Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A0M8MQF8

Protein Details
Accession A0A0M8MQF8    Localization Confidence High Confidence Score 19.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
7-29VYNYERTTRQILKRHRKDPASFIHydrophilic
328-353AKSADAKKAAKKKKRIKGRDEPDTPTBasic
362-386AAATDASRSKPKRRKKDESSTDEMPHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
333-346AKKAAKKKKRIKGR
369-377RSKPKRRKK
Subcellular Location(s) nucl 18.5, cyto_nucl 12, cyto 4.5, mito 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR021950  Spt20  
IPR046468  Spt20-like_SEP  
Gene Ontology GO:0000124  C:SAGA complex  
GO:0003712  F:transcription coregulator activity  
Pfam View protein in Pfam  
PF12090  Spt20  
Amino Acid Sequences MATTASVYNYERTTRQILKRHRKDPASFIIHMHPQFMRFEKQDGYFLFESRTKEFLHYICDQVIPVDLMDVFQQAGVPFFEGCLMVEIHDHRKLVSANEPSNNRFSVDGSRDSRADDSLFYLREGGRYGFYQTRFRSRSQLTTDDVKTSPDGVEIYRIIMRPSAESLWNDLRMMDAKMGGVWSDEDALRIESQIVNLTAPPLCLTPDPHVSRMANWIQSSTMPSPAYPTSATLQPQRRDKATGHKLNSVELAQAKSQDVRREQIMLMMKDGWSSELELSRMRDITSETGSFVPSFSRLDFLRTWRSNRKEEGTGSSETMTSPSQADTAKSADAKKAAKKKKRIKGRDEPDTPTIKTTEAATAAATDASRSKPKRRKKDESSTDEMPTAKAGASHMTASTSSPFEGHVSLPGRPFGTDMAMANTKSDNLVLPGSGAAKGATTQGHATPGMPVIMPSSTPFAPPTSDQKNNNHWFFS
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.4
2 0.46
3 0.53
4 0.62
5 0.7
6 0.79
7 0.82
8 0.84
9 0.84
10 0.81
11 0.8
12 0.79
13 0.75
14 0.66
15 0.61
16 0.57
17 0.56
18 0.5
19 0.45
20 0.36
21 0.31
22 0.34
23 0.35
24 0.35
25 0.3
26 0.33
27 0.34
28 0.35
29 0.39
30 0.35
31 0.39
32 0.33
33 0.32
34 0.32
35 0.31
36 0.33
37 0.3
38 0.31
39 0.25
40 0.27
41 0.3
42 0.28
43 0.3
44 0.29
45 0.29
46 0.27
47 0.27
48 0.24
49 0.2
50 0.2
51 0.14
52 0.11
53 0.1
54 0.08
55 0.08
56 0.08
57 0.08
58 0.07
59 0.06
60 0.08
61 0.07
62 0.08
63 0.08
64 0.09
65 0.08
66 0.08
67 0.09
68 0.08
69 0.08
70 0.08
71 0.08
72 0.07
73 0.1
74 0.13
75 0.18
76 0.21
77 0.2
78 0.19
79 0.23
80 0.24
81 0.24
82 0.29
83 0.32
84 0.33
85 0.4
86 0.43
87 0.42
88 0.44
89 0.42
90 0.35
91 0.28
92 0.25
93 0.27
94 0.27
95 0.32
96 0.31
97 0.34
98 0.33
99 0.34
100 0.33
101 0.27
102 0.23
103 0.17
104 0.17
105 0.18
106 0.18
107 0.17
108 0.18
109 0.17
110 0.17
111 0.18
112 0.15
113 0.13
114 0.13
115 0.18
116 0.21
117 0.23
118 0.3
119 0.31
120 0.4
121 0.41
122 0.42
123 0.47
124 0.45
125 0.49
126 0.48
127 0.49
128 0.43
129 0.47
130 0.46
131 0.42
132 0.38
133 0.32
134 0.27
135 0.23
136 0.2
137 0.14
138 0.13
139 0.1
140 0.12
141 0.11
142 0.12
143 0.13
144 0.14
145 0.13
146 0.14
147 0.14
148 0.12
149 0.15
150 0.15
151 0.15
152 0.15
153 0.19
154 0.21
155 0.21
156 0.2
157 0.17
158 0.17
159 0.16
160 0.16
161 0.11
162 0.09
163 0.08
164 0.08
165 0.08
166 0.07
167 0.06
168 0.05
169 0.05
170 0.06
171 0.06
172 0.06
173 0.07
174 0.08
175 0.08
176 0.07
177 0.08
178 0.07
179 0.07
180 0.08
181 0.08
182 0.07
183 0.07
184 0.08
185 0.08
186 0.07
187 0.08
188 0.06
189 0.07
190 0.08
191 0.1
192 0.12
193 0.2
194 0.22
195 0.23
196 0.26
197 0.25
198 0.25
199 0.29
200 0.28
201 0.23
202 0.2
203 0.2
204 0.17
205 0.17
206 0.2
207 0.15
208 0.16
209 0.13
210 0.13
211 0.15
212 0.15
213 0.16
214 0.13
215 0.14
216 0.12
217 0.15
218 0.17
219 0.21
220 0.27
221 0.3
222 0.36
223 0.37
224 0.37
225 0.37
226 0.37
227 0.41
228 0.44
229 0.47
230 0.44
231 0.47
232 0.46
233 0.43
234 0.43
235 0.32
236 0.24
237 0.18
238 0.16
239 0.11
240 0.12
241 0.12
242 0.14
243 0.16
244 0.19
245 0.2
246 0.2
247 0.21
248 0.22
249 0.21
250 0.23
251 0.26
252 0.22
253 0.21
254 0.2
255 0.18
256 0.16
257 0.16
258 0.12
259 0.07
260 0.08
261 0.08
262 0.08
263 0.09
264 0.11
265 0.12
266 0.13
267 0.13
268 0.12
269 0.11
270 0.12
271 0.13
272 0.14
273 0.13
274 0.13
275 0.13
276 0.14
277 0.13
278 0.12
279 0.1
280 0.08
281 0.09
282 0.08
283 0.1
284 0.1
285 0.14
286 0.16
287 0.19
288 0.28
289 0.3
290 0.37
291 0.44
292 0.49
293 0.51
294 0.54
295 0.54
296 0.49
297 0.48
298 0.47
299 0.42
300 0.38
301 0.33
302 0.29
303 0.24
304 0.2
305 0.19
306 0.13
307 0.1
308 0.09
309 0.09
310 0.1
311 0.11
312 0.11
313 0.11
314 0.13
315 0.14
316 0.16
317 0.17
318 0.17
319 0.22
320 0.25
321 0.31
322 0.4
323 0.48
324 0.55
325 0.64
326 0.72
327 0.77
328 0.84
329 0.86
330 0.86
331 0.87
332 0.88
333 0.88
334 0.83
335 0.79
336 0.74
337 0.68
338 0.59
339 0.5
340 0.41
341 0.31
342 0.26
343 0.22
344 0.18
345 0.15
346 0.14
347 0.12
348 0.12
349 0.11
350 0.11
351 0.1
352 0.08
353 0.09
354 0.12
355 0.2
356 0.25
357 0.35
358 0.44
359 0.55
360 0.65
361 0.74
362 0.81
363 0.83
364 0.9
365 0.9
366 0.89
367 0.86
368 0.79
369 0.71
370 0.62
371 0.52
372 0.41
373 0.31
374 0.23
375 0.16
376 0.12
377 0.11
378 0.11
379 0.12
380 0.13
381 0.12
382 0.13
383 0.13
384 0.13
385 0.15
386 0.14
387 0.12
388 0.12
389 0.12
390 0.13
391 0.14
392 0.13
393 0.17
394 0.18
395 0.21
396 0.22
397 0.24
398 0.23
399 0.22
400 0.22
401 0.17
402 0.17
403 0.16
404 0.15
405 0.19
406 0.21
407 0.21
408 0.21
409 0.2
410 0.18
411 0.17
412 0.16
413 0.12
414 0.11
415 0.12
416 0.11
417 0.11
418 0.12
419 0.12
420 0.12
421 0.11
422 0.09
423 0.08
424 0.09
425 0.11
426 0.1
427 0.11
428 0.13
429 0.14
430 0.17
431 0.17
432 0.17
433 0.17
434 0.17
435 0.16
436 0.14
437 0.13
438 0.12
439 0.12
440 0.13
441 0.12
442 0.16
443 0.15
444 0.16
445 0.18
446 0.17
447 0.21
448 0.24
449 0.31
450 0.35
451 0.43
452 0.48
453 0.56
454 0.65
455 0.71