Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A0M8MN06

Protein Details
Accession A0A0M8MN06    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
34-53RVAARERRTNTQKRARSTSPHydrophilic
441-465SSGPAPKGKKGKRGAAPRKFKLQNTHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
444-461PAPKGKKGKRGAAPRKFK
Subcellular Location(s) nucl 12, cyto 11.5, cyto_mito 7.5, mito 2.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR010347  Tdp1  
IPR040501  TFA2_Winged_2  
IPR016656  TFIIE-bsu  
IPR003166  TFIIE_bsu_DNA-bd  
Gene Ontology GO:0005673  C:transcription factor TFIIE complex  
GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0008081  F:phosphoric diester hydrolase activity  
GO:0003743  F:translation initiation factor activity  
GO:0006281  P:DNA repair  
GO:0006367  P:transcription initiation at RNA polymerase II promoter  
Pfam View protein in Pfam  
PF18121  TFA2_Winged_2  
PF02186  TFIIE_beta  
PF06087  Tyr-DNA_phospho  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51351  TFIIE_BETA_C  
Amino Acid Sequences MSSEDPSTERAGSSTSLLALIPDRAQLEKERLARVAARERRTNTQKRARSTSPTAPDEVPPRAKASAHAIHPRYIPISPEDRFWKGALKATYNRYARVSKAGSTLAQAIAPASSTERCGLERVLLTSYDVEIDWIESLFPANVPVTYIGNPPRGDSRTDPSVPSPGFYASDTMPNWEMCIPKKPHPRALQHMKLLLLYYSTHLRVIVSTANLTQLDWSRYENMLNLALAEGEVYSQPANTGVGVHESTQLVAAVDALKNTTHPVRMEDFALVHNLHALLDRNSSLFQRFKQHPKVLYDEKTDLWSYKPDYDIHSPADIVALLRQKYYHPSALTPLSSAAGMRVAELRESYPQAREAIEELVNEQPIENRQVLVLRGKRDGAIKHVFWNPIQGEIVKPIDEEFKELWRGLTVPNVVDLASDLENEGLSATKMVESTAKSVPSSGPAPKGKKGKRGAAPRKFKLQNTHLKGVDLSKDFVKPSG
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.16
2 0.14
3 0.13
4 0.13
5 0.13
6 0.13
7 0.14
8 0.12
9 0.14
10 0.15
11 0.15
12 0.18
13 0.21
14 0.26
15 0.31
16 0.35
17 0.36
18 0.36
19 0.38
20 0.4
21 0.43
22 0.47
23 0.48
24 0.5
25 0.54
26 0.58
27 0.65
28 0.72
29 0.74
30 0.74
31 0.77
32 0.78
33 0.78
34 0.82
35 0.77
36 0.76
37 0.74
38 0.73
39 0.71
40 0.66
41 0.62
42 0.55
43 0.54
44 0.51
45 0.5
46 0.45
47 0.38
48 0.38
49 0.36
50 0.34
51 0.33
52 0.36
53 0.35
54 0.37
55 0.45
56 0.44
57 0.45
58 0.46
59 0.45
60 0.39
61 0.34
62 0.29
63 0.25
64 0.29
65 0.26
66 0.31
67 0.34
68 0.34
69 0.35
70 0.34
71 0.36
72 0.31
73 0.37
74 0.36
75 0.37
76 0.4
77 0.44
78 0.52
79 0.47
80 0.48
81 0.46
82 0.45
83 0.4
84 0.42
85 0.38
86 0.32
87 0.33
88 0.33
89 0.28
90 0.27
91 0.27
92 0.2
93 0.17
94 0.15
95 0.12
96 0.09
97 0.09
98 0.08
99 0.08
100 0.08
101 0.09
102 0.11
103 0.12
104 0.13
105 0.14
106 0.15
107 0.16
108 0.17
109 0.17
110 0.16
111 0.15
112 0.16
113 0.14
114 0.14
115 0.11
116 0.1
117 0.08
118 0.07
119 0.07
120 0.07
121 0.06
122 0.06
123 0.05
124 0.06
125 0.05
126 0.05
127 0.06
128 0.06
129 0.06
130 0.07
131 0.08
132 0.09
133 0.1
134 0.14
135 0.17
136 0.21
137 0.22
138 0.22
139 0.26
140 0.26
141 0.28
142 0.28
143 0.3
144 0.32
145 0.33
146 0.33
147 0.29
148 0.34
149 0.31
150 0.28
151 0.24
152 0.18
153 0.17
154 0.16
155 0.17
156 0.11
157 0.15
158 0.15
159 0.16
160 0.16
161 0.15
162 0.16
163 0.16
164 0.17
165 0.14
166 0.23
167 0.26
168 0.33
169 0.43
170 0.47
171 0.54
172 0.6
173 0.65
174 0.66
175 0.72
176 0.71
177 0.63
178 0.61
179 0.52
180 0.44
181 0.38
182 0.28
183 0.18
184 0.11
185 0.1
186 0.1
187 0.1
188 0.1
189 0.1
190 0.1
191 0.09
192 0.1
193 0.1
194 0.08
195 0.08
196 0.08
197 0.1
198 0.1
199 0.1
200 0.1
201 0.1
202 0.11
203 0.11
204 0.12
205 0.13
206 0.14
207 0.14
208 0.13
209 0.12
210 0.12
211 0.11
212 0.1
213 0.07
214 0.06
215 0.06
216 0.05
217 0.03
218 0.03
219 0.03
220 0.03
221 0.03
222 0.03
223 0.04
224 0.04
225 0.04
226 0.04
227 0.04
228 0.04
229 0.06
230 0.06
231 0.07
232 0.08
233 0.08
234 0.08
235 0.08
236 0.08
237 0.06
238 0.05
239 0.05
240 0.05
241 0.05
242 0.05
243 0.05
244 0.05
245 0.05
246 0.07
247 0.08
248 0.09
249 0.1
250 0.13
251 0.15
252 0.16
253 0.16
254 0.16
255 0.15
256 0.13
257 0.15
258 0.12
259 0.09
260 0.09
261 0.08
262 0.07
263 0.08
264 0.09
265 0.07
266 0.09
267 0.09
268 0.09
269 0.1
270 0.11
271 0.13
272 0.14
273 0.16
274 0.23
275 0.28
276 0.37
277 0.45
278 0.5
279 0.51
280 0.53
281 0.58
282 0.57
283 0.55
284 0.51
285 0.44
286 0.39
287 0.36
288 0.33
289 0.27
290 0.21
291 0.2
292 0.19
293 0.19
294 0.2
295 0.19
296 0.23
297 0.27
298 0.28
299 0.27
300 0.25
301 0.22
302 0.2
303 0.19
304 0.15
305 0.1
306 0.11
307 0.13
308 0.12
309 0.13
310 0.13
311 0.14
312 0.19
313 0.23
314 0.24
315 0.21
316 0.22
317 0.26
318 0.29
319 0.28
320 0.23
321 0.2
322 0.16
323 0.15
324 0.13
325 0.09
326 0.08
327 0.08
328 0.08
329 0.1
330 0.09
331 0.1
332 0.11
333 0.12
334 0.12
335 0.16
336 0.17
337 0.16
338 0.18
339 0.19
340 0.18
341 0.18
342 0.17
343 0.17
344 0.16
345 0.15
346 0.15
347 0.15
348 0.15
349 0.14
350 0.13
351 0.11
352 0.13
353 0.16
354 0.15
355 0.13
356 0.13
357 0.15
358 0.17
359 0.24
360 0.26
361 0.26
362 0.28
363 0.28
364 0.3
365 0.33
366 0.32
367 0.31
368 0.34
369 0.32
370 0.35
371 0.39
372 0.4
373 0.35
374 0.4
375 0.33
376 0.29
377 0.29
378 0.24
379 0.2
380 0.23
381 0.24
382 0.17
383 0.16
384 0.15
385 0.19
386 0.19
387 0.22
388 0.19
389 0.21
390 0.24
391 0.24
392 0.24
393 0.19
394 0.2
395 0.17
396 0.22
397 0.19
398 0.17
399 0.18
400 0.17
401 0.16
402 0.15
403 0.15
404 0.11
405 0.1
406 0.1
407 0.09
408 0.09
409 0.09
410 0.08
411 0.08
412 0.06
413 0.05
414 0.06
415 0.06
416 0.07
417 0.07
418 0.08
419 0.12
420 0.13
421 0.17
422 0.2
423 0.22
424 0.21
425 0.23
426 0.23
427 0.24
428 0.27
429 0.27
430 0.32
431 0.38
432 0.43
433 0.5
434 0.59
435 0.62
436 0.67
437 0.71
438 0.73
439 0.74
440 0.8
441 0.83
442 0.83
443 0.87
444 0.83
445 0.85
446 0.83
447 0.79
448 0.78
449 0.77
450 0.78
451 0.76
452 0.78
453 0.69
454 0.63
455 0.59
456 0.54
457 0.51
458 0.43
459 0.37
460 0.32
461 0.34