FuNGI

A0A0M9VMV2

Protein Details

Accession

A0A0M9VMV2

Localization Confidence

High

Confidence Score

15.4

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
128-150	GGFTRAKPFKKRVREVHKSGNAA	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
134-146	KPFKKRVREVHKS
571-577	EPKKKLR

Subcellular Location(s)

nucl 20.5, cyto_nucl 13, cyto 4.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR008851 TFIIF-alpha IPR011039 TFIIF_interaction
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0003677 F:DNA binding GO:0032968 P:positive regulation of transcription elongation by RNA polymerase II GO:0006367 P:transcription initiation at RNA polymerase II promoter

Amino Acid Sequences

MKQEPGIKAEPEDTKPRAGQRGYRDIPLYSMGATNAMTHLMKFASHTRVDPNQETQFVPPVKLNRKMPLRLKMPPAQPGDVVVDKWGKPVMDKDGQPLTWPAPGFDLESVRPYLGLDQPKVLDEETGGGFTRAKPFKKRVREVHKSGNAARRTRNEEFYPWVLEDFETSQEWESAREPLPNSLKMLEQYYYAEKERREHGTDTKPRMPKSEATSSAAHGPSSSHAPWIGQLEGDSDENSTSHHVLFVFDERNAGGFKVVPIRRQYKFMQLQKHALSSEQVEEEFARQQRSSETDRWMMRYRYQTGAGTGAVASAGPSRAGAAAARMPMLSLPGQPSMLGWQSSARLVAVQGESQHGRDDDDDLFGAMPKQETTYDELDFEEEFADDEERIGMNDEAEEAEAKELDERLKREMVADHVDDMAIKQEPDDDAAYDAVAVNRRSGAADPLYGSAATYDRHDDAMLTGSGRQMRKIMKALSRREGLDMYDSDEEAKNPYASDESDDNEDLDVLHPERAILAAREEKARAERMAAAAAAAAATATPTSAPPSGTHTPDPDASLKRKNELLRPGPDEPKKKLRTDSRASSPGAGGTPGRASSPPRPLSPLESEIAHLLSNGVVASTSDLVQHFRARLKQDATLKEQLSAAVKRIAYMDKKDNKLKLKEAYAMDGGASSPRGGRPGSTA

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.43
2	0.46
3	0.5
4	0.53
5	0.52
6	0.54
7	0.55
8	0.63
9	0.61
10	0.62
11	0.57
12	0.49
13	0.47
14	0.42
15	0.34
16	0.24
17	0.22
18	0.16
19	0.15
20	0.15
21	0.14
22	0.11
23	0.13
24	0.12
25	0.11
26	0.13
27	0.12
28	0.12
29	0.14
30	0.19
31	0.23
32	0.25
33	0.27
34	0.32
35	0.39
36	0.46
37	0.47
38	0.48
39	0.47
40	0.47
41	0.47
42	0.42
43	0.43
44	0.38
45	0.35
46	0.33
47	0.37
48	0.42
49	0.49
50	0.52
51	0.53
52	0.6
53	0.67
54	0.71
55	0.71
56	0.7
57	0.69
58	0.72
59	0.71
60	0.67
61	0.67
62	0.63
63	0.56
64	0.49
65	0.44
66	0.42
67	0.35
68	0.3
69	0.26
70	0.26
71	0.23
72	0.25
73	0.25
74	0.2
75	0.2
76	0.24
77	0.28
78	0.3
79	0.31
80	0.35
81	0.38
82	0.38
83	0.38
84	0.36
85	0.3
86	0.27
87	0.27
88	0.22
89	0.18
90	0.19
91	0.19
92	0.18
93	0.19
94	0.16
95	0.19
96	0.19
97	0.17
98	0.16
99	0.15
100	0.16
101	0.19
102	0.24
103	0.23
104	0.24
105	0.25
106	0.26
107	0.27
108	0.24
109	0.18
110	0.12
111	0.14
112	0.12
113	0.12
114	0.11
115	0.11
116	0.11
117	0.13
118	0.22
119	0.25
120	0.29
121	0.36
122	0.46
123	0.55
124	0.65
125	0.73
126	0.75
127	0.79
128	0.84
129	0.84
130	0.86
131	0.83
132	0.78
133	0.75
134	0.73
135	0.69
136	0.63
137	0.62
138	0.58
139	0.6
140	0.59
141	0.58
142	0.53
143	0.49
144	0.5
145	0.46
146	0.42
147	0.34
148	0.3
149	0.24
150	0.21
151	0.19
152	0.14
153	0.14
154	0.12
155	0.12
156	0.12
157	0.13
158	0.13
159	0.13
160	0.13
161	0.15
162	0.16
163	0.19
164	0.19
165	0.25
166	0.29
167	0.29
168	0.3
169	0.26
170	0.27
171	0.24
172	0.26
173	0.19
174	0.16
175	0.17
176	0.18
177	0.2
178	0.22
179	0.24
180	0.23
181	0.26
182	0.3
183	0.33
184	0.34
185	0.34
186	0.39
187	0.46
188	0.54
189	0.58
190	0.61
191	0.61
192	0.58
193	0.59
194	0.55
195	0.5
196	0.48
197	0.49
198	0.44
199	0.43
200	0.43
201	0.39
202	0.41
203	0.36
204	0.29
205	0.2
206	0.17
207	0.15
208	0.18
209	0.17
210	0.13
211	0.12
212	0.13
213	0.14
214	0.16
215	0.15
216	0.1
217	0.1
218	0.1
219	0.11
220	0.12
221	0.1
222	0.08
223	0.08
224	0.08
225	0.08
226	0.09
227	0.08
228	0.08
229	0.09
230	0.09
231	0.09
232	0.1
233	0.13
234	0.13
235	0.12
236	0.13
237	0.11
238	0.12
239	0.12
240	0.11
241	0.07
242	0.06
243	0.07
244	0.16
245	0.17
246	0.2
247	0.26
248	0.32
249	0.33
250	0.38
251	0.38
252	0.4
253	0.48
254	0.5
255	0.53
256	0.5
257	0.55
258	0.52
259	0.52
260	0.42
261	0.33
262	0.28
263	0.21
264	0.19
265	0.13
266	0.11
267	0.1
268	0.1
269	0.11
270	0.14
271	0.14
272	0.14
273	0.14
274	0.14
275	0.15
276	0.2
277	0.24
278	0.24
279	0.26
280	0.3
281	0.31
282	0.35
283	0.39
284	0.36
285	0.35
286	0.37
287	0.37
288	0.33
289	0.35
290	0.31
291	0.26
292	0.26
293	0.21
294	0.15
295	0.12
296	0.09
297	0.06
298	0.05
299	0.05
300	0.04
301	0.04
302	0.04
303	0.04
304	0.04
305	0.04
306	0.05
307	0.04
308	0.05
309	0.06
310	0.07
311	0.07
312	0.06
313	0.06
314	0.06
315	0.07
316	0.07
317	0.06
318	0.08
319	0.08
320	0.08
321	0.08
322	0.08
323	0.09
324	0.09
325	0.09
326	0.07
327	0.07
328	0.08
329	0.09
330	0.09
331	0.07
332	0.06
333	0.05
334	0.07
335	0.07
336	0.07
337	0.07
338	0.09
339	0.1
340	0.1
341	0.11
342	0.09
343	0.09
344	0.09
345	0.11
346	0.09
347	0.1
348	0.09
349	0.08
350	0.08
351	0.08
352	0.08
353	0.06
354	0.05
355	0.05
356	0.06
357	0.06
358	0.07
359	0.11
360	0.13
361	0.13
362	0.14
363	0.14
364	0.14
365	0.13
366	0.12
367	0.08
368	0.06
369	0.05
370	0.05
371	0.06
372	0.05
373	0.05
374	0.05
375	0.05
376	0.05
377	0.06
378	0.06
379	0.05
380	0.05
381	0.06
382	0.05
383	0.06
384	0.06
385	0.04
386	0.05
387	0.05
388	0.05
389	0.05
390	0.06
391	0.09
392	0.12
393	0.13
394	0.16
395	0.17
396	0.17
397	0.18
398	0.18
399	0.19
400	0.19
401	0.19
402	0.16
403	0.15
404	0.15
405	0.13
406	0.12
407	0.1
408	0.07
409	0.06
410	0.06
411	0.07
412	0.07
413	0.09
414	0.1
415	0.08
416	0.08
417	0.09
418	0.09
419	0.07
420	0.08
421	0.07
422	0.1
423	0.1
424	0.09
425	0.1
426	0.1
427	0.11
428	0.11
429	0.13
430	0.11
431	0.11
432	0.12
433	0.12
434	0.13
435	0.12
436	0.11
437	0.09
438	0.09
439	0.08
440	0.08
441	0.1
442	0.1
443	0.11
444	0.11
445	0.1
446	0.1
447	0.12
448	0.11
449	0.09
450	0.09
451	0.11
452	0.16
453	0.16
454	0.16
455	0.18
456	0.21
457	0.24
458	0.29
459	0.33
460	0.36
461	0.44
462	0.49
463	0.51
464	0.52
465	0.48
466	0.45
467	0.4
468	0.34
469	0.29
470	0.23
471	0.2
472	0.18
473	0.17
474	0.17
475	0.16
476	0.16
477	0.14
478	0.15
479	0.12
480	0.11
481	0.12
482	0.12
483	0.12
484	0.15
485	0.14
486	0.14
487	0.17
488	0.17
489	0.17
490	0.15
491	0.15
492	0.11
493	0.1
494	0.11
495	0.09
496	0.1
497	0.09
498	0.09
499	0.09
500	0.09
501	0.1
502	0.08
503	0.11
504	0.15
505	0.17
506	0.19
507	0.2
508	0.21
509	0.24
510	0.26
511	0.23
512	0.21
513	0.21
514	0.2
515	0.21
516	0.19
517	0.15
518	0.11
519	0.11
520	0.08
521	0.05
522	0.04
523	0.02
524	0.03
525	0.03
526	0.03
527	0.03
528	0.04
529	0.07
530	0.09
531	0.1
532	0.1
533	0.18
534	0.23
535	0.27
536	0.29
537	0.28
538	0.3
539	0.31
540	0.33
541	0.31
542	0.32
543	0.34
544	0.4
545	0.4
546	0.4
547	0.45
548	0.47
549	0.49
550	0.53
551	0.55
552	0.54
553	0.59
554	0.61
555	0.65
556	0.68
557	0.67
558	0.64
559	0.67
560	0.66
561	0.64
562	0.68
563	0.69
564	0.71
565	0.73
566	0.74
567	0.72
568	0.72
569	0.69
570	0.61
571	0.52
572	0.44
573	0.35
574	0.28
575	0.2
576	0.16
577	0.16
578	0.14
579	0.15
580	0.15
581	0.2
582	0.26
583	0.36
584	0.38
585	0.38
586	0.42
587	0.43
588	0.47
589	0.48
590	0.44
591	0.36
592	0.32
593	0.31
594	0.28
595	0.27
596	0.2
597	0.14
598	0.11
599	0.09
600	0.08
601	0.07
602	0.05
603	0.05
604	0.05
605	0.07
606	0.08
607	0.08
608	0.1
609	0.11
610	0.13
611	0.16
612	0.2
613	0.21
614	0.26
615	0.32
616	0.34
617	0.41
618	0.42
619	0.47
620	0.52
621	0.55
622	0.57
623	0.59
624	0.55
625	0.49
626	0.46
627	0.41
628	0.39
629	0.34
630	0.3
631	0.27
632	0.26
633	0.25
634	0.28
635	0.33
636	0.32
637	0.38
638	0.45
639	0.49
640	0.56
641	0.64
642	0.69
643	0.71
644	0.72
645	0.73
646	0.71
647	0.67
648	0.67
649	0.61
650	0.59
651	0.51
652	0.43
653	0.36
654	0.28
655	0.23
656	0.17
657	0.15
658	0.11
659	0.12
660	0.13
661	0.16
662	0.16

A0A0M9VMV2

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer