FuNGI

P06777

Protein Details

Accession

P06777

Localization Confidence

High

Confidence Score

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
525-544	LNKLKWYRKQREETKKLVKE	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Subcellular Location(s)

nucl 25

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR006166 ERCC4_domain IPR011335 Restrct_endonuc-II-like IPR010994 RuvA_2-like IPR006167 XPF IPR047520 XPF_nuclease
Gene Ontology	GO:1905348 C:endonuclease complex GO:0000110 C:nucleotide-excision repair factor 1 complex GO:0005634 C:nucleus GO:0003684 F:damaged DNA binding GO:0004520 F:DNA endonuclease activity GO:0003697 F:single-stranded DNA binding GO:0006277 P:DNA amplification GO:0000724 P:double-strand break repair via homologous recombination GO:0000736 P:double-strand break repair via single-strand annealing, removal of nonhomologous ends GO:0000710 P:meiotic mismatch repair GO:0006312 P:mitotic recombination GO:0006289 P:nucleotide-excision repair GO:1901255 P:nucleotide-excision repair involved in interstrand cross-link repair GO:0000715 P:nucleotide-excision repair, DNA damage recognition GO:0000735 P:removal of nonhomologous ends GO:0000712 P:resolution of meiotic recombination intermediates
KEGG	sce:YPL022W -
Pfam	View protein in Pfam PF02732 ERCC4
CDD	cd20078 XPF_nuclease_XPF_euk

Amino Acid Sequences

MSQLFYQGDSDDELQEELTRQTTQASQSSKIKNEDEPDDSNHLNEVENEDSKVLDDDAVLYPLIPNEPDDIETSKPNINDIRPVDIQLTLPLPFQQKVVENSLITEDALIIMGKGLGLLDIVANLLHVLATPTSINGQLKRALVLVLNAKPIDNVRIKEALEELSWFSNTGKDDDDTAVESDDELFERPFNVVTADSLSIEKRRKLYISGGILSITSRILIVDLLSGIVHPNRVTGMLVLNADSLRHNSNESFILEIYRSKNTWGFIKAFSEAPETFVMEFSPLRTKMKELRLKNVLLWPRFRVEVSSCLNATNKTSHNKVIEVKVSLTNSMSQIQFGLMECLKKCIAELSRKNPELALDWWNMENVLDINFIRSIDSVMVPNWHRISYESKQLVKDIRFLRHLLKMLVTSDAVDFFGEIQLSLDANKPSVSRKYSESPWLLVDEAQLVISYAKKRIFYKNEYTLEENPKWEQLIHILHDISHERMTNHLQGPTLVACSDNLTCLELAKVLNASNKKRGVRQVLLNKLKWYRKQREETKKLVKEVQSQDTFPENATLNVSSTFSKEQVTTKRRRTRGASQVAAVEKLRNAGTNVDMEVVFEDHKLSEEIKKGSGDDLDDGQEENAANDSKIFEIQEQENEILIDDGDAEFDNGELEYVGDLPQHITTHFNKDLWAEHCNEYEYVDRQDEILISTFKSLNDNCSLQEMMPSYIIMFEPDISFIRQIEVYKAIVKDLQPKVYFMYYGESIEEQSHLTAIKREKDAFTKLIRENANLSHHFETNEDLSHYKNLAERKLKLSKLRKSNTRNAGGQQGFHNLTQDVVIVDTREFNASLPGLLYRYGIRVIPCMLTVGDYVITPDICLERKSISDLIGSLQNNRLANQCKKMLKYYAYPTLLIEFDEGQSFSLEPFSERRNYKNKDISTVHPISSKLSQDEIQLKLAKLVLRFPTLKIIWSSSPLQTVNIILELKLGREQPDPSNAVILGTNKVRSDFNSTAKGLKDGDNESKFKRLLNVPGVSKIDYFNLRKKIKSFNKLQKLSWNEINELINDEDLTDRIYYFLRTEKEEQEQESTDENLESPGKTTDDNALHDHHNDVPEAPV

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.14
2	0.14
3	0.15
4	0.13
5	0.14
6	0.13
7	0.13
8	0.15
9	0.18
10	0.22
11	0.27
12	0.3
13	0.34
14	0.42
15	0.5
16	0.53
17	0.56
18	0.54
19	0.53
20	0.55
21	0.55
22	0.51
23	0.48
24	0.47
25	0.47
26	0.44
27	0.39
28	0.35
29	0.29
30	0.24
31	0.22
32	0.21
33	0.2
34	0.21
35	0.21
36	0.2
37	0.19
38	0.19
39	0.19
40	0.15
41	0.1
42	0.09
43	0.11
44	0.12
45	0.13
46	0.12
47	0.11
48	0.11
49	0.12
50	0.13
51	0.1
52	0.1
53	0.12
54	0.13
55	0.14
56	0.17
57	0.18
58	0.2
59	0.22
60	0.24
61	0.25
62	0.24
63	0.27
64	0.3
65	0.29
66	0.35
67	0.35
68	0.39
69	0.36
70	0.37
71	0.34
72	0.3
73	0.29
74	0.23
75	0.22
76	0.16
77	0.16
78	0.18
79	0.21
80	0.2
81	0.2
82	0.21
83	0.25
84	0.28
85	0.33
86	0.33
87	0.29
88	0.3
89	0.32
90	0.28
91	0.23
92	0.19
93	0.12
94	0.09
95	0.09
96	0.08
97	0.05
98	0.05
99	0.05
100	0.04
101	0.04
102	0.04
103	0.03
104	0.03
105	0.04
106	0.04
107	0.04
108	0.04
109	0.04
110	0.04
111	0.04
112	0.04
113	0.03
114	0.04
115	0.05
116	0.05
117	0.06
118	0.06
119	0.07
120	0.09
121	0.13
122	0.17
123	0.17
124	0.21
125	0.24
126	0.25
127	0.25
128	0.24
129	0.21
130	0.18
131	0.2
132	0.23
133	0.21
134	0.24
135	0.23
136	0.23
137	0.23
138	0.23
139	0.27
140	0.26
141	0.25
142	0.26
143	0.3
144	0.3
145	0.3
146	0.3
147	0.25
148	0.2
149	0.2
150	0.18
151	0.16
152	0.16
153	0.15
154	0.14
155	0.15
156	0.16
157	0.16
158	0.17
159	0.15
160	0.17
161	0.18
162	0.19
163	0.17
164	0.16
165	0.15
166	0.13
167	0.12
168	0.11
169	0.1
170	0.1
171	0.09
172	0.09
173	0.08
174	0.09
175	0.09
176	0.09
177	0.09
178	0.1
179	0.09
180	0.09
181	0.12
182	0.12
183	0.12
184	0.13
185	0.15
186	0.2
187	0.24
188	0.27
189	0.28
190	0.31
191	0.32
192	0.34
193	0.38
194	0.4
195	0.42
196	0.39
197	0.37
198	0.33
199	0.31
200	0.28
201	0.22
202	0.14
203	0.07
204	0.06
205	0.05
206	0.05
207	0.05
208	0.05
209	0.05
210	0.05
211	0.05
212	0.05
213	0.05
214	0.06
215	0.07
216	0.08
217	0.07
218	0.08
219	0.08
220	0.09
221	0.1
222	0.09
223	0.1
224	0.11
225	0.11
226	0.11
227	0.11
228	0.11
229	0.11
230	0.11
231	0.12
232	0.12
233	0.12
234	0.14
235	0.13
236	0.16
237	0.18
238	0.18
239	0.17
240	0.15
241	0.16
242	0.14
243	0.17
244	0.18
245	0.19
246	0.18
247	0.19
248	0.22
249	0.22
250	0.26
251	0.26
252	0.26
253	0.25
254	0.27
255	0.26
256	0.25
257	0.24
258	0.25
259	0.21
260	0.21
261	0.19
262	0.18
263	0.17
264	0.16
265	0.14
266	0.11
267	0.11
268	0.1
269	0.16
270	0.17
271	0.19
272	0.2
273	0.24
274	0.3
275	0.4
276	0.47
277	0.44
278	0.51
279	0.55
280	0.55
281	0.54
282	0.53
283	0.51
284	0.46
285	0.46
286	0.39
287	0.36
288	0.36
289	0.33
290	0.29
291	0.24
292	0.27
293	0.28
294	0.29
295	0.27
296	0.27
297	0.28
298	0.26
299	0.25
300	0.23
301	0.24
302	0.25
303	0.27
304	0.31
305	0.32
306	0.34
307	0.36
308	0.36
309	0.36
310	0.33
311	0.32
312	0.31
313	0.29
314	0.27
315	0.23
316	0.2
317	0.18
318	0.19
319	0.17
320	0.13
321	0.12
322	0.12
323	0.12
324	0.1
325	0.12
326	0.1
327	0.13
328	0.13
329	0.16
330	0.15
331	0.14
332	0.14
333	0.17
334	0.21
335	0.29
336	0.36
337	0.42
338	0.51
339	0.52
340	0.52
341	0.47
342	0.42
343	0.36
344	0.31
345	0.27
346	0.19
347	0.19
348	0.19
349	0.18
350	0.17
351	0.14
352	0.12
353	0.07
354	0.07
355	0.07
356	0.06
357	0.08
358	0.08
359	0.08
360	0.08
361	0.08
362	0.08
363	0.08
364	0.09
365	0.08
366	0.08
367	0.13
368	0.13
369	0.17
370	0.17
371	0.16
372	0.16
373	0.17
374	0.24
375	0.23
376	0.31
377	0.33
378	0.35
379	0.35
380	0.38
381	0.41
382	0.35
383	0.4
384	0.35
385	0.34
386	0.33
387	0.34
388	0.35
389	0.34
390	0.35
391	0.28
392	0.25
393	0.22
394	0.2
395	0.19
396	0.16
397	0.12
398	0.1
399	0.09
400	0.08
401	0.07
402	0.06
403	0.05
404	0.06
405	0.05
406	0.05
407	0.05
408	0.05
409	0.05
410	0.06
411	0.08
412	0.08
413	0.08
414	0.09
415	0.1
416	0.13
417	0.18
418	0.2
419	0.19
420	0.23
421	0.28
422	0.3
423	0.37
424	0.35
425	0.31
426	0.3
427	0.29
428	0.25
429	0.2
430	0.17
431	0.11
432	0.09
433	0.07
434	0.06
435	0.05
436	0.05
437	0.08
438	0.09
439	0.11
440	0.13
441	0.16
442	0.2
443	0.28
444	0.34
445	0.39
446	0.45
447	0.51
448	0.53
449	0.53
450	0.54
451	0.51
452	0.51
453	0.46
454	0.4
455	0.31
456	0.28
457	0.26
458	0.21
459	0.16
460	0.14
461	0.15
462	0.15
463	0.16
464	0.15
465	0.14
466	0.16
467	0.17
468	0.14
469	0.13
470	0.12
471	0.11
472	0.13
473	0.16
474	0.19
475	0.19
476	0.19
477	0.18
478	0.17
479	0.18
480	0.16
481	0.14
482	0.09
483	0.07
484	0.06
485	0.08
486	0.08
487	0.07
488	0.07
489	0.07
490	0.07
491	0.07
492	0.07
493	0.06
494	0.06
495	0.06
496	0.06
497	0.07
498	0.11
499	0.16
500	0.18
501	0.23
502	0.29
503	0.3
504	0.33
505	0.38
506	0.41
507	0.4
508	0.46
509	0.48
510	0.53
511	0.57
512	0.55
513	0.52
514	0.52
515	0.53
516	0.52
517	0.53
518	0.53
519	0.56
520	0.65
521	0.71
522	0.76
523	0.78
524	0.8
525	0.81
526	0.75
527	0.69
528	0.64
529	0.57
530	0.54
531	0.52
532	0.5
533	0.41
534	0.37
535	0.36
536	0.33
537	0.3
538	0.21
539	0.19
540	0.12
541	0.11
542	0.12
543	0.1
544	0.09
545	0.09
546	0.1
547	0.08
548	0.09
549	0.1
550	0.1
551	0.1
552	0.11
553	0.15
554	0.23
555	0.31
556	0.37
557	0.46
558	0.55
559	0.57
560	0.61
561	0.63
562	0.63
563	0.66
564	0.66
565	0.57
566	0.49
567	0.5
568	0.45
569	0.4
570	0.3
571	0.21
572	0.13
573	0.13
574	0.12
575	0.09
576	0.09
577	0.09
578	0.1
579	0.1
580	0.1
581	0.09
582	0.09
583	0.08
584	0.08
585	0.07
586	0.06
587	0.06
588	0.06
589	0.05
590	0.06
591	0.06
592	0.07
593	0.1
594	0.14
595	0.15
596	0.16
597	0.16
598	0.16
599	0.16
600	0.16
601	0.13
602	0.1
603	0.1
604	0.1
605	0.1
606	0.09
607	0.08
608	0.08
609	0.08
610	0.07
611	0.07
612	0.06
613	0.06
614	0.06
615	0.07
616	0.06
617	0.07
618	0.07
619	0.06
620	0.09
621	0.1
622	0.11
623	0.13
624	0.13
625	0.12
626	0.12
627	0.11
628	0.08
629	0.07
630	0.05
631	0.04
632	0.03
633	0.04
634	0.04
635	0.04
636	0.03
637	0.04
638	0.04
639	0.03
640	0.03
641	0.03
642	0.03
643	0.03
644	0.04
645	0.04
646	0.04
647	0.04
648	0.05
649	0.06
650	0.06
651	0.06
652	0.1
653	0.12
654	0.19
655	0.21
656	0.2
657	0.2
658	0.21
659	0.25
660	0.23
661	0.24
662	0.2
663	0.2
664	0.21
665	0.22
666	0.21
667	0.18
668	0.18
669	0.18
670	0.16
671	0.15
672	0.14
673	0.13
674	0.14
675	0.12
676	0.11
677	0.11
678	0.09
679	0.08
680	0.1
681	0.11
682	0.11
683	0.14
684	0.14
685	0.15
686	0.18
687	0.19
688	0.17
689	0.19
690	0.19
691	0.15
692	0.17
693	0.15
694	0.13
695	0.12
696	0.11
697	0.09
698	0.09
699	0.09
700	0.07
701	0.06
702	0.06
703	0.06
704	0.07
705	0.08
706	0.08
707	0.09
708	0.09
709	0.1
710	0.1
711	0.11
712	0.11
713	0.13
714	0.13
715	0.16
716	0.16
717	0.15
718	0.16
719	0.17
720	0.25
721	0.26
722	0.31
723	0.28
724	0.29
725	0.3
726	0.29
727	0.28
728	0.19
729	0.19
730	0.14
731	0.14
732	0.14
733	0.12
734	0.12
735	0.12
736	0.12
737	0.09
738	0.08
739	0.08
740	0.08
741	0.08
742	0.13
743	0.16
744	0.21
745	0.24
746	0.26
747	0.28
748	0.32
749	0.36
750	0.35
751	0.35
752	0.37
753	0.36
754	0.41
755	0.39
756	0.36
757	0.34
758	0.34
759	0.36
760	0.3
761	0.33
762	0.29
763	0.29
764	0.28
765	0.26
766	0.24
767	0.19
768	0.19
769	0.15
770	0.13
771	0.14
772	0.15
773	0.15
774	0.14
775	0.16
776	0.19
777	0.25
778	0.31
779	0.33
780	0.39
781	0.46
782	0.49
783	0.55
784	0.61
785	0.62
786	0.66
787	0.71
788	0.73
789	0.74
790	0.79
791	0.79
792	0.76
793	0.7
794	0.62
795	0.64
796	0.55
797	0.49
798	0.4
799	0.37
800	0.32
801	0.29
802	0.28
803	0.18
804	0.17
805	0.16
806	0.14
807	0.08
808	0.07
809	0.07
810	0.07
811	0.07
812	0.08
813	0.08
814	0.09
815	0.09
816	0.08
817	0.11
818	0.1
819	0.1
820	0.1
821	0.1
822	0.09
823	0.09
824	0.1
825	0.08
826	0.1
827	0.11
828	0.12
829	0.12
830	0.13
831	0.15
832	0.15
833	0.14
834	0.14
835	0.12
836	0.11
837	0.11
838	0.1
839	0.09
840	0.08
841	0.08
842	0.08
843	0.08
844	0.07
845	0.08
846	0.09
847	0.1
848	0.11
849	0.12
850	0.12
851	0.13
852	0.18
853	0.18
854	0.17
855	0.16
856	0.16
857	0.17
858	0.21
859	0.21
860	0.19
861	0.21
862	0.24
863	0.24
864	0.24
865	0.29
866	0.3
867	0.36
868	0.39
869	0.43
870	0.45
871	0.47
872	0.52
873	0.52
874	0.49
875	0.5
876	0.51
877	0.52
878	0.49
879	0.47
880	0.42
881	0.38
882	0.34
883	0.27
884	0.22
885	0.13
886	0.12
887	0.13
888	0.12
889	0.1
890	0.1
891	0.1
892	0.09
893	0.1
894	0.09
895	0.09
896	0.12
897	0.16
898	0.23
899	0.25
900	0.33
901	0.41
902	0.47
903	0.55
904	0.61
905	0.6
906	0.61
907	0.63
908	0.6
909	0.59
910	0.56
911	0.48
912	0.42
913	0.4
914	0.35
915	0.36
916	0.34
917	0.26
918	0.26
919	0.26
920	0.28
921	0.34
922	0.32
923	0.33
924	0.33
925	0.31
926	0.3
927	0.32
928	0.29
929	0.24
930	0.28
931	0.27
932	0.29
933	0.3
934	0.3
935	0.35
936	0.33
937	0.35
938	0.31
939	0.32
940	0.27
941	0.3
942	0.32
943	0.25
944	0.3
945	0.27
946	0.26
947	0.23
948	0.22
949	0.19
950	0.19
951	0.17
952	0.12
953	0.15
954	0.15
955	0.15
956	0.17
957	0.18
958	0.18
959	0.21
960	0.24
961	0.25
962	0.32
963	0.33
964	0.3
965	0.3
966	0.27
967	0.25
968	0.24
969	0.22
970	0.19
971	0.2
972	0.22
973	0.2
974	0.22
975	0.22
976	0.23
977	0.3
978	0.31
979	0.34
980	0.38
981	0.39
982	0.41
983	0.41
984	0.41
985	0.34
986	0.33
987	0.33
988	0.32
989	0.4
990	0.42
991	0.45
992	0.45
993	0.5
994	0.46
995	0.42
996	0.44
997	0.4
998	0.42
999	0.47
1000	0.51
1001	0.47
1002	0.53
1003	0.54
1004	0.48
1005	0.43
1006	0.36
1007	0.32
1008	0.33
1009	0.36
1010	0.38
1011	0.46
1012	0.48
1013	0.52
1014	0.55
1015	0.61
1016	0.63
1017	0.68
1018	0.7
1019	0.71
1020	0.78
1021	0.79
1022	0.78
1023	0.77
1024	0.74
1025	0.71
1026	0.68
1027	0.6
1028	0.51
1029	0.5
1030	0.48
1031	0.39
1032	0.36
1033	0.29
1034	0.22
1035	0.18
1036	0.17
1037	0.13
1038	0.12
1039	0.13
1040	0.1
1041	0.09
1042	0.1
1043	0.11
1044	0.12
1045	0.14
1046	0.2
1047	0.21
1048	0.27
1049	0.32
1050	0.37
1051	0.44
1052	0.47
1053	0.48
1054	0.46
1055	0.45
1056	0.42
1057	0.39
1058	0.35
1059	0.28
1060	0.24
1061	0.21
1062	0.19
1063	0.19
1064	0.17
1065	0.16
1066	0.17
1067	0.17
1068	0.17
1069	0.19
1070	0.24
1071	0.27
1072	0.29
1073	0.3
1074	0.32
1075	0.33
1076	0.34
1077	0.34
1078	0.3
1079	0.28
1080	0.25

P06777

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer