	0.54
422	0.56
423	0.5
424	0.5
425	0.55
426	0.56
427	0.62
428	0.65
429	0.62
430	0.6
431	0.63
432	0.62
433	0.6
434	0.58
435	0.55
436	0.52
437	0.53
438	0.5
439	0.45
440	0.39
441	0.29
442	0.23
443	0.15
444	0.13
445	0.15
446	0.15
447	0.17
448	0.19
449	0.19
450	0.2
451	0.2
452	0.22
453	0.21
454	0.2
455	0.16
456	0.17
457	0.18
458	0.18
459	0.21
460	0.2
461	0.19
462	0.2
463	0.25
464	0.23
465	0.25
466	0.25
467	0.22
468	0.2
469	0.17
470	0.16

P53972

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer