FuNGI

P20448

Protein Details

Accession

P20448

Localization Confidence

High

Confidence Score

21.4

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
1-22	MAKKNRLNTTQRKTLRQKEDEY	Hydrophilic
524-543	EDKSKQPRTKYDKMFERKNQ	Hydrophilic
658-685	NIDKQVAKEKKQEKKRKRLEAMRREMEA	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
412-428	RKIEPGKLNIKQSKKKS
665-677	KEKKQEKKRKRLE

Subcellular Location(s)

nucl 24.5, cyto_nucl 13.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR011545 DEAD/DEAH_box_helicase_dom IPR025313 DUF4217 IPR014001 Helicase_ATP-bd IPR001650 Helicase_C IPR027417 P-loop_NTPase IPR000629 RNA-helicase_DEAD-box_CS IPR014014 RNA_helicase_DEAD_Q_motif
Gene Ontology	GO:0005730 C:nucleolus GO:0005634 C:nucleus GO:0032040 C:small-subunit processome GO:0005524 F:ATP binding GO:0016887 F:ATP hydrolysis activity GO:0008186 F:ATP-dependent activity, acting on RNA GO:0042802 F:identical protein binding GO:0003723 F:RNA binding GO:0003724 F:RNA helicase activity GO:0030490 P:maturation of SSU-rRNA GO:0006364 P:rRNA processing
KEGG	sce:YJL033W -
Pfam	View protein in Pfam PF00270 DEAD PF13959 DUF4217 PF00271 Helicase_C
PROSITE	View protein in PROSITE PS00039 DEAD_ATP_HELICASE PS51192 HELICASE_ATP_BIND_1 PS51194 HELICASE_CTER PS51195 Q_MOTIF
CDD	cd17941 DEADc_DDX10 cd18787 SF2_C_DEAD

Amino Acid Sequences

MAKKNRLNTTQRKTLRQKEDEYIENLKTKIDEYDPKITKAKFFKDLPISDPTLKGLRESSFIKLTEIQADSIPVSLQGHDVLAAAKTGSGKTLAFLVPVIEKLYREKWTEFDGLGALIISPTRELAMQIYEVLTKIGSHTSFSAGLVIGGKDVKFELERISRINILIGTPGRILQHLDQAVGLNTSNLQMLVLDEADRCLDMGFKKTLDAIVSTLSPSRQTLLFSATQSQSVADLARLSLTDYKTVGTHDVMDGSVNKEASTPETLQQFYIEVPLADKLDILFSFIKSHLKCKMIVFLSSSKQVHFVYETFRKMQPGISLMHLHGRQKQRARTETLDKFNRAQQVCLFATDVVARGIDFPAVDWVVQVDCPEDVDTYIHRVGRCARYGKKGKSLIMLTPQEQEAFLKRLNARKIEPGKLNIKQSKKKSIKPQLQSLLFKDPELKYLGQKAFISYVRSIYVQKDKQVFKFDELPTEEFAYSLGLPGAPKIKMKGMKTIEQAKERKNAPRQLAFLSKANEDGEVIEDKSKQPRTKYDKMFERKNQTILSEHYLNITKAQAQEDEDDDFISVKRKDHEINEAELPALTLPTSRRAQKKALSKKASLASKGNASKLIFDDEGEAHPVYELEDEEEFHKRGDAEVQKTEFLTKESAVMADIDNIDKQVAKEKKQEKKRKRLEAMRREMEAAMEEEISGDEEEGKTVAYLGTGNLSDDMSDGDMPDSEGHLKKKARTVDYSHGHNPSNSVDDDIIEVEEPQTLEDLESLTAKLIQG

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.85
2	0.85
3	0.82
4	0.8
5	0.77
6	0.77
7	0.71
8	0.67
9	0.62
10	0.55
11	0.52
12	0.45
13	0.38
14	0.32
15	0.28
16	0.26
17	0.27
18	0.32
19	0.34
20	0.45
21	0.46
22	0.5
23	0.56
24	0.53
25	0.55
26	0.55
27	0.55
28	0.53
29	0.52
30	0.57
31	0.59
32	0.61
33	0.56
34	0.54
35	0.53
36	0.47
37	0.45
38	0.39
39	0.35
40	0.33
41	0.31
42	0.28
43	0.24
44	0.27
45	0.28
46	0.3
47	0.3
48	0.3
49	0.32
50	0.31
51	0.31
52	0.33
53	0.32
54	0.28
55	0.23
56	0.24
57	0.21
58	0.18
59	0.16
60	0.11
61	0.11
62	0.1
63	0.1
64	0.09
65	0.09
66	0.09
67	0.09
68	0.09
69	0.08
70	0.08
71	0.07
72	0.08
73	0.09
74	0.09
75	0.09
76	0.1
77	0.1
78	0.1
79	0.14
80	0.13
81	0.12
82	0.12
83	0.13
84	0.12
85	0.13
86	0.15
87	0.12
88	0.13
89	0.18
90	0.23
91	0.26
92	0.29
93	0.3
94	0.3
95	0.34
96	0.36
97	0.32
98	0.28
99	0.23
100	0.19
101	0.17
102	0.15
103	0.09
104	0.06
105	0.06
106	0.05
107	0.05
108	0.05
109	0.06
110	0.06
111	0.06
112	0.08
113	0.09
114	0.1
115	0.1
116	0.11
117	0.11
118	0.11
119	0.1
120	0.09
121	0.07
122	0.08
123	0.11
124	0.11
125	0.12
126	0.13
127	0.15
128	0.16
129	0.16
130	0.16
131	0.12
132	0.12
133	0.12
134	0.11
135	0.09
136	0.1
137	0.09
138	0.09
139	0.09
140	0.1
141	0.1
142	0.11
143	0.16
144	0.19
145	0.21
146	0.23
147	0.26
148	0.25
149	0.25
150	0.25
151	0.19
152	0.15
153	0.18
154	0.16
155	0.15
156	0.14
157	0.15
158	0.14
159	0.14
160	0.17
161	0.14
162	0.2
163	0.19
164	0.19
165	0.18
166	0.18
167	0.18
168	0.16
169	0.14
170	0.08
171	0.07
172	0.08
173	0.07
174	0.06
175	0.06
176	0.05
177	0.05
178	0.06
179	0.06
180	0.06
181	0.06
182	0.07
183	0.07
184	0.07
185	0.07
186	0.06
187	0.08
188	0.09
189	0.13
190	0.14
191	0.14
192	0.15
193	0.15
194	0.16
195	0.15
196	0.14
197	0.11
198	0.1
199	0.11
200	0.11
201	0.11
202	0.11
203	0.11
204	0.1
205	0.11
206	0.11
207	0.12
208	0.12
209	0.15
210	0.17
211	0.17
212	0.22
213	0.21
214	0.2
215	0.19
216	0.18
217	0.14
218	0.13
219	0.12
220	0.07
221	0.07
222	0.06
223	0.07
224	0.06
225	0.08
226	0.11
227	0.12
228	0.13
229	0.13
230	0.14
231	0.14
232	0.15
233	0.15
234	0.11
235	0.11
236	0.1
237	0.1
238	0.1
239	0.1
240	0.1
241	0.1
242	0.11
243	0.1
244	0.1
245	0.1
246	0.1
247	0.12
248	0.15
249	0.14
250	0.16
251	0.19
252	0.19
253	0.19
254	0.19
255	0.17
256	0.13
257	0.13
258	0.1
259	0.07
260	0.07
261	0.08
262	0.09
263	0.08
264	0.08
265	0.06
266	0.08
267	0.08
268	0.1
269	0.09
270	0.09
271	0.11
272	0.12
273	0.18
274	0.17
275	0.21
276	0.24
277	0.25
278	0.26
279	0.26
280	0.32
281	0.27
282	0.28
283	0.27
284	0.26
285	0.26
286	0.3
287	0.29
288	0.22
289	0.24
290	0.23
291	0.21
292	0.19
293	0.17
294	0.18
295	0.23
296	0.25
297	0.25
298	0.26
299	0.26
300	0.25
301	0.25
302	0.21
303	0.18
304	0.17
305	0.16
306	0.17
307	0.16
308	0.21
309	0.21
310	0.21
311	0.25
312	0.3
313	0.34
314	0.39
315	0.44
316	0.47
317	0.5
318	0.54
319	0.52
320	0.55
321	0.56
322	0.58
323	0.57
324	0.51
325	0.49
326	0.46
327	0.48
328	0.39
329	0.34
330	0.27
331	0.28
332	0.26
333	0.25
334	0.22
335	0.14
336	0.15
337	0.13
338	0.13
339	0.07
340	0.06
341	0.05
342	0.05
343	0.06
344	0.05
345	0.05
346	0.04
347	0.06
348	0.06
349	0.06
350	0.05
351	0.05
352	0.05
353	0.05
354	0.05
355	0.04
356	0.04
357	0.05
358	0.05
359	0.05
360	0.05
361	0.06
362	0.06
363	0.09
364	0.11
365	0.12
366	0.12
367	0.13
368	0.18
369	0.21
370	0.24
371	0.27
372	0.29
373	0.36
374	0.45
375	0.47
376	0.5
377	0.5
378	0.48
379	0.47
380	0.45
381	0.38
382	0.37
383	0.35
384	0.27
385	0.25
386	0.24
387	0.19
388	0.18
389	0.16
390	0.11
391	0.12
392	0.11
393	0.15
394	0.17
395	0.23
396	0.27
397	0.29
398	0.28
399	0.35
400	0.39
401	0.4
402	0.41
403	0.4
404	0.43
405	0.44
406	0.5
407	0.48
408	0.51
409	0.53
410	0.55
411	0.61
412	0.62
413	0.65
414	0.68
415	0.72
416	0.73
417	0.71
418	0.74
419	0.71
420	0.7
421	0.65
422	0.57
423	0.54
424	0.45
425	0.39
426	0.36
427	0.28
428	0.25
429	0.25
430	0.23
431	0.18
432	0.25
433	0.26
434	0.23
435	0.23
436	0.21
437	0.22
438	0.23
439	0.24
440	0.17
441	0.18
442	0.16
443	0.17
444	0.18
445	0.18
446	0.25
447	0.24
448	0.28
449	0.34
450	0.36
451	0.39
452	0.44
453	0.42
454	0.36
455	0.43
456	0.38
457	0.37
458	0.37
459	0.35
460	0.29
461	0.3
462	0.26
463	0.18
464	0.18
465	0.13
466	0.1
467	0.08
468	0.07
469	0.05
470	0.05
471	0.07
472	0.1
473	0.09
474	0.1
475	0.11
476	0.17
477	0.22
478	0.24
479	0.32
480	0.33
481	0.38
482	0.43
483	0.5
484	0.5
485	0.53
486	0.56
487	0.52
488	0.54
489	0.53
490	0.56
491	0.55
492	0.57
493	0.55
494	0.55
495	0.53
496	0.51
497	0.53
498	0.47
499	0.43
500	0.38
501	0.32
502	0.28
503	0.26
504	0.22
505	0.16
506	0.14
507	0.12
508	0.11
509	0.11
510	0.11
511	0.12
512	0.13
513	0.21
514	0.27
515	0.29
516	0.32
517	0.41
518	0.49
519	0.58
520	0.65
521	0.67
522	0.7
523	0.74
524	0.8
525	0.78
526	0.78
527	0.72
528	0.67
529	0.59
530	0.51
531	0.46
532	0.4
533	0.38
534	0.31
535	0.27
536	0.26
537	0.27
538	0.25
539	0.23
540	0.2
541	0.17
542	0.17
543	0.18
544	0.17
545	0.16
546	0.18
547	0.18
548	0.19
549	0.16
550	0.15
551	0.13
552	0.12
553	0.11
554	0.15
555	0.14
556	0.15
557	0.18
558	0.21
559	0.25
560	0.28
561	0.36
562	0.34
563	0.36
564	0.37
565	0.34
566	0.31
567	0.27
568	0.24
569	0.14
570	0.11
571	0.07
572	0.07
573	0.08
574	0.14
575	0.18
576	0.25
577	0.31
578	0.36
579	0.43
580	0.48
581	0.57
582	0.62
583	0.69
584	0.69
585	0.64
586	0.66
587	0.67
588	0.65
589	0.59
590	0.52
591	0.45
592	0.47
593	0.48
594	0.42
595	0.39
596	0.34
597	0.32
598	0.3
599	0.31
600	0.23
601	0.2
602	0.21
603	0.18
604	0.19
605	0.19
606	0.17
607	0.13
608	0.13
609	0.12
610	0.1
611	0.1
612	0.09
613	0.08
614	0.09
615	0.1
616	0.12
617	0.16
618	0.16
619	0.15
620	0.17
621	0.15
622	0.15
623	0.23
624	0.28
625	0.29
626	0.35
627	0.37
628	0.37
629	0.37
630	0.38
631	0.3
632	0.25
633	0.22
634	0.16
635	0.16
636	0.15
637	0.15
638	0.13
639	0.13
640	0.12
641	0.12
642	0.12
643	0.11
644	0.11
645	0.11
646	0.11
647	0.11
648	0.12
649	0.19
650	0.24
651	0.29
652	0.38
653	0.47
654	0.57
655	0.67
656	0.78
657	0.79
658	0.84
659	0.9
660	0.91
661	0.92
662	0.93
663	0.93
664	0.93
665	0.93
666	0.87
667	0.79
668	0.7
669	0.6
670	0.5
671	0.4
672	0.31
673	0.21
674	0.15
675	0.12
676	0.1
677	0.1
678	0.11
679	0.09
680	0.08
681	0.08
682	0.08
683	0.09
684	0.08
685	0.08
686	0.07
687	0.07
688	0.07
689	0.06
690	0.06
691	0.06
692	0.09
693	0.09
694	0.1
695	0.1
696	0.1
697	0.1
698	0.09
699	0.1
700	0.09
701	0.09
702	0.09
703	0.08
704	0.09
705	0.1
706	0.1
707	0.11
708	0.15
709	0.2
710	0.22
711	0.29
712	0.34
713	0.38
714	0.45
715	0.52
716	0.53
717	0.56
718	0.61
719	0.63
720	0.65
721	0.68
722	0.67
723	0.64
724	0.59
725	0.53
726	0.47
727	0.4
728	0.38
729	0.31
730	0.27
731	0.22
732	0.2
733	0.21
734	0.19
735	0.17
736	0.12
737	0.12
738	0.09
739	0.11
740	0.11
741	0.1
742	0.1
743	0.09
744	0.09
745	0.1
746	0.1
747	0.09
748	0.1
749	0.1
750	0.1

P20448

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer