Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

P34161

Protein Details
Accession P34161    Localization Confidence High Confidence Score 15.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
349-376KRPVSNPSGSPKRKRKFGFKIVDQQPLKHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
173-182APLARRKRRR
347-364KAKRPVSNPSGSPKRKRK
Subcellular Location(s) nucl 21.5, cyto_nucl 15.5, cyto 4.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR009057  Homeobox-like_sf  
IPR017970  Homeobox_CS  
IPR001356  Homeobox_dom  
Gene Ontology GO:0000785  C:chromatin  
GO:0005737  C:cytoplasm  
GO:0005634  C:nucleus  
GO:0000981  F:DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific  
GO:0000978  F:RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding  
GO:0000977  F:RNA polymerase II transcription regulatory region sequence-specific DNA binding  
GO:0043565  F:sequence-specific DNA binding  
GO:0030154  P:cell differentiation  
GO:0071930  P:negative regulation of transcription involved in G1/S transition of mitotic cell cycle  
GO:0006357  P:regulation of transcription by RNA polymerase II  
KEGG sce:YML027W  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00046  Homeodomain  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS00027  HOMEOBOX_1  
PS50071  HOMEOBOX_2  
CDD cd00086  homeodomain  
Amino Acid Sequences MSQETKMLPSLSSLLSGTEISSSPVSPSFTNPRTSFHLDDRGTIKLPPLNTSINRPRSVESALRHTVTSLHENSSAYGDDMLKHTQSDSALSSQLNSSQETVDESHENLLLTPLNSKKRDYSVSSKKNDILTPLSAAKSIIIPSASKEKRRAFAFITHSQETFPKKEPKIDNAPLARRKRRRTSSQELSILQAEFEKCPAPSKEKRIELAESCHMTEKAVQIWFQNKRQAVKRQRIATSKSTTIIQTVSPPSPPLDVHATPLASRVKADILRDGSSCSRSSSSSPLENTPPRPHHSLNRRSSTPSIKRSQALTFHLNPQKKTLTPVKTSPNSRVNKLINSIDHSPSKAKRPVSNPSGSPKRKRKFGFKIVDQQPLKDLDPNAFRG
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.14
2 0.15
3 0.15
4 0.13
5 0.12
6 0.11
7 0.12
8 0.13
9 0.13
10 0.13
11 0.15
12 0.18
13 0.17
14 0.23
15 0.3
16 0.32
17 0.4
18 0.39
19 0.41
20 0.46
21 0.52
22 0.5
23 0.47
24 0.53
25 0.46
26 0.49
27 0.47
28 0.43
29 0.38
30 0.34
31 0.32
32 0.26
33 0.26
34 0.24
35 0.26
36 0.29
37 0.3
38 0.39
39 0.45
40 0.49
41 0.51
42 0.5
43 0.48
44 0.44
45 0.48
46 0.44
47 0.38
48 0.39
49 0.41
50 0.4
51 0.37
52 0.34
53 0.32
54 0.3
55 0.32
56 0.26
57 0.25
58 0.26
59 0.26
60 0.26
61 0.25
62 0.22
63 0.16
64 0.15
65 0.13
66 0.12
67 0.14
68 0.16
69 0.14
70 0.14
71 0.14
72 0.14
73 0.14
74 0.15
75 0.15
76 0.14
77 0.16
78 0.15
79 0.16
80 0.14
81 0.18
82 0.17
83 0.16
84 0.15
85 0.13
86 0.14
87 0.15
88 0.16
89 0.15
90 0.14
91 0.14
92 0.14
93 0.15
94 0.14
95 0.12
96 0.12
97 0.1
98 0.09
99 0.13
100 0.18
101 0.24
102 0.26
103 0.28
104 0.3
105 0.33
106 0.38
107 0.39
108 0.44
109 0.48
110 0.56
111 0.58
112 0.58
113 0.57
114 0.55
115 0.5
116 0.43
117 0.36
118 0.27
119 0.27
120 0.25
121 0.22
122 0.19
123 0.18
124 0.15
125 0.13
126 0.12
127 0.1
128 0.08
129 0.08
130 0.1
131 0.2
132 0.23
133 0.26
134 0.33
135 0.36
136 0.41
137 0.43
138 0.45
139 0.37
140 0.42
141 0.45
142 0.44
143 0.46
144 0.41
145 0.39
146 0.37
147 0.38
148 0.34
149 0.3
150 0.3
151 0.32
152 0.32
153 0.4
154 0.42
155 0.45
156 0.5
157 0.51
158 0.51
159 0.48
160 0.55
161 0.55
162 0.6
163 0.63
164 0.62
165 0.66
166 0.7
167 0.72
168 0.75
169 0.76
170 0.77
171 0.77
172 0.76
173 0.72
174 0.63
175 0.56
176 0.48
177 0.38
178 0.28
179 0.21
180 0.14
181 0.1
182 0.1
183 0.09
184 0.07
185 0.11
186 0.13
187 0.19
188 0.24
189 0.32
190 0.39
191 0.41
192 0.43
193 0.43
194 0.44
195 0.39
196 0.38
197 0.34
198 0.28
199 0.25
200 0.25
201 0.22
202 0.18
203 0.18
204 0.15
205 0.14
206 0.14
207 0.14
208 0.14
209 0.22
210 0.26
211 0.28
212 0.33
213 0.32
214 0.36
215 0.43
216 0.51
217 0.54
218 0.59
219 0.62
220 0.63
221 0.67
222 0.68
223 0.66
224 0.63
225 0.58
226 0.5
227 0.44
228 0.39
229 0.33
230 0.28
231 0.24
232 0.17
233 0.16
234 0.17
235 0.17
236 0.16
237 0.16
238 0.16
239 0.17
240 0.16
241 0.15
242 0.18
243 0.18
244 0.2
245 0.21
246 0.21
247 0.19
248 0.24
249 0.22
250 0.16
251 0.16
252 0.14
253 0.16
254 0.18
255 0.19
256 0.21
257 0.22
258 0.23
259 0.23
260 0.25
261 0.24
262 0.24
263 0.24
264 0.2
265 0.19
266 0.19
267 0.21
268 0.24
269 0.26
270 0.29
271 0.3
272 0.31
273 0.37
274 0.41
275 0.44
276 0.46
277 0.47
278 0.47
279 0.51
280 0.51
281 0.54
282 0.59
283 0.64
284 0.65
285 0.68
286 0.65
287 0.64
288 0.66
289 0.67
290 0.66
291 0.63
292 0.61
293 0.58
294 0.58
295 0.56
296 0.56
297 0.51
298 0.48
299 0.46
300 0.43
301 0.48
302 0.53
303 0.54
304 0.5
305 0.49
306 0.49
307 0.42
308 0.46
309 0.46
310 0.46
311 0.47
312 0.52
313 0.57
314 0.6
315 0.63
316 0.65
317 0.65
318 0.63
319 0.6
320 0.63
321 0.57
322 0.54
323 0.55
324 0.52
325 0.46
326 0.47
327 0.48
328 0.44
329 0.42
330 0.4
331 0.42
332 0.41
333 0.46
334 0.47
335 0.49
336 0.51
337 0.56
338 0.63
339 0.64
340 0.67
341 0.63
342 0.66
343 0.72
344 0.72
345 0.76
346 0.77
347 0.77
348 0.8
349 0.83
350 0.84
351 0.84
352 0.86
353 0.86
354 0.84
355 0.87
356 0.84
357 0.86
358 0.76
359 0.67
360 0.6
361 0.53
362 0.46
363 0.41
364 0.35
365 0.32