Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A0M9VPA1

Protein Details
Accession A0A0M9VPA1    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
215-234GTGRRKRHIISEQRRRNQIRBasic
286-306EEEIQRRKRNAQRRARSRAMAHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
291-323RRKRNAQRRARSRAMAGKSQRGRGRGRGRGGSA
Subcellular Location(s) nucl 13.5, mito 11, cyto_nucl 8.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR011598  bHLH_dom  
IPR036638  HLH_DNA-bd_sf  
Gene Ontology GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0046983  F:protein dimerization activity  
Pfam View protein in Pfam  
PF00010  HLH  
Amino Acid Sequences MPRRPSMDNSSLTTGALPSAPGPFEDFAVPSQLPPNLELDESFLSRLTCELQSETPAAASMSDRPTSSTTSTPADMAPTVPMTTSLTVPAHVASSLPSTLTAPADAQAASSTLLNENESAMLTNFLHSLDADFAELPSVPSLGLPTSDLPLPPLASLGSSTFLSLAPSWANAASPSSRPGPSGASGMASPTPPVKSNDTGDEDSTSDATQGTGTGTGRRKRHIISEQRRRNQIREGFTKLSELLDAGRGYGARALGLNSGAGTGVEDEELDDRTDTEEDLLLGCDEEEIQRRKRNAQRRARSRAMAGKSQRGRGRGRGRGGSAGGAGSKSAVLFQVIDLLDWLQGRNATLERELHELDSQIHAAHAQATHMYRRTRHYS
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.28
2 0.21
3 0.18
4 0.13
5 0.09
6 0.11
7 0.12
8 0.11
9 0.15
10 0.14
11 0.15
12 0.16
13 0.16
14 0.14
15 0.19
16 0.18
17 0.16
18 0.19
19 0.2
20 0.2
21 0.19
22 0.22
23 0.18
24 0.18
25 0.18
26 0.18
27 0.19
28 0.18
29 0.18
30 0.16
31 0.15
32 0.14
33 0.15
34 0.14
35 0.13
36 0.14
37 0.17
38 0.17
39 0.2
40 0.21
41 0.2
42 0.17
43 0.16
44 0.14
45 0.11
46 0.11
47 0.13
48 0.16
49 0.17
50 0.17
51 0.19
52 0.21
53 0.24
54 0.26
55 0.23
56 0.23
57 0.24
58 0.25
59 0.23
60 0.22
61 0.2
62 0.17
63 0.16
64 0.14
65 0.12
66 0.11
67 0.1
68 0.11
69 0.11
70 0.12
71 0.12
72 0.13
73 0.13
74 0.13
75 0.13
76 0.13
77 0.11
78 0.1
79 0.1
80 0.07
81 0.09
82 0.09
83 0.09
84 0.09
85 0.09
86 0.1
87 0.11
88 0.1
89 0.08
90 0.09
91 0.1
92 0.09
93 0.08
94 0.07
95 0.07
96 0.07
97 0.07
98 0.07
99 0.08
100 0.09
101 0.09
102 0.09
103 0.09
104 0.08
105 0.08
106 0.08
107 0.07
108 0.08
109 0.07
110 0.08
111 0.08
112 0.08
113 0.08
114 0.07
115 0.08
116 0.07
117 0.07
118 0.07
119 0.06
120 0.06
121 0.06
122 0.07
123 0.06
124 0.05
125 0.05
126 0.05
127 0.04
128 0.05
129 0.05
130 0.05
131 0.06
132 0.06
133 0.07
134 0.08
135 0.08
136 0.08
137 0.09
138 0.09
139 0.08
140 0.08
141 0.06
142 0.06
143 0.07
144 0.06
145 0.07
146 0.07
147 0.07
148 0.07
149 0.07
150 0.08
151 0.07
152 0.08
153 0.06
154 0.06
155 0.07
156 0.06
157 0.06
158 0.05
159 0.07
160 0.07
161 0.08
162 0.1
163 0.12
164 0.13
165 0.13
166 0.14
167 0.14
168 0.14
169 0.14
170 0.12
171 0.1
172 0.1
173 0.1
174 0.1
175 0.08
176 0.07
177 0.07
178 0.08
179 0.09
180 0.12
181 0.14
182 0.16
183 0.18
184 0.21
185 0.25
186 0.25
187 0.24
188 0.22
189 0.19
190 0.17
191 0.16
192 0.12
193 0.08
194 0.07
195 0.06
196 0.05
197 0.05
198 0.05
199 0.06
200 0.06
201 0.12
202 0.18
203 0.24
204 0.26
205 0.28
206 0.31
207 0.31
208 0.39
209 0.42
210 0.48
211 0.53
212 0.62
213 0.7
214 0.73
215 0.81
216 0.75
217 0.69
218 0.67
219 0.63
220 0.59
221 0.54
222 0.55
223 0.48
224 0.46
225 0.44
226 0.35
227 0.29
228 0.21
229 0.16
230 0.1
231 0.1
232 0.1
233 0.08
234 0.09
235 0.08
236 0.08
237 0.1
238 0.09
239 0.06
240 0.07
241 0.07
242 0.07
243 0.08
244 0.07
245 0.06
246 0.06
247 0.05
248 0.05
249 0.04
250 0.04
251 0.04
252 0.04
253 0.04
254 0.05
255 0.06
256 0.07
257 0.07
258 0.06
259 0.07
260 0.08
261 0.09
262 0.08
263 0.08
264 0.08
265 0.07
266 0.08
267 0.08
268 0.07
269 0.06
270 0.06
271 0.05
272 0.05
273 0.07
274 0.14
275 0.18
276 0.24
277 0.3
278 0.33
279 0.43
280 0.52
281 0.6
282 0.64
283 0.7
284 0.75
285 0.8
286 0.86
287 0.84
288 0.78
289 0.75
290 0.73
291 0.67
292 0.65
293 0.6
294 0.6
295 0.58
296 0.63
297 0.6
298 0.57
299 0.57
300 0.58
301 0.63
302 0.61
303 0.64
304 0.62
305 0.6
306 0.59
307 0.54
308 0.46
309 0.36
310 0.29
311 0.22
312 0.16
313 0.13
314 0.1
315 0.09
316 0.07
317 0.07
318 0.07
319 0.07
320 0.07
321 0.07
322 0.13
323 0.12
324 0.13
325 0.12
326 0.12
327 0.13
328 0.13
329 0.14
330 0.09
331 0.1
332 0.11
333 0.14
334 0.15
335 0.16
336 0.18
337 0.21
338 0.22
339 0.26
340 0.26
341 0.25
342 0.25
343 0.24
344 0.22
345 0.22
346 0.21
347 0.16
348 0.15
349 0.13
350 0.12
351 0.14
352 0.13
353 0.11
354 0.15
355 0.18
356 0.24
357 0.3
358 0.35
359 0.37