Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A0M8MYR6

Protein Details
Accession A0A0M8MYR6    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
109-129DGVAPRAKMNQQRSRRFRSAQHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
405-406RK
410-427ERQEANKRRHAARDGKPR
919-941RRGGGGGHRGGGFGGRGGRGGRR
Subcellular Location(s) cyto 13, mito 8, nucl 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR027073  5_3_exoribonuclease  
IPR041412  Xrn1_helical  
IPR004859  Xrn1_N  
IPR017151  Xrn2/3/4  
IPR001878  Znf_CCHC  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0004534  F:5'-3' RNA exonuclease activity  
GO:0003676  F:nucleic acid binding  
GO:0008270  F:zinc ion binding  
GO:0006353  P:DNA-templated transcription termination  
GO:0006397  P:mRNA processing  
Pfam View protein in Pfam  
PF17846  XRN_M  
PF03159  XRN_N  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50158  ZF_CCHC  
CDD cd18673  PIN_XRN1-2-like  
Amino Acid Sequences MQGVPALFRWLSKKYPKIVQSVEEDEPGQMTGPDGEMIEVPVDISRPNPNGEEYDCLYLDMNGIVHPCTHPEGKPAPETEEEMMAEVFQYTERVVAMIRPRKLLMMAIDGVAPRAKMNQQRSRRFRSAQDAKIMHDQREQELAERKKKGQADDDESVKKSWDSNAITPGTPFMDLLASSLRYWIAHKLNTDPGWKNLCVVLSDASVPGEGEHKIMDYIRRKRSDPNHDPNMKHVIYGLDADLIMLSLATHEPHFKVLREDVFAQDNKSRGCHRCGQEGHYAANCVAERVEKPVPAKKPFIFLDVPTLREYLAVELQTPGIPFPFDLERAIDDWVFLIFFVGNDFLPHLPSLEIREGAIDTLLKIWKRELPRMTGYVTNNGRVELRNAQLILDGLANLEDEIFRKRKETEERQEANKRRHAARDGKPRNTEASTKPVAAPPVVAPPVVAPSKPVPGARNKGPILLDGDSMDVVKNRAQIRMANISAAETMRVELAAKKGTKRAAGALDTSRKRGKVEDSALFPMDEEMPRDTATPSEDRAKALASALEGTANESDDMLKKDVLGKEALVKQEDESSEAAVKEEESPALKKEEDEEQDERGVKDDDDEDGDDDDDDEEEETSPLTRKVNDDGTVEYEDTVKLYEPGYRERYYRQKFGVELSDTAFRRAVVQKYVEGLCWVLAYYYQGCPSWKWYYPYHYAPFAADFTDMASLAIEFGESEPFRPFEQLMGVLPAASKTNLPEPFQWLMTDPESEIVDFYPSEFSIDMNGKKMAWQGVALLPFIDEKRLLTALHKRYGQLTKDEVRRNSFGRNVLFVNEDADLYPAISRMYAKRNDGQPQPIDTTRIRQIAGTMEVDPSCVPSSTFYSPLSSLPDMKDIHNDHSVSVYYDFPAQRTPHRSVLLRGLRLPPRRLTPADADWVRRGGGGGHRGGGFGGRGGRGGRRDGWSSQGALYGRDAHPGGPYHAPSNGPYGGGPYGGGPYNAGPYNAGPYNAGPYNAGPYNAGPYQPAPSGPYGGGAYAGHYANPYGGHNYQAYGYGQATNSFGASPYGHAGTAYGSAYGQPSAYGGYGQASHPYSGYGGPPPNRGGRGSHRGGAYR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.5
2 0.6
3 0.63
4 0.67
5 0.67
6 0.64
7 0.61
8 0.6
9 0.55
10 0.48
11 0.43
12 0.34
13 0.3
14 0.25
15 0.18
16 0.12
17 0.1
18 0.09
19 0.09
20 0.09
21 0.09
22 0.09
23 0.09
24 0.1
25 0.09
26 0.08
27 0.08
28 0.08
29 0.08
30 0.08
31 0.1
32 0.16
33 0.18
34 0.21
35 0.22
36 0.24
37 0.28
38 0.3
39 0.33
40 0.29
41 0.31
42 0.28
43 0.27
44 0.25
45 0.21
46 0.2
47 0.15
48 0.13
49 0.09
50 0.1
51 0.1
52 0.11
53 0.11
54 0.13
55 0.17
56 0.2
57 0.2
58 0.26
59 0.32
60 0.36
61 0.41
62 0.4
63 0.4
64 0.39
65 0.42
66 0.36
67 0.33
68 0.28
69 0.24
70 0.21
71 0.17
72 0.14
73 0.11
74 0.09
75 0.06
76 0.07
77 0.06
78 0.07
79 0.07
80 0.07
81 0.07
82 0.12
83 0.22
84 0.29
85 0.32
86 0.34
87 0.34
88 0.36
89 0.36
90 0.34
91 0.27
92 0.25
93 0.23
94 0.21
95 0.22
96 0.2
97 0.2
98 0.18
99 0.15
100 0.1
101 0.13
102 0.19
103 0.26
104 0.37
105 0.45
106 0.55
107 0.66
108 0.74
109 0.8
110 0.82
111 0.79
112 0.76
113 0.77
114 0.76
115 0.72
116 0.73
117 0.65
118 0.6
119 0.66
120 0.61
121 0.53
122 0.48
123 0.44
124 0.36
125 0.4
126 0.37
127 0.33
128 0.39
129 0.45
130 0.48
131 0.51
132 0.51
133 0.53
134 0.57
135 0.56
136 0.56
137 0.56
138 0.56
139 0.56
140 0.6
141 0.58
142 0.55
143 0.5
144 0.42
145 0.34
146 0.27
147 0.25
148 0.27
149 0.27
150 0.29
151 0.35
152 0.37
153 0.36
154 0.35
155 0.33
156 0.26
157 0.21
158 0.17
159 0.11
160 0.1
161 0.09
162 0.1
163 0.12
164 0.12
165 0.11
166 0.12
167 0.12
168 0.12
169 0.13
170 0.2
171 0.22
172 0.24
173 0.26
174 0.3
175 0.37
176 0.4
177 0.45
178 0.4
179 0.41
180 0.43
181 0.41
182 0.38
183 0.32
184 0.3
185 0.24
186 0.23
187 0.18
188 0.14
189 0.14
190 0.13
191 0.12
192 0.11
193 0.1
194 0.09
195 0.09
196 0.08
197 0.08
198 0.08
199 0.08
200 0.09
201 0.11
202 0.18
203 0.26
204 0.35
205 0.43
206 0.47
207 0.49
208 0.57
209 0.66
210 0.69
211 0.7
212 0.71
213 0.73
214 0.76
215 0.75
216 0.7
217 0.69
218 0.57
219 0.47
220 0.38
221 0.28
222 0.22
223 0.22
224 0.18
225 0.1
226 0.1
227 0.09
228 0.08
229 0.07
230 0.05
231 0.04
232 0.03
233 0.03
234 0.04
235 0.05
236 0.06
237 0.08
238 0.09
239 0.14
240 0.16
241 0.16
242 0.2
243 0.24
244 0.26
245 0.28
246 0.29
247 0.26
248 0.3
249 0.3
250 0.29
251 0.28
252 0.28
253 0.25
254 0.27
255 0.32
256 0.3
257 0.35
258 0.4
259 0.41
260 0.47
261 0.49
262 0.5
263 0.52
264 0.5
265 0.47
266 0.39
267 0.37
268 0.28
269 0.28
270 0.23
271 0.16
272 0.14
273 0.13
274 0.12
275 0.17
276 0.2
277 0.18
278 0.22
279 0.29
280 0.36
281 0.38
282 0.44
283 0.39
284 0.44
285 0.42
286 0.44
287 0.38
288 0.32
289 0.37
290 0.33
291 0.33
292 0.28
293 0.27
294 0.22
295 0.2
296 0.2
297 0.12
298 0.13
299 0.11
300 0.11
301 0.11
302 0.12
303 0.12
304 0.12
305 0.09
306 0.07
307 0.07
308 0.06
309 0.09
310 0.1
311 0.1
312 0.11
313 0.11
314 0.12
315 0.13
316 0.15
317 0.12
318 0.1
319 0.09
320 0.08
321 0.07
322 0.06
323 0.05
324 0.04
325 0.04
326 0.05
327 0.05
328 0.05
329 0.05
330 0.07
331 0.07
332 0.08
333 0.08
334 0.08
335 0.07
336 0.08
337 0.12
338 0.12
339 0.12
340 0.11
341 0.12
342 0.12
343 0.11
344 0.11
345 0.07
346 0.06
347 0.08
348 0.11
349 0.11
350 0.11
351 0.13
352 0.18
353 0.22
354 0.29
355 0.3
356 0.33
357 0.36
358 0.38
359 0.38
360 0.39
361 0.36
362 0.37
363 0.35
364 0.33
365 0.29
366 0.28
367 0.27
368 0.22
369 0.24
370 0.2
371 0.19
372 0.18
373 0.18
374 0.17
375 0.16
376 0.16
377 0.13
378 0.09
379 0.07
380 0.05
381 0.05
382 0.05
383 0.04
384 0.04
385 0.04
386 0.04
387 0.09
388 0.12
389 0.12
390 0.14
391 0.16
392 0.23
393 0.33
394 0.42
395 0.47
396 0.56
397 0.6
398 0.66
399 0.74
400 0.74
401 0.71
402 0.67
403 0.62
404 0.54
405 0.56
406 0.56
407 0.56
408 0.58
409 0.63
410 0.65
411 0.68
412 0.68
413 0.64
414 0.6
415 0.53
416 0.48
417 0.4
418 0.38
419 0.33
420 0.31
421 0.3
422 0.28
423 0.26
424 0.21
425 0.19
426 0.13
427 0.15
428 0.15
429 0.13
430 0.12
431 0.11
432 0.15
433 0.14
434 0.13
435 0.1
436 0.12
437 0.14
438 0.16
439 0.18
440 0.17
441 0.24
442 0.29
443 0.31
444 0.37
445 0.35
446 0.36
447 0.35
448 0.33
449 0.29
450 0.25
451 0.21
452 0.13
453 0.13
454 0.11
455 0.1
456 0.09
457 0.06
458 0.06
459 0.07
460 0.12
461 0.13
462 0.14
463 0.15
464 0.17
465 0.21
466 0.25
467 0.24
468 0.2
469 0.18
470 0.18
471 0.17
472 0.15
473 0.11
474 0.06
475 0.06
476 0.05
477 0.05
478 0.05
479 0.06
480 0.08
481 0.12
482 0.13
483 0.14
484 0.18
485 0.2
486 0.21
487 0.2
488 0.22
489 0.2
490 0.2
491 0.22
492 0.22
493 0.28
494 0.28
495 0.3
496 0.29
497 0.27
498 0.27
499 0.26
500 0.26
501 0.26
502 0.3
503 0.3
504 0.31
505 0.33
506 0.32
507 0.3
508 0.25
509 0.18
510 0.14
511 0.11
512 0.09
513 0.08
514 0.08
515 0.09
516 0.1
517 0.09
518 0.08
519 0.1
520 0.1
521 0.11
522 0.16
523 0.16
524 0.16
525 0.16
526 0.16
527 0.14
528 0.13
529 0.12
530 0.07
531 0.07
532 0.06
533 0.06
534 0.06
535 0.06
536 0.06
537 0.06
538 0.06
539 0.05
540 0.06
541 0.07
542 0.09
543 0.09
544 0.09
545 0.08
546 0.13
547 0.14
548 0.15
549 0.14
550 0.12
551 0.16
552 0.19
553 0.2
554 0.16
555 0.15
556 0.14
557 0.17
558 0.17
559 0.14
560 0.11
561 0.11
562 0.11
563 0.11
564 0.11
565 0.08
566 0.08
567 0.07
568 0.07
569 0.07
570 0.07
571 0.08
572 0.09
573 0.11
574 0.11
575 0.1
576 0.12
577 0.17
578 0.18
579 0.22
580 0.22
581 0.22
582 0.24
583 0.25
584 0.23
585 0.18
586 0.17
587 0.12
588 0.12
589 0.11
590 0.09
591 0.09
592 0.1
593 0.09
594 0.08
595 0.09
596 0.07
597 0.07
598 0.06
599 0.05
600 0.05
601 0.04
602 0.04
603 0.05
604 0.05
605 0.05
606 0.05
607 0.06
608 0.07
609 0.08
610 0.09
611 0.1
612 0.13
613 0.17
614 0.18
615 0.19
616 0.19
617 0.21
618 0.21
619 0.19
620 0.16
621 0.13
622 0.11
623 0.1
624 0.09
625 0.06
626 0.06
627 0.06
628 0.08
629 0.1
630 0.15
631 0.21
632 0.22
633 0.23
634 0.28
635 0.38
636 0.41
637 0.44
638 0.41
639 0.39
640 0.38
641 0.4
642 0.4
643 0.31
644 0.27
645 0.23
646 0.27
647 0.24
648 0.25
649 0.22
650 0.16
651 0.18
652 0.22
653 0.22
654 0.2
655 0.21
656 0.21
657 0.23
658 0.24
659 0.2
660 0.16
661 0.14
662 0.11
663 0.09
664 0.08
665 0.05
666 0.05
667 0.06
668 0.07
669 0.08
670 0.09
671 0.1
672 0.11
673 0.12
674 0.17
675 0.21
676 0.23
677 0.26
678 0.28
679 0.33
680 0.38
681 0.44
682 0.41
683 0.38
684 0.35
685 0.32
686 0.3
687 0.24
688 0.19
689 0.13
690 0.1
691 0.08
692 0.08
693 0.08
694 0.06
695 0.06
696 0.05
697 0.05
698 0.04
699 0.04
700 0.03
701 0.04
702 0.07
703 0.07
704 0.08
705 0.1
706 0.11
707 0.12
708 0.13
709 0.13
710 0.1
711 0.12
712 0.11
713 0.11
714 0.11
715 0.11
716 0.09
717 0.09
718 0.09
719 0.08
720 0.08
721 0.07
722 0.07
723 0.14
724 0.17
725 0.19
726 0.2
727 0.25
728 0.26
729 0.27
730 0.26
731 0.2
732 0.2
733 0.19
734 0.18
735 0.13
736 0.13
737 0.13
738 0.12
739 0.11
740 0.08
741 0.08
742 0.07
743 0.08
744 0.08
745 0.07
746 0.08
747 0.08
748 0.08
749 0.11
750 0.15
751 0.15
752 0.16
753 0.17
754 0.16
755 0.17
756 0.19
757 0.17
758 0.14
759 0.13
760 0.13
761 0.15
762 0.16
763 0.15
764 0.12
765 0.11
766 0.12
767 0.12
768 0.11
769 0.08
770 0.08
771 0.1
772 0.11
773 0.11
774 0.15
775 0.24
776 0.29
777 0.34
778 0.35
779 0.33
780 0.39
781 0.45
782 0.43
783 0.38
784 0.39
785 0.41
786 0.48
787 0.54
788 0.52
789 0.5
790 0.51
791 0.49
792 0.48
793 0.45
794 0.42
795 0.37
796 0.36
797 0.32
798 0.29
799 0.29
800 0.24
801 0.2
802 0.15
803 0.13
804 0.11
805 0.1
806 0.09
807 0.07
808 0.08
809 0.06
810 0.06
811 0.06
812 0.08
813 0.12
814 0.19
815 0.23
816 0.27
817 0.34
818 0.4
819 0.46
820 0.49
821 0.52
822 0.48
823 0.47
824 0.48
825 0.43
826 0.41
827 0.36
828 0.36
829 0.35
830 0.34
831 0.3
832 0.26
833 0.26
834 0.25
835 0.27
836 0.23
837 0.18
838 0.17
839 0.17
840 0.17
841 0.16
842 0.14
843 0.12
844 0.11
845 0.11
846 0.11
847 0.16
848 0.18
849 0.21
850 0.2
851 0.21
852 0.22
853 0.23
854 0.26
855 0.22
856 0.22
857 0.21
858 0.26
859 0.25
860 0.25
861 0.31
862 0.28
863 0.31
864 0.34
865 0.33
866 0.27
867 0.28
868 0.28
869 0.22
870 0.21
871 0.17
872 0.13
873 0.18
874 0.18
875 0.17
876 0.22
877 0.23
878 0.29
879 0.34
880 0.39
881 0.4
882 0.44
883 0.45
884 0.43
885 0.51
886 0.51
887 0.48
888 0.46
889 0.47
890 0.51
891 0.56
892 0.57
893 0.51
894 0.5
895 0.53
896 0.52
897 0.5
898 0.48
899 0.45
900 0.5
901 0.48
902 0.45
903 0.41
904 0.4
905 0.35
906 0.29
907 0.25
908 0.19
909 0.22
910 0.24
911 0.23
912 0.24
913 0.24
914 0.24
915 0.24
916 0.21
917 0.15
918 0.12
919 0.13
920 0.11
921 0.12
922 0.14
923 0.18
924 0.2
925 0.24
926 0.26
927 0.28
928 0.32
929 0.32
930 0.36
931 0.34
932 0.33
933 0.29
934 0.3
935 0.26
936 0.23
937 0.23
938 0.24
939 0.21
940 0.24
941 0.23
942 0.19
943 0.22
944 0.23
945 0.25
946 0.24
947 0.25
948 0.23
949 0.26
950 0.26
951 0.24
952 0.27
953 0.25
954 0.2
955 0.18
956 0.2
957 0.18
958 0.16
959 0.15
960 0.1
961 0.12
962 0.12
963 0.12
964 0.1
965 0.11
966 0.15
967 0.16
968 0.16
969 0.14
970 0.14
971 0.2
972 0.2
973 0.2
974 0.17
975 0.17
976 0.22
977 0.22
978 0.22
979 0.17
980 0.17
981 0.22
982 0.22
983 0.22
984 0.17
985 0.17
986 0.22
987 0.22
988 0.22
989 0.18
990 0.18
991 0.21
992 0.21
993 0.22
994 0.19
995 0.2
996 0.22
997 0.2
998 0.21
999 0.18
1000 0.16
1001 0.17
1002 0.13
1003 0.13
1004 0.14
1005 0.14
1006 0.12
1007 0.12
1008 0.12
1009 0.12
1010 0.13
1011 0.14
1012 0.16
1013 0.16
1014 0.19
1015 0.2
1016 0.2
1017 0.2
1018 0.22
1019 0.21
1020 0.18
1021 0.18
1022 0.18
1023 0.18
1024 0.19
1025 0.19
1026 0.16
1027 0.16
1028 0.14
1029 0.13
1030 0.12
1031 0.12
1032 0.13
1033 0.15
1034 0.15
1035 0.15
1036 0.14
1037 0.14
1038 0.13
1039 0.15
1040 0.13
1041 0.1
1042 0.09
1043 0.1
1044 0.12
1045 0.12
1046 0.11
1047 0.08
1048 0.09
1049 0.09
1050 0.1
1051 0.09
1052 0.08
1053 0.1
1054 0.11
1055 0.12
1056 0.17
1057 0.18
1058 0.18
1059 0.18
1060 0.19
1061 0.18
1062 0.18
1063 0.2
1064 0.21
1065 0.27
1066 0.3
1067 0.34
1068 0.38
1069 0.43
1070 0.43
1071 0.43
1072 0.43
1073 0.45
1074 0.5
1075 0.51
1076 0.52