Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A0N1HDD9

Protein Details
Accession A0A0N1HDD9    Localization Confidence High Confidence Score 16.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
251-276VIVVRPSSKRMKKKMKRQQESGRSLYHydrophilic
436-464ADILRDKPAPRNRSRSRSRNRDPSLGRSPHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
258-267SKRMKKKMKR
442-469KPAPRNRSRSRSRNRDPSLGRSPARGSR
Subcellular Location(s) nucl 16, cyto_nucl 12.5, cyto 7, mito 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR006016  UspA  
Pfam View protein in Pfam  
PF00582  Usp  
CDD cd00293  USP_Like  
Amino Acid Sequences MAATAITPTHPTPSTDKSSQSIEAQELEFGQAWDGAGQAQSPVITRPNLELCGRRKSSVAFHTAGAEETIRRESIINPPPKVPSRESKRMSSPPPPSHYSRGVSFDTFDNKEATDESFTLIYKHRDYASSARSRTFLCGTDAKDYSEYALEWMMDELVDDGDEIVCLRVIEKEDKPAILAKYRREAEKLLDSVKKKNSSEDKAISMIMELAVGRVQEVFQRMIGLYEPLHSSSEHEDAISAYCLQHSPVPVIVVRPSSKRMKKKMKRQQESGRSLYTTLTQQAAQTGGRHLRDNSIVESPPTAATDQEAEAVAKAISQGRRKGGILKNYNYGGPLQRVTSNPSDVASDEEDPATSRFALPIGYLTTEEAPRADLAMQSRESVAAPGGKTERSGSDAFMSSAGEEEEAEDDGFLNVGPAKIVEHRRPSMRETTPWLADILRDKPAPRNRSRSRSRNRDPSLGRSPARGSR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.4
2 0.4
3 0.43
4 0.41
5 0.44
6 0.45
7 0.42
8 0.38
9 0.32
10 0.31
11 0.28
12 0.26
13 0.22
14 0.21
15 0.18
16 0.15
17 0.13
18 0.11
19 0.1
20 0.1
21 0.09
22 0.08
23 0.07
24 0.07
25 0.07
26 0.07
27 0.07
28 0.08
29 0.1
30 0.13
31 0.14
32 0.15
33 0.2
34 0.23
35 0.26
36 0.29
37 0.35
38 0.36
39 0.45
40 0.47
41 0.43
42 0.41
43 0.41
44 0.46
45 0.45
46 0.46
47 0.37
48 0.35
49 0.37
50 0.35
51 0.32
52 0.25
53 0.19
54 0.14
55 0.15
56 0.16
57 0.13
58 0.13
59 0.14
60 0.15
61 0.24
62 0.32
63 0.37
64 0.38
65 0.4
66 0.46
67 0.51
68 0.54
69 0.49
70 0.5
71 0.53
72 0.61
73 0.63
74 0.63
75 0.66
76 0.69
77 0.7
78 0.69
79 0.69
80 0.67
81 0.69
82 0.68
83 0.65
84 0.62
85 0.62
86 0.56
87 0.49
88 0.46
89 0.42
90 0.38
91 0.34
92 0.31
93 0.31
94 0.29
95 0.27
96 0.23
97 0.21
98 0.21
99 0.2
100 0.18
101 0.15
102 0.13
103 0.14
104 0.14
105 0.13
106 0.15
107 0.17
108 0.19
109 0.18
110 0.21
111 0.21
112 0.21
113 0.25
114 0.3
115 0.35
116 0.4
117 0.4
118 0.39
119 0.39
120 0.39
121 0.38
122 0.33
123 0.26
124 0.22
125 0.25
126 0.26
127 0.3
128 0.3
129 0.28
130 0.26
131 0.24
132 0.21
133 0.17
134 0.15
135 0.1
136 0.1
137 0.08
138 0.08
139 0.08
140 0.06
141 0.05
142 0.05
143 0.05
144 0.04
145 0.04
146 0.04
147 0.04
148 0.04
149 0.04
150 0.04
151 0.03
152 0.04
153 0.04
154 0.04
155 0.06
156 0.08
157 0.14
158 0.14
159 0.2
160 0.21
161 0.21
162 0.21
163 0.24
164 0.23
165 0.25
166 0.28
167 0.26
168 0.33
169 0.35
170 0.36
171 0.34
172 0.33
173 0.31
174 0.33
175 0.32
176 0.29
177 0.32
178 0.33
179 0.37
180 0.42
181 0.43
182 0.37
183 0.43
184 0.47
185 0.46
186 0.51
187 0.48
188 0.43
189 0.38
190 0.38
191 0.3
192 0.22
193 0.17
194 0.1
195 0.07
196 0.05
197 0.04
198 0.04
199 0.04
200 0.04
201 0.04
202 0.04
203 0.06
204 0.08
205 0.08
206 0.07
207 0.08
208 0.08
209 0.09
210 0.09
211 0.08
212 0.06
213 0.07
214 0.07
215 0.08
216 0.09
217 0.08
218 0.09
219 0.11
220 0.13
221 0.11
222 0.11
223 0.1
224 0.1
225 0.1
226 0.09
227 0.07
228 0.05
229 0.06
230 0.06
231 0.06
232 0.07
233 0.07
234 0.08
235 0.08
236 0.09
237 0.09
238 0.1
239 0.11
240 0.12
241 0.13
242 0.14
243 0.18
244 0.26
245 0.34
246 0.42
247 0.51
248 0.59
249 0.67
250 0.77
251 0.82
252 0.85
253 0.85
254 0.86
255 0.86
256 0.85
257 0.83
258 0.76
259 0.67
260 0.57
261 0.49
262 0.4
263 0.31
264 0.22
265 0.16
266 0.14
267 0.12
268 0.11
269 0.12
270 0.13
271 0.11
272 0.11
273 0.13
274 0.16
275 0.17
276 0.19
277 0.18
278 0.2
279 0.22
280 0.23
281 0.22
282 0.21
283 0.2
284 0.18
285 0.18
286 0.17
287 0.14
288 0.13
289 0.11
290 0.08
291 0.08
292 0.09
293 0.09
294 0.09
295 0.09
296 0.08
297 0.08
298 0.08
299 0.07
300 0.06
301 0.07
302 0.1
303 0.15
304 0.19
305 0.23
306 0.26
307 0.29
308 0.29
309 0.37
310 0.39
311 0.44
312 0.47
313 0.46
314 0.48
315 0.47
316 0.46
317 0.38
318 0.34
319 0.27
320 0.22
321 0.2
322 0.17
323 0.19
324 0.2
325 0.25
326 0.26
327 0.25
328 0.22
329 0.22
330 0.21
331 0.18
332 0.2
333 0.18
334 0.15
335 0.14
336 0.14
337 0.13
338 0.14
339 0.14
340 0.12
341 0.1
342 0.09
343 0.08
344 0.09
345 0.09
346 0.08
347 0.09
348 0.09
349 0.1
350 0.1
351 0.11
352 0.13
353 0.13
354 0.13
355 0.12
356 0.11
357 0.1
358 0.11
359 0.1
360 0.1
361 0.13
362 0.17
363 0.17
364 0.17
365 0.17
366 0.17
367 0.17
368 0.15
369 0.14
370 0.14
371 0.13
372 0.16
373 0.18
374 0.17
375 0.18
376 0.19
377 0.19
378 0.2
379 0.21
380 0.18
381 0.2
382 0.21
383 0.2
384 0.19
385 0.17
386 0.13
387 0.13
388 0.11
389 0.08
390 0.06
391 0.07
392 0.07
393 0.08
394 0.08
395 0.07
396 0.07
397 0.07
398 0.07
399 0.06
400 0.06
401 0.06
402 0.06
403 0.06
404 0.06
405 0.08
406 0.15
407 0.24
408 0.3
409 0.38
410 0.43
411 0.5
412 0.54
413 0.57
414 0.6
415 0.57
416 0.55
417 0.55
418 0.56
419 0.51
420 0.49
421 0.44
422 0.35
423 0.33
424 0.33
425 0.28
426 0.27
427 0.28
428 0.29
429 0.38
430 0.47
431 0.53
432 0.57
433 0.64
434 0.69
435 0.77
436 0.86
437 0.87
438 0.89
439 0.9
440 0.91
441 0.92
442 0.89
443 0.88
444 0.83
445 0.82
446 0.8
447 0.78
448 0.69
449 0.63